Entry information : ZmRboh05(Zm00001d043543 / GRMZM2G138152 / ZmRbohB )
Entry ID 5487
Creation 2007-07-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-07-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmRboh05(Zm00001d043543 / GRMZM2G138152 / ZmRbohB )
Name ZmRboh05(Zm00001d043543 / GRMZM2G138152 / ZmRbohB )
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Meristems
Mixed tissues
Roots
Seedlings
Inducer Lignification
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmRboh05
start..stop
S start..stop
SbRboh03 1933 0 1..943 1..944
OsRboh02 1714 0 1..943 1..943
BdiRboh03 1692 0 1..943 1..943
OsRboh05 1670 0 7..943 15..951
Literature and cross-references ZmRboh05(Zm00001d043543 / GRMZM2G138152 / ZmRbohB )
Literature Lin F., Jiang M. Cloning and characterization of respiratory burst oxidase homolog gene from Zea mays.
Protein ref. UniProtKB:   A1YBM1
DNA ref. GenBank:   AC190883 (51082..31338)
mRNA ref. GenBank:   DQ890023
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Zm.85093
Protein sequence: ZmRboh05(Zm00001d043543 / GRMZM2G138152 / ZmRbohB )
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   943
PWM (Da):   %s   106130.82 Transmb domain:   %s   o382-401i520-542o567-589i741-758o
PI (pH):   %s   9.59
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGAAAPGHQ RWSGSAGTTP RSLSTGSSPR GSERSSDDGE ELVEVTLDLQ EDDTIILRSV EPAAAGGATA LPLGARGDHA GGASSSSRSL SPSIRRTSSH RLLQFSQELK AEAMSIARQF  SQDLTKRFGR TQSRAEGQGQ QQQPSSGIES ALAARAARRQ RAQLDRTRSG AHKALRGLRF ISSNKANNAW MEVQANFDRL ASEGFLSRSD FAECIGMTES KEFALELFDT LSRRRQVQVD  KINKEELREI WQQITDNSFD SRLQIFFDMV DKNADGRIGE EEVKEIIMLS ASANKLSRLK EQAEEYAALI MEELDPEGLG YIELWQLETL LLQKDTYMNY SQALSYTSQA LSQNLAGLRK  KSPIRKISTT LSYYLEDNWK RLWVLALWIG IMAGLFTWKF MQYRNRYVFN VMGYCVTTAK GAAETLKLNM AIILLPVCRN TITWLRNTRA ARALPFDDNI NFHKTIAAAI VVGIILHAGN  HLVCDFPRLI NSSNEKYAPL GQYFGETKPT YFTLVKGVEG ITGVIMVICM IIAFTLATRW FRRSLVKLPK PFDKLTGFNA FWYSHHLFII VYLALIVHGQ FLYLIHVWYR KTTWMYLAVP  VCLYVGERVL RFFRSGSYSV RLLKVAIYPG NVLTLQMSKP PAFRYKSGQY MFVQCPAVSP FEWHPFSITS APGDDYLSIH VRQLGDWTRE LKRVFAAACE PPVGGKSGLL RADETTKKAL  PKLLIDGPYG SPAQDYSKYD VLLLVGLGIG ATPFISILKD LLNNIIRMEE EEDASTDLYP PVGPNKPHID LSTLMTVTSR PKRVLRTTNA YFYWVTREQG SFDWFKGVMN EIAELDQRNI 
IEMHNYLTSV YEEGDARSAL ITMLQALNHA KNGVDIVSGT KVRTHFARPN WKKVLSKIAS KHPFAKIGVF YCGAPVLAQE LNKLCHEFNG KSTTKFEFHK EHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, 13 introns), 2 mRNA (AY109999 and DQ890023) and 29 ESTs. Cultivar="W23", "B73", "Ohio43", "F2".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGCG CCGCCGCCCC GGGCCACCAG CGATGGAGCG GCTCGGCGGG GACGACGCCG CGGTCACTCA GCACGGGCTC CTCGCCGCGG GGCTCCGAAC GCAGCTCCGA CGACGGGGAG  GAGCTGGTCG AGGTCACGCT CGACCTGCAG GAGGACGACA CCATCATTCT GCGGAGCGTC GAGCCGGCCG CGGCGGGGGG CGCCACCGCG CTGCCGCTGG GCGCGCGCGG GGACCATGCC  GGCGGCGCGT CGTCGTCGTC GCGGTCCTTG TCGCCGTCGA TCAGGCGGAC CTCGTCGCAC CGGCTCCTGC AGTTCTCGCA GGAGCTCAAG GCGGAGGCCA TGTCCATCGC GCGCCAGTTC  TCGCAGGACC TCACCAAGCG CTTCGGCCGC ACCCAAAGCC GCGCGGAAGG GCAGGGGCAG CAGCAGCAGC CGTCGTCAGG CATCGAGTCG GCCCTCGCTG CCCGCGCCGC GCGGCGGCAG  CGCGCGCAGC TCGACCGCAC GCGCTCCGGC GCGCACAAGG CGCTCCGCGG CCTCCGCTTC ATCAGCAGCA ACAAGGCCAA CAACGCCTGG ATGGAGGTGC AGGCCAACTT CGACCGCCTC  GCTTCCGAGG GTTTCCTCTC CCGCTCCGAC TTCGCGGAAT GCATTGGTAC CACCACGCCG CGCTGCCTCC CCTCGGCTTT CTCCTCCATT TCCCTTCGTC GTTGAAACAT TGGGGAGCTG  CATGTACACG TGCAGGGATG ACGGAATCGA AAGAGTTCGC GCTCGAGCTG TTTGACACAT TGAGCCGCCG CCGTCAGGTG CAGGTTGACA AAATCAACAA GGAGGAGCTG CGCGAGATCT  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TCTAGAGGCC AATCCAATGT TGGATTTTTT TCATTTGGTT CCCTATTCAA TTTTTTGTAT TATACTTTAG TACATCTCAT TTTATGTATA CCTTTTTTAT AAATCCTAGT GATGTGTGTT  GGTGGGGCTT TGCATAGGAT TTTTTTTTTC TTAATATGAC AATATACACT AACGGCTCCA ATAAGAGTGT GGTCTGGGTA AGGAATAATC GAGGCAAACC TTATCCCTGT ATTTTTTGTA  GAGACTAGAG AGGGTGTGTT GAACCTAGGA CCTTTGGCTC AGTAGAAACA CTTCTCCTGT TTATGGGGAA AATATTTATT TTGTAAATGC CATTTTTTAT TGATATAATA CGCTAACATA  TTCATACAGT ACAGTAAGGC TGCTTCAATT TTTGGTGTGT TTCAAGGGAA AAGTTCGTCA ACAACTCGCG TAGATGTTTT TTCCATAACT GTGCATTTAC TTTCTTTGGA AGATTTAATT  TATTTCTATG TATGCAGAAT CTTTTGGGCT GCATTATGGA TTTATTTTAT GCATGTAAAT CTTGTTTTTC TAAAGCACGA GTAGTTCAGC CGATGAGGGC CTTTTCTGTT TTATAATATA  GAACATTAAC TTCTTCTCTT GTAGTAATTA TGTCAGCCAT AGTTGTCTCC AGATGTGCGC TTATCAGCTT TTCATTACAA ATGCATGATG TTCCTTCTTG ACCACTTGTA TGAAACAATG  ACCTTAATAT TTGTTAATAG AATATTATCC TTTTATTAAT CTAAACTATT ATTTTTATTA ACCTAACCTG TTCAGCCTTT GATTTTTTTT CTAAATAATG CGTGGGTTTC GTTGGTATTG  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TAATAGGCAT CCGTTCTCAA TTACTTCAGC GCCTGGGGAT GATTATCTAA GCATTCATGT TCGACAACTT GGTGACTGGA CACGAGAGCT CAAGAGGGTT TTTGCAGCAG CTTGTGAACC  CCCAGTGGGC GGTAAAAGTG GCCTTCTTAG AGCAGACGAG ACAACCAAGA AAGCGTATGA GCCCTCAATC ATAAAGGGTT GTTTTGTGTG TAATTGGTCT TTAACAAATT ACATGTTATA  ATATTTTCCT TTTGATAATG CAGCTTACCA AAACTTCTGA TTGATGGACC TTATGGTTCT CCTGCTCAGG ATTACAGCAA GTATGATGTT CTTCTACTTG TTGGATTAGG GATTGGTGCA  ACTCCTTTTA TCAGCATACT GAAAGATCTT CTTAACAATA TTATAAGGAT GGAGGAAGAG GAGGTAATTT ACTATCTTCC ATATCTTCAT TTGTCACCAT CTGACCTTCC TAATTCCATT  AGTGAAATAA CAGATCACAT ATGAAAAATA TTCTTTCTGT TGGGTTTTGT CATTTTGCTA ACCACAATTC TGTTTTATGT GTGTGCATGT GTTGGTAGGA TGCTTCCACT GATCTTTATC  CTCCAGTTGG TCCGAACAAG CCGCACATTG ATCTCAGCAC ACTTATGACG GTCACATCAA GACCAAAGAG GGTTCTAAGG ACCACAAACG CTTACTTCTA TTGGGTTACA CGTGAGCAAG  GTTCTTTTGA TTGGTTCAAG GGAGTCATGA ATGAAATTGC TGAACTGGAC CAAAGGGTGC ATAGTACCAA TTGACCACTT GTTTTGTTTG AGTTACATTT TCTAATTGTC AGAATTCATA  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TCTGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGCG CCGCCGCCCC GGGCCACCAG CGATGGAGCG GCTCGGCGGG GACGACGCCG CGGTCACTCA GCACGGGCTC CTCGCCGCGG GGCTCCGAAC GCAGCTCCGA CGACGGGGAG  GAGCTGGTCG AGGTCACGCT CGACCTGCAG GAGGACGACA CCATCATTCT GCGGAGCGTC GAGCCGGCCG CGGCGGGGGG CGCCACCGCG CTGCCGCTGG GCGCGCGCGG GGACCATGCC  GGCGGCGCGT CGTCGTCGTC GCGGTCCTTG TCGCCGTCGA TCAGGCGGAC CTCGTCGCAC CGGCTCCTGC AGTTCTCGCA GGAGCTCAAG GCGGAGGCCA TGTCCATCGC GCGCCAGTTC  TCGCAGGACC TCACCAAGCG CTTCGGCCGC ACCCAAAGCC GCGCGGAAGG GCAGGGGCAG CAGCAGCAGC CGTCGTCAGG CATCGAGTCG GCCCTCGCTG CCCGCGCCGC GCGGCGGCAG  CGCGCGCAGC TCGACCGCAC GCGCTCCGGC GCGCACAAGG CGCTCCGCGG CCTCCGCTTC ATCAGCAGCA ACAAGGCCAA CAACGCCTGG ATGGAGGTGC AGGCCAACTT CGACCGCCTC  GCTTCCGAGG GTTTCCTCTC CCGCTCCGAC TTCGCGGAAT GCATTGGGAT GACGGAATCG AAAGAGTTCG CGCTCGAGCT GTTTGACACA TTGAGCCGCC GCCGTCAGGT GCAGGTTGAC  AAAATCAACA AGGAGGAGCT GCGCGAGATC TGGCAGCAGA TCACGGACAA CAGCTTCGAT TCCCGCCTCC AGATCTTCTT CGACATGGTG GATAAGAACG CGGACGGCCG GATTGGGGAG  GAGGAGGTGA AAGAGATTAT CATGTTAAGT GCATCTGCCA ATAAGCTGTC CAGGCTTAAG GAGCAAGCCG AAGAGTATGC CGCCCTGATT ATGGAGGAGC TTGATCCTGA AGGACTTGGC  TACATTGAGT TGTGGCAGTT GGAGACCCTT CTGTTGCAGA AGGATACCTA CATGAACTAC AGTCAGGCGC TAAGTTACAC AAGCCAAGCA CTAAGTCAGA ACCTAGCAGG CTTAAGGAAA  AAGAGTCCAA TTCGCAAGAT AAGTACCACA TTGAGTTACT ATTTGGAGGA TAATTGGAAA CGCCTATGGG TGCTTGCATT ATGGATTGGA ATAATGGCTG GACTGTTCAC TTGGAAGTTC  ATGCAGTATC GCAACAGGTA TGTCTTTAAT GTGATGGGCT ACTGTGTGAC CACTGCAAAA GGCGCTGCTG AAACCCTGAA GCTGAACATG GCAATTATCC TCCTCCCAGT ATGCCGTAAC  ACCATTACTT GGTTGAGAAA TACAAGGGCT GCACGGGCAT TGCCATTTGA TGATAATATT AACTTCCACA AGACTATTGC AGCAGCAATC GTTGTTGGTA TAATCCTCCA TGCAGGGAAC  CATCTTGTGT GTGATTTTCC ACGGCTTATA AATTCATCAA ATGAGAAATA TGCTCCTCTG GGCCAGTACT TCGGTGAAAC AAAGCCAACA TACTTTACAT TGGTCAAAGG AGTGGAAGGC  ATCACTGGTG TAATTATGGT TATCTGTATG ATTATTGCTT TCACTTTAGC TACACGGTGG TTCCGTCGTA GCCTGGTGAA GCTTCCAAAA CCATTTGACA AACTGACTGG CTTCAATGCC  TTCTGGTACT CTCATCATTT ATTCATAATT GTGTATTTGG CTCTCATTGT TCATGGCCAG TTCCTTTACC TCATTCATGT CTGGTACCGA AAAACGACAT GGATGTATCT GGCAGTGCCT  GTTTGCCTGT ATGTAGGGGA GAGGGTGCTG AGGTTCTTCA GGTCTGGCAG TTATTCTGTC AGGCTATTGA AGGTGGCCAT ATATCCTGGT AATGTGTTGA CACTGCAAAT GTCCAAGCCT  CCGGCTTTCC GATACAAGAG TGGGCAATAT ATGTTTGTTC AATGTCCAGC AGTGTCACCC TTTGAATGGC ATCCGTTCTC AATTACTTCA GCGCCTGGGG ATGATTATCT AAGCATTCAT  GTTCGACAAC TTGGTGACTG GACACGAGAG CTCAAGAGGG TTTTTGCAGC AGCTTGTGAA CCCCCAGTGG GCGGTAAAAG TGGCCTTCTT AGAGCAGACG AGACAACCAA GAAAGCCTTA  CCAAAACTTC TGATTGATGG ACCTTATGGT TCTCCTGCTC AGGATTACAG CAAGTATGAT GTTCTTCTAC TTGTTGGATT AGGGATTGGT GCAACTCCTT TTATCAGCAT ACTGAAAGAT  CTTCTTAACA ATATTATAAG GATGGAGGAA GAGGAGGATG CTTCCACTGA TCTTTATCCT CCAGTTGGTC CGAACAAGCC GCACATTGAT CTCAGCACAC TTATGACGGT CACATCAAGA  CCAAAGAGGG TTCTAAGGAC CACAAACGCT TACTTCTATT GGGTTACACG TGAGCAAGGT TCTTTTGATT GGTTCAAGGG AGTCATGAAT GAAATTGCTG AACTGGACCA AAGGAATATT  ATTGAGATGC ACAACTACCT TACGAGTGTT TATGAGGAAG GAGATGCTCG GTCAGCGCTC ATCACCATGC TTCAAGCTTT GAACCATGCA AAGAATGGCG TTGACATTGT CTCTGGAACT  AAAGTCCGGA CACACTTTGC AAGACCAAAT TGGAAAAAAG TCCTATCTAA AATTGCCTCG AAGCATCCAT TTGCTAAGAT AGGTGTATTC TACTGTGGAG CTCCAGTTCT TGCACAAGAA 
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