Entry information : PnoLDS02
| Entry ID | 5347 |
|---|---|
| Creation | 2007-05-14 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2007-05-14 (Marcel Zamocky) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2013-09-04 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PnoLDS02
| Name | PnoLDS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Dothideomycetes Phaeosphaeriaceae Phaeosphaeria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phaeosphaeria nodorum (Stagonospora nodorum) [TaxId: 13684 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5347' 'complement(join(1177929..1179983,1180021..1180354,1180406..1180499,1180598..1180846,1180898..1181354))' |
Exons►
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Literature and cross-references PnoLDS02
| Literature | The Broad Institute Genome Sequencing Platform;
Birren B., Lander E., Galagan J., Devon K., Nusbaum C., Jaffe D., Butler J., Alvarez P., Gnerre S., Grabherr M., Kleber M., Mauceli E., Brockman W., Rounsley S., Young S., LaButti K., Pushparaj V., DeCaprio D., Crawford M., Koehrsen M., Engels R., Montgomery P., Pearson M., Howarth C., Kodira C., Zeng Q., Yandava C., Alvarado L., Oleary S., Oliver R.O., Solomon P.; "Annotation of the Phaeosphaeria nodorum SN15 genome."; Submitted (MAR-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. |
|---|---|
| Protein ref. | GenPept: EAT89123 UniProtKB: Q0UWE6 |
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_5 (1181354..1177929) |
Protein sequence: PnoLDS02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (4 intron) and 2 short ESTs (EH397567 and EH397842). Strain="SN15". Contig position: 199169-195849. Regions 118-535 heme peroxidase domain; 597-1002 cytochrome P450 domain. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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