Entry information : OsRboh03(LOC_Os01g61880 / OsNox03 / OsRbohE)
| Entry ID | 5565 |
|---|---|
| Creation | 2007-07-18 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2007-07-18 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2022-02-28 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsRboh03(LOC_Os01g61880 / OsNox03 / OsRbohE)
| Name | OsRboh03(LOC_Os01g61880 / OsNox03 / OsRbohE) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Flowers Inflorescences Leaves Roots Seeds Stems Whole plant |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5565' 'join(35806557..35806932,35807517..35807679,35807789..35807837,35807943..35808866,35808954..35809049,35809142..35809257,35809345..35809447,35809570..35809658,35809750..35809900,35809995..35810141,35810238..35810366,35810451..35810529,35810616..35810725)' |
Exons►
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Literature and cross-references OsRboh03(LOC_Os01g61880 / OsNox03 / OsRbohE)
| Literature | Sasaki T., et al., The genome sequence and structure of rice chromosome 1. Nature 420:312-316(2002). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q8S1T0 Q5QMH3 [Incorrect splicing] Q5QMH4 [Incorrect splicing] |
| DNA ref. | GenBank: NC_008394.1 (35806557..35810722) |
| mRNA ref. | GenBank: AK100241 [Sequencing error] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.91330 |
Protein sequence: OsRboh03(LOC_Os01g61880 / OsNox03 / OsRbohE)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo, 12 introns), 4 mRNA and 26 ESTs. Three SwissProt/TREMBL accessions: Q8S1T0, Q5QMH4 (uncorrect prediction) and Q5QMH3 (uncorrect prediction). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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