Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
350 (306) |
PWM (Da): |
37454.56 (32898.3) |
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PI (pH): |
4.25 (4.65) |
Peptide Signal: |
cut: 25 range:25-330 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MSSLRLALCCVVVVLGALPHFSYAQLDPSFYDSTCSNVTSIVREVLSNVSQSDPRILASLIRLHFHDCFVQGCDASILLNDTDTIVSEQSAVPNNNSIRGLDVVNQIKTAVENACPGIVS CADILALAAQISSDLANGPVWQVPLGRRDSLTANQTLANQNLPAPTFTIDQLIESFGNQSLNITDLVALSGAHTIGRAQCRFFVDRLYNFSNTGNPDPTLNTTLLQSLQGICPNGGPGTN LTNLDLTTPDTFDSNYYSNLQLQNGLLQSDQELLSANNTDIVAIVNNFISNQTLFFENFKASMIKMGNIGVLTGSQGEIRSQCNSVNGNSSGLTTTATKESSQDSMVSSL* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (3 introns) and 4 ESTs. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGTTCCCTTCGTCTGGCTTTATGCTGTGTGGTGGTAGTGCTTGGAGCACTACCACACTTCTCATATGCACAGCTAGATCCTTCATTTTACGATAGCACATGTTCAAATGTGACTTCA ATCGTACGTGAGGTGCTCTCAAATGTCTCCCAGTCTGATCCCCGCATACTTGCAAGTCTCATCAGGCTCCATTTTCACGACTGTTTTGTTCAGAGGTAACTATATATAATTACTCTTCTT CATATCTTAATTAACTCCATTCATAGTTAATTTCTTGCCACATGCAGCTAATTAGTTAACTCTTATCACGTCTTTTGATTTTAGAGTAGTAAATCCTTCCCTACTTCTATTACCCCGAGC AAAACTCGTTTATCAAATTAGTAATATTTTTTCTTTTATATTAGATGGCTAAAATGCAAGGGTTCATGAAAACATTTCTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGTTTGATTTA TCAAATTTTCAAAAGCTGTTTTCATTGAGAAGTAATTTAAATGAATATCTTTTATTGATCTTTTATACAAAATACATTGATACATCATAATACATAGAAGTGGTTGTACAATAGATTGGA TTTTAGTGTGCGTCTCCCCTATGAGTAACGACTATTTGAAATATAAATTCAAAATAACATCAAGTAATAAATAATTTTAAAATACTTATTTTAGAAATAATTTATAACACTTAATAGATT TTCATAATTTCTGAGAACGGAATCAATCATGCACCTGGTCTCCTCCATCAATTTTAGTGAAATCTTTTTCCACTCCAAGTTATGAACTGGGGCCTCTGGCTCAACCACTCCTTATAATGT TAAGTGTAAAAGCAAACGTGGTTTGAAATGTCAAGGTTTCCTTATCTTGGGCACTGATAAAAGAGTACGTTGAATAAAAGAAAAGGAAAAATAAAGTGCACGTTGCTTTTTAATGTAACT CAATTATTTTGTTGCTGAGAGAATTGAATTAATTATACATGGATGGATATGACAGGGGTGTGACGCATCAATTCTGCTGAACGACACGGACACGATCGTGAGCGAGCAAAGTGCAGTGCC AAACAACAACTCAATAAGAGGTTTGGATGTTGTGAACCAGATCAAGACTGCAGTGGAAAATGCTTGTCCCGGCATAGTTTCTTGTGCTGATATTCTTGCTCTTGCAGCTCAAATATCTTC TGATCTGTGGTATAAATAAATATATATATATATATGAAGAATTGATTAAAACAAATCATCGTCAAGAATATAAAAAAATAAAAAATAAATAAAAACTTCGTGGAATTTTAATCTTAATTG AAACCATAACTTCTCAACAATTTTTGTTCACCTTTTGAATTCTATTTTGTCCAACTTATAGAGTTTTAGTATTTTTTGATGCATTTATATATAGAGTTTTAGTATAACTATATATTTGGC AGGCTAATGGTCCTGTTTGGCAAGTTCCATTGGGAAGAAGGGATAGTTTGACAGCAAATCAAACCCTTGCTAACCAAAATCTTCCGGCTCCTACTTTTACCATTGATCAACTTATCGAAT CATTTGGTAATCAAAGCCTCAACATTACTGATCTAGTTGCACTTTCAGAGGTATGAAAGCTTTTACATTTAATAAATAAAATGTTTTATAATTTGTATTTACGAGTGTATAGTATTTTTT GGATTTTTATGAAATCAGTGAGAATTTATTGATTATCTTTAATAGGATATTTTCTCTTAATCACTATAAGACTTGAGCTAGTTAGGGATCCAAACTTAGTTTGACTAGAACCAAGGACAT AATATTAAATATATCTTCTTATATGCTTTATATTGTTTAAATAAAAAAAAAACTAAATGACGATGAGTTTTTTTTGTGTGATCATATTGCTACTCTTATAATAATACTTAAACTAATTCT AATTTAGATAACTTGGATGAAAATTAATTAAACAACAGTAGCAATGTTTATAATCAAATGACAATGAATGCTCTCTTTTGATATAAATACATTCTTTTTTTATAAAAAAAATTATCGTTA TACATCTTTAGTATCATGTGTACCCATTAGAAAACCCTTTAATTGCATTACTTATTGAAATTTTTCTTTTTTTAGGTGCTCATACAATTGGTAGAGCTCAATGCAGATTTTTTGTTGATC GATTATACAATTTCAGCAACACTGGCAACCCAGATCCTACTCTAAACACAACTCTCTTACAATCATTGCAAGGAATATGTCCAAATGGTGGACCTGGCACTAATCTCACCAATTTGGACT TAACCACTCCAGACACATTCGACTCCAACTATTACTCCAATCTTCAACTTCAAAATGGCTTGCTTCAGAGTGATCAAGAGTTGCTTAGTGCAAATAATACGGATATCGTTGCCATTGTCA ACAATTTCATTAGTAACCAAACTCTTTTCTTTGAAAACTTTAAGGCGTCAATGATAAAAATGGGCAACATTGGAGTGCTAACGGGATCACAAGGAGAAATCCGATCGCAATGTAATTCTG TGAATGGAAATTCTTCCGGACTTACTACTACTGCCACCAAAGAATCATCACAAGATAGCATGGTTAGCTCATTGTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGTTCCCTTCGTCTGGCTTTATGCTGTGTGGTGGTAGTGCTTGGAGCACTACCACACTTCTCATATGCACAGCTAGATCCTTCATTTTACGATAGCACATGTTCAAATGTGACTTCA ATCGTACGTGAGGTGCTCTCAAATGTCTCCCAGTCTGATCCCCGCATACTTGCAAGTCTCATCAGGCTCCATTTTCACGACTGTTTTGTTCAGGGGTGTGACGCATCAATTCTGCTGAAC GACACGGACACGATCGTGAGCGAGCAAAGTGCAGTGCCAAACAACAACTCAATAAGAGGTTTGGATGTTGTGAACCAGATCAAGACTGCAGTGGAAAATGCTTGTCCCGGCATAGTTTCT TGTGCTGATATTCTTGCTCTTGCAGCTCAAATATCTTCTGATCTGGCTAATGGTCCTGTTTGGCAAGTTCCATTGGGAAGAAGGGATAGTTTGACAGCAAATCAAACCCTTGCTAACCAA AATCTTCCGGCTCCTACTTTTACCATTGATCAACTTATCGAATCATTTGGTAATCAAAGCCTCAACATTACTGATCTAGTTGCACTTTCAGGTGCTCATACAATTGGTAGAGCTCAATGC AGATTTTTTGTTGATCGATTATACAATTTCAGCAACACTGGCAACCCAGATCCTACTCTAAACACAACTCTCTTACAATCATTGCAAGGAATATGTCCAAATGGTGGACCTGGCACTAAT CTCACCAATTTGGACTTAACCACTCCAGACACATTCGACTCCAACTATTACTCCAATCTTCAACTTCAAAATGGCTTGCTTCAGAGTGATCAAGAGTTGCTTAGTGCAAATAATACGGAT ATCGTTGCCATTGTCAACAATTTCATTAGTAACCAAACTCTTTTCTTTGAAAACTTTAAGGCGTCAATGATAAAAATGGGCAACATTGGAGTGCTAACGGGATCACAAGGAGAAATCCGA TCGCAATGTAATTCTGTGAATGGAAATTCTTCCGGACTTACTACTACTGCCACCAAAGAATCATCACAAGATAGCATGGTTAGCTCATTGTAA |
Retrieve as FASTA
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