Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
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Length (aa):  |
319 |
| PWM (Da): |
34092.45 |
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| PI (pH):
| 7.78 |
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Sequence
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Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MRLGVSVSVRCSIGTASGNTQTDYPAKFQRSSFSTANFLPDNASSDLAVSISSSSSRRGLIRIATLPCLLPLIGCLPANAMQPGSKEYLLIKEEVRKVLSKGKAAGVLRLVFHDAGTFDIDDSGGMNGSIVYELERPENAGLKKSVVLQKAKTQIDAIQPVSWADMIAVAGAEAVEVCGGPPIQVSLGRLDTLVPDPEGRLPEESLNASGLKKCFQSKGFSTQELVALSGAHTIGSKGFGSPISFDNSYYKVLLEKPWTSGGMPSMIGLPSDHALVEDDECLRWIKKYADSENLFFEDFKNAYVKLVNSGVRRNSL |
Retrieve as FASTA
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| Remarks |
Complete sequence from genomic (chromo 6, 9 introns) and 8 ESTs (Unigene and two TGI: TC232761, TC220505) + EV275649. Cultivar="Williams", "Kefeng 1" and "Harosoy". |
DNA ►
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| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATTAGGTGTGAGTGTGAGTGTGCGGTGCTCAATCGGCACCGCTTCAGGCAACACCCAAACCGATTATCCCGCCAAATTCCAACGGTCATCTTTCTCAACTGCCAACTTCCTCCCC
GACAACGCTTCTTCAGGTAAGGGAGGCAACCTTCAACCTCGGATGGAGCTGCTGTTATTGTGCTTATACTTTAACTACACGGTAACCGTTTTTCGTAGATTTAGCAGTTTCAATTTCGAG
TAGTAGCAGCAGGAGAGGGCTAATACGCATAGCCACGTTGCCATGTCTTCTTCCCCTCATAGGTTGCCTCCCAGCCAACGCCATGCAGTAAGTATGTATATAATTAAAATTTAATTTTGG
ACCATACATATTACATATTCATTCATGTCTTGAATAGTGAATACATGGTGGTGATTGAAGGCCAGGTTCAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCCAAGGG
AAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTATTCCATGATGCCGGAACCTTTGACATCGATGACAGTACAGGTAGTATTCTTATCTCATCTGAGGGACTCAAGGTTGCTGTTATTTTTCATAC
AGTCCTTCTACTCTCTTTTATGACCAGAGTAAAACATTTGTCTGAAAAATGAATAGCCATGTTTTCTCAGTGTCAAACAAACAGAAATAATCCTCGTTATGACTTTAAAAGTAGTTATTA
TACATAGCAGTTTGTAATTGGATTGGATGACAGTATAATAACCTTTACACGATCAGTGCATATATTATGTTTTTCCCGTTAAATATGTAGCTAGTCCACATTTGGGGTGCCAATGCCATT
TGTTTTGACTTTTTTACCTGATATAATTAAGCTTGCATCCTCTACTTGATATGCTTCCTTAATCATCCAATTTGGCATCAAGAGCCTAACTCTAAAACTAAGTAGAATTCCAAGCTGAAT
TCGATTTTGAGTCTTACAGGAAAAAATGCCAATCATTGCTATCATGGAGACAAACCATGCTAGTAACGTAGTGATGGCTTTTTCAGATATGTCTCATTGCTGGTCCTTTTCAAACAAAAT
TATCCTGTGACTTTTCTCCTATGTAATGAATAATCAAATGGAAAATTTCCCATCTTTCTCTTTTCTATAACTCCATTTTAGTAGTAGTTCTAGCCTTTGCTCATCGATTGAATTTGTTTA
GGTAATTTTTCACAAGGCGTGAGCCAATTATAGAGGAAGCTGTGCGGTATCTTATTATGTTTTCTTGGTAATAGTGTCATCATCAAATTCAAAATGTACATATATTTTTTGCACTTTTCA
TGTTGCAGGTGGTATGAATGGTTCTATAGTCTATGAACTTGAAAGACCTGAAAATGCTGGCCTGAAAAAATCAGTAAAGGCATGCTCTGTCTCACTTTTTTCTCATTCCCCTTCTACCAC
TTCTATTTCTATTACTATTTGGAGAATTCCACATGATAGTGAGGTAGTGATGGCTTTAAGACAAATATCTTTTCTTACATTTTAACTGCCACCTAATATCTCAGTGGACGTATCACATAT
TTTTTAGGTTCTGCAAAAAGCAAAGACTCAGATAGATGCTATCCAACCAGGTCCTTCTTCTATCTGGTAACTGCTGCTAATAGTAAGTGATAATTTGGTCTGGATCAACAAATTTTCGTT
TATCTTTATTAGTATCTTGGGCGGACATGATTGCTGTGGCTGGAGCTGAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATTCAAGTTTCACTGGGCAGATTAGATACACTGTAAGATGCTT
GGTTTCTAGTTGACTTGTTTTCAAGTTAGTACTTATGAAGTATGATGTGACAAGCAACTGGTCTTTTCTTAACAGGATGACAAACAAACAGTTATATGTTAGTTTTGGTGCATTAGGTGC
TCTGAAAATGTTTTTTAACCAATTATTGAATTATGTTCAATCTGTTTGTTTAATGAATGATCAACCATTTTGCTGGGAATAAAAATTTCCTCCATGGGAATTTAACTCATTGGTTTTCAT
ATAACAATGAAGTCTGGTTAGTCTTCAGTCAAATAATATTTTCATTCATTTTAATGATAGGGTGCCTGATCCAGAAGGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAGAA
ATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTCGTGAGTATGAGGAAAAACTCCTAATTTACCTTGTATTTGTGTTCTATAAAGTATCATTTATTTGTATCTATTTTAGACTAGTGCAGCTATACATCA
TCTAAAAACTGTCTGATTGTCCATAACATGAGAATCTTAAGATTACAAAGGCAGACTGAATCTTATACTACCTCCGATCCTATATATAAGAAACAATTACCTAATTCATAAACACCAATA
AAAGTAGTTAGATTAGTTAATTTGTCATAAAATTTTATTTTATTTCAAGACTACCCATAATATTAGATGATTTAAGAGGTGAATATTTTTTAAAAAATAATTTTTCAACTAATGAGTGTC
TCTTATTTTGATGATACCTCAATAAATGCACCCACTTTGATGGAAAAATGATTATAATCATTAATAGACCTCACAATAATTAGGGGTCAAAAGCAAATTTAGCAATAAAGTAATCTTATG
TTTCTTATAATTAAGACCAAGAAAATGTTACATTTTGTTTCATATATAGAGGATTAGAGGTAGTATCTTATAAAGTCCTAATTCTAAACCAGACTAACAAGGCAAGAAAATAGTGATTTT
CTGTCCCAAAAATTACTTATCATATGTTTATTAGTCATTGTATAAATTTTATAAAATATTTTACTTGAATTAGTTTTGCTTATGCATCCTTATCATTTGGAGCTTTTCTTTCATAGAACA
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AATTTAACAGCTTATCTCATTTAAACATTGTTTTTATATTTTTTTTGTATACTTGCTACAAGTCGTTGTTTTCTGAAGACAATAAGGAAATGCAAGAGTTGAATGGATGTTACTATGTTA
GGCTTAGCCATTGGATTATCACATAATTTTTGTCCAGTCTTCTCTGGATATGTTCCAATCAACAGCTCTACTTTGCGGTTGCATGCTCATTTTTCTGGATAGACCCAACATATTTATTGG
TTTGTTTTTGTAAAAAAAAAAAAATTATTTGTATAATTCTCATCTGCTGGTTGTCTTTTATGCAGGTGGTATGCCGAGTATGATTGGGCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAGGATGA
TGAATGCTTAAGGTTCTTTATCTTTGACAACCTCTTATGCTACTCTTAATATGAATTTGTCCCCCACTTTTTTTCTTTTCTGGCTAAGCACTAAAATTTTAGTGCTGAAGTGGTAAATCC
TTTAAAGAATGTTAGGTTATCTAAACAGGTAAAACAATTAAAATGAGAAGCATATCCTTTTCTTGTTTTTCAGGATTCTATAAAATAACAGGTAACGCAAATAATCCATCAATTGGAAGC
AAATAATCTCTATCAATTGGTAGTGAATAAGTTATGTTAGTTATATTTGTCTGACAGTCTGACACCATAATTCGTGATTCATCGTGTCTTGCCCTAGTACACCATATCCTTGTCTCTGGA
GTACTAGTTTACACACAAAACTAAACATTGAATTTTCCTTTTCTAGACCTCTAGTTGAAATCTGAAACATCAATTTTCAAACAGTTAGGTGATGATCCCGAGCCTAACGCATGTTCTTGT
TCAAATTCTTGTATTATAGTTGTTTGTTGGCCTCAGGACTCATTTCTGATTCTTTTTTGTCCATGTAAGCAAACAATGACGTGCTGAAAAGAAAATTGTCTTTTTAAGTAAGCTAGAGTC
GGTATTGTCTATCAAAAACTCCCATCAATCATGTATTTAGGAGGGGGAAATTTTAACTAAAATTTTTAGCTGGACCATTTTATTATATCTTAATGATGACTAGACATTCACTTGCATGTT
ACATATCCCGGTGCACCGCATGTGTATGTTTCTGCTGATTATATGTTCCTTAGTGTGCATAACTAAGAGAGCTCCATTGATTGAACAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGTGAGAATC
TATTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGAGGCGGAATAGCTTATAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
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| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATTAGGTGTGAGTGTGAGTGTGCGGTGCTCAATCGGCACCGCTTCAGGCAACACCCAAACCGATTATCCCGCCAAATTCCAACGGTCATCTTTCTCAACTGCCAACTTCCTCCCC
GACAACGCTTCTTCAGATTTAGCAGTTTCAATTTCGAGTAGTAGCAGCAGGAGAGGGCTAATACGCATAGCCACGTTGCCATGTCTTCTTCCCCTCATAGGTTGCCTCCCAGCCAACGCC
ATGCAGCCAGGTTCAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCCAAGGGAAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTATTCCATGATGCCGGAACCTTTGACATC
GATGACAGTACAGGTGGTATGAATGGTTCTATAGTCTATGAACTTGAAAGACCTGAAAATGCTGGCCTGAAAAAATCAGTAAAGGTTCTGCAAAAAGCAAAGACTCAGATAGATGCTATC
CAACCAGTATCTTGGGCGGACATGATTGCTGTGGCTGGAGCTGAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATTCAAGTTTCACTGGGCAGATTAGATACACTGGTGCCTGATCCAGAA
GGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAGAAATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTCAACACAAGAACTTGTGGCTTTGTCTGGAGCCCACACTATTGGAAGTAAAGGT
TTTGGAAGCCCAATTTCTTTTGACAATTCATATTATAAGGTTCTTTTGGAGAAGCCGTGGACGTCTTCAGGTGGTATGCCGAGTATGATTGGGCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAG
GATGATGAATGCTTAAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGTGAGAATCTATTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGAGGCGGAATAGCTTATAA
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Retrieve as FASTA
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cDNA►
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GTGTGTGGCG TCAGGTAGAG ATAATGAGAT TAGGTGTGAG TGTGAGTGTG CGGTGCTCAA TCGGCACCGC TTCAGGCAAC ACCCAAACCG ATTATCCCGC CAAATTCCAA CGGTCATCTT
TCTCAACTGC CAACTTCCTC CCCGACAACG CTTCTTCAGA TTTAGCAGTT TCAATTTCGA GTAGTAGCAG CAGGAGAGGG CTAATACGCA TAGCCACGTT GCCATGTCTT CTTCCCCTCA
TAGGTTGCCT CCCAGCCAAC GCCATGCAGC CAGGTTCAAA GGAATATCTT CTCATTAAAG AAGAGGTGAG GAAGGTCTTG TCCAAGGGAA AGGCTGCTGG CGTGCTTCGA TTGGTATTCC
ATGATGCCGG AACCTTTGAC ATCGATGACA GTACAGGTGG TATGAATGGT TCTATAGTCT ATGAACTTGA AAGACCTGAA AATGCTGGCC TGAAAAAATC AGTAAAGGTT CTGCAAAAAG
CAAAGACTCA GATAGATGCT ATCCAACCAG TATCTTGGGC GGACATGATT GCTGTGGCTG GAGCTGAAGC AGTTGAAGTA TGTGGAGGTC CACCTATTCA AGTTTCACTG GGCAGATTAG
ATACACTGGT GCCTGATCCA GAAGGGAGAC TTCCTGAGGA ATCTCTCAAT GCTTCTGGTT TGAAGAAATG TTTCCAGAGC AAAGGCTTTT CAACACAAGA ACTTGTGGCT TTGTCTGGAG
CCCACACTAT TGGAAGTAAA GGTTTTGGAA GCCCAATTTC TTTTGACAAT TCATATTATA AGGTTCTTTT GGAGAAGCCG TGGACGTCTT CAGGTGGTAT GCCGAGTATG ATTGGGCTTC
CTTCAGATCA CGCTCTTGTT GAGGATGATG AATGCTTAAG ATGGATTAAA AAATACGCAG ACAGTGAGAA TCTATTCTTT GAAGATTTCA AAAATGCGTA TGTCAAGCTG GTGAATTCTG
GTGTGAGGCG GAATAGCTTA TAAATTCAGG AGTTGAATGT TCCAACTTCC ACTGAAGGGG CAACTTGCAT TTTTATTGAC TTTCTAACAG TGTTTATGCA CAGTTGCCAT GAAGTTTTGG
GTGCTTTATT ATTGATTTGA ACATCAAGAT CTACTACCCC CTAAAAATCA ACCAACGAAG TATGTGCATG CAGGGCCAAT AAATnTCATG GAAAAGTCGT TTAAGGGGT
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Retrieve as FASTA
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