RedOxiBase: View Perox 543

Entry information : GmPrx48 (Glyma09g00480)

Entry ID	543
Creation	2005-11-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes	2014-04-10 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2014-04-10 (Christophe Dunand)

Peroxidase information: GmPrx48 (Glyma09g00480)

Name (synonym)

GmPrx48 (Glyma09g00480)

Class

Class III peroxidase [Orthogroup: Prx020]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine

Organism

Glycine max (soybean) [TaxId: 3847 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue types

Globular embryos
Immature seed coats
Mature flowers
Roots
Seeds

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	GmPrx48 start..stop	S start..stop
GmPrx231	633	0	17..342	15..339
PvPrx17	571	0	18..333	20..335
MtPrx94	553	0	23..342	96..413
LjPrx33	550	0	17..342	22..347

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	213552..213767	216	N° 2	213285..213476	192	N° 3	210876..211496	621
complement(join(210876..211496,213285..213476,213552..213767))

Literature and cross-references GmPrx48 (Glyma09g00480)

Literature	Public Soybean EST Project.
DNA ref.	Phytozome 12: Gm09 (213767..210876)

Protein sequence: GmPrx48 (Glyma09g00480)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	342 (318)
PWM (Da):	38165 (35272.5)	Transmb domain:	i7-24o
PI (pH):	7.31 (7.68)	Peptide Signal:	cut: 25 range:25-342

Sequence 384
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MSMNMNMALFLMFLVLHIAWLVASSDLRAGFYSKTCPKAEVIVRDVMKKALMREARSVASVMRFQFHDCFVNGCDGSMLLDDTATMLGEKMALSNINSLRSYKVVDQVKQALEKDCPGVVSCADIIIMASRDAVALTGGPEWEVRLGRLDSLSASQEDSNNIMPSPRANASSLIDLFQKYNLSVKDLVALSGSHSIGQGRCFSIMFRLYNQSGTGRPDPAIDPSYRQELNRICPLDVDQNVTGNLDSTPLVFDNQYFKDLVAGRGFLNSDQTLFTSPHTREFVRLFSRRQTEFFKAFVEGMLKMGDLQSGRPGEVRTNCRFVNARPANLLLQSPRDMESNDK*

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Remarks

Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 46 ESTs.

Promoter►
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Send to cis Analysis

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

AAAAAATTAC TCCATCCATA TCGCTCTTAA AAAAGTTAAC AAATATAATT TCGATAACAT AAAATATAAT AATATCAAAT AAAAAATATT AAATTAATAT TTTTATTTTG TTTGTTATAA ATATATATAA TTTGTTTTTA GATTTTATAT TTTATTTTGT TTCACAAATA AAACTTTTTT TTTTACTTAG CCTAATCTCT AAGTGTTTTA GGTCTTTTTA CATTAGACGA TAACACATGT TATTTGTTTT AAGAAAAAAA AATTAAATTT CTAAAAACAC AATTTAATCC CCCCTTCTTA TGTTATTTGC TTATATACAA ATTCTATGAG AATATTTTTT GCATTAAAAA ATCTTAAACA CAAATTATTA GATGAAAGTC TTAAATGTAT TATTTAAATG TTATGTTAAA TCGTCTTAGG AATGTATTGT TTAAAAATAA AGATGCATCA ATACATATTA TGATCGGATA GTATATCAGA CACAATATTT ATCATTTATA TTTATTTACA TCTAATCAAA ATAATTAAGA GTTTTGATTC ATTTTTAAAA TATAAATATC TTTTAACTTA ACATATATAA CACTTAAGAA AGATAAAAAA AAAAAAAAAA AAACCTTACC CTATATGCTA TTCTCTTTCA TGCTCACATG AACCCACCCC AAACGACGAT GTCACTAGCA CAACACCCTT GTCATCAATA ACATTTATTA AGTAAGAAAA TATTAATATA TTTAAATTAT TTTATAAAAT AATATTTACA CATGCATGAC TCAAGTCATC TACTCTAGTT AATAGCATAT AAGATAATAG TTTCATTTGG TAGAAGATTT GATTTGGAAC CTTATAAAAT ATTGTTAGTA ATATCAGATT TAACATTTTC ATTAAATGAC AAAATTTGTA GGAGGAATGT AAAAATAAGA GGGACAAAGA ATACAAGTCA AAAAATATGA TTATGTATAT ACTAATAGTT TACGTATAAC ATGAGACTTG ATTGAAAATT TAAAAGTATT TTTAGAGATG AAATAGTATT TGATTAAGTT TGGAGACCAA AATGTTTCAA TAAATAATTT ATTAAGTTCA AAGTCTAAAT TAAAAATATA ACTAACAATT ATCAAGTATC ACATCATCAC CGATGATGAC ATGTAGGTAC GCAAGTTAAG GATGACAAAA AAAAATAATG ATATAAATAA TTTATTGTAC TTTTTACCCA TTTAAGAATT ACATTCAATT TTTTTATTTT CATGAAGTCA ATATGTTAGT GTTTTACACT TTTAAATATT AAAATTAATA TTTATCTTTA AATTTAATTG TATCAATTAA AACAAAGTAT TTATTACAAA TTATACCTTT TATTAACATT TATATTGTTA TAAATAAAAT TTTGTAACAA TAGTCCTTTT TATTCAAATA CTGATGATTT TTACTTTCAA TTTTTAACAC AAAAAATTGA GCAACACGAA AAACAAAAAA CCACGCCCCT ACATGAAGGC AACAATTATG GCACTATGGC CGAAAAAAAA TCACGGCAAC ACCCATACCT GAATGCCCAC TTTATCTATA TCTAACATAC TGCAGTGAAA TAAAACATTT TTGCTTAAAT TAATCTTTTG GTACTATTAT ATAAAATAAA AAAAAGTAAG AATCACAAAA TGAGAGAGTA ATTTAACTCA TATTTTACTT TAATGGCATT GAATGCGACT TATACAACCG GTAACCATTA TGGATGCTGG CCCTCGGATT CAAAAAGAAA CTTATCTAAC GGCCGAGGGT ACTTTCCCAA AATGGGAGAC ATGTCCAGCC GACGCCTTAT TTCATTCCTA TAAAAGTGAG AAACCGTGTT CTCTAAGTCA GACGATATTC CAAAAACGAT TTTATTAATT GTTAAAATGA AAAAAAGAAT TACTTTATCC ACCTCCAAAG
TGAGTTAGTA GTTGATACTA ACCATATATA GCCACACTCC TCAGCTACTC TGATCAAAAC AAGGGGACAT CTTTGTTTGT G

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DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGAGCATGAACATGAACATGGCTCTGTTTCTGATGTTCCTTGTTCTGCACATAGCTTGGCTTGTAGCATCATCGGATCTCCGAGCTGGCTTTTACTCAAAAACATGTCCAAAAGCGGAA
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CTGGTTCGTTCCTTCCTTCCTTCCCTCATACTTAAGATGATCATAGTTACAAAATATTATTTTGACACCCCTAGACTACCACTCAGAACCCGAATCACATTAAAATAAAAGAGAAGAAAA
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TTTAACAACCAATTGATAATTAATACTGTTAAAGTGTTCAAAATATGCTTTTAAGGTAAATTATGCTAACCATTCTTTAGCCTTTTGGTATAGTAATGACTTGCATTGCAGACAGGTGGA
CCCGAGTGGGAGGTGAGGTTGGGAAGATTGGACAGCTTGAGTGCGAGTCAAGAAGACTCAAACAACATCATGCCGAGCCCAAGAGCCAACGCAAGCTCTCTTATTGATCTCTTCCAGAAA
TATAACCTCAGCGTGAAAGACCTTGTAGCACTCTCAGGATCTCACTCTATTGGCCAAGGTCGTTGTTTCTCCATCATGTTTAGGCTATACAATCAATCTGGAACTGGAAGGCCTGATCCT
GCCATTGATCCTAGCTATAGGCAAGAGCTTAACAGGATATGTCCACTGGATGTTGACCAAAATGTCACTGGGAACCTTGATTCCACGCCTCTCGTCTTTGATAACCAATATTTCAAGGAT
TTGGTTGCTGGGAGGGGCTTTCTCAACTCTGATCAAACACTCTTCACATCCCCTCACACAAGGGAGTTTGTGAGGTTATTTAGTAGACGCCAAACTGAGTTTTTCAAAGCATTTGTCGAA
GGAATGTTGAAGATGGGTGACTTGCAGTCTGGTCGTCCTGGGGAAGTTAGGACTAATTGCCGGTTCGTCAACGCTCGCCCGGCTAATTTGCTGCTTCAGTCTCCACGCGACATGGAGAGT
AACGATAAATAA

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CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

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