Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
261 |
PWM (Da): |
28604.63 |
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PI (pH):
| 4.94 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASSAPCASLISSNPNILFSPKFPSSSFSSLSFPNSPNSLFKPLRTSLNPSSPPLRTFVARASSELPLVGNTAPDFEAEAVFDQEFIKVKLSDYIGKKYVILFFYPLDFTFVCPTEITAFSDRYAEFEALNTEILGVSVDSVFSHLAWVQTDRKSGGLGDLNYPLISDVTKSISKSYDVLIPDQGIALRGLFIIDKEGVIQHSTINNLAIGRSVDETKRTLQALQYVQENPDEVCPAGWKPGEKSMKPDPKLSKEYFSAI* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic and 1 EST. cultivar="Negro Jamapa 81" and "G19833". |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTCCTCAGCTCCCTGTGCTTCTCTCATATCCTCAAACCCTAACATTCTCTTCTCTCCCAAATTCCCTTCTTCTTCCTTTTCTTCCCTCTCCTTCCCCAATTCCCCCAACTCTCTT TTCAAACCTTTACGCACTTCTCTCAATCCTTCATCTCCCCCTCTCAGAACCTTCGTTGCCAGGGCTTCGGTAATTCTTTTCTCCTACCACTTACTCTCCTTTTCCCACTTAAATCTTACA TTGCGCTGCAACAATTTGCTCCTTTTTTATGTTTCTGCTGATTTTACTGTTACCTGCTTCTTTGCTTGCTTGCTTGTTGGCCTCTATTTTTTGTGCATTTTTCTCTCTTCCCATCAATGT GTGCTTTCATATCCAACTCTCTTGTTTCTAGTCCTCGCTGCTCTCGCTCACCTGCTAATTTTATGCACTTCTGTGACTGAACTGTGGAAATGAACTACGGCGGTGATTGTGAAAATTCTG TTTCTGTTTGCTGCATTTCTGAGCATATTACTTCAAGATGTGTTGCATGTCATCCAGTGTAGCACAGATTCATTGTAATTTGTAATTAGTCGAACAATGCTTTAAAATAATATGGTAATT CTACATTCTTCCTTCTTCAAGGTTGTAAGTTTTGTATTGGAATTTCTATTCGTGTGTGGGAGAATCTACTTCTGCAAAGCTTTACAGCTGTAACTTCCTTGATGAAGCTGAAAACTCAAT TTTTTTTATAGTGTACTATTTCTCTGGCCTGACCTTTGAAGCAATTTATTTATTCTTTTTTGTTTGCTTATTTTGAAAGAGTGAACTTCCATTAGTTGGGAACACAGCACCGGATTTTGA AGCAGAGGCCGTTTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTATTTACGATGGAATGCTGATTGGTAAATTTTGTGATTACAAATTATGTTGAATGAAACACTGTCTTGTCTTGTCTGTCAGGTCA AACTATCTGATTATATTGGGAAAAAATATGTTATCCTCTTTTTCTATCCACTGGACTTCACATTCGTTTGTCCGACAGGTTAGTAGACTTCTGATTGCGATTGCTGTGGATCCTAAATTT TCTCCTTTTTAACTGTTCATTACTTGTGTACAGAAATCACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAGTTTGAGGCACTAAATACAGAAATTTTGGGTGTTTCAGTTGACAGTGTTGTGAGTT GTTTTGATCCCTTTTTTAATTATTTCTTCAGATTCTAGCTCTTGTATAATTTTCCCCCCATACTTTTATTCTATGGCATTGTTTGATCCATATAACTGACAATACCAATTGAGGAAAAAG GCTTTGTTTGCTGTAATACTTTTATCGATTCTTGAAAAGACATGTTTTTTGCCTGTATACAAGCTGCTGAGAACATGAAAGGTGTTCGATGACTTTGCCCTCTAACTGCTTAGGTTAAGG TTTTAATGATTCATTTGAGAGGAAGAAGCTATGACCGAGAGTTCTGAGCATAATTGGCAAAACTGTATGAATTCTGCATTTTTTTCTCTTTCAAACTTAATGCAAAGAATTAGGATGTAT CGGACAGTATGGTCAGTGGAAATTACTATATAAATAATGGAAAGCCAAATATTGGACAATGAGTTCATTCCAACCTTAATAATTGAAATGTCTTTTTCTTGACCCACAGATGTAATGTTA TTCTCAATATTTGTGAAGGATGTGTGACATTGTGGAGTGGGACGCAGTATTCCCACTTGTTCCCAAGAAAACAGACAGATTTTTATGTTATGATCTATTACCGTTCCTATTTCTAAATGC ACAATTAACTTTTTATAGCCTTATCCGTAGGCCCTTCTTAAGTTTGCTTCTTCTTGATCAGTGGTGCTGTTGTTATCATTGTAGTTTTCACACCTTGCATGGGTTCAAACTGATAGAAAG TCGGGTGGTCTTGGCGACTTGAATTATCCATTGATTTCTGATGTCACCAAATCCATCTCAAAATCTTATGATGTTCTCATTCCCGATCAGGTATTTTTTTATAATGATATATTCATATTC CCCTGCTATCATCAGCCCCAATGTATTTTGTGCTTTAGTTTCAAATTCTCTGGAAAGAAATGTAGGATGCTGTCTAGGTTCATTGTTTAAATATTGTTTGTGAAACTATTGATTTTCATT AACTTTTTTAGCACCTTTCACAACAATTCTAAATGTTTCCAATGATTGGGGATTGCATTGAGAGGATTGTTCATTATTGACAAGGAAGGGGTTATTCAGCATTCTACCATTAACAACCTG GCCATTGGTAGAAGTGTTGATGAGACAAAGAGAACGCTCCAGGTAATTATACGAAAAATCAGGACAACACCAGGATTGACAATTTTTTTAGTATATGTTGAACTCTTTTTTTTTTTCTTT TTTTTTTTCTAGTCATCTGTCATTTATATAAATTCTTGGCATCCATTTATGTGCATTGGTTTCCAGGCCTTGCAGTATGTGCAGGAGAACCCAGATGAAGTTTGCCCAGCTGGGTGGAAG CCTGGTGAGAAGTCCATGAAACCAGACCCTAAACTTAGCAAAGAGTACTTCTCTGCTATTTAG |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTCCTCAGCTCCCTGTGCTTCTCTCATATCCTCAAACCCTAACATTCTCTTCTCTCCCAAATTCCCTTCTTCTTCCTTTTCTTCCCTCTCCTTCCCCAATTCCCCCAACTCTCTT TTCAAACCTTTACGCACTTCTCTCAATCCTTCATCTCCCCCTCTCAGAACCTTCGTTGCCAGGGCTTCGAGTGAACTTCCATTAGTTGGGAACACAGCACCGGATTTTGAAGCAGAGGCC GTTTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTCAAACTATCTGATTATATTGGGAAAAAATATGTTATCCTCTTTTTCTATCCACTGGACTTCACATTCGTTTGTCCGACAGAAATCACTGCCTTC AGTGACCGGTATGCAGAGTTTGAGGCACTAAATACAGAAATTTTGGGTGTTTCAGTTGACAGTGTTTTTTCACACCTTGCATGGGTTCAAACTGATAGAAAGTCGGGTGGTCTTGGCGAC TTGAATTATCCATTGATTTCTGATGTCACCAAATCCATCTCAAAATCTTATGATGTTCTCATTCCCGATCAGGGGATTGCATTGAGAGGATTGTTCATTATTGACAAGGAAGGGGTTATT CAGCATTCTACCATTAACAACCTGGCCATTGGTAGAAGTGTTGATGAGACAAAGAGAACGCTCCAGGCCTTGCAGTATGTGCAGGAGAACCCAGATGAAGTTTGCCCAGCTGGGTGGAAG CCTGGTGAGAAGTCCATGAAACCAGACCCTAAACTTAGCAAAGAGTACTTCTCTGCTATTTAG |
Retrieve as FASTA
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