Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
314 (295) |
PWM (Da): |
34004.07 (31932.0) |
Transmb domain: |
o258-280i |
PI (pH): |
7.67 (7.68) |
Peptide Signal: |
cut: 20 range:20-314 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASYYFLLLVLVGATTASGAELCADFYSCTCPNLLPIVKKGVAKAIQKEPRMGASLLRLHFHDCFVNGCDASILLDDTSNFIGEQTAAANNQSARGFNVINDIKASVEKECPRVVSCADI LALSARDSVVYLGGPSWEVGLGRRDSTTASRSDANNSIPGPFLSLTALINNFANQGLSVTDLVALSGAHTIGLAECKNFRAHIYNDSNVDPSYRKFLQSKCPRSGNDKTLEPLDHQTPIH FDNLYFQNLVSKKALLHSDQELFNGSSTDNLVRKYATNAAAFFEDFAKGMLKMSNIKPLTGSQGQIRINCGKVN* |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic and 14 ESTs. |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTCTTACTACTTCCTCTTGCTTGTTCTCGTCGGTGCAACTACAGCTTCTGGGGCTGAACTATGTGCAGACTTTTACTCATGCACCTGCCCAAACTTGTTGCCTATAGTGAAGAAA GGAGTGGCCAAAGCCATTCAGAAAGAACCACGCATGGGCGCTTCCTTACTCCGATTGCATTTCCATGACTGCTTTGTAAACACGTGAGTATATAATTAATAATGTAGTTGAATTAATATG ACATACATTTTATGTTTACATCATGTAACCTTTTTTGTATAGGTTGCAAGTTGCGAGAAACTATTACATTGTCTGGCTCATTATGATCCAAATAATCTTCACATGACACGTAATTAAGTG TTAAGTGTTATTAGTTTTTTTAAAATTAAACAAAAAATTGAATGCATGTCACCTAGAAATTGATTGAAACTATAAACATGTAGTGGTCTGAAACTATCTAATAAATTCCTCCAAGTTGCT TTCCTAAGATAGTGATATTTCAGGGTTGTGATGCATCTATACTGTTGGATGATACAAGCAACTTCATTGGGGAGCAAACAGCAGCAGCTAACAACCAATCAGCTAGAGGGTTCAACGTGA TTAATGATATTAAGGCCAGTGTGGAGAAAGAATGCCCCAGAGTAGTGTCATGTGCTGATATTCTTGCTTTGTCAGCTAGAGATTCTGTAGTTTATATGTAATAATACTATACTAATATTC TGAGATTCTATTTCTATCCCAGTCAAAGTTATCAATTATTATGGCCCTTGAATTAATAGCACTTACTATATATCTTTTTGTGTAAAACATTTTCAGTTAGGAGGACCTTCTTGGGAAGTG GGGTTGGGGAGAAGAGATTCTACTACAGCAAGCAGAAGTGATGCTAATAATAGCATTCCTGGGCCTTTCCTCAGTCTAACTGCTCTGATAAACAATTTTGCTAATCAAGGCCTCTCAGTT ACAGATTTGGTGGCTCTTTCAGAGGTGCTATAACAATTTATGAGATGTCTTGAATCAGTTAAAACAAATGCTTTCCAAAAAGAGAAGACTTCCACAAAAATAAGTTAAAATAAATGTTTT TTAACACGTTTGGCTTCCAAATTAAAGTTGTGATTTTATATGTGTAGTGATTGTGATCAATGGCGGATTGAGGGGATCTAGGTTCATTTGAGGGAGTGCACTTGCACCTCCTCATTTTTT AAAATTTATCAAATTTGTAAATAAATTTTTATATTTTTGTATTTTATTTTATCTATATTTATATAATTGAACCTTCTAATTTTATTTTTTATAATTTGTAGCCACTAACTTAAGGTCTTG GATTCACCACTTATTACGATGACATGTGCAGTTTGTTGCATTAGTAATTTAATTATTTGACTAAATAATCCCTATTAAATAGAATTTGCCAGAGATGAACTCATAATAAAAAAATTGAGG AAATTGTTCTTTCTTTTCATTTTAACTAAATGAATAGAAGTGATATTAAAAAAATTAATAAATGCAATGACAAAAAAATGATAAATATTATTCGTCAATTTTTCAATTATTAAAAATAAG GTGGCTGAAATTAAATAAAAATTGATAAATAGTCCGTTTCATTGAGCTTAAAGAAAGTAAATTTGTGATTCGGCCTTTCCAGAGCTTTTTCCATAAACTAATTCTTTTCACTTTTAAGAA AAATACTAAAATATTTTTTACTTTTCATTTTTAAAAAATTAAAACTTACATAATTATTATAATTTTTTTGAACATATCTATAATTAAAAACTCACTTTTCACTTTTAATTATTTTATTTC ATGCAATCCAACAAAAACTCATTGTTTACTCATCTGCTTTCCATTGAGGTATGAAATTTGAACCGATTAATTATTTATTACTTTTCTTATTATTCCGTTTAGTTTACTTCTTAAATAATG TGATAAAAATTTCTTCCTAAACATAAAATATAAATAATCAAGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAAATATCCCA TCGTATTGATCTAGGTGTCTTTATTTGTTTCTACAAGTCAACGGATTCTAGTACTCTTAAGTCTTGGTTGTTGAGTGAGTAACAAAACAATCCTTTTATCAAGGGAATCTAACTAGATGA TTGAGTGAGTTATTGGAGACTATTACCTGTAAAAAAAATAAAATCTTTTCGCGGTTATTGTCATGATTAAGAGTGGTGTCCTATTCCTATCTATCTATTATCTAAAACCATCACTCGTCA GTTTGAGTTTTGCTCAACCTATATATTGCCAAAAGAAATTACCACTTTGTTGTTCAAAAGTTGTGCTAGGAAAAATATTTTAGTGAATTTGGTCATTTCATTTTTTTCTGGAGAATAAAT AATAATACCTTCCATTTCCTGCACTGAATTGTGTTTTCCTCTGCCTTTGTAAAAAAACTGTCGTACTAAAGAAATAAGAGGATCCTAATTGAATTTTGGCTTCCCATATTCACAAAGTGC TTCAACTACCTAACAGCATCTTTTCAATAACAGGGGCACATACAATTGGCCTGGCTGAATGCAAAAATTTCCGAGCACACATCTACAATGATTCCAACGTTGATCCCTCTTACCGAAAGT TCCTGCAGAGCAAGTGCCCCAGAAGTGGAAATGATAAAACACTCGAACCCCTTGACCACCAAACTCCAATCCATTTTGATAATCTATACTTTCAGAATTTGGTGAGTAAGAAGGCCCTTC TCCATTCCGATCAGGAGCTGTTCAATGGCAGTTCTACTGACAATCTGGTAAGAAAATATGCTACCAATGCTGCTGCATTCTTTGAAGACTTTGCCAAGGGCATGCTCAAAATGAGCAACA TCAAGCCTCTTACAGGAAGCCAGGGCCAGATCAGAATCAATTGTGGGAAAGTCAATTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTTCTTACTACTTCCTCTTGCTTGTTCTCGTCGGTGCAACTACAGCTTCTGGGGCTGAACTATGTGCAGACTTTTACTCATGCACCTGCCCAAACTTGTTGCCTATAGTGAAGAAA GGAGTGGCCAAAGCCATTCAGAAAGAACCACGCATGGGCGCTTCCTTACTCCGATTGCATTTCCATGACTGCTTTGTAAACGGTTGTGATGCATCTATACTGTTGGATGATACAAGCAAC TTCATTGGGGAGCAAACAGCAGCAGCTAACAACCAATCAGCTAGAGGGTTCAACGTGATTAATGATATTAAGGCCAGTGTGGAGAAAGAATGCCCCAGAGTAGTGTCATGTGCTGATATT CTTGCTTTGTCAGCTAGAGATTCTGTAGTTTATTTAGGAGGACCTTCTTGGGAAGTGGGGTTGGGGAGAAGAGATTCTACTACAGCAAGCAGAAGTGATGCTAATAATAGCATTCCTGGG CCTTTCCTCAGTCTAACTGCTCTGATAAACAATTTTGCTAATCAAGGCCTCTCAGTTACAGATTTGGTGGCTCTTTCAGGGGCACATACAATTGGCCTGGCTGAATGCAAAAATTTCCGA GCACACATCTACAATGATTCCAACGTTGATCCCTCTTACCGAAAGTTCCTGCAGAGCAAGTGCCCCAGAAGTGGAAATGATAAAACACTCGAACCCCTTGACCACCAAACTCCAATCCAT TTTGATAATCTATACTTTCAGAATTTGGTGAGTAAGAAGGCCCTTCTCCATTCCGATCAGGAGCTGTTCAATGGCAGTTCTACTGACAATCTGGTAAGAAAATATGCTACCAATGCTGCT GCATTCTTTGAAGACTTTGCCAAGGGCATGCTCAAAATGAGCAACATCAAGCCTCTTACAGGAAGCCAGGGCCAGATCAGAATCAATTGTGGGAAAGTCAATTAA |
Retrieve as FASTA
|
|