Entry information : NtPrx11-1A(Nitab4.5_0012071g0010 / tpoxC1)
Entry ID 51
Creation 2006-06-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-06-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx11-1A(Nitab4.5_0012071g0010 / tpoxC1)
Name NtPrx11-1A(Nitab4.5_0012071g0010 / tpoxC1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Tobacco mosaic virus infection
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx11-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx11-1B 626 0 1..321 1..321
NtPrx78-1A 581 0 1..321 1..319
CanPrx18 580 0 1..321 1..324
NtPrx78-2B 576 0 1..321 1..319
Literature and cross-references NtPrx11-1A(Nitab4.5_0012071g0010 / tpoxC1)
Literature Hiraga,S., Ito,H., Matsui,H., Honma,M. and Ohashi,Y. cDNA sequences for two novel tobacco peroxidase isoenzymes. Plant Physiol. 120, 1205 (1999)
Protein ref. UniProtKB:   Q9XIV9
mRNA ref. GenBank:   AB027752
EST ref. GenBank:   AM827125.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx11-1A(Nitab4.5_0012071g0010 / tpoxC1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (297)
PWM (Da):   %s   34234.33 (31792.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.69 (9.52) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-321
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLKINAIV LFILVSLLIG SSSAQLSTGF YSKSCPKLYQ TVKSAVQSAI NKETRMGASL LRLFFHDCFV NGCDGSLLLD DTSSFTGEKR AAPNVNSARG FEVIDNIKSA VEKVCPGVVS  CADILAVTAR DSVVILGGPN WNVKLGRRDS RTASQSAANS GIPPATSNLN RLISSFSAVG LSTKDMVALS GAHTIGQARC TSFRARIYNE TNNLDASFAR TRQSNCPRSS GSGDNNLAPL 
DLQTPNKFDN NYFKNLVDKK GLLHSDQQLF NGGSADSIVT SYSNNPSSFS SDFVTAMIKM GDIRPLTGSN GEIRKNCRRL N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Cultivar="Samsun NN". Uncorrect prediction from SGN (splicing error introns 1 and 3)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT TAAAGATTAA TGCTATAGTT TTGTTTATTT TAGTGAGTTT ACTAATTGGA AGCTCATCAG CTCAACTATC AACTGGTTTT TACTCAAAAT CTTGTCCTAA ACTTTATCAA  ACTGTGAAAT CAGCAGTGCA ATCTGCTATT AACAAGGAAA CAAGAATGGG TGCTTCTCTT CTTCGTCTAT TCTTCCATGA TTGCTTCGTC AATGTAATTT ACCATCTTCA TTTCCTCTTT  TATTTTTCCT TTTTTCCTTT TTTATAATTA TTACTCCCTC GGTTTCATTT TATATGACAC AATTACTATT TAAGGAGTCA AAGAAGGTGC CTTTTGACCA CGTTTTATGT AAATACTTCT  CAAATATTTT AAATTGTTAG GTATTTTAAC TGAAGGGCAA CCTTGACGTA ACTAGTAAAG TTGTTGCCAT GTGACCAGGA GGTCAAGAGT TCAAGCCGTG AAAATAGATT ATTGCAGAAA  TGAAGTCTAA GACTACATAT ACCATAGACC CTTATGGTCC AGCCCTTTCC TGGACCTCGA GTATAGTAAG AGCTTTAGTA CACCAGGAGT TTAATTGTTA AGGGATTTTT ACAGAAATAG  CTGGCTGAAT TCACTGTTTA TTTTTCCTAT AGTTGTATAC ATAGATTATC AACTGATTAT ATATGGTTAT ACACATACAG TTAAATCTCT CTATAACGGC CTTATTCATT CCAGATTTTT  TTGGCTATTA TAGCGAAGTG CTATTAAGGA AGAACATACA TTATAACTTA CAGAGGCGGA CCCCAGAATT TTTACACGAC GGGGGTACAT TTTCTGCTCA ACCAATGTCC CCTAAAGGCT  TTTAGTGTTC AGGGTGCCAA CTGCTTTAAA TTAACCATTT TTAAGATATA TATATATATA TTTATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA CGTATATATA TACAGGATTT  CGGTCGAAGT TTACGGGGTC CGGTGACCCC TCACCCATAC ACATGGGTCC GCCTCTGATA ACATAGCGTG AAAAATTGGT TTCATACAAA ACTTGGCTTT TATAGTAAAT GACTGTTATA  TATCGATGCT GTTATATCGA GGTTTGACTG TATTATATAT AAATTATACA TATATTACAC GGCTATTTTT AGTTTAAACA GTTGAGTGAA CGACTATTTA AATTAATTCT TTTTTAATTA  TTTTCTTTCA GGGATGCGAT GGATCGCTAC TCCTCGATGA TACATCAAGC TTCACAGGAG AGAAAAGGGC TGCACCAAAT GTTAATTCTG CTAGAGGATT TGAAGTTATT GACAATATCA  AATCTGCTGT GGAGAAAGTG TGCCCTGGTG TTGTTTCTTG TGCTGATATT TTGGCCGTTA CTGCTCGGGA CTCTGTTGTC ATTGTAAGTT TTAATTATAT TATCAAGACT TTTTCAAGTA  AAAACATCTG CATTTTAAGT TTATATAGAG TAATTTTGGT GATCTTATTA TATGTATATA TGCAGCTTGG AGGTCCCAAT TGGAATGTAA AATTGGGAAG AAGAGATTCT AGAACTGCAA  GTCAAAGTGC TGCCAATAGT GGCATTCCTC CTGCTACTTC TAACCTTAAT AGACTCATCT CAAGTTTCAG TGCTGTTGGC CTTTCTACCA AAGATATGGT TGCCTTATCT GGTTTGTTCT  CCCCCCCTCC CCCCCATAAT TCTTCTCCTT TGTTATAGAA TTTAAGTCAT TTAAACGGAT AATATAAATC TTTTTAACCC TATCGCTATA ATTTAACATG TTATAGCATG TACGTACCAT  TATTCTGGAT TATCGGTCAA TACTTACTAA ATAGAGTTAC TTGTGATTAC CTTTTAAATA ACGTACTTTG TATTTTCTTA TACTGTCAGT TCATAAATCT TAAACTCTTT ATAAACACTA  GTGTTCGTCA AGTTGCTTAA ATGTTGACTA TTTGATCGGA TACCTGCTAT CTCCTTCCAA CAATTATACC GCGGATTTCC ACCCGCATTT ATTCTAGCTT GCCATAATCT CCCCCTTGCC  CCCCCCCCCA ACTCCCCCTG CCCCCCAAAA CCCCCACCCC CCAAATTGAG AGGAAAATAT ACTCAACAAT CCAGAAAAAG CTGATGGAAT TACATATAGA GTGCCTAAAT TTAAACAGAA  TTTTTATTGT AGATAAGCTA GATTCTAGAA CATACAAGTT CTATTAAAGT ATGTTCATCT CAACTCACTA AATCTAGCTG TATTTATATT AAAACAGGTA ATTACAAATT AAACTCACAT  TATAACAAAA AATTTTGCAC ATTATAAACG TCCCCGGCTT AGGCCTTAAC ACCAATAACA GAGGAAATCT CTGAAAATTA AAGGGCAAAG ATCATTTTTA GTCTGCGGCC GAAACTATTT  AAATTTGGTA TCCGTAAAAG TGTATAAAAA TTTGCATATT TTTTGTCTAT AACATATAAA AATGTATGTA TACACAATTT CTTTTCCAGC TATTATTTTA TGAGCGGCTG TAATCAATTT  CCTAAAACAA ACTATGGTTA TGTTTGTATT GGACAGGGGC TCACACAATT GGACAAGCAA GATGTACATC TTTTAGGGCA CGTATATACA ACGAGACCAA TAACTTAGAT GCATCATTTG  CACGAACTAG ACAAAGCAAC TGCCCAAGAA GTTCAGGCTC AGGGGACAAC AATTTGGCAC CACTTGATCT CCAAACTCCT AACAAATTTG ACAACAATTA TTTCAAGAAT CTTGTTGACA  AAAAGGGTCT TCTTCACTCT GATCAACAAC TCTTTAATGG TGGATCTGCC GATTCGATTG TGACATCTTA CAGTAACAAT CCTAGCAGTT TTAGCTCTGA TTTTGTCACT GCTATGATTA  AGATGGGTGA TATTCGTCCA CTTACTGGTT CTAATGGAGA GATTAGGAAG AATTGCCGTA GGCTCAATTA ACGTTGATTA GCATTTTTTT TTTGTGTGTG TGAACTCTCC TGTGTGGGCT  GGGTAAATCT GCGTACAATT GACTCTTGTG GTCCGACCCT TCCTCGGACC TCGCGTATAA CGGAGCTTAG TGTACCGGGC ATTTTGTGTG TGTGTGTGAA CTGCAAACTT TGAGACTTCT 
TTATTTTTTA CAATGTTTTA CTTTCCTTTT AAGTTTCTTT CTTAATATGC AGGTTCAATG TATGTTACCT TGTCAAAGCT TAAAAGCACA ACTTTTTCTC GA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGACAACA ATTATTTCAA GAATCTTGTT GACAAAAAGG GTCTTCTTCA CTCTGATCAA CAACTCTTTA ATGGTGGATC TGCCGATTCG ATTGTGACAT CTTACAGTAA CAATCCTAGC  AGTTTTAGCT CTGATTTTGT CACTGCTATG ATTAAGATGG GTGATATTCG TCCACTTACT GGTTCTAATG GAGAGATTAG GAAGAATTGC CGTAGGCTCA ATTAACGTTG ATTAGCATTT  TTTTTTTGCG TGTGTGAACT CTCCTGTGTG GGCTGGGTAA ATCTGCGTAC AATTGACTCT TGTGGTCCGA CCCTTCCTCG GACCTCGCGT ATAACGGAGC TTAGTGTACC GGGCATTTTG  TGTGTGTGTG TGAACTGCAA ACTTTGAGAC TTCTTTATTT TTTACAATGT TTTACTTTCC TTTTAAGTTT CTTCCTTAAT ATGCAGGTTC AATGTATGTT ACCTTGTCAA AGCTTAAAAG 
CACAACTTTT TCTCGAGTAA AGGACTGTAT TTGTATCATT GTTGGAATAT TATGAATAAA AACACCCTTT TTGA 

Retrieve as FASTA