Entry information : OsAPx-R(LOC_Os08g41090)
| Entry ID | 3961 |
|---|---|
| Creation | 2007-04-13 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-08-06 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-05-03 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsAPx-R(LOC_Os08g41090)
| Name | OsAPx-R(LOC_Os08g41090) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Chloroplastic |
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| Tissue types | Leaves Stems Whole plant |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3961' 'complement(join(25964937..25965039,25965297..25965363,25965540..25965661,25965868..25965951,25966138..25966234,25966330..25966372,25966490..25966560,25966751..25966878,25967168..25967258,25967357..25967472,25967566..25967639))' |
Exons►
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Literature and cross-references OsAPx-R(LOC_Os08g41090)
| Literature | Sasaki,T., Matsumoto,T. and Yamamoto,K. Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 8, BAC clone:OJ1081_B12. Published Only in Database (2001)
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|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q7F1J9 |
| DNA ref. | GenBank: NC_008401.1 (25967639..25964940) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.17125 |
Protein sequence: OsAPx-R(LOC_Os08g41090)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 8, 10 introns), 3 cDNA and 19 ESTs. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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| cDNA► Send to BLAST |
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