Entry information : BfuLDS01
| Entry ID | 5855 |
|---|---|
| Creation | 2007-10-11 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2007-10-11 (Marcel Zamocky) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: BfuLDS01
| Name | BfuLDS01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Leotiomycetes Sclerotiniaceae Botryotinia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Botryotinia fuckeliana (Botrytis cinerea Sclerotinia fuckeliana) [TaxId: 40559 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5855' 'complement(join(358003..358365,358415..358524,358574..358755,358802..359150,359201..359404,359456..360402,360454..360543,360596..360831,360878..361277,361334..361473,361522..361887))' |
Exons►
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Literature and cross-references BfuLDS01
| Literature | REFERENCE 1: Birren,B., et al., The Broad Institute Genome Sequencing Platform. Annotation of the Botryotinia fuckeliana B05.10 genome.
REFERENCE 2: Silva,E.M., Valdes,J., Holmes,D., Shmaryahu,A. and Valenzuela,P.D. Generation and analysis of expressed sequence tags from Botrytis cinerea. Biol. Res. 39 (2), 367-379 (2006). |
|---|---|
| Protein ref. | GenBank: XP_001557644.1 |
| DNA ref. | JGI genome: Supercontig_1.15 (361887..358003) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001557594 |
| EST ref. | GenBank: EB809814 [Fragment] |
Protein sequence: BfuLDS01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and 1 EST. Strain="B05.10". Regions: 163-627 peroxidase domain, 969-1085 cytochrome P450 domain. |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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