Entry information : Tn1CysPrx (PrxVI)
| Entry ID | 4953 |
|---|---|
| Creation | 2007-03-11 (Nicolas Rouhier) |
| Last sequence changes | 2016-06-28 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2016-06-28 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: Tn1CysPrx (PrxVI)
| Name (synonym) | Tn1CysPrx (PrxVI) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | 1-Cysteine peroxiredoxin [Orthogroup: 1CysPrx001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Tetraodontidae Tetraodon | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Tetraodon nigroviridis [TaxId: 99883 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4953' 'join(1..92,467..623,696..851,944..1090,1173..1301)' |
Exons►
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Literature and cross-references Tn1CysPrx (PrxVI)
| Literature | Jaillon O., A et al. Genome duplication in the teleost fish Tetraodon nigroviridis reveals the early vertebrate proto-karyotype. Nature 431:946-957(2004). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q4SP21 [Incorrect splicing] |
| DNA ref. | GenBank: CAAE01014542 (485072..483772) |
| mRNA ref. | GenBank: CAF97611 [Incorrect splicing] |
Protein sequence: Tn1CysPrx (PrxVI)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 15, 3 introns). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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