Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
331 (305) |
PWM (Da): |
35750.7 (32585.2) |
Transmb domain: |
i7-24o |
PI (pH): |
6.49 (5.35) |
Peptide Signal: |
cut: 30 range:27-331 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MKRPCSSSGYYFCLMNMFLLLLPVRSQLTTDFYKSSCPNLSKIVRREVQKALMNEIRMAASLLRLHFHDCFVNGCDGSILLDGGDDGEKSAAPNLNSARGYEVVDTIKSSVESACSGVVS CADILAIAARDSVFLSGGPFWKVPLGRRDGTVSNGTLATEVLPAPFDPLNTIISKFTNMGLNLTDVVSLSGAHTIGRARCTLFSNRLFNFSGTGAPDSTLETGMLSDLQSLCPQNGDGNV TTVLDRNSSDLFDIHYFKNLLSGKGLLSSDQILFSSDEANSTTKPLVQSYSNDSGQFFGDFANSMIKMGNINIKTGTDGEIRKNCRVINSQ* |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic (3 introns) and 1 EST. |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAGCGGCCATGTAGTTCCAGCGGTTATTACTTTTGTCTAATGAATATGTTCCTGTTGCTTTTGCCAGTAAGGTCCCAACTGACAACAGACTTCTATAAGTCATCATGTCCTAACCTT TCCAAAATAGTAAGAAGAGAGGTTCAAAAAGCTCTAATGAATGAGATTCGAATGGCTGCTTCTTTGCTTCGCCTTCACTTTCATGATTGCTTTGTGAATATGTAAGTTTTATGGTTGTTT TGTTATATGCACACTTCAGTCAAATTGTTAGGATACTATTATCATTCTTATCCTACTAACCTACAAGAATTGGTAGCAAAATACTTTCTAATACACCTTTTTAAACACATTCTTTATTAT TACCTGATATTAAAATTTACATAATTAGAGTTTCACTTCATATTTAATGAGTCAAATTAATGATTTTGTAGTTGCTAATAAATTTTAGCCAATGATAAAAAGTGTGTTAGAGAGTACTGG TATGTTGCTCACACAAATCTAACCTCAGTCCTAAATAAAATAGGTAGAAAGGATTGCAATTTATTCAAGGTTTTAAATTACAGTCTACAACAGTTATTGAGGTTGCAATATTCAGGGCAC ATTGCATCAACTGCATTTGCATGTAATTGTCCACAATATCAAATTTTTATTGGTCTATGCAATCACGCAGAAACACAATTTGAAACTTTGATTTGTCCTAAAAATATTTTATTGCAATTA AAGGGCAGTAAAATGAAAGCTTAGAATATTATTATGATCAGTTTAATGTGTCAACACATCGTTGTCAGTAAACTGCACTAAAGATTTTATTTTATTTTTATGAAATTTATCAGAAGAGAA ATGATTATGTTATTGAAATTCTGTTATATTGGGTATTCCGAATTTCCAATTAATTATGTGACACAGAATTAGTAAGTTAGAGCATAATCTGTTACACCTTATTTTCATTGATATCAATTT TTTTTTCTTTGAACATGATCAGGGTTGTGATGGATCGATACTACTAGATGGTGGTGATGATGGAGAGAAATCTGCTGCTCCTAACCTGAACTCTGCTAGAGGATATGAGGTTGTAGATAC AATCAAAAGTTCAGTGGAGAGTGCATGTAGTGGGGTTGTCTCCTGTGCTGATATATTAGCCATTGCTGCCAGAGATTCTGTTTTCCTATAGTAATTCTATTCAAATCCCATTTTATAGAC TTATTTCTTCATTGATTTTACTTATTTCGTTCACTACTCAAGGAACATGCATGCACGGGAATGAAATGTGAATTACTCAAACAAGTTGGAAATTAAATTGTGGTTAACTATGCCTTCCAC GTTTCTTTTAAACTTTATTTTATACGACGATTTTGTGTTTTAGCATGATTATATATGTCACTCATAAAGTCATAATGTTTCGTAGAGTGGTGGTCCTTTTTGGAAGGTTCCGCTAGGACG AAGAGATGGAACAGTCTCAAACGGAACACTGGCAACTGAGGTGCTTCCAGCGCCATTTGATCCATTGAATACCATCATTTCAAAGTTTACTAATATGGGCCTTAATCTCACTGACGTTGT TTCTTTATCAGAGGTAACAGAGAACTTCACAATCTCGATCTTCAAGCTAGCTCGAAATTACTTTTAGAAAACTTAGATGCAATTTCTTAAGTGATGTGGTGTTGTTCCTAACTCCAATTG AAGTTTCACCTCGTTAATCCGTGTAATAAACGTATGTATTAAAGGATTACACCTCAGAGGGAAACTTCAATTCTAGTTGGAAAACAGCAACAACAACTTCTAAGGAACTGTAAGTAAGTT TTGTCAAAAAAACTTTCTTAGACCTTGGTAATCTTTATAATAGACGTATTTATTAAAAGAGTACGACTAGCAGATTATCAAGATGAAACCTCAATTTTGATTGGAGAACAATAACAACCA TACTAAGTAACTGTATCTAAGTTTTAATCCATAATTTGTTAGCTTAATTGCTTCAGTATATATATGTTAACCAATATATATTAATCGAATTATATGTGAAGGTGCCCATACAATTGGCCG AGCAAGGTGTACACTGTTTAGCAATAGATTATTCAACTTCTCAGGAACAGGTGCACCAGACAGCACACTAGAAACTGGCATGCTCTCTGACCTGCAAAGTTTGTGTCCTCAAAATGGAGA TGGAAATGTTACTACAGTCCTTGATCGGAATTCATCGGATCTATTTGACATTCACTACTTCAAGAACCTGCTCAGTGGAAAGGGGCTTCTCAGTTCTGACCAGATTCTATTTTCTAGTGA TGAAGCTAATTCAACAACAAAACCTTTAGTCCAAAGCTATAGCAACGATAGTGGACAATTCTTTGGGGACTTTGCCAACTCTATGATCAAGATGGGGAATATAAATATTAAGACTGGGAC TGATGGAGAGATTAGGAAAAACTGCAGAGTGATAAATTCTCAGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAGCGGCCATGTAGTTCCAGCGGTTATTACTTTTGTCTAATGAATATGTTCCTGTTGCTTTTGCCAGTAAGGTCCCAACTGACAACAGACTTCTATAAGTCATCATGTCCTAACCTT TCCAAAATAGTAAGAAGAGAGGTTCAAAAAGCTCTAATGAATGAGATTCGAATGGCTGCTTCTTTGCTTCGCCTTCACTTTCATGATTGCTTTGTGAATGGTTGTGATGGATCGATACTA CTAGATGGTGGTGATGATGGAGAGAAATCTGCTGCTCCTAACCTGAACTCTGCTAGAGGATATGAGGTTGTAGATACAATCAAAAGTTCAGTGGAGAGTGCATGTAGTGGGGTTGTCTCC TGTGCTGATATATTAGCCATTGCTGCCAGAGATTCTGTTTTCCTAAGTGGTGGTCCTTTTTGGAAGGTTCCGCTAGGACGAAGAGATGGAACAGTCTCAAACGGAACACTGGCAACTGAG GTGCTTCCAGCGCCATTTGATCCATTGAATACCATCATTTCAAAGTTTACTAATATGGGCCTTAATCTCACTGACGTTGTTTCTTTATCAGGTGCCCATACAATTGGCCGAGCAAGGTGT ACACTGTTTAGCAATAGATTATTCAACTTCTCAGGAACAGGTGCACCAGACAGCACACTAGAAACTGGCATGCTCTCTGACCTGCAAAGTTTGTGTCCTCAAAATGGAGATGGAAATGTT ACTACAGTCCTTGATCGGAATTCATCGGATCTATTTGACATTCACTACTTCAAGAACCTGCTCAGTGGAAAGGGGCTTCTCAGTTCTGACCAGATTCTATTTTCTAGTGATGAAGCTAAT TCAACAACAAAACCTTTAGTCCAAAGCTATAGCAACGATAGTGGACAATTCTTTGGGGACTTTGCCAACTCTATGATCAAGATGGGGAATATAAATATTAAGACTGGGACTGATGGAGAG ATTAGGAAAAACTGCAGAGTGATAAATTCTCAGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|