The peroxidases and oxidases database
Entry information : AtKat03(At1g20620 / CAT3)
Entry ID 5143
Creation 2007-04-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Catherine
Last annotation changes 2021-04-06 (Catherine )
Peroxidase information: AtKat03(At1g20620 / CAT3)
Name AtKat03(At1g20620 / CAT3)
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtKat03
start..stop		 S start..stop
AlyKat03 1024 0 1..492 1..492
BnKat03_other 1018 0 1..492 1..492
ThasKat05 854 0 1..492 1..492
ThasKat04 853 0 1..492 1..492
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 7143142..7143156 15 N° 2 7144207..7144303 97 N° 3 7144459..7144736 278 N° 4 7144829..7145605 777
N° 5 7145691..7145780 90 N° 6 7145880..7146041 162 N° 7 7146134..7146193 60  
join(7143142..7143156,7144207..7144303,7144459..7144736,7144829..7145605,7145691 ..7145780,7145880..7146041,7146134..7146193)


exon

Literature and cross-references AtKat03(At1g20620 / CAT3)
Literature Frugoli J.A., McPeek M.A., Thomas T.L., McClung C.R. Intron loss and gain during evolution of the catalase gene family in angiosperms. Genetics 149:355-365(1998).
Protein ref. UniProtKB:   Q42547
DNA ref. Phytozome 12:   Chr1 (7143142..7146193)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19653073 UniGene:   At.24821
Omic ref. AtProteome:   At1g20620 ATTED-II:   At1g20620 e-FP Browser:   At1g20620 ePlant:   At1g20620 Genevestigator:   At1g20620 TAIR:   At1g20620
Protein sequence: AtKat03(At1g20620 / CAT3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   492
PWM (Da):   %s   56546.48  
PI (pH):   %s   7.69
Sequence 660
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDPYKYRPSSAYNAPFYTTNGGAPVSNNISSLTIGERGPVLLEDYHLIEKVANFTRERIPERVVHARGISAKGFFEVTHDISNLTCADFLRAPGVQTPVIVRFSTVVHERASPETMRDIRGFAVKFYTRGNFDLVGNNTPVFFIRDGIQFPDVVHALKPNPKTNIQEYWRILDYMSHLPESLLTWCWMFDDVGIPQDYRHMEGFGVHTYTLIAKSGKVLFVKFHWKPTCGIKNLTDEEAKVVGGANHSHATKDLHDAIASGNYPEWKLFIQTMDPADEDKFDFDPLDVTKIWPEDILPLQPVGRLVLNRTIDNFFNETEQLAFNPGLVVPGIYYSDDKLLQCRIFAYGDTQRHRLGPNYLQLPVNAPKCAHHNNHHEGFMNFMHRDEEINYYPSKFDPVRCAEKVPTPTNSYTGIRTKCVIKKENNFKQAGDRYRSWAPDRQDRFVKRWVEILSEPRLTHEIRGIWISYWSQADRSLGQKLASRLNVRPSI*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (6 introns), 10 cDNA and 1958 ESTs. Three SwissProt/TREMBL accessions: Q42547, Q2V4M3 and Q2V4M4. Cultivar="Landsberg erecta" and "Columbia".
Promoter►
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Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AAGCTTCTGG CATTTTTTGA CTTTTGTCGT CACTAAACGA AGAGACTTGA CCGTGGTAAG ACGATTTCAA CAACTTTATC TGATAAGGGG ACTATGATAT TTTGTGTCAA AAAAAAACGG  GGGCTATGAT ATTTTTTACA TAGCTACAAT TTCTTTTTCT TTTTTTGGGG TGAATCTAGA TATCAGGCTT GGGTTCATTA TTACTTCAGG TTTAGGATTA ATATTGGATA GCATATATAT  CCTCTAATTT GTAATTAACT CAACATTTGA TAACACGAAG ATATATTCTG TGATTTGAAA TTATCTATCA TCAAAAATGG AGCCAATAAC TTTGAAACAA CACGTTTTAC CAGTGATAGT  AACACCACAT TTGGTTATGT CATATGTGCT CCACGTGATG TGGTCCATGT GGATACAAAA TAACACACAC ACAAAAAACT GCATTTGAGT TATTTTAGTC ATTGCACTTA ATATATATGC  GGCATACTGG AGAGGATTAA AAGTCCTAAT AACTCTAAAT GTCTAAATTA TAAACAAGTA AATTTATAAC TACGAGAGTA TCTCCCTACT CCACTTTTAT CTCTTATAGC TTATTGGATT  GTTGTTTTCG TAACAGAGCT ACTACAATGT TTATGGAGGG GGGCAACTGC GCAATATGTC CTTTAAAGAA ATATATAAAA GAATGCGAAA TGAATTCTGT TAAACGGAGA TAGATGAAGA  TTGTCTTCTA ATGATTGCCA CTTTCTGAGA ATAGTATGTT ACTGTTGATT GTTGTACCTA GCTCTAGTTG TAAATAATAA TATCAAACTA AGTAACAAGA GCAACTTGTT GACACTAAAG  GGACCCCAAG TTACCCTCAA TCAAAAATTG TGGATCAGTT CATCATCGAA GTAACGTGTT AATTATCGTC ATATGCTCCA CAACATCGAC TCCCCACCAT ACCCACTCAA TAATGTCAAT  TCAGCTCTCT CTTTTTGTAT TTTTATAAAG AATGTATTTA AATTTTCAAC CCATAATTTA TAGATTCATG ATCATCTATT AATAATTCAT TAAATACTTT TCTGCATATT GATTTATTTA  AAAGCCGTAC GCAAGCTCAA ATCGGATAAG ACTAAAATAA TATCACCCAG TTAAGTTAAC TAACTTATTT TATTTTGAAT AGTAGTATTA ATTACTTTTG TTCAACTACT CCAATACTGT  TTATATCCTT TCGACGGTAT TAGTTATTTT CATGTTTCAC GCATTTTTGT AATTGCAAAT ACAGACACCT TTGTTGTAAC ACATGTTGAT TAATTTTCCG AAACTATATA CTTTTGAAGA  CAAAAATTTA AAACAAAGAA ACCTCAGATC TACAGTTCCA CCTCGTGTCT GACACGAGTT TCTATGCGAT AAGATCGAAC ATGTATATCA GCAGACTTTA CTATAGATGA ACTCATATTA  GTAATAAGAT CCAAATACGG AAATAAACAA CTTGGAAAGT GAATGGAAGT TTTAAGAGAA AAATCATTTC TAGAATTATT TTTTAGATCA TTTCTTTTTT TGGAGCATCC ATTAGAGTTT  TGTTTTTAGA CTTTATGATT TATTTTTCTT TTGTTATCAG CACAATAATT GATTTTCAAA AGATATTGTA TCTTTTTTTT ATCTCTTGAG AAGCACAGCA CAACAACGAG CAATGCTGAC  TTGTCGGGGT CAGCGATTAT TATTAGTCAC CGAACGAATT TTTCTTGGGT TGGAGCCAAA ACCTAGCAAA AAAATATCTA AGTGGGGGCA CTACATTATT GTTTTAACAC CAAGGAAAAG  TAAACAACAA TGGCCCATTT TTACTGTATC GAGAAATTGA TCTCGAAAGG ACAAATGTAC CCTTCCACTT CGGGAATCCA TTATTGTGCA TAACACACGC TGTTTCACTA TATATACTTT 
CACATAGGAT CTCAACACTC TCACTAAACC AAAATCCTCA AAAGCCTATT TGGGGGATCA TCAACCTTCT ATCATCACC 

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Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGGCCAATCT CCATATAAGC TCAGTCTATG TGAGGTACAA TCAATCTCAT CGATCTATCA TCGCTTGGTC GTTAAATCCG TCAAAAAGAT AATCACATGT GTTGTTGTTT CTTGTCTATA  TAATAATAAT GCTTGTAATC CCAAAAACTC ATGTTTCCTT CCTTTCTACT CTCACTGTCT TTGTAATCTC TTTTTACAAT AAATCAATGT TTCTTGAAGC AGTAAACAAT TTCTAAGATT  TATGGTGGTC GTTATACATA TTATTAATTC AGGAAAAAAA AGAGAAGATA CCGTAATTGA ACATGTATTA TTTTAAGGAG AATCCTGAAA TGGATCAACA ATTGTCTAAT TATGGTATAG  TATCTGGCGA AATCAAAGAC GATATCATCC ACACGTAATT AGTTTGACTA TTAATACGAG GATTATCATT TGGATAAGGA TTAACAAAGA CAAAACACAT ACGTGTTTTG GTGTTGAGCT  AAAATAAGAT ATTTTGGCTC TCGCTATAAA AAAAAAATCG ACAACAGTGC AGACACACGC CGATTTGCGA GATACACACA GTCTCACCTA AAAATCGCAA AAGAAGAAAA ATTCGGATCA  AAATTGTCTT CAAGCATCAT GGATCCATAC AGGGTACATC GATTGATTCT CTTTTTTTGT AATCTGTGAT TTTACCTTAC TTGATTTCGT ATCGATTTGG TGTGATTTCG TGTTGAATCC  AAAGTGTATG AATGATCTCT CTCTCTCGGT TAAAATGATG CAAAATTGGG GTGATTGTTC GACTTGTTGA GGTTTTTTTG TGTGAATCGA TTTCTTTATT ATATAGTGGA GATTGGGTTT  CGATTTGCAT GCGTTGAAGA TTCCACTGGA AAATTCAACA TGTTTTTCCG TCTATTGATT GTTTATTTGT CAACATGCTC ATGCTCATGC TCATGTTCTA ATACACAAGT CTTAAGGCTG 
ACGTGATCTG TCAATATCGT TGTACATGTT TTAAGGTTT 

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DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATCCTTACAAGGTATCTTCGATCATATTCTTCTTACTTTTTCTTTGTTTTTGTGTGGTGTATGTGTATCTTAATTAGAATTAGGTTCAACTATATATGCTCGTTTTCTAAACTATT
TTTTAATTGGATTGATGTTCTTAAATCTTAAGGGTCAAAATACTTTTTATGCTCAAAAACTTACTTAAATTCTGTGATCGCTTGAACCTAAGTTGATGATGTTGATTTCTGTTTTGGCTG
GCTATCTTTAATTAAAACGTTTAACCACTGCGTGAGAAAGACACGCCACATGTGGTTTTTGTTGTTTTTTTCCTTAGATTAGAAGTTATTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTATTATTATTA
CACACATGTGTTCTAAAAATCGGACGTTCAAATGATATAATCGATTGTTTAGACGTCCGACCGTATATTATTTTAGTGATATCAGCCAAATCAGATTAAGTAATCATCAACAAAATGATT
GATCAGATCTACTAAACACCTGAGTAATCAAATCTACACGTTTGATTAATCAAATTAAATAACCGATCAGTTAGATCTATACATATGATAAATCTTTTTTTACAACATTCGGTTAATCAA
ACCATTGTCGGTCGATCTATCAATACAAGTGTATTTTTTTTTCACATACAAAAAAATTATCTCACCGACGAAAAAAAAATAAAAAATTATTATGTAGATCCATCGAACAAAAGGCTTGAA
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GGCAAATAATGGTCGGAAGACTACTCGTGTCGGGATGGACCACCCGGATCCGATCAGGAAACGGGTTTTGATATGTTTCGGGTTACGACAAAAAATTAGGGCTTTTTATCAAATCAATCA
GTTGGTAGTAAAATTTTGTGGATTGTTCTTGTCGATTCCGTTTGATTGTTGACCAAATTTCTTCCTGGATTTTGTTGATAATCGATCGTATAATGGTGATTGCAGTATCGTCCTTCAAGC
GCGTACAACGCCCCATTCTACACCACAAACGGTGGTGCTCCAGTCTCCAACAACATCTCTTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTATCGTAACCCTGAATTTCAAGAGTCTATCAATAAGA
ATCGGAACTTGTTGGATTTATGAAAGAGATAAAACTGAGATATAGAGTCTAAGCTGAGATCTTGTTCGTGAAGCGTGATGTGATTATTTTTAACATGTGTTACTTCGTAATGGGCAGGTC
CGGTTCTTCTTGAGGATTATCATTTGATCGAGAAGGTTGCTAATTTCACCAGAGAGAGGATCCCTGAGAGAGTGGTTCATGCTAGAGGAATCAGTGCTAAGGGTTTCTTTGAAGTCACCC
ATGACATTTCAAACCTCACTTGTGCTGATTTTCTCAGAGCCCCTGGTGTTCAAACTCCGGTTATTGTCCGTTTCTCCACCGTTGTCCACGAACGTGCCAGTCCTGAAACCATGAGGGATA
TTCGTGGTTTTGCTGTCAAGTTTTACACCAGAGAGGTATAAGAAAAGATTCAAAGTTTCCATTTTTAATCGTCTTTTAGCTTCTTTAGAATCAGGACTGATTTTTGTCTTGTTACTGTTA
TGATCAGGGAAACTTTGATCTTGTTGGGAACAACACTCCGGTGTTCTTCATCCGTGATGGGATTCAGTTCCCGGATGTTGTCCACGCGTTGAAACCTAACCCGAAAACAAACATCCAAGA
GTACTGGAGGATTCTGGACTACATGTCCCACTTGCCTGAGAGTTTGCTCACATGGTGCTGGATGTTTGATGATGTTGGTATTCCACAAGATTACAGGCACATGGAGGGTTTCGGTGTCCA
CACCTACACTCTTATTGCCAAATCTGGAAAAGTTCTCTTTGTGAAGTTCCACTGGAAACCAACTTGTGGGATCAAGAATCTGACTGATGAAGAGGCCAAGGTTGTTGGAGGAGCCAATCA
CAGCCACGCCACTAAGGATCTCCACGATGCCATTGCATCTGGCAACTACCCCGAGTGGAAACTTTTCATCCAGACCATGGATCCTGCAGATGAGGATAAGTTTGACTTTGACCCACTTGA
TGTGACCAAGATCTGGCCTGAGGATATTTTGCCTCTGCAACCGGTTGGTCGCTTGGTTCTGAACAGGACCATTGACAATTTCTTCAATGAAACTGAGCAGCTTGCGTTCAACCCGGGTCT
TGTGGTTCCTGGAATCTACTACTCAGACGACAAGCTGCTCCAGTGTAGGATCTTTGCTTATGGTGACACTCAGAGACATCGCCTTGGACCGAATTATTTGCAGCTTCCAGTCAATGCTCC
CAAATGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTACGTCTTAGTACACCACTTGAGCTACCATTGTTAGTCTTTTTACTTGGAATCAA
AATTCTCATTTGGTTTGTACTTTTTACAGATCAATTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTCCGCTGCGCTGAGAAAGTTCCCACCCCTACAAACTCCTACACTGGAATTCGAACAAAGG
TCCGATTCCTGCCATGCCTTCTCTAAATCTTCAAATCCTAAACTCAAGTTTATTAGAATATTGGTGCTAAGAAAACCTTTTAATTGCTAATGTTGCAGTGCGTCATCAAGAAAGAGAACA
ACTTCAAACAGGCTGGAGACAGGTACAGATCATGGGCACCAGACAGGCAAGACAGGTTTGTTAAGAGATGGGTGGAGATTCTATCGGAGCCACGTCTCACCCACGAGATCCGCGGCATCT
GGATCTCTTACTGGTCTCAGGTCAGAACAAAAAAACACTCGGTCAAATTTCTACGTCCTTTTTACCAAGTTTCAGCAAACTAAAACATTATTTATCTCTCTGTATCTCTCAGGCTGATCG
ATCCTTGGGACAGAAACTTGCAAGCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATCTAG

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CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATCCTTACAAGTATCGTCCTTCAAGCGCGTACAACGCCCCATTCTACACCACAAACGGTGGTGCTCCAGTCTCCAACAACATCTCTTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTCCGGTT
CTTCTTGAGGATTATCATTTGATCGAGAAGGTTGCTAATTTCACCAGAGAGAGGATCCCTGAGAGAGTGGTTCATGCTAGAGGAATCAGTGCTAAGGGTTTCTTTGAAGTCACCCATGAC
ATTTCAAACCTCACTTGTGCTGATTTTCTCAGAGCCCCTGGTGTTCAAACTCCGGTTATTGTCCGTTTCTCCACCGTTGTCCACGAACGTGCCAGTCCTGAAACCATGAGGGATATTCGT
GGTTTTGCTGTCAAGTTTTACACCAGAGAGGGAAACTTTGATCTTGTTGGGAACAACACTCCGGTGTTCTTCATCCGTGATGGGATTCAGTTCCCGGATGTTGTCCACGCGTTGAAACCT
AACCCGAAAACAAACATCCAAGAGTACTGGAGGATTCTGGACTACATGTCCCACTTGCCTGAGAGTTTGCTCACATGGTGCTGGATGTTTGATGATGTTGGTATTCCACAAGATTACAGG
CACATGGAGGGTTTCGGTGTCCACACCTACACTCTTATTGCCAAATCTGGAAAAGTTCTCTTTGTGAAGTTCCACTGGAAACCAACTTGTGGGATCAAGAATCTGACTGATGAAGAGGCC
AAGGTTGTTGGAGGAGCCAATCACAGCCACGCCACTAAGGATCTCCACGATGCCATTGCATCTGGCAACTACCCCGAGTGGAAACTTTTCATCCAGACCATGGATCCTGCAGATGAGGAT
AAGTTTGACTTTGACCCACTTGATGTGACCAAGATCTGGCCTGAGGATATTTTGCCTCTGCAACCGGTTGGTCGCTTGGTTCTGAACAGGACCATTGACAATTTCTTCAATGAAACTGAG
CAGCTTGCGTTCAACCCGGGTCTTGTGGTTCCTGGAATCTACTACTCAGACGACAAGCTGCTCCAGTGTAGGATCTTTGCTTATGGTGACACTCAGAGACATCGCCTTGGACCGAATTAT
TTGCAGCTTCCAGTCAATGCTCCCAAATGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGATCAATTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTC
CGCTGCGCTGAGAAAGTTCCCACCCCTACAAACTCCTACACTGGAATTCGAACAAAGTGCGTCATCAAGAAAGAGAACAACTTCAAACAGGCTGGAGACAGGTACAGATCATGGGCACCA
GACAGGCAAGACAGGTTTGTTAAGAGATGGGTGGAGATTCTATCGGAGCCACGTCTCACCCACGAGATCCGCGGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCCTTGGGACAG
AAACTTGCAAGCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATCTAG

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cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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GGTCGTTATA CATATTATTA ATTCAGGAAA AAAAAGAGAA GATACCGTAA TTGAACATGT ATTATTTTAA GGAGAATCCT GAAATGGATC AACAATTGTC T 

Retrieve as FASTA