The peroxidases and oxidases database
Entry information : ZmRboh03(Zm00001d042961 / GRMZM2G426953 / ZmRbohA)
Entry ID 5488
Creation 2007-07-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-12-23 (Marie Brette (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2023-01-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmRboh03(Zm00001d042961 / GRMZM2G426953 / ZmRbohA)
Name ZmRboh03(Zm00001d042961 / GRMZM2G426953 / ZmRbohA)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Meristems
Mixed tissues
Roots
Seeds
Whole plant
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmRboh03
start..stop		 S start..stop
SbRboh05 1692 0 1..852 1..854
BdiRboh06 1500 0 2..852 68..907
TaRboh07-1D 1495 0 2..852 6..847
TaRboh07-1B 1489 0 3..852 7..850
Literature and cross-references ZmRboh03(Zm00001d042961 / GRMZM2G426953 / ZmRbohA)
Literature Lin F., Jiang M. Cloning and characterization of respiratory burst oxidase homolog gene from Zea mays.
Protein ref. UniProtKB:   Q0MRQ8
DNA ref. GenBank:   AC205292 (163261..159285)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Zm.4257
Protein sequence: ZmRboh03(Zm00001d042961 / GRMZM2G426953 / ZmRbohA)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   852
PWM (Da):   %s   95699.26 Transmb domain:   %s   o302-320i433-455o483-505i670-687o
PI (pH):   %s   9.87
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGYGDRRSP PLEGITVDGA SRAQSPGAGA GAGAGRLPPP PGGFARGLMK QPSRLASGVR QFASRVSMKV PEGVAGMRPG RMTRMQSSAQ MGLRGLRFLD KTSGGKEGWK AVERRFDDMA  KGSGRLQKES FGKCIGMGDS KEFAGELFVA LARRRSLEPE DGITKEQLKE FWEEMTDQNF DSRLRIFFDM CDKNGDGMLT EDEVKEVIIL SASANKLAKL KGHAATYASL IMEELDPDDR  GYIEIWQLET LLRGMVSAQA PEKLKRTTSS LARTMIPSRY RNPLKRHLSK TVDFIHENWK RIWLVTLWLV VNVALFVYKF EQYKRRTAFQ VMGYCVCVAK GAAEILKLNM ALILLPVCRN  TLTTLRSTAL SHVIPFDDNI NFHKVIALSI AIATAIHTLA HVTCDFPRLI SCPTDKFMAT LGSNFHYKQP TYLGLLESTP GVTGILMIII MSFSFTLATH SFRRSVVKLP SPLHHLAGFN  AFWYAHHLLV LAYVLLVVHS YFIFLTREWY KKTTWMYLIV PVLFYACERV IRKFRENNYH AGIVRAAIYP GDVLSIHMKK PQGFKYKSGM YLFVKCPEVS PFEWHPFSIT SAPGDDYLSV  HIRTLGDWTS ELRMLFGKAC QAQVTSKKAT LTRLETTVVA DAQTEDTRFP KVYIDGPYGA PAQNYRKYDI LLLIGLGIGA TPFISILKDM LNNLKSNEEV ESIHGSEIGS FKNNGPGRAY  FYWVTREQGS FEWFKGVMNE VAGSDHSNVI EMHNYLTSVY EEGDARSALI AMVQSLQRAK NGVDIVSGSK IRTHFARPNW RKVFCDLASA HKNSRIGVFY CGSPTLTKQL KDLSKEFSQT 
TTTRFHFHKE NF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from partial genomic (chromo 3, 12 exons but 3'end is missing), 2 mRNA and 38 ESTs. Cultivar="W23", "B73".
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGT ACGGGGACCG GCGATCGCCG CCGCTGGAGG GCATCACCGT CGACGGGGCC AGCAGGGCCC AATCGCCCGG GGCGGGTGCG GGGGCGGGGG CGGGGAGGCT GCCGCCGCCG  CCAGGAGGCT TCGCGCGCGG GCTCATGAAG CAGCCGTCGC GGCTGGCGTC CGGGGTGCGG CAGTTCGCTT CGCGTGTGTC GATGAAGGTG CCCGAGGGCG TGGCCGGGAT GCGGCCGGGA  CGGATGACGC GGATGCAGTC TAGCGCGCAG ATGGGGCTCC GTGGCTTGCG CTTCCTCGAC AAGACCTCCG GCGGCAAGGA GGGATGGAAG GCCGTCGAGC GCCGCTTCGA CGACATGGCC  AAGGGCAGCG GACGACTCCA GAAGGAGAGC TTCGGCAAGT GCATCGGTAA GCAAAGTGCT AGTGTGCTGC TTGCTCTTGC TCCATCGAGA TTGCCTCTTC TGTCGGTTGG CCACATGCTG  CCTAAGTGCT TGGTGTGATC CAGACTGGAA ATAAACCCCA AATAATCGAT AGTTGAGACG CTGATAAGAA CCGCTAGGCG TAGGCACTCA TATGACAGCA ATTGTTAATA TGTGCATCGA  ATCTCTTTCC TTGCTTTTAG GAATTCTTGT TTGCTTTACT TTTTTTTTTG AGTGTTTCAA AGAGCTCTCA TGGAGTCATG GTACTGCAAT GAACTGTGCC TGTTTCCACC AAGCCTACCT  AACTGAGATG AGATCCACCG TCATTCGCTC CCCAAGGGTC TTCCCAAATC ATGCTGAAAG AAAAGACTCT TCCCAAATTT TAATGAAGTT TCTCCCCAAA GTGGTCCTTT AGCACTAATC  GGTCAGCTCG GACAAACAAG ATTCTAGCTA GTAACGCCAT GGGCCACCAC CATGTAATTC TATCCCATGC TTTCATCTGC CAGCAAGCGT AAAATCATTT GCTGGCGAGC TGTTCGTGTT  GCTGGTGCCC GTGGCGTGAT CAATGGATGA TCCGTGGCTG ACTGACTGAT CTCATTCCCA AGGCATGGGG GACTCCAAGG AGTTTGCCGG CGAGCTGTTC GTGGCGCTGG CGCGGAGGCG  GAGCCTGGAG CCGGAGGATG GCATCACCAA AGAGCAGCTC AAGGAGTTCT GGGAGGAGAT GACCGACCAG AACTTCGACT CGCGGCTGCG CATTTTCTTT GACATGTAAA GCTCCACCGC  GCCCTCGTTC CCGGCCCAAC GGACATGTTC ATCGTTAGGC TACTGATAAA ACGAATTCCC CTCTGCGTCT GACTCAGGTG CGACAAGAAC GGCGATGGGA TGCTCACGGA AGATGAGGTC  AAAGAGGTGA GCGACGGCAA CTTTTCGCGA TTTGGATGAC CAAATATTTA GGAGTGGACG AACTTATTAA ATTATCAACA AATTAATTTG TTTTTTAATT TGTTCCCCCC GGCAGGTTAT  TATACTGAGC GCGTCAGCGA ACAAGCTAGC CAAGCTGAAG GGTCACGCCG CGACCTACGC GTCCCTGATC ATGGAAGAGC TCGACCCGGA CGACCGCGGC TACATTGAGG TCGTGCTTGC  AGAAACAACA TTTTGCTTTC TGTTCGTATC CAACAGCGAT AAGTGGTACG CGTTGCTTAT ACAACCAAAC GGTGTGATGC AGATTTGGCA ACTGGAGACG TTGCTCCGGG GCATGGTGAG  CGCGCAGGCT CCCGAGAAGC TGAAGCGGAC GACGTCGAGC CTGGCGCGGA CGATGATCCC GTCGCGGTAC CGGAACCCGC TGAAGCGGCA CCTGTCCAAG ACGGTGGACT TCATCCACGA  GAACTGGAAG CGGATATGGC TCGTGACGCT GTGGCTGGTC GTCAACGTCG CCCTGTTCGT GTACAAGTTC GAGCAGTACA AGCGCCGAAC CGCGTTCCAG GTGATGGGCT ACTGCGTCTG  CGTCGCCAAG GGTGCCGCTG AGATCCTCAA GCTCAACATG GCTCTCATCC TGCTGCCCGT CTGCCGGAAT ACGCTGACGA CGCTCAGGTC CACCGCGCTC AGCCATGTCA TACCCTTCGA  TGACAACATC AACTTCCACA AGGTCATCGC GCTGTCCATC GCGATCGCCA CAGCGATCCA CACGCTCGCA CACGTGACCT GCGACTTCCC AAGGCTGATC AGCTGCCCGA CGGACAAGTT  CATGGCCACC TTGGGGTCCA ACTTCCACTA CAAGCAGCCG ACTTACCTGG GCTTGCTGGA GAGCACACCC GGGGTTACCG GAATCCTCAT GATCATCATA ATGTCCTTCT CCTTCACGCT  GGCAACACAT TCCTTCAGGC GGAGTGTGGT GAAGCTGCCA TCGCCGCTAC ACCACCTTGC CGGTTTCAAT GCCTTCTGGT ACGCTCACCA CCTGCTGGTC CTTGCGTATG TCCTGCTGGT  GGTGCACTCC TACTTCATAT TCCTCACCAG GGAGTGGTAC AAGAAGACGG TAAACCTCGG ACACCTTGCT TTGAGATGAA ACTCATTCTC CCCTCTGCAT GTTCAGTCAG TGTTGGGAGC  AGCAAAATAA CATATGGTCT CAATTGTTTA TTCAGACATG GATGTACCTG ATTGTCCCTG TCCTCTTCTA TGCCTGTGAA AGAGTCATCA GGAAATTTCG TGAGAACAAC TACCATGCGG  GAATTGTGAG GGTAAGCTAT TGAACTAAAT TGATTTGGTT CATTCTGAGT TTCTGGCTGG TAATTGTTAA TCAAATTCTG TTATGTATAT GCAGGCAGCA ATTTATCCGG GAGATGTGCT  CTCTATTCAC ATGAAGAAGC CACAGGGTTT CAAGTACAAG AGTGGGATGT ATCTGTTTGT TAAATGCCCA GAAGTCTCGC CCTTCGAGTG GTACCATTTC ATTAATTGTT GCATACATCT  CCAAGAAATA ATTTATCTGT GGTTCTTGCT TACCGTTCTC TCATATTTGC AGGCACCCCT TCTCTATAAC TTCGGCACCA GGCGATGACT ACTTGAGTGT GCATATCCGT ACGCTGGGTG  ACTGGACATC CGAACTGCGG ATGCTTTTTG GGAAGGTTAG TTTGAGGCAG CAAAAGTGTT AAGAGTTGGA AGAGTAACAA TACTGTTTTT TGAATGGCAG AATAATGTGG ACTATCAGAA  ATGTATAATG TGGATTATTC GCACAGGCTT GCCAGGCACA AGTAACTTCC AAGAAGGCTA CCCTTACAAG ACTTGAAACT ACAGTTGTGG CAGACGCCCA GACAGAGGAC ACTAGGTGCT  TACCTTTCTT TCATTTTTTC ACACCCTATA GTTTGATTGG TTTTAGAGAA ACTACTGCAA CTTTAAGATT TTATTAACCT GGTCAGCTTT GGTGTGTTTG CTTTAGGTTT CCCAAGGTCT  ACATAGACGG GCCATACGGT GCACCAGCAC AAAATTACAG GAAATATGAC ATTCTTCTGC TTATTGGCCT TGGAATAGGA GCAACTCCTT TCATCAGCAT ACTGAAGGAT ATGTTGAACA  ACCTAAAATC CAACGAAGTA ATTTCCCTTT TTAATGCATT ATTTCGATAC TGTTAAGAAA ATCAAGGATA GCTGATAACC GTACTGAGTT GATTAAACAG GAGGTGGAAA GCATCCACGG  CTCTGAGATA GGCAGCTTCA AGAACAATGG TCCAGGAAGG GCTTACTTCT ACTGGGTCAC CAGAGAGCAA GGATCTTTCG AATGGTTCAA AGGAGTCATG AATGAGGTTG CAGGGAGCGA  TCACAGCGTA CTGTCTCACT CTCATTTCTC TTAAATCTTA ATTACAGCGT ATGTTCATAA ACTAAGTTGA AATCTGGCTG CTGCAGAATG TTATAGAGAT GCACAATTAC CTGACCAGCG  TGTATGAAGA AGGTGACGCA AGGTCAGCTC TGATTGCCAT GGTACAGTCA CTTCAGCGTG CTAAAAACGG CGTGGATATC GTCTCCGGCA GCAAGGTATA CGATAATTTC CCTTTTGCTC  AACTGTAAAG TGTTTTGCAT ATGCTATCTG TTTTGGTTAA CGGAGCACTC TGTTGCAGAT TCGAACACAT TTTGCAAGAC CAAACTGGAG GAAGGTATTC TGTGATTTGG CCAGCGCACA  CAAGAACTCT CGCATAGGTA AGCCACTTGT CAGTGAACAT CGAGTGACAC GATTTTCAGA TTCAGTACAA CAGTTAATGT TTTCTCTAAA AAAAAATTCA GGAGTTTTCT ATTGTGGATC 
TCCGACGCTC ACAAAACAAC TGAAGGATCT TTCGAAAGAA TTCAGCCAGA CAACCACAAC CCGGTTCCAT TTCCACAAAG AGAACTTCTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGT ACGGGGACCG GCGATCGCCG CCGCTGGAGG GCATCACCGT CGACGGGGCC AGCAGGGCCC AATCGCCCGG GGCGGGTGCG GGGGCGGGGG CGGGGAGGCT GCCGCCGCCG  CCAGGAGGCT TCGCGCGCGG GCTCATGAAG CAGCCGTCGC GGCTGGCGTC CGGGGTGCGG CAGTTCGCTT CGCGTGTGTC GATGAAGGTG CCCGAGGGCG TGGCCGGGAT GCGGCCGGGA  CGGATGACGC GGATGCAGTC TAGCGCGCAG ATGGGGCTCC GTGGCTTGCG CTTCCTCGAC AAGACCTCCG GCGGCAAGGA GGGATGGAAG GCCGTCGAGC GCCGCTTCGA CGACATGGCC  AAGGGCAGCG GACGACTCCA GAAGGAGAGC TTCGGCAAGT GCATCGGCAT GGGGGACTCC AAGGAGTTTG CCGGCGAGCT GTTCGTGGCG CTGGCGCGGA GGCGGAGCCT GGAGCCGGAG  GATGGCATCA CCAAAGAGCA GCTCAAGGAG TTCTGGGAGG AGATGACCGA CCAGAACTTC GACTCGCGGC TGCGCATTTT CTTTGACATG TGCGACAAGA ACGGCGATGG GATGCTCACG  GAAGATGAGG TCAAAGAGGT TATTATACTG AGCGCGTCAG CGAACAAGCT AGCCAAGCTG AAGGGTCACG CCGCGACCTA CGCGTCCCTG ATCATGGAAG AGCTCGACCC GGACGACCGC  GGCTACATTG AGATTTGGCA ACTGGAGACG TTGCTCCGGG GCATGGTGAG CGCGCAGGCT CCCGAGAAGC TGAAGCGGAC GACGTCGAGC CTGGCGCGGA CGATGATCCC GTCGCGGTAC  CGGAACCCGC TGAAGCGGCA CCTGTCCAAG ACGGTGGACT TCATCCACGA GAACTGGAAG CGGATATGGC TCGTGACGCT GTGGCTGGTC GTCAACGTCG CCCTGTTCGT GTACAAGTTC  GAGCAGTACA AGCGCCGAAC CGCGTTCCAG GTGATGGGCT ACTGCGTCTG CGTCGCCAAG GGTGCCGCTG AGATCCTCAA GCTCAACATG GCTCTCATCC TGCTGCCCGT CTGCCGGAAT  ACGCTGACGA CGCTCAGGTC CACCGCGCTC AGCCATGTCA TACCCTTCGA TGACAACATC AACTTCCACA AGGTCATCGC GCTGTCCATC GCGATCGCCA CAGCGATCCA CACGCTCGCA  CACGTGACCT GCGACTTCCC AAGGCTGATC AGCTGCCCGA CGGACAAGTT CATGGCCACC TTGGGGTCCA ACTTCCACTA CAAGCAGCCG ACTTACCTGG GCTTGCTGGA GAGCACACCC  GGGGTTACCG GAATCCTCAT GATCATCATA ATGTCCTTCT CCTTCACGCT GGCAACACAT TCCTTCAGGC GGAGTGTGGT GAAGCTGCCA TCGCCGCTAC ACCACCTTGC CGGTTTCAAT  GCCTTCTGGT ACGCTCACCA CCTGCTGGTC CTTGCGTATG TCCTGCTGGT GGTGCACTCC TACTTCATAT TCCTCACCAG GGAGTGGTAC AAGAAGACGA CATGGATGTA CCTGATTGTC  CCTGTCCTCT TCTATGCCTG TGAAAGAGTC ATCAGGAAAT TTCGTGAGAA CAACTACCAT GCGGGAATTG TGAGGGCAGC AATTTATCCG GGAGATGTGC TCTCTATTCA CATGAAGAAG  CCACAGGGTT TCAAGTACAA GAGTGGGATG TATCTGTTTG TTAAATGCCC AGAAGTCTCG CCCTTCGAGT GGCACCCCTT CTCTATAACT TCGGCACCAG GCGATGACTA CTTGAGTGTG  CATATCCGTA CGCTGGGTGA CTGGACATCC GAACTGCGGA TGCTTTTTGG GAAGGCTTGC CAGGCACAAG TAACTTCCAA GAAGGCTACC CTTACAAGAC TTGAAACTAC AGTTGTGGCA  GACGCCCAGA CAGAGGACAC TAGGTTTCCC AAGGTCTACA TAGACGGGCC ATACGGTGCA CCAGCACAAA ATTACAGGAA ATATGACATT CTTCTGCTTA TTGGCCTTGG AATAGGAGCA  ACTCCTTTCA TCAGCATACT GAAGGATATG TTGAACAACC TAAAATCCAA CGAAGAGGTG GAAAGCATCC ACGGCTCTGA GATAGGCAGC TTCAAGAACA ATGGTCCAGG AAGGGCTTAC  TTCTACTGGG TCACCAGAGA GCAAGGATCT TTCGAATGGT TCAAAGGAGT CATGAATGAG GTTGCAGGGA GCGATCACAG CAATGTTATA GAGATGCACA ATTACCTGAC CAGCGTGTAT  GAAGAAGGTG ACGCAAGGTC AGCTCTGATT GCCATGGTAC AGTCACTTCA GCGTGCTAAA AACGGCGTGG ATATCGTCTC CGGCAGCAAG ATTCGAACAC ATTTTGCAAG ACCAAACTGG  AGGAAGGTAT TCTGTGATTT GGCCAGCGCA CACAAGAACT CTCGCATAGG AGTTTTCTAT TGTGGATCTC CGACGCTCAC AAAACAACTG AAGGATCTTT CGAAAGAATT CAGCCAGACA 
ACCACAACCC GGTTCCATTT CCACAAAGAG AACTTCTGA 

Retrieve as FASTA