Entry information : OsGPx06
Entry ID 5730
Creation 2007-08-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-01-20 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2022-02-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: OsGPx06
Name OsGPx06
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx2005]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare    [TaxId: 39947 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value OsGPx06
start..stop
S start..stop
TaGPx06-1A 301 8e-107 1..171 1..171
TaGPx06-1B 300 3e-106 1..169 1..169
HvGPx06 298 1e-105 1..169 1..169
SbGPx06 289 7e-102 1..171 1..171
Literature and cross-references OsGPx06
Literature Li R., Fan W., Zhang J., Zheng H., Zhang Y., Li J., Zhao M., McDermott J., Samudrala R., Kristiansen K., Wang J., Wong G.K.-S. Re-annotation of the rice genome(s) by selective pre-masking of intergenic transposable elements. Submitted (SEP-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
Protein ref. UniProtKB:   Q259Q9 [Incorrect splicing]   Q7XPV2 [Incorrect splicing] UniProtKB_Uniparc:   A3AYS5 [Incorrect splicing]
DNA ref. GenBank:   NC_008397.1 (34955779..34957222)
Protein sequence: OsGPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   171
PWM (Da):   %s   18654.54  
PI (pH):   %s   8.43
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAAESSSKL AGSIHEFTVK DARGSDVELS RYKGKVVLIV NAASRCGLTN YNYTELGQLY GKYKETGLEI LAFPCNQFAG QEPGSNEQVV EFACTRFKAE YPILGKVDVN GGNAAPLYKF 
LKSERGGLFG ERIKWNFTKF LVDKEGHVVN RYAPTSSPLS IENDIKNLLG A 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (Chromo 4, 5 introns). No prediction from Phytozome (34920643..34921973)
Four SwissProt/TREMBL accessions: not correct splicing prediction: missing sequence (Q7XPV2) and previous ORF is associated to the GPX (A3AYS5, Q259Q9). No EST has been found but TaGPx06 has 2 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCAG CTGAGTCATC TTCAAAGCTC GCTGGCTCCA TCCATGAATT CACTGTGAAG GTCTGTTGAG CGCCTGTCCC TCCTTCCATT TCTCTAGAAT TATTTATTCT TATTTTTTAT  CAAGCATGTT GAGAGGTTTT ATGGGAAATT TTGAAGAAGC CACGTTGAAG TGTCTGTGAA CCAATGCAAT CGGGCTATTT GAAAATTGAT AATACAAGAA CAAGAGATGG AGTTTTTCAA  TGACAGGGTC TCTATTCCCA TTCATCCAAC TTTGATTTCA TTTCGTCGTG TTTAAATAAC GGTCTGTGGA ATAATTCTGC AGGATGCGAG GGGGAGTGAT GTGGAACTCA GCAGATACAA  GGGAAAAGTT GTTCTTATTG TGAATGCTGC ATCTCGATGG TATTGGTCTT TACATTTTCA TTCGAAATTG TCTAATGAGA GTTTGTACTT TCCCACCTGA TCTGATGATA TCTCTGCAGT  GGTCTGACGA ATTACAACTA CACTGAACTT GGTCAGTTAT ATGGGAAATA CAAGGAGACA GGTACTAGTT GTTTACCTAT ATGACAGTAC GTTTGTTGCA ACTCGGCTCT GAAGTCACGC  GAATACCTTT ATGAAGTACT TTTGGAGAAA TCGCTGCAAA TTTCTTGAAT CTTGACCAGT GCTCATTTTT CAGTATCGGT TTTTTTAATA ACATTTTTAG ACTTTTATCT GTGGGCACTG  GGCAGCTGTA TAATACCGTA CTGCTGTTAT TGCTTTTACT CTGAAGAAAG TATTCACTCT CTTATCGTTT CCTCTGCCGT CCAGTTAAAT TGCATCAAAT CTTTCAGTTT CCCCTTGACA  CCTCAATTGT AATTTATGAG AGCATAACGC TGTCCGTTGA CAGTCTACAA TGACCTCAAT TGCTTTGTAT TTCCCCTTTT TCTTGTGCAA TTAGGATTGG AGATATTGGC GTTCCCATGC  AATCAATTTG CAGGACAGGA GCCACCGAGC CAGGCAGCAA TGAGCAGGTT GTGGAGTTTG CTTGTACCCG CTTCAAAGCA GAGTATCCTA TCCTTGGCAA GGTCCAACCA ATGGCAATCT  TTTCTTCCAG TGCTAGCTTC CAAAACCATA TCCAATTATT TGTTGTTTCG GTCTAAAATC AACGCGCCCG AGTTGTCAAA CAGGTTGATG TGAATGGCGG CAATGCTGCT CCACTGTACA  AGTTCTTGAA GTCAGAGAGA GGTGGCCTCT TCGGAGAACG CATCAAATGG AACTTCACCA AATTTCTGGT TGACAAAGAG GGTCATGTGG TGAACCGTTA TGCACCAACC AGCTCCCCAT  TGAGCATTGA GGTGATGAAA CAAAACAGTG TTCGTTTTCA TTTTATTATA TAGCTTCACA GGCATGATTA CTCATCAGTC AATGGTTGTT TCTGCAGAAT GACATCAAGA ACCTGCTAGG  GGCTTAGATG ATGATGCTGA GTTCCTTCTT CCTCGCCCTC GCCCTGCGGG CCCCGCTCGA CTGCGCTGCC ACCGATGTCG AAGGATTCTA CGCCATTTCC GCGATGGACA TTGACGGAAA  CTATGTGTCG CTCTCCAAGT ACAGCGGCAC GGTGTCCCTG GTGGTGAATG TGGCGAGCAA ATGCGGGCTT ACGAAATCGG TATTGTTTTC GTTTTGTGTT GTTnGCGACA GCACAGTGCA  TCCTTGTACT CCACAGAAGA TGATGATGCT GAGTTCCTTC TTCCTCGTCC TCCTGGTTAT TATCCTTATT CATCACATGC CTCCGAGGAC TTCTCCCCAG TTCGGGCGCC CACGCTGTTC  GTGTTCTCTC TCGAGGAGTT AACTACATCG GATTGATATT CCTTGAGTTG GTGTTTGAGC TCTTCGAATG CCCTTTTCAA AGCCAAAGAC TCTGCTTCAG TTTTTTTCGC CTTTTCGATG  GCCTCTTTGG CTTTCTTGGT CAAGGACGCG TTTTCCACTC GCAATTGGGT CGCCTGAAAA AGGGTAAAAC CAGAGAGTGA GAGAGACAGA CAGACAGGTA GGAATAGACA GTGAAAATCA  TAGAAAGAAA GAATTAGCAA GGAATGAAGG GAAAGGTTTA ATGAAAGGTT TTCGGGAAAT AGTGGTTTTC GGGAAAGACG ACCCAAAGAC TTGAGAAAAA GACnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnGCGTT GTTGTCGTTT CAATCTCGAC CTTCTGGCTG AATCCCGGTT CGATTTCATC CTGAAATTCA AGAATGCATG  AATTGTAGGT AAGTAATGCA GCAATTCAAG TTGATAAATA AAAGACATTG AGAAATTGTG TTGTGGCCCT CGTCCCAACA CATGGTGATC TGTGATAGAT CATTGCATCT ATTGTGGGAA  GAGAGTGCAT AACTGGGAGA AAATGAGCCC AATCGAAATC GGAATCGATA CAGAAAAAAT CCACAACAAC TCAATTGCCA TCATTTGTAC ATTTCAGAGA AACATGCAGC AGCGCACAGC  GGATTCGTTA AGTGGCAACC GGAAAGGAAA CTGTCAACCC AGTTTGTAAA TCATTGAGAA CCATCACTGA AGGGGATGTG CGAAGGTCAG GGTGATTACC TCCTGAGTTT CTTTCCCCGC  TCATCATTCT TCAAATCTCC ATCGGCTnTT TTTTTTTTGT TTTGACGTTC TCATGTTTTT CCGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTTTTCTGTC TCCGAGGATT TGCATCCATC ATTTATCTCG  GAAATTTGCT CCTCAAATTT TTCACCCGAG ATTGACCATC CCCTTTTTTT CCATCTTGTT TTGAACCCGC CCTGTTTAGA ATTACGAACA ACTATCTCAA CTCCAAAATA GATTTGGCCC  TCGTGGATTC CAAGTTCTGG CTTTCCCTTG CAATCAATTC AACTCTCAAG AGCCTGGTAT GTTTAGAGTA CACGTTATAA AATAAGAATG GTCGCATCAT TAAAACTATC CATGCAAAGC  GATTGAATTT GTTAAAAACG CATTCGTCTC GGCCCAATCA AAGTTCCACT TCGAAACTAC AAACTAGAAA GCTGTCATGA CAACTAGAAT CATACAAACG GTTATCTTAG TGCAATAAAA  TGCACACACA ATGGTTGTTA ACATTTTTAG CATCCATACA AAAATTTGTA TCCTGAAATC CAGAGAATTG CAATCATCAA AATTGGGAAC AAAAACAACG AATGTGATGA ATTCATACGT  TATACATGTT GTATCGTGTT TCATATTCAT TTCGAATCAC TGTTCTCATC ATTATTTTTC TTGCATTCTT CAATTTATGT GTCAAGGCTC AAACGAGGAA GTGAAGCGCT TTGCAATTCA  AAGCGGTGCA AACTATCCCC TTTTTGCAAA ATTGACTGTG AATGAACCCA TGTGCAAGGA TGGAGGGTTA GAGGATTGTT CTTCCTCATC CTCCCAATGC TGCTCCGCCA ACAACAGTAT  CTACACTTAC CTCAAATCCG CATTCAAGGG CGACATCGAT TGGAACTTCG CCAAAGTACT TATCGATTTT TTTGTTTTGT TTTATCATCG AATATTTTTA TGCTGACTCC TTTTTACCTG  CTCATTCTTC TATCTATTTC ACAACTTGTG ACTTGTACAT CGTTTGATTC ATTCACCCTA AATCACATCC AGTCCGCATT TTATCAACCA TCTTTCACTG AGTTAGTCAT CTGTTGTCTA  AATACGCGTC TTAGTATATT TAACTTGCCC ATCATCGGCA TCATCACATA TCATTACAGC AATTAGGTTG CCGCTGCGGG TATTAATACT GGTCTTGCTC TTTTCCCCTT TTTTTGTTCC  TTTCTAATAT TAAGTTTCTA CCTTTTTATC TCTCATTTGC AGTTTTTGAT TGGACGAGAT GGCCAAGTCC TTCAAAGATA CAGAGCTCAA ACATACCCAT TGAGCATTGC CAATGACATC  GAAATGGCGT TGGATAAAGA CTACCCCTTC ACTGTTTGAA TGTTGAGGCT TTTCAGTGGC AAGAACAAAG CTTCGCCGAT TGATTCCAAC GGGAAAACGC TGCACGATTT CACGGTCCAA  GTACATCATC TTTCCTCTTC TTTTGCACTG GATTCACGCT GCTTTTTTTT TTnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnAA TGGCATGCGT TTCTACTCGT GAATCAACGC TGGTTGGAAG TTGTTCGCGT ATCCTCCTTT TGTTGTTGTT ATTGTTGTTT TTTATTCTTT GGGATGGCAT TTGTTTTTGG  TTGGTAGGAT GTGGATGGGA AGGACGTAGA TTTGAGCGAG TACAAAGGAA AGGTCGCTTT GGTGGTCAAT GTCGCTTCGC AATGGTAGAT TTACAATCCA AATTCGATGG AGCAACGAAA  TGGAGCGATG TTGATTGATT TTGATGTATG CGTATTGGTT GCTCGTCATT TCCTCGGTCT AAACGGGCCC GAATGCATGT TTTTGTATCG ATGTTTGCCA GTGGTCTCAC CAACACAAAC  TACAAAGAAT TGACCGCGTT GTATGACAAG TATAAAGACC AAGGTATGAT GCCTCGTTGC ATTTCTTAAT TCGAATCGCA ATGAATGAAT CATGCTTTCA AAGCTTGCAT CCACATGGAA  GATGTGACTC AGCATGCTTG CTTTTGGAAC GGACTCCACG CACTTCAACT GTTCATCTTT CCAAGCTTAC TTGTTCAAAT CTGACTCACG TGCATCCATT CTCCCGCATC AATAGATTCA  CCAATGGATT CACGATCTTG GATTCATTTT TTGATGCCTT TGAGTCTCAT ATTGGAATGC TCATTTCAAG GTTTTGTGGT TCTCGCATTC CCATCCAACC AGTTTGGATC TCAGGAGCCC  GGAACCAACC AAGAAATCAA AGAGTTTGCT TGCTCCAGAT ACAAAGCTTC GTTTCCCTTA TTCGCCAAAG TGAGTGGTGT CACCCTCACG CTTGCACAAT TCAACCAAAC CCCATTTCTC  TTGTTGTCAA ATGTGTACAA TTCCACTCCA ATCTTTGGAG AGTTTCCAAT ACTTGGCCCC TGCCTGCCCA CTCTCCGTGG TCTCTCCTTG ACATCCTTCT GCACTTAATT TTTCAAAGTA  CTATTTCGCA ATCGGATGAT GTGAATTTCA GATTGATGTC AATGGTCCCA ACACCGCGCC CGTGTACCAA TTCCTGAAAT CCCAGAAGAG CAGCATCCTG GGAGAGAGCA TCAAATGGAA 
TTTCAGCAAG TTTTTGGTGG ACAAAGAAGG CAGAGTGGTG GAGAGATACT TACCCACCAC CTCTCCCAAG TCCATCGAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCAG CTGAGTCATC TTCAAAGCTC GCTGGCTCCA TCCATGAATT CACTGTGAAG GATGCGAGGG GGAGTGATGT GGAACTCAGC AGATACAAGG GAAAAGTTGT TCTTATTGTG  AATGCTGCAT CTCGATGTGG TCTGACGAAT TACAACTACA CTGAACTTGG TCAGTTATAT GGGAAATACA AGGAGACAGC CAGGCAGCAA TGAGCAGGTT GTGGAGTTTG CTTGTACCCG  CTTCAAAGCA GAGTATCCTA TCCTTGGCAA GGTTGATGTG AATGGCGGCA ATGCTGCTCC ACTGTACAAG TTCTTGAAGT CAGAGAGAGG TGGCCTCTTC GGAGAACGCA TCAAATGGAA 
CTTCACCAAA TTTCTGGTTG ACAAAGAGGG TCATGTGGTG AACCGTTATG CACCAACCAG CTCCCCATTG AGCATTGAGA ATGACATCAA GAACCTGCTA GGGGCTTAG 

Retrieve as FASTA