Entry information : VvAPx03 (GSVIVT01024035001)
| Entry ID | 5171 |
|---|---|
| Creation | 2007-04-11 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-11-25 (Qiang LI) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-01-05 (Qiang LI) |
Peroxidase information: VvAPx03 (GSVIVT01024035001)
| Name (synonym) | VvAPx03 (GSVIVT01024035001) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Vitaceae Vitis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Vitis vinifera (Grape) [TaxId: 29760 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Peroxisomal |
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| Tissue types | Berries Flowers Inflorescences Leaves Stems |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5171' 'complement(join(1587828..1588028,1589299..1589401,1589545..1589624,1589712..1589794,1591815..1591863,1591949..1592014,1593171..1593220,1593904..1594028,1594161..1594273))' |
Exons►
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Literature and cross-references VvAPx03 (GSVIVT01024035001)
| Literature | REFERENCE 1 Reid,K.E., Liao,N., Peng,F., Schlosser,J., Kirkpatrick,R., Shukin ,R., Barber,S., Holt,R., Siddiqui,A., Jones,S., Marra,M., Bowen,P., Bohlmann,J., Martinez Zapater,J.M. and Lund,S.T. Expressed sequence tags from grapevine (Vitis vinifera cv. Cabernet Sauvignon). |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chr3 (1594273..1587828) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vvi.1497 |
Protein sequence: VvAPx03 (GSVIVT01024035001)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 4, 8 introns, incorrect prediction with FGENESH) and 44 ESTs. Cultivar="Pinot Noir", "Chardonnay", "Cabernet Sauvignon" and "Thompson-seedless". |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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