Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
260 |
PWM (Da): |
28604.63 |
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PI (pH):
| 4.94 |
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Sequence 302
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Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASSAPCASLISSNPNILFSPKFPSSSFSSLSFPNSPNSLFKPLRTSLNPSSPPLRTFVARASSELPLVGNTAPDFEAEAVFDQEFIKVKLSDYIGKKYVILFFYPLDFTFVCPTEITAFSDRYAEFEALNTEILGVSVDSVFSHLAWVQTDRKSGGLGDLNYPLISDVTKSISKSYDVLIPDQGIALRGLFIIDKEGVIQHSTINNLAIGRSVDETKRTLQALQYVQENPDEVCPAGWKPGEKSMKPDPKLSKEYFSAI* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic and 1 EST. cultivar="Negro Jamapa 81" and "G19833". |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TGGCTTCCTCAGCTCCCTGTGCTTCTCTCATATCCTCAAACCCTAACATTCTCTTCTCTCCCAAATTCCCTTCTTCTTCCTTTTCTTCCCTCTCCTTCCCCAATTCCCCCAACTCTCTTT TCAAACCTTTACGCACTTCTCTCAATCCTTCATCTCCCCCTCTCAGAACCTTCGTTGCCAGGGCTTCGGTAATTCTTTTCTCCTACCACTTACTCTCCTTTTCCCACTTAAATCTTACAT TGCGCTGCAACAATTTGCTCCTTTTTTATGTTTCTGCTGATTTTACTGTTACCTGCTTCTTTGCTTGCTTGCTTGTTGGCCTCTATTTTTTGTGCATTTTTCTCTCTTCCCATCAATGTG TGCTTTCATATCCAACTCTCTTGTTTCTAGTCCTCGCTGCTCTCGCTCACCTGCTAATTTTATGCACTTCTGTGACTGAACTGTGGAAATGAACTACGGCGGTGATTGTGAAAATTCTGT TTCTGTTTGCTGCATTTCTGAGCATATTACTTCAAGATGTGTTGCATGTCATCCAGTGTAGCACAGATTCATTGTAATTTGTAATTAGTCGAACAATGCTTTAAAATAATATGGTAATTC TACATTCTTCCTTCTTCAAGGTTGTAAGTTTTGTATTGGAATTTCTATTCGTGTGTGGGAGAATCTACTTCTGCAAAGCTTTACAGCTGTAACTTCCTTGATGAAGCTGAAAACTCAATT TTTTTTATAGTGTACTATTTCTCTGGCCTGACCTTTGAAGCAATTTATTTATTCTTTTTTGTTTGCTTATTTTGAAAGAGTGAACTTCCATTAGTTGGGAACACAGCACCGGATTTTGAA GCAGAGGCCGTTTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTATTTACGATGGAATGCTGATTGGTAAATTTTGTGATTACAAATTATGTTGAATGAAACACTGTCTTGTCTTGTCTGTCAGGTCAA ACTATCTGATTATATTGGGAAAAAATATGTTATCCTCTTTTTCTATCCACTGGACTTCACATTCGTTTGTCCGACAGGTTAGTAGACTTCTGATTGCGATTGCTGTGGATCCTAAATTTT CTCCTTTTTAACTGTTCATTACTTGTGTACAGAAATCACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAGTTTGAGGCACTAAATACAGAAATTTTGGGTGTTTCAGTTGACAGTGTTGTGAGTTG TTTTGATCCCTTTTTTAATTATTTCTTCAGATTCTAGCTCTTGTATAATTTTCCCCCCATACTTTTATTCTATGGCATTGTTTGATCCATATAACTGACAATACCAATTGAGGAAAAAGG CTTTGTTTGCTGTAATACTTTTATCGATTCTTGAAAAGACATGTTTTTTGCCTGTATACAAGCTGCTGAGAACATGAAAGGTGTTCGATGACTTTGCCCTCTAACTGCTTAGGTTAAGGT TTTAATGATTCATTTGAGAGGAAGAAGCTATGACCGAGAGTTCTGAGCATAATTGGCAAAACTGTATGAATTCTGCATTTTTTTCTCTTTCAAACTTAATGCAAAGAATTAGGATGTATC GGACAGTATGGTCAGTGGAAATTACTATATAAATAATGGAAAGCCAAATATTGGACAATGAGTTCATTCCAACCTTAATAATTGAAATGTCTTTTTCTTGACCCACAGATGTAATGTTAT TCTCAATATTTGTGAAGGATGTGTGACATTGTGGAGTGGGACGCAGTATTCCCACTTGTTCCCAAGAAAACAGACAGATTTTTATGTTATGATCTATTACCGTTCCTATTTCTAAATGCA CAATTAACTTTTTATAGCCTTATCCGTAGGCCCTTCTTAAGTTTGCTTCTTCTTGATCAGTGGTGCTGTTGTTATCATTGTAGTTTTCACACCTTGCATGGGTTCAAACTGATAGAAAGT CGGGTGGTCTTGGCGACTTGAATTATCCATTGATTTCTGATGTCACCAAATCCATCTCAAAATCTTATGATGTTCTCATTCCCGATCAGGTATTTTTTTATAATGATATATTCATATTCC CCTGCTATCATCAGCCCCAATGTATTTTGTGCTTTAGTTTCAAATTCTCTGGAAAGAAATGTAGGATGCTGTCTAGGTTCATTGTTTAAATATTGTTTGTGAAACTATTGATTTTCATTA ACTTTTTTAGCACCTTTCACAACAATTCTAAATGTTTCCAATGATTGGGGATTGCATTGAGAGGATTGTTCATTATTGACAAGGAAGGGGTTATTCAGCATTCTACCATTAACAACCTGG CCATTGGTAGAAGTGTTGATGAGACAAAGAGAACGCTCCAGGTAATTATACGAAAAATCAGGACAACACCAGGATTGACAATTTTTTTAGTATATGTTGAACTCTTTTTTTTTTTCTTTT TTTTTTTCTAGTCATCTGTCATTTATATAAATTCTTGGCATCCATTTATGTGCATTGGTTTCCAGGCCTTGCAGTATGTGCAGGAGAACCCAGATGAAGTTTGCCCAGCTGGGTGGAAGC CTGGTGAGAAGTCCATGAAACCAGACCCTAAACTTAGCAAAGAGTACTTCTCTGCTATTTAG |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TGGCTTCCTCAGCTCCCTGTGCTTCTCTCATATCCTCAAACCCTAACATTCTCTTCTCTCCCAAATTCCCTTCTTCTTCCTTTTCTTCCCTCTCCTTCCCCAATTCCCCCAACTCTCTTT TCAAACCTTTACGCACTTCTCTCAATCCTTCATCTCCCCCTCTCAGAACCTTCGTTGCCAGGGCTTCGAGTGAACTTCCATTAGTTGGGAACACAGCACCGGATTTTGAAGCAGAGGCCG TTTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTCAAACTATCTGATTATATTGGGAAAAAATATGTTATCCTCTTTTTCTATCCACTGGACTTCACATTCGTTTGTCCGACAGAAATCACTGCCTTCA GTGACCGGTATGCAGAGTTTGAGGCACTAAATACAGAAATTTTGGGTGTTTCAGTTGACAGTGTTTTTTCACACCTTGCATGGGTTCAAACTGATAGAAAGTCGGGTGGTCTTGGCGACT TGAATTATCCATTGATTTCTGATGTCACCAAATCCATCTCAAAATCTTATGATGTTCTCATTCCCGATCAGGGGATTGCATTGAGAGGATTGTTCATTATTGACAAGGAAGGGGTTATTC AGCATTCTACCATTAACAACCTGGCCATTGGTAGAAGTGTTGATGAGACAAAGAGAACGCTCCAGGCCTTGCAGTATGTGCAGGAGAACCCAGATGAAGTTTGCCCAGCTGGGTGGAAGC CTGGTGAGAAGTCCATGAAACCAGACCCTAAACTTAGCAAAGAGTACTTCTCTGCTATTTAG |
Retrieve as FASTA
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