Entry information : PabPrx17(PAB00038182 / MA_3486g0010 /prx17)
Entry ID 4052
Creation 2006-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx17(PAB00038182 / MA_3486g0010 /prx17)
Name PabPrx17(PAB00038182 / MA_3486g0010 /prx17)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx100]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Cell culture
Inducer Lignification
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx17
start..stop
S start..stop
PsiPrx06 662 0 1..321 1..321
PabPrx01 573 0 1..330 1..329
PtaPrx36 570 0 1..321 1..321
PabPrx199 540 0 1..321 1..321
Literature and cross-references PabPrx17(PAB00038182 / MA_3486g0010 /prx17)
Literature Koutaniemi,S., Warinowski,T., Kaerkoenen,A., Alatalo,E., Fossdal,C.G., Fagerstedt,K.V., Simola,L.K., Paulin,L. and Rudd,S. Untangling the lignin biosyntehtic pathway in Norway spruce
mRNA ref. GenBank:   AM293547   AM293546 [Mismatch]
Protein sequence: PabPrx17(PAB00038182 / MA_3486g0010 /prx17)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331
PWM (Da):   %s   35697.09 Transmb domain:   %s   i9-31o
PI (pH):   %s   8.78
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAQIKHSPGL TLQFLSVLIT GLALMLWIQT VDAQSCNGLS HHFYYKSCPK AQAIIKSVVE DAVRKEARMA ASLLRLHFHD CFVKGCDGSI LLDDTSSFTG EKTANPNRNS VRGFGVVDQI  KCELEKACPG VVSCADILAV AARDSVGFSG GPFWKVLLGR RDSRSASKSG ANNDIPGPNS THQTLETKFK RQGLNVVDLV ALSGAHTIGL ARCSSFKARL YNQTVNGKPD PTLDTTYLKH 
LRAVCPQTGT DDNQTTPLDP VTPIKFDIDY YDNVVAGKGL LASDQILYST KGSRTVGLVE SYSTSTHAFF KQFAASMIKM GMHSSSNSLH Q 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and cDNA.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACAGA TCAAACATAG TCCGGGCCTT ACACTGCAGT TTCTGTCTGT GCTGATCACG GGACTGGCAT TGATGCTATG GATCCAGACA GTGGATGCTC AGAGCTGTAA TGGGCTGAGT  CATCATTTTT ATTACAAATC CTGTCCCAAG GCCCAGGCTA TCATTAAATC TGTAGTAGAA GATGCTGTCA GAAAGGAAGC AAGAATGGCT GCTTCCCTGC TTCGTCTGCA TTTTCATGAC  TGTTTTGTTA AGGTAAGCGT TCATTAATGT TTAACTAGTA TGCCAGTTTA TGTACCAGTA TATAATCCCA CAAGCATTTC TGCAATGGCA AACATTATAC ACCCTGGAAA CTCAAGTTGG  AACCTTCCAA CTTGCCTGCC TGCCTCTTCA TGGTTCTGGC TAGCTCCTGG CAGGTATATG ATGTGGATAA TGTTTACCCT TTCCTGAATT ACTCTCCTGT ATCAATATAG TGAATAGTCC  CATCATAAAT ATATGAGAAA TGTTTTTTTT TCATCAATCA ATCAATGCTA GTTGTTATAG CTAGGTTAAA GATTTTAAGA AACCATGATT TTTTCAGGGG ATATTTATTC AAAATCTGTC  TGGTGAGAAA TTGTTGGATT TTTGGATTTG AGTCATCATT TTTGTAGAGT AGAGTGTGTA CTGAGAATTT TTCAGCATAC TGAATCTATT CAAAAATAAA TTTTAAACAA CAAAAAATAC  TGATTCATTT AAATTTATAT TAACTAATTC CTACCTAAAA AACCATTTTG TTAAACAGCT AGCCAACGCC GTTGTTATAT ATGAGCAATG TGTTGAGCCC GATGAATCTT TTCTGCATCA  TCTAACTGAC TTTGTTCATC CCTGCATAGG TATTGAGACC CTTAAGGTGC ACAATTCCTT CTGACAGCAA TCATTGGACA AAATATTTAA TACCGACCAT TCTGCAATTT AGAAAGTTTT  AAGAATTCTT AACGTTGGGT TTATCAGGCA TTTGATCAAG TGATACAACT AGTGCTAATG TTAATATATG TTCCAATACA GCACCTCGTT ACTGTTGGTG TTACATTTTT TATGTGTTTA  CATCAATGTT TGAAAACTGT TTCAACGGTA TTATGGTGTT TCATAATAGT ACGCTAATTA GCTCTAAAAG GCGTAGGGTG TTATGTAACT ATATGCAAGC AGCAGTGCAG CAATAGATGC  TGGGATATAT ACAGTAGATC CAAGGTTTCC TGCAACTAGA GATGTTGGGA TATATATTAT CGGGTATGAT ATATTTCAGA TTCAACAGTA TATATCCCAG CATCTATTAC ACTTATTACT  ATATTGTGAA TTTAGTTTTG TTATTGATCG CCATGTAATA CTGTCTGTCC TGACATTTGA GCTGTGGGTC AGTTAAAAAG GCTGATTGAT ATAATCTATT GCATTGCATT GACACAGGGC  TGCGACGGTT CAATTCTGCT TGATGACACT TCTAGCTTCA CGGGGGAGAA GACAGCAAAT CCTAACAGGA ATTCTGTAAG AGGCTTTGGA GTAGTGGATC AGATCAAATG CGAACTGGAG  AAAGCATGTC CCGGCGTGGT CTCATGTGCT GACATTCTTG CTGTGGCAGC CCGTGATTCA GTTGGCTTTG TGAGTATACG TTTGTGCCAT TACTCATTCA CATTTAGTCC TTATATTTGC  ATCAATGAAA CAAGGTGTTT TAGTTCATAA ACATCATGCA TTTAGCAGCA AGGTTATATA TATTATTAGA TGCATTTAGT AGCAATGATA TATATAGAGA GAGAGGGGGG TTAGATTTTA  GCAATTTTTA AAAAAATAGT TGGGAAAGTT AAAGTGATTG ATTTTTTTAA AACCTTGATA AATTTAAAAT TTGATGGAAG AATTGATCAT TTCAATAATC CGAATAAAAT TTCAATAAAA  TACAGAATTT CCACCAAAAA CATGTATACA AGATATAATA CAATCAATGC AACACTTTGT TGTGACTTGC TAATCCAGTG AAATGTCACT AATTTGGTTT TTCCTTGTAA GGTTCTTTCC  ATATTTTAAA AACTCTAGCT TAAAAGAACA GTTGTGCATG TCCATCTCAA CAGTTATCTA TGTCATCTCA ACTCAAATCA GTTGTCACCT CCAGTTTTTC TCTGTCTCCA TGCTTAATCC  AAGATTAAAA ATCCAGATCT ATTCACTATA ACCGATATTT TTAAAACTTG CATTTAACGA TGATGGAGAG TGATTTAATA CTTGCATTTT TTTAAATCCA GATCTATTCA CTATAAAAGT  TGCATTTAAC GATGATGGAG AGTGATTTAA TACTTGATTT GGTTGGGCAT GAAGCAGAGT GGAGGGCCGT TTTGGAAGGT TCTACTGGGT AGGAGGGATT CAAGAAGTGC AAGCAAGAGC  GGCGCAAACA ACGACATTCC TGGGCCCAAC TCAACCCATC AGACTTTGGA AACCAAATTC AAACGCCAAG GTCTCAATGT GGTCGACCTG GTTGCTCTAT CAGGTATTCA CTCAGTCCAC  TCTTTGCAGG CAACTTTCAT AAACTAACGT ATTGATTAAA CTTGACACAC ACACTCTCTA TATATATATA TATATTATCG ATTAAACTTG ATTATATATA TATATATATA TATATATATA  TACATATTTT AAACTAGCAA AGCCACACAC TAGTGACTGG TGAAAGCAGA AAGGTTTAGG TTGGTAAAAT TCCTAAAGTA GTAAAAAAGA AAACTCTAAG CAATTACTCT TTTTTGTTTC  TTTCATTTGA ATGGGCAGTT GCCAGACTCT ATGAGGATGA CACGAGAATA TGAAAAGGTT GGAATTAAGT TTGATAATCA TTTGAATATG GCAATTAGAT AGTCACAAAG TAAATCATAT  TAAATAAATG TTAAAAAGTA AACAAGTTAA CGGATGTCTT GATAAATGCA AGAAAGTTAT GAACAATAAA TCTTTAGAGT TTAAGGTTAA ATAAGGTTAA AAGATCATTA ATTGTGCCCA  TTACAAAGGT GTACGTCTTT TGAGTAAAAA TCATTAATTA TATGTAGTAA TACCTTTGTC CTCCATTTAT TTTTTTTATA TTCTGCTATG AGATTTATTT AGTGCTTGTT ATTTCAAATT  CAAAAAAATC TGTATATATC CAAGTTTATC TACCCAGCAT TGGAAGAATG GTTCCACCTG CAAACTGTAG AGAACTTTGG ATGCAATAAT TGTTTTAATA AAACAAATTG CACGTAAATG  TTGATCCCGA TCGTATATGA TATGCAGGCG CCCATACGAT AGGTTTAGCG CGATGCTCAA GCTTCAAGGC GAGGCTGTAC AATCAGACTG TAAATGGGAA GCCTGACCCT ACACTTGACA  CGACGTACTT AAAGCATCTG AGGGCCGTGT GTCCTCAAAC TGGCACCGAT GATAATCAAA CGACGCCATT GGATCCGGTC ACTCCTATAA AATTCGACAT AGACTACTAC GATAACGTGG  TGGCGGGAAA GGGGCTGCTG GCGTCAGATC AGATTCTGTA TTCCACCAAA GGAAGTAGAA CAGTGGGTTT AGTGGAGTCC TACAGCACCA GCACGCATGC ATTCTTCAAG CAATTCGCTG 
CATCAATGAT AAAGATGGGC ATGCATTCTT CAAGCAATTC GCTGCATCAA TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACAGA TCAAACATAG TCCGGGCCTT ACACTGCAGT TTCTGTCTGT GCTGATCACG GGACTGGCAT TGATGCTATG GATCCAGACA GTGGATGCTC AGAGCTGTAA TGGGCTGAGT  CATCATTTTT ATTACAAATC CTGTCCCAAG GCCCAGGCTA TCATTAAATC TGTAGTAGAA GATGCTGTCA GAAAGGAAGC AAGAATGGCT GCTTCCCTGC TTCGTCTGCA TTTTCATGAC  TGTTTTGTTA AGGGCTGCGA CGGTTCAATT CTGCTTGATG ACACTTCTAG CTTCACGGGG GAGAAGACAG CAAATCCTAA CAGGAATTCT GTAAGAGGCT TTGGAGTAGT GGATCAGATC  AAATGCGAAC TGGAGAAAGC ATGTCCCGGC GTGGTCTCAT GTGCTGACAT TCTTGCTGTG GCAGCCCGTG ATTCAGTTGG CTTTAGTGGA GGGCCGTTTT GGAAGGTTCT ACTGGGTAGG  AGGGATTCAA GAAGTGCAAG CAAGAGCGGC GCAAACAACG ACATTCCTGG GCCCAACTCA ACCCATCAGA CTTTGGAAAC CAAATTCAAA CGCCAAGGTC TCAATGTGGT CGACCTGGTT  GCTCTATCAG GCGCCCATAC GATAGGTTTA GCGCGATGCT CAAGCTTCAA GGCGAGGCTG TACAATCAGA CTGTAAATGG GAAGCCTGAC CCTACACTTG ACACGACGTA CTTAAAGCAT  CTGAGGGCCG TGTGTCCTCA AACTGGCACC GATGATAATC AAACGACGCC ATTGGATCCG GTCACTCCTA TAAAATTCGA CATAGACTAC TACGATAACG TGGTGGCGGG AAAGGGGCTG  CTGGCGTCAG ATCAGATTCT GTATTCCACC AAAGGAAGTA GAACAGTGGG TTTAGTGGAG TCCTACAGCA CCAGCACGCA TGCATTCTTC AAGCAATTCG CTGCATCAAT GATAAAGATG 
GGCATGCATT CTTCAAGCAA TTCGCTGCAT CAATGA 

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