Entry information : SsclLDS01
| Entry ID | 5856 |
|---|---|
| Creation | 2007-10-11 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2007-10-11 (Marcel Zamocky) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2012-04-27 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: SsclLDS01
| Name | SsclLDS01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Leotiomycetes Sclerotiniaceae Sclerotinia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Sclerotinia sclerotiorum [TaxId: 5180 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5856' 'complement(join(446147..446509,446564..446673,446726..446907,446955..447303,447355..447558,447611..448557,448609..448698,448749..448984,449032..449431,449485..449624,449672..450135,450369..450459))' |
Exons►
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Literature and cross-references SsclLDS01
| Literature | The Broad Institute Genome Sequencing Platform. Annotation of the Sclerotinia sclerotiorum 1980 genome. |
|---|---|
| Protein ref. | GenBank: XP_001588258.1 UniProtKB: A7EZD8 |
| DNA ref. | JGI genome: Supercontig_2.16 (450459..446147) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001588208 |
Protein sequence: SsclLDS01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (11 introns). Strain="1980". Regions: 226-689 peroxidase domain; 757-1148 "cypX" cytochrome P450 domain. |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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