Entry information : SsclLDS02
| Entry ID | 5937 |
|---|---|
| Creation | 2007-10-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2007-10-26 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-04-27 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: SsclLDS02
| Name | SsclLDS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Leotiomycetes Sclerotiniaceae Sclerotinia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Sclerotinia sclerotiorum [TaxId: 5180 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5937' 'complement(join(1505628..1505679,1505841..1505933,1506280..1506669,1506844..1506914,1507070..1507852,1507939..1508206,1508391..1508922,1508983..1509257,1509317..1509540,1509606..1510460))' |
Exons►
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Literature and cross-references SsclLDS02
| Literature | The Broad Institute Genome Sequencing Platform. Annotation of the Sclerotinia sclerotiorum 1980 genome. |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A7E8M9 |
| DNA ref. | JGI genome: Supercontig_2.2 (1510460..1505628) |
Protein sequence: SsclLDS02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (9 introns). Strain="1980". Regions: 296-608 peroxidase domain; 1044-1096 "cypX" cytochrome P450 domain. |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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