Entry information : OsDiOx01(LOC_Os12g26290)
| Entry ID | 4159 |
|---|---|
| Creation | 2007-01-31 (Filippo Passardi) |
| Last sequence changes | 2007-01-31 (Filippo Passardi) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2022-02-13 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsDiOx01(LOC_Os12g26290)
| Name | OsDiOx01(LOC_Os12g26290) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Alpha-dioxygenase [Orthogroup: DiOx001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Callus Flowers Leaves Roots Stems Whole plant |
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| Inducers | Hydrogen peroxide Magnaporthe grisea infection Pathogen interaction |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4159' 'complement(join(15374814..15374997,15375304..15375547,15376035..15376237,15377275..15377502,15377674..15377819,15378020..15378233,15378410..15378543,15378986..15379135,15379892..15380155,15380962..15381051))' |
Exons►
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Literature and cross-references OsDiOx01(LOC_Os12g26290)
| Literature | REFERENCE 1 Matsumoto, T., Wu, J., Kanamori, H., et al. (2005) The map-based sequence of the rice genome. Nature 436, 793-800.
REFERENCE 2 Zamocky M. et al. (2007) Phylogenetic relationship in the peroxidase-cyclooxygenase superfamily (in preparation). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q2QRV3 Q9M5J1 [Other strain] |
| DNA ref. | GenBank: NC_008405.1 (15381051..15374817) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.2371 |
Protein sequence: OsDiOx01(LOC_Os12g26290)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 12, 10 introns) 3 mRNA and 226 ESTs (UniGene and TC from TGI): mix between Indica and japonica. 6 splicing variant from Phytozome. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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