Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
324 |
PWM (Da): |
35830.26 |
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PI (pH):
| 9.32 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
METPKFAFLSLLLLLTSATISSAQLSSGFYKNTCPNVEQLVRSAVAQKFQQTFVTAPATLRLFFHDCFVRGCDASILLANGRPEKDHPDQISLAGDGFDTVIKAKAAVDRDPKCRNKVSCADILALATRDVVNLAGGPFYNVELGRRDGRISTIASVQRHLPHPEFNLDQLNSMFNFNGLSQTDMIALSGAHTIGFSHCNKFSNRIYNFSPRNRIDPTLNLQYAFQLRQMCPLRVDPRIAINMDPVTPQKFDNQYFKNLQQGKGLFTSDQVLFTDARSKATVNLFASNEGAFQKAFVDAVTKLGRVGVKTGNQGEIRFDCTRPN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (3 introns) and 8 ESTs. Roots of 'Supernod' plants, roots of bulked plants, floral meristematic mRNA, root hairs. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGAAACTCCTAAATTTGCATTCTTGTCTTTGCTTCTTCTCCTTACTAGTGCTACTATAAGTTCAGCTCAACTAAGTAGTGGCTTCTACAAGAACACATGCCCCAATGTGGAGCAGTTG GTTCGCTCTGCTGTTGCACAGAAGTTCCAACAGACCTTTGTGACTGCTCCTGCCACTCTTAGACTCTTCTTCCATGATTGCTTTGTGAGGGTGTGTATATTCCTTCTTCATCACTTTCAT GGTTTTCTTACGTACATAACTTAGCATGGTTTGAGTTCACATATATTTCTTTATCATTATTTTGTTAATTAAAACGAAAATTTATGTGTGCTTAATTTTGCATTCAGGAACCTTCACAAA ACTATATAGGTTCTATATACAATTATTATCTATTAGTCTATATTTTCAGCTTAAAAACATTTTTTTAGTGAAGTCAGACTATATATAATTAGTCAATATTATTAGCTCTGAGCCCATCCT AGTGGTCATTGTTGGGTTTATTGGCCACTTGTTATCCAACCACATACAAATATCCAATCATGTAAAATTCATATCCCATGATGCTTAATTCTCAACATAAGGATTGTGTGTTGAAGATCT CATAATATTAGTGGCCAAAACAATATATATAAATAGAACATAATTATAATCTTATGAGCTAGTTTTTTAGTTAAACTCAAAGTATAAGAACTCTAATGAAATTTTAGCATGTTTATCATT TAGACTATAGAGTAAACAGTAGGTTTTTAAAATGACTGATGACTTTTTTTATTTTATTGTTGATTATTTTGTATGTAAGGTGATAACAAATTTGTTTGCGCAACAGGGTTGTGATGCTTC GATTTTGCTTGCAAATGGTAGGCCAGAGAAGGATCATCCTGATCAAATTTCTCTAGCTGGTGATGGTTTTGACACAGTGATTAAAGCCAAGGCAGCTGTTGATAGAGACCCTAAGTGCCG TAACAAAGTCTCTTGTGCTGACATACTCGCTCTGGCTACTAGGGATGTCGTAAATTTGGTATTATTTCATTTTCTTTGAAATTTTATTTGCTTCGTTAAGTTATTGACCATAATGACCAG CAATTCATTAGTTTACCTCTAAATCGTTTGATCGATGCCCATTAAGAATTATACTGTTTGACGACATTGCATTCCCAATAGTAATAATAAGTGCATATCATTAATAGGCTGGTGGACCAT TTTATAATGTTGAATTGGGAAGGCGTGACGGGAGAATATCTACTATTGCCAGTGTTCAACGCCATCTTCCTCACCCTGAATTCAATTTGGATCAGCTCAATTCCATGTTTAACTTTAATG GCCTATCCCAGACAGATATGATTGCATTATCAGGTAATTTCACCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTTCTATTTTATTCAATCATACTTACTTTTATAACTTTAAACCAAACATGTATT AAATTATAGTAGGATAAAGAATGTTAGGTAGTTTAATTTAACTTTTTTATATAACAAAGCCTGAAGAAGAATAATGTGTTTTAATATGCTAGGTGCGCATACAATTGGGTTCTCTCACTG CAACAAATTCTCGAATCGAATCTACAACTTCAGCCCCAGAAACAGAATTGACCCAACACTGAATTTACAATATGCTTTTCAACTTAGGCAAATGTGCCCCTTAAGGGTTGATCCTAGAAT AGCCATAAACATGGACCCTGTCACGCCTCAAAAGTTTGACAACCAATACTTCAAGAATCTGCAGCAAGGTAAGGGTCTCTTCACTTCTGATCAGGTGCTGTTTACAGATGCAAGGTCAAA GGCCACAGTCAACTTATTTGCATCAAATGAAGGAGCTTTTCAGAAAGCTTTTGTTGATGCTGTTACTAAGTTGGGAAGGGTTGGTGTTAAAACTGGAAATCAAGGTGAAATTAGGTTTGA TTGCACCAGGCCCAACTAG |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGAAACTCCTAAATTTGCATTCTTGTCTTTGCTTCTTCTCCTTACTAGTGCTACTATAAGTTCAGCTCAACTAAGTAGTGGCTTCTACAAGAACACATGCCCCAATGTGGAGCAGTTG GTTCGCTCTGCTGTTGCACAGAAGTTCCAACAGACCTTTGTGACTGCTCCTGCCACTCTTAGACTCTTCTTCCATGATTGCTTTGTGAGGGGTTGTGATGCTTCGATTTTGCTTGCAAAT GGTAGGCCAGAGAAGGATCATCCTGATCAAATTTCTCTAGCTGGTGATGGTTTTGACACAGTGATTAAAGCCAAGGCAGCTGTTGATAGAGACCCTAAGTGCCGTAACAAAGTCTCTTGT GCTGACATACTCGCTCTGGCTACTAGGGATGTCGTAAATTTGGCTGGTGGACCATTTTATAATGTTGAATTGGGAAGGCGTGACGGGAGAATATCTACTATTGCCAGTGTTCAACGCCAT CTTCCTCACCCTGAATTCAATTTGGATCAGCTCAATTCCATGTTTAACTTTAATGGCCTATCCCAGACAGATATGATTGCATTATCAGGTGCGCATACAATTGGGTTCTCTCACTGCAAC AAATTCTCGAATCGAATCTACAACTTCAGCCCCAGAAACAGAATTGACCCAACACTGAATTTACAATATGCTTTTCAACTTAGGCAAATGTGCCCCTTAAGGGTTGATCCTAGAATAGCC ATAAACATGGACCCTGTCACGCCTCAAAAGTTTGACAACCAATACTTCAAGAATCTGCAGCAAGGTAAGGGTCTCTTCACTTCTGATCAGGTGCTGTTTACAGATGCAAGGTCAAAGGCC ACAGTCAACTTATTTGCATCAAATGAAGGAGCTTTTCAGAAAGCTTTTGTTGATGCTGTTACTAAGTTGGGAAGGGTTGGTGTTAAAACTGGAAATCAAGGTGAAATTAGGTTTGATTGC ACCAGGCCCAACTAG |
Retrieve as FASTA
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