Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
319 |
PWM (Da): |
34092.45 |
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PI (pH):
| 7.78 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MRLGVSVSVRCSIGTASGNTQTDYPAKFQRSSFSTANFLPDNASSDLAVSISSSSSRRGLIRIATLPCLLPLIGCLPANAMQPGSKEYLLIKEEVRKVLSKGKAAGVLRLVFHDAGTFDIDDSGGMNGSIVYELERPENAGLKKSVVLQKAKTQIDAIQPVSWADMIAVAGAEAVEVCGGPPIQVSLGRLDTLVPDPEGRLPEESLNASGLKKCFQSKGFSTQELVALSGAHTIGSKGFGSPISFDNSYYKVLLEKPWTSGGMPSMIGLPSDHALVEDDECLRWIKKYADSENLFFEDFKNAYVKLVNSGVRRNSL |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (chromo 6, 9 introns) and 8 ESTs (Unigene and two TGI: TC232761, TC220505) + EV275649. Cultivar="Williams", "Kefeng 1" and "Harosoy". |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATTAGGTGTGAGTGTGAGTGTGCGGTGCTCAATCGGCACCGCTTCAGGCAACACCCAAACCGATTATCCCGCCAAATTCCAACGGTCATCTTTCTCAACTGCCAACTTCCTCCCC GACAACGCTTCTTCAGGTAAGGGAGGCAACCTTCAACCTCGGATGGAGCTGCTGTTATTGTGCTTATACTTTAACTACACGGTAACCGTTTTTCGTAGATTTAGCAGTTTCAATTTCGAG TAGTAGCAGCAGGAGAGGGCTAATACGCATAGCCACGTTGCCATGTCTTCTTCCCCTCATAGGTTGCCTCCCAGCCAACGCCATGCAGTAAGTATGTATATAATTAAAATTTAATTTTGG ACCATACATATTACATATTCATTCATGTCTTGAATAGTGAATACATGGTGGTGATTGAAGGCCAGGTTCAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCCAAGGG AAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTATTCCATGATGCCGGAACCTTTGACATCGATGACAGTACAGGTAGTATTCTTATCTCATCTGAGGGACTCAAGGTTGCTGTTATTTTTCATAC AGTCCTTCTACTCTCTTTTATGACCAGAGTAAAACATTTGTCTGAAAAATGAATAGCCATGTTTTCTCAGTGTCAAACAAACAGAAATAATCCTCGTTATGACTTTAAAAGTAGTTATTA TACATAGCAGTTTGTAATTGGATTGGATGACAGTATAATAACCTTTACACGATCAGTGCATATATTATGTTTTTCCCGTTAAATATGTAGCTAGTCCACATTTGGGGTGCCAATGCCATT TGTTTTGACTTTTTTACCTGATATAATTAAGCTTGCATCCTCTACTTGATATGCTTCCTTAATCATCCAATTTGGCATCAAGAGCCTAACTCTAAAACTAAGTAGAATTCCAAGCTGAAT TCGATTTTGAGTCTTACAGGAAAAAATGCCAATCATTGCTATCATGGAGACAAACCATGCTAGTAACGTAGTGATGGCTTTTTCAGATATGTCTCATTGCTGGTCCTTTTCAAACAAAAT TATCCTGTGACTTTTCTCCTATGTAATGAATAATCAAATGGAAAATTTCCCATCTTTCTCTTTTCTATAACTCCATTTTAGTAGTAGTTCTAGCCTTTGCTCATCGATTGAATTTGTTTA GGTAATTTTTCACAAGGCGTGAGCCAATTATAGAGGAAGCTGTGCGGTATCTTATTATGTTTTCTTGGTAATAGTGTCATCATCAAATTCAAAATGTACATATATTTTTTGCACTTTTCA TGTTGCAGGTGGTATGAATGGTTCTATAGTCTATGAACTTGAAAGACCTGAAAATGCTGGCCTGAAAAAATCAGTAAAGGCATGCTCTGTCTCACTTTTTTCTCATTCCCCTTCTACCAC TTCTATTTCTATTACTATTTGGAGAATTCCACATGATAGTGAGGTAGTGATGGCTTTAAGACAAATATCTTTTCTTACATTTTAACTGCCACCTAATATCTCAGTGGACGTATCACATAT TTTTTAGGTTCTGCAAAAAGCAAAGACTCAGATAGATGCTATCCAACCAGGTCCTTCTTCTATCTGGTAACTGCTGCTAATAGTAAGTGATAATTTGGTCTGGATCAACAAATTTTCGTT TATCTTTATTAGTATCTTGGGCGGACATGATTGCTGTGGCTGGAGCTGAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATTCAAGTTTCACTGGGCAGATTAGATACACTGTAAGATGCTT GGTTTCTAGTTGACTTGTTTTCAAGTTAGTACTTATGAAGTATGATGTGACAAGCAACTGGTCTTTTCTTAACAGGATGACAAACAAACAGTTATATGTTAGTTTTGGTGCATTAGGTGC TCTGAAAATGTTTTTTAACCAATTATTGAATTATGTTCAATCTGTTTGTTTAATGAATGATCAACCATTTTGCTGGGAATAAAAATTTCCTCCATGGGAATTTAACTCATTGGTTTTCAT ATAACAATGAAGTCTGGTTAGTCTTCAGTCAAATAATATTTTCATTCATTTTAATGATAGGGTGCCTGATCCAGAAGGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAGAA ATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTCGTGAGTATGAGGAAAAACTCCTAATTTACCTTGTATTTGTGTTCTATAAAGTATCATTTATTTGTATCTATTTTAGACTAGTGCAGCTATACATCA TCTAAAAACTGTCTGATTGTCCATAACATGAGAATCTTAAGATTACAAAGGCAGACTGAATCTTATACTACCTCCGATCCTATATATAAGAAACAATTACCTAATTCATAAACACCAATA AAAGTAGTTAGATTAGTTAATTTGTCATAAAATTTTATTTTATTTCAAGACTACCCATAATATTAGATGATTTAAGAGGTGAATATTTTTTAAAAAATAATTTTTCAACTAATGAGTGTC TCTTATTTTGATGATACCTCAATAAATGCACCCACTTTGATGGAAAAATGATTATAATCATTAATAGACCTCACAATAATTAGGGGTCAAAAGCAAATTTAGCAATAAAGTAATCTTATG TTTCTTATAATTAAGACCAAGAAAATGTTACATTTTGTTTCATATATAGAGGATTAGAGGTAGTATCTTATAAAGTCCTAATTCTAAACCAGACTAACAAGGCAAGAAAATAGTGATTTT CTGTCCCAAAAATTACTTATCATATGTTTATTAGTCATTGTATAAATTTTATAAAATATTTTACTTGAATTAGTTTTGCTTATGCATCCTTATCATTTGGAGCTTTTCTTTCATAGAACA CAAGAACTTGTGGCTTTGTCTGGAGCCCACACTATTGGAAGTAAAGGTTTTGGAAGCCCAATTTCTTTTGACAATTCATATTATAAGGTTCTTTTGGAGAAGCCGTGGACGTCTTCAGGT AATTTAACAGCTTATCTCATTTAAACATTGTTTTTATATTTTTTTTGTATACTTGCTACAAGTCGTTGTTTTCTGAAGACAATAAGGAAATGCAAGAGTTGAATGGATGTTACTATGTTA GGCTTAGCCATTGGATTATCACATAATTTTTGTCCAGTCTTCTCTGGATATGTTCCAATCAACAGCTCTACTTTGCGGTTGCATGCTCATTTTTCTGGATAGACCCAACATATTTATTGG TTTGTTTTTGTAAAAAAAAAAAAATTATTTGTATAATTCTCATCTGCTGGTTGTCTTTTATGCAGGTGGTATGCCGAGTATGATTGGGCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAGGATGA TGAATGCTTAAGGTTCTTTATCTTTGACAACCTCTTATGCTACTCTTAATATGAATTTGTCCCCCACTTTTTTTCTTTTCTGGCTAAGCACTAAAATTTTAGTGCTGAAGTGGTAAATCC TTTAAAGAATGTTAGGTTATCTAAACAGGTAAAACAATTAAAATGAGAAGCATATCCTTTTCTTGTTTTTCAGGATTCTATAAAATAACAGGTAACGCAAATAATCCATCAATTGGAAGC AAATAATCTCTATCAATTGGTAGTGAATAAGTTATGTTAGTTATATTTGTCTGACAGTCTGACACCATAATTCGTGATTCATCGTGTCTTGCCCTAGTACACCATATCCTTGTCTCTGGA GTACTAGTTTACACACAAAACTAAACATTGAATTTTCCTTTTCTAGACCTCTAGTTGAAATCTGAAACATCAATTTTCAAACAGTTAGGTGATGATCCCGAGCCTAACGCATGTTCTTGT TCAAATTCTTGTATTATAGTTGTTTGTTGGCCTCAGGACTCATTTCTGATTCTTTTTTGTCCATGTAAGCAAACAATGACGTGCTGAAAAGAAAATTGTCTTTTTAAGTAAGCTAGAGTC GGTATTGTCTATCAAAAACTCCCATCAATCATGTATTTAGGAGGGGGAAATTTTAACTAAAATTTTTAGCTGGACCATTTTATTATATCTTAATGATGACTAGACATTCACTTGCATGTT ACATATCCCGGTGCACCGCATGTGTATGTTTCTGCTGATTATATGTTCCTTAGTGTGCATAACTAAGAGAGCTCCATTGATTGAACAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGTGAGAATC TATTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGAGGCGGAATAGCTTATAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATTAGGTGTGAGTGTGAGTGTGCGGTGCTCAATCGGCACCGCTTCAGGCAACACCCAAACCGATTATCCCGCCAAATTCCAACGGTCATCTTTCTCAACTGCCAACTTCCTCCCC GACAACGCTTCTTCAGATTTAGCAGTTTCAATTTCGAGTAGTAGCAGCAGGAGAGGGCTAATACGCATAGCCACGTTGCCATGTCTTCTTCCCCTCATAGGTTGCCTCCCAGCCAACGCC ATGCAGCCAGGTTCAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCCAAGGGAAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTATTCCATGATGCCGGAACCTTTGACATC GATGACAGTACAGGTGGTATGAATGGTTCTATAGTCTATGAACTTGAAAGACCTGAAAATGCTGGCCTGAAAAAATCAGTAAAGGTTCTGCAAAAAGCAAAGACTCAGATAGATGCTATC CAACCAGTATCTTGGGCGGACATGATTGCTGTGGCTGGAGCTGAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATTCAAGTTTCACTGGGCAGATTAGATACACTGGTGCCTGATCCAGAA GGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAGAAATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTCAACACAAGAACTTGTGGCTTTGTCTGGAGCCCACACTATTGGAAGTAAAGGT TTTGGAAGCCCAATTTCTTTTGACAATTCATATTATAAGGTTCTTTTGGAGAAGCCGTGGACGTCTTCAGGTGGTATGCCGAGTATGATTGGGCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAG GATGATGAATGCTTAAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGTGAGAATCTATTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGAGGCGGAATAGCTTATAA
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Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTGTGTGGCG TCAGGTAGAG ATAATGAGAT TAGGTGTGAG TGTGAGTGTG CGGTGCTCAA TCGGCACCGC TTCAGGCAAC ACCCAAACCG ATTATCCCGC CAAATTCCAA CGGTCATCTT
TCTCAACTGC CAACTTCCTC CCCGACAACG CTTCTTCAGA TTTAGCAGTT TCAATTTCGA GTAGTAGCAG CAGGAGAGGG CTAATACGCA TAGCCACGTT GCCATGTCTT CTTCCCCTCA
TAGGTTGCCT CCCAGCCAAC GCCATGCAGC CAGGTTCAAA GGAATATCTT CTCATTAAAG AAGAGGTGAG GAAGGTCTTG TCCAAGGGAA AGGCTGCTGG CGTGCTTCGA TTGGTATTCC
ATGATGCCGG AACCTTTGAC ATCGATGACA GTACAGGTGG TATGAATGGT TCTATAGTCT ATGAACTTGA AAGACCTGAA AATGCTGGCC TGAAAAAATC AGTAAAGGTT CTGCAAAAAG
CAAAGACTCA GATAGATGCT ATCCAACCAG TATCTTGGGC GGACATGATT GCTGTGGCTG GAGCTGAAGC AGTTGAAGTA TGTGGAGGTC CACCTATTCA AGTTTCACTG GGCAGATTAG
ATACACTGGT GCCTGATCCA GAAGGGAGAC TTCCTGAGGA ATCTCTCAAT GCTTCTGGTT TGAAGAAATG TTTCCAGAGC AAAGGCTTTT CAACACAAGA ACTTGTGGCT TTGTCTGGAG
CCCACACTAT TGGAAGTAAA GGTTTTGGAA GCCCAATTTC TTTTGACAAT TCATATTATA AGGTTCTTTT GGAGAAGCCG TGGACGTCTT CAGGTGGTAT GCCGAGTATG ATTGGGCTTC
CTTCAGATCA CGCTCTTGTT GAGGATGATG AATGCTTAAG ATGGATTAAA AAATACGCAG ACAGTGAGAA TCTATTCTTT GAAGATTTCA AAAATGCGTA TGTCAAGCTG GTGAATTCTG
GTGTGAGGCG GAATAGCTTA TAAATTCAGG AGTTGAATGT TCCAACTTCC ACTGAAGGGG CAACTTGCAT TTTTATTGAC TTTCTAACAG TGTTTATGCA CAGTTGCCAT GAAGTTTTGG
GTGCTTTATT ATTGATTTGA ACATCAAGAT CTACTACCCC CTAAAAATCA ACCAACGAAG TATGTGCATG CAGGGCCAAT AAATnTCATG GAAAAGTCGT TTAAGGGGT
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Retrieve as FASTA
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