Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
322 (293) |
PWM (Da): |
34294.57 (30927.9) |
Transmb domain: |
i5-27o |
PI (pH): |
4.85 (4.60) |
Peptide Signal: |
cut: 30 range:30-322 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MATTSFYMTIPIFKIRFFLFLCFFGIGSSQLSSDFYSTTCPNALS TIKSVVDSAVSNEARMGASLLRLHFHDCFVQGCDASVLLNDTTSFTGEQTARGNVNSIRGFGVIDNIKSQVESLCPGVVSCADILAVAARDSVVALGGPSWTVQLGRRDSTTASLSSANSDLPRFDLSLQQLSDNFQNKGLTTAEMVALSG GHTIGQAQCSTFRTRIYNETNIDSSFATSLQANCPSVGGDSNLAPLDSSQNTFDNAYFKDLQSQKGLLHTDQVLFNGGSTDSQVNGYASDPSSFNTDFANAMIKMGNISPLTGSSGEIRT NCWKTN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from Phytozome (=> no splicing intron 1). No EST. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTACTACTTCTTTCTACATGACCATACCAATCTTCAAAATTCGCTTCTTCTTGTTCTTATGCTTTTTTGGGATAGGTTCTTCTCAATTGTCCTCTGATTTTTACTCCACAACGTGT CCCAATGCACTTTCAACCATTAAGAGCGTAGTGGACTCTGCTGTGAGCAATGAGGCTCGCATGGGAGCATCCCTCCTACGTCTCCATTTCCATGATTGCTTTGTTCAAAAGCAAGTCAAC TTACCCTTTCATCAATCTTCTTCAAGTTTTTATTATTTCAAATTTCATGTTCCCCATGCATATACGCGCGCACACGCATGCACATGCATGTTTATCACGAATAATACACAGAAAAATTTC TTGAATAAAGTAGCAGTTTTGCTAGCTTACTTGGTTTTCTTTCGATAAAGAAAAAGGAAATCATGGTTCACGTTGTTGAAAATTCGAATTGTATTCTTACACTAACACCATGAAACCAAT CAAAATGCTAAAAAAAAAAAACTATATACTAAAGGAAAAGAAATATATATTACGTATTATAGTTGTCATTATATTATTAATATATACATTATAGACTTACCATCAGGGATTCAGGGGTTA CTTTAAATTCCTATGCTTCCCTGTTATAGACAGAGTAACTCGGTGGAGCGGTGCTGTCATTTGTAATTTTAGTACTTGCTTGAACAATTTTGTTATTTCATTTTATATTTCATAAGAATC GTAAATAAGTATAAATAATTTATGATAATTTGTGTATTTTGTTCCATCAAGCTGGATACCTTAATCAAATTCTAATATTTTTTATCATAAGTTTGATTGTGATTACGTCTCTTTTTATAT AAAATAAAGTACTAATCTATAACGTCTACTTTAACAGTTTAATTTTGATTTGACAAATAATATATCAATTCAAACAAATTCAATTCCTAACTGTTAATACATGACATATTTTAGTGATTA TATTAACATCTAATTATCCATTAGTATTTATTCAATTTCCTAGTGGCCAGAAAAAGAGACCTAGCCTAAATCATTCTTTAGAAAAAGAAAACTTGACATTGACAATCATGTATGTGTGTT GCTAAAAATTAACTCAATTTATTTTCATTTTATTTACCCATTTTGTGTTTAATTTCATTTCAGGGATGTGATGCATCAGTGCTATTAAACGATACAACAAGTTTCACAGGTGAACAGACG GCACGTGGCAACGTTAATTCCATAAGGGGTTTTGGTGTAATAGACAACATCAAGTCTCAAGTTGAGAGCTTATGCCCTGGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATTCTCGCTGTGGCTGCAAGG GACTCTGTTGTTGCTCTGTAAGTATATATAACATATATCAAAACGCTACACAATAATTAAATTAATAAAACCCATATACTATGCATATTATATGAGTTAGCTAGGTACTAATTTATTGAA ACATATCTATCTCTTAGCTTGGTGGACCTAGTTGGACAGTGCAATTGGGCAGAAGAGACTCAACCACTGCAAGTTTAAGTTCTGCAAACTCAGACTTGCCCCGTTTTGATTTAAGTCTAC AACAACTTAGCGATAATTTCCAAAACAAAGGTCTCACCACCGCAGAAATGGTTGCTCTGTCAGAGGTAATTAACTACCCGCTAAATGCATATTAAATGTATTTTTAGAGCATGAAAACAT ATAACATTTTTTGTGTGTGATGTTACATGGCTGCCGGAACAAGCGAACCTATTAGAATAAATAAGAATTAAAATGGGCTATAAACTTGCATACCATATTAGATTTCAACTTAAAATCAAT TAATATTAAGTAAAATTGTCCAACATATATATAAGTTACATCTCGAGAGTTGAAACAAATAATATGCGACTTCCTAACATAATCAAGTCTTATTAGCTCTTTTTTTATAAACTAAAAAAT TTAATTATGTATCATATAATGATTGATCGAGACTATATATTGATTTTTTCCTGAGATTCAGGATCATATATTGATATTTCCTTTAACAGGGAGATATAAGAGATGAGATATGATGTCACT AGACTAGGTCACTCAATGATGAAATGAGATATTGTATATTTATAAATATAATTACTTTTAACATGCACTTTATGTTCTACTATTTGCAATAAATATTTCAGGAGGGCACACAATTGGGCA AGCTCAATGTTCAACTTTCAGAACAAGGATTTATAACGAGACCAACATAGATTCCTCTTTTGCAACATCATTGCAAGCAAATTGTCCAAGCGTGGGTGGTGACAGCAATTTGGCCCCTCT TGACAGCAGCCAAAACACCTTTGACAATGCTTACTTCAAGGATTTGCAGAGCCAAAAGGGTCTCTTGCACACTGATCAAGTGCTCTTCAATGGAGGATCCACTGACTCTCAAGTAAATGG TTATGCCAGCGACCCTTCAAGCTTCAACACTGACTTTGCCAATGCAATGATTAAAATGGGGAACATTAGCCCACTTACTGGCTCTAGTGGCGAAATCAGGACCAACTGTTGGAAAACCAA TTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTACTACTTCTTTCTACATGACCATACCAATCTTCAAAATTCGCTTCTTCTTGTTCTTATGCTTTTTTGGGATAGGTTCTTCTCAATTGTCCTCTGATTTTTACTCCACAACGTGT CCCAATGCACTTTCAACCATTAAGAGCGTAGTGGACTCTGCTGTGAGCAATGAGGCTCGCATGGGAGCATCCCTCCTACGTCTCCATTTCCATGATTGCTTTGTTCAAGGATGTGATGCA TCAGTGCTATTAAACGATACAACAAGTTTCACAGGTGAACAGACGGCACGTGGCAACGTTAATTCCATAAGGGGTTTTGGTGTAATAGACAACATCAAGTCTCAAGTTGAGAGCTTATGC CCTGGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATTCTCGCTGTGGCTGCAAGGGACTCTGTTGTTGCTCTTGGTGGACCTAGTTGGACAGTGCAATTGGGCAGAAGAGACTCAACCACTGCAAGTTTA AGTTCTGCAAACTCAGACTTGCCCCGTTTTGATTTAAGTCTACAACAACTTAGCGATAATTTCCAAAACAAAGGTCTCACCACCGCAGAAATGGTTGCTCTGTCAGGAGGGCACACAATT GGGCAAGCTCAATGTTCAACTTTCAGAACAAGGATTTATAACGAGACCAACATAGATTCCTCTTTTGCAACATCATTGCAAGCAAATTGTCCAAGCGTGGGTGGTGACAGCAATTTGGCC CCTCTTGACAGCAGCCAAAACACCTTTGACAATGCTTACTTCAAGGATTTGCAGAGCCAAAAGGGTCTCTTGCACACTGATCAAGTGCTCTTCAATGGAGGATCCACTGACTCTCAAGTA AATGGTTATGCCAGCGACCCTTCAAGCTTCAACACTGACTTTGCCAATGCAATGATTAAAATGGGGAACATTAGCCCACTTACTGGCTCTAGTGGCGAAATCAGGACCAACTGTTGGAAA ACCAATTAA |
Retrieve as FASTA
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