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Entry information : PtRboh02 (POPTR_0001s09970 / Potri.001G098300)
Entry ID 6078
Creation 2008-01-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-07-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2012-03-08 (Qiang Li)
Peroxidase information: PtRboh02 (POPTR_0001s09970 / Potri.001G098300)
Name (synonym) PtRboh02 (POPTR_0001s09970 / Potri.001G098300)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus
Organism Populus trichocarpa (Western balsam poplar)    [TaxId: 3694 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtRboh02
start..stop		 S start..stop
PtRboh03 1843 0 1..949 1..948
CcaRboh05 1660 0 1..949 1..945
CcaRboh01 1660 0 1..949 1..945
CsRboh01 1651 0 1..949 1..946
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 7710950..7711610 659 N° 2 7711828..7711987 158 N° 3 7712387..7712435 47 N° 4 7713089..7713202 112
N° 5 7714515..7714937 421 N° 6 7716391..7716777 385 N° 7 7716859..7716954 94 N° 8 7717112..7717227 114
N° 9 7717585..7717752 166 N° 10 7717865..7718024 158 N° 11 7718189..7718386 196 N° 12 7718488..7718616 127
N° 13 7718809..7718887 77 N° 14 7718973..7719082 108  
join(7710950..7711610,7711828..7711987,7712387..7712435,7713089..7713202,7714515 ..7714937,7716391..7716777,7716859..7716954,7717112..7717227,7717585..7717752,77 17865..7718024,7718189..7718386,7718488..7718616,7718809..7718887,7718973..77190 82)


exon

Literature and cross-references PtRboh02 (POPTR_0001s09970 / Potri.001G098300)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_1 (7710950..7719082)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pth.12536 [3' end]
Omic ref. ePlant:   Potri.001G098300
Protein sequence: PtRboh02 (POPTR_0001s09970 / Potri.001G098300)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   949
PWM (Da):   %s   107523.5 Transmb domain:   %s   o387-406i526-548o568-590i747-764o
PI (pH):   %s   9.72
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MRASLPKHERRWASDTLPGNATMSTGTSPGTESGEEFVEVTLDLQGDDTIVLRSVEPATSTVINIDDVSFTTGGSVSAGAVTPVSRSPTIRRSSSNKLLQFSQELKAEAVAKARQFSHEL
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Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 13 introns) and 3 ESTs.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGAGCTTCATTGCCTAAACACGAGCGGAGATGGGCCTCGGACACGCTTCCCGGCAATGCAACGATGAGCACCGGAACATCGCCGGGAACTGAGTCCGGCGAGGAGTTTGTTGAGGTG
ACACTTGATTTACAAGGTGATGACACGATTGTGCTTCGTAGTGTTGAGCCAGCAACATCAACGGTTATCAACATCGATGATGTTTCTTTCACTACTGGTGGTTCTGTGTCTGCCGGAGCT
GTAACTCCGGTGTCGAGATCGCCGACGATCAGGCGGAGTTCGTCGAATAAGTTGTTGCAATTTTCTCAGGAGTTGAAAGCTGAAGCTGTAGCGAAAGCTAGGCAATTTTCGCATGAGTTG
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GGGTGGACAAGAACGAAGACGGTAGAATCACTGAAGAAGAAGTCAAAGAGAGGTACTACAAATGAATTTAAGAAGACATTATAATTAATCATGTCTTTCTCTCTAATTCAATTAATTTAA
TCTTAACTAGTTACATTGATTAAGTGCTTAATCTTAAAGTAACGTGCATGAATTAGCCAACAGCCTGTCAAATTATTGTAGAAATAAAATAAGAACCGACCTTCCAAATATGAGGTAGAA
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GACAGAAGAAGAGAGAAATGGCAATCGTTTCTTACAAATGGCACAACTAATTAATCTGGTTAAGCAAGCTTATTTATATTGAAGAATATTTGTGGTAGTTGAACAGCTCCCTGGCTTTCT
TTTCCACTTTAATATGCACGTCTGTTATAGCATAGAAGACTTTTAAGTTTTAAGTAGAGGTACGCAGTTTCTGAGGCAAAGCTGGTTCAAACTTCAGATGTTTTTAGGACCAGTACTAAC
ATTAAAAAAAAAAAAAAGGTTGTCCACCAAGTAATGATAAATTCAACGAAAACTTGAACGTGAATGGCCATCGTCTAACACAGTTGTCATTGTCACCAACTAACTCAAGATTTTCTTAAG
CGTCTTTCTTCAATTTGGTAGGGTAAATATTGATTCTTTATCCAATAGGCTTTCGAATTACGTACTGTCATTCCTCTTGTTGTCAAAATGGAACGAACCTTTTGAAGATTTCTAAGAGCA
TGAACCTTTACCACTCCAGATTTTATATGGATCCTAGAGACTGGCTCGGATGGAAGGACAGTTTATTTCTCATGGTAGAGGATCGAGATTTTAAATATAAATAATTTATTCACGATCCAA
GTAAGAAAAGAAAGGATGGAGGTCGGCGTACAGCTAAATAAACAAGTGTTATCTACTGTATCGGAAGTGCCTTGATGACCTGTACTTTTTTTAATTTTAAAATTGATATTGATGATCTGA
ACTATTATTCCTGCCACTGTTTGAACCTGACCTCTCAAATAATGCTTAGCCTTCACTCATACATAAATCATTACGCGTGCTCCACTCTGCATCAATTGTAGTGTAATAAGTTGACATGAC
CAAGATTCTCTTTTCCATTATATGTATAACTCCACTGCTGATGATTTGATGCAACCTTCTTGTTTTCTTGTTGTTGCTTAAAATGATATGTAGCTATGGCAGCTAGAAACACTCCTTCTA
CAAAAGGACACGTATCTGAACTACAGTCAAGCTCTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAAAATCTACAAGGGCTAAGAAAGAGGAGCCCAATAAGGAGAGTGAGCAAGCAATGCGTA
TACTTTTTTCAAGAGAATTGGAGAAGAATTTGGGTTTTGACATTATGGGTTATGATAATGATAGGGCTGTTCGCATGGAAATTCTTTCAATACAAGCAAAAGAATGCTTTTCAAGTAATG
GGTTATTGTCTCCTAACAGCCAAAGGTGCAGCAGAGACATTGAAGTTCAATATGGCTCTAATTCTCTTGCCTGTGTGTAGAAATACTATCACTTGGCTGAGGTCCACTAGGCTGGGTCCC
TTGGTGCCTTTTGACGACAATATCAACTTTCACAAGAGGTACGTCCAAGGTTACCGACCCCCTCCTCTTCTTGTCTGTATTGCTTTTTTAATACGTTTACATCCTTCTAGGGTCCCATAT
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TCATATATACCCCTCTTTTTTTATTAAATAATGTTAGCCACAGCATATGAATTTTGTTGCCGAAGAAGGAATTTGAAAGAAAAGAGCCACATAAATCGATAATTTTGTATTGTTTTATTT
AGTTCTTATTTTTTTATAAATAAAATTATAATTTTTTTACACCTTGTAAAATTGTTTATTAAAATTTGTAATTTCTTTATTTTTAAATAGATATTTTATTTATTGATATATTTGATTACT
TATTTTCTTATGATTATGTTTTATGAATTACACAAATAAAATTACTTTTTCATTTTTTCATTATTATTTATAAACTATTTTCCAAAAAATTGATTACTTTTACTTTAAAACAAATTATTT
TATTTTATTTTATTTTTCATAAATAAATATTTATTTTTAAAAGTAATTATCTTTTATTAAATTATTTATTTTCATGCAAACACCAACCAGCTTTATAAAATACTTGTGTTGTAATGGCTT
GTGCTTTCCCGTGACCAAACATGTTCTTAAATTCGTGTTTGGTAACGAGGACACTTCGTCGAAATGAATTACAATTTGTTCTCTCTTTTCATTTGGTTAAACTTAGGGGAGATGGGTCAA
ATCTAAAGGATTATTCCTATTGTGGGGATTTGATCTTCGTAAACTCTTGTCTTTTCCAAGGGCTACTACACGGGGCTTGTAGCTCAGTGGCCTTGGCAGGCTTTGCCCTGCCTGAGTGCC
CTGGTTCGAGCTCTGTTGTGTACCCAGCACTTGAGGGTCTAACTGCTGTGGTCCATTGTGGACTTGTTCCGCCCCCTCCCGGGTTCGACCCTCTATGTGCACGCCTGTCACCCCCGCGGT
GCCTTACCTGCTCCTGGGCTTGCAGGATGTCCAGTGGGCCGTGGGGAATAGTCGTGGTGCGCGTAAGCTGGCCCGGACACCCCACGTGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCGAATAA
ATACATAAACAACTTTTTTGTTTATTAAATTCTCATCAGTTAAAGGCTCTGCGTATGCTAGCTAAGACCCAAATGCTCCGTGTGCTATAAAATAAAAGAGTAAATTCATAACTAATTCAA
AGCTATTTTACCACTGATAAAAGATATTGAAAATTTCAGTCGAGCTTAAATCAATCTTGATGATGTACAAAATGACACCATTTAATCACAAAATGATTTATATATATATATAAACTTGTT
TAATTACTTGTGGTAAATTGCATTGATTTAATATTTCTCACACACATGCAGACCATAGCAGCAGCAATTGTAATTGGTGTGATTCTCCATGCTGGAAACCATCTAGTCTGTGATTTTCCA
AGGCTTATTAATTCATCTGATGAGCAATATAGAGCATACCTGAGTGATGACTTTGGTGGAAACAAACCTTCATATGCAAAACTGGCTAGAGGGACTGAAGGTGTGACTGGAATCTTAATG
GTGATCAGCATGGCCATTGCATTTACACTTGCAACAAGATGGTTCAGGAGGAGCCTCATTAAGTTTCCAAAACCCTTTGACAGGCTCACTGGATACAATGCATTCTGGTATTCGCACCAC
TTGTTTGTCATTGTCTACATCCTGCTCACCATCCATGGTGTATTCCTGTATATGGTGCATAAATGGTACAAAAAGACGCGGTATGAATCTGAAATCTTTTAATGGCAGTGAATGTTTTTC
TTGTTTGAGATTGTAAACTGACGGCATTTTATTGCTTGCAGACATGGATGTATCTTTCTGTTCCAGTTTTACTATATGCCGGAGAAAGGGCGCTGAGGTTTTTTCGTTCTGGCTTCTATA
CTGTCAGGCTTCTCAAGAGGTATAACATCCTGAAGACCTCTGTCATTTCAGTTCGATCTTATGGTTAATGTCTAAATGTTACCATCTTGAAAGAGCCCTATAAACTGGCACAGTACTTCT
GTAAAGTTTAAAACCTACTGTACTAGATTTTTGTCATAATTCTTTTTTTCATCCAGGTTGCAATTTATCCTGGAAATGTTCTCACATTGCAAATGTCTAAGCCTCCCCAATTCCGGTACA
AGAGTGGACAGTACATGTTTGTCCAGTGCCCTGCTGTTTCTCTATTTGAGTGTGGTAAATCACTATTAATTTCTTAACTCACATGAAAATGGCTTTTTTGGTAGTTTAAAAAAACTCAGT
TGTAGTCTACCAGAGAAAGGTGCTTGTAAAATACATCTAGGCCAACTGCTAGCAAGAAACTTGCTCATTTTGTGCTTATTCTCTTTATGGGATATGGTCATTATTTTGTATGATTTTTTT
TTCATTTTCTGATGAAAGCTAGTGAAAAATAAATTTGATAGGAATCAGTATTTGATTTCTTTCTTTTGTAATTGATGATCGATTGATGCCAACGGTTTCAGTTGGTTTCTTTGCTCTGAT
ACCTGATTTTCTCCAGAACTTACAATCAGCATGCTTTATTTTTCCACCCAGGCATCCATTTTCAATTACCTCCGCACCTGGTGATGACTACCTCAGTGTTCACATTCGGCAGCTAGGTGA
CTGGACTCAAGAACTAAGAAGAGTGTTCTCTGAAGCCTGTGAACGTCCTGTAGCCGGTAAGAGTGGACTTCTCAGGGCTGATGAAACAACAAAAAAAAGAGGTACAGAATATGTCTATGT
TTCCCTTTTCTTTTCCCATTCCCTTTTTTTTTTTTTCCTTTGGATAGCATTTTGTGATTATATTGTTTATGTAACTTTCCTCTCTAATGACAGCTTGCCAAAGCTCTTGATAGATGCGCC
TTATGGTGCACCGGCACAAGATTACCGTAAATATGATGTGTTGTTACTTGTTGGTCTGGGAATTGGAGCAACACCTTTCATCAGCATTCTCAAAGATCTTCTTAATAACATTGTCAAAAT
GGAGGAGCAAGCACAGTAAGTGACTAGAAACCTGACTTTCACTTTTCCAATCTGCAATTTATACACATGATCGTTCCTTTAATACTATAGATTCTGTATTGCGAACTATAGAAAATTTCC
AGACTTAATCCATGATAATCTTCTAAATGCACAGTCACAAGTCTGATTCTCATTCTCAGGATTCGGTCTTGGATATCAGTAGGACATCAGACCTGAGCATTGGAAGCAATGATACATCAA
CCTCTAACAAAGTTTCACCAAAACGTAAGAAGGCTGTAAGGACCACCAACGCTTATTTCTATTGGGTAACAAGGGAGCAAAGTTCTTTTGATTGGTTCAAAGGAGTCATGAATGAAGTTG
CAGAGCTTGATCAAAGGGGGTAATTAATGTCACCTTAGCTTGAAATTATGTAAATTACAAAAAAAATTCCCGTTTTGCTTGGTTTCCTTGATTGTTGACTTTGTCGTTGGACTATTCCAG

GGTGTGATTGAGATGCATAATTACTTGACCAGTGTGTATGAGGAAGGCGATGCTCGATCAACCCTCATTACCATGGTCCAAGCCTTAAACCATGCGAAAAACGGTGTGGACATTGTCTCC
GGGACCAGGGGGTAATACTAATTATTTTGTTTAGGCTCATTGCATGTTCATGTTGCGGCTCGCATGTTATATCAGTTGGGCTTTTCCAAATTTTCTGACACCTTCAATTACACATAAATT
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TTCTTTCTAAATTATGTTCCAAGCACTGTAATGCAAGGATAGAGGTGATTATACCTTCTAGCTAACAGATTTTTTAACAGAGAAAACCTATCCTCCTGTTCTAATCACATCACTATGGTT
TTGGAGCAGGTGTGTTTTACTGCGGAGCACCTGTCTTGGCTAAAGAACTAGGCAAGCTCTGCTATGATTTCAATCAAAAAGGTTCCACAAAGTTCGAGTTCCACAAGGAGCATTTCTAA

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CDS►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGAGCTTCATTGCCTAAACACGAGCGGAGATGGGCCTCGGACACGCTTCCCGGCAATGCAACGATGAGCACCGGAACATCGCCGGGAACTGAGTCCGGCGAGGAGTTTGTTGAGGTG
ACACTTGATTTACAAGGTGATGACACGATTGTGCTTCGTAGTGTTGAGCCAGCAACATCAACGGTTATCAACATCGATGATGTTTCTTTCACTACTGGTGGTTCTGTGTCTGCCGGAGCT
GTAACTCCGGTGTCGAGATCGCCGACGATCAGGCGGAGTTCGTCGAATAAGTTGTTGCAATTTTCTCAGGAGTTGAAAGCTGAAGCTGTAGCGAAAGCTAGGCAATTTTCGCATGAGTTG
AAAGCTGAGTTAAGGAGGTTTTCTTGGAGTCATGGACAGGCAGCTCGGATTTTATCAGCCTCGGGAAATAATGGCGGTGGTGCTTTTGAGTCAGCTTTAGCCGCCCGTGCTTTGAGAAAG
CAGCGAGCGCAGCTGGACCGGACTCGGTCTGGTGCTCACAAAGCCTTGCGTGGATTGAGATTTATAAGTAAGAACAGTAAAAAAACTAATGGCGTTGATGCATGGAGTGAAGTTCAAAGC
AATTTTGAAAAACTTGCTGAAGATGGTTATCTTAACCGGGCCGATTTTGCACAATGCATAGGAATGAAAGATTCGAAGGAGTTTGCTTTGGAGCTTTTTGATGCATTGGGAAGGAGAAGA
AGATTGAAAGCGGACAAGATTTGTGGAGATGAGCTTTACGAGTTTTGGTCACAAATTACCGATCAAAGCTTTGATTCTCGACTCCAGATCTTCTTCGATATGGTGGACAAGAACGAAGAC
GGTAGAATCACTGAAGAAGAAGTCAAAGAGATTATCATGCTAAGTGCTTCTGCAAATAAGTTATCAAGATTAAAAGAACAAGCAGAGGAATACGCAGCTTTGATCATGGAAGAGTTGGAC
CCAGAAAGATTTGGCTACATCGAGCTATGGCAGCTAGAAACACTCCTTCTACAAAAGGACACGTATCTGAACTACAGTCAAGCTCTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAAAATCTA
CAAGGGCTAAGAAAGAGGAGCCCAATAAGGAGAGTGAGCAAGCAATGCGTATACTTTTTTCAAGAGAATTGGAGAAGAATTTGGGTTTTGACATTATGGGTTATGATAATGATAGGGCTG
TTCGCATGGAAATTCTTTCAATACAAGCAAAAGAATGCTTTTCAAGTAATGGGTTATTGTCTCCTAACAGCCAAAGGTGCAGCAGAGACATTGAAGTTCAATATGGCTCTAATTCTCTTG
CCTGTGTGTAGAAATACTATCACTTGGCTGAGGTCCACTAGGCTGGGTCCCTTGGTGCCTTTTGACGACAATATCAACTTTCACAAGACCATAGCAGCAGCAATTGTAATTGGTGTGATT
CTCCATGCTGGAAACCATCTAGTCTGTGATTTTCCAAGGCTTATTAATTCATCTGATGAGCAATATAGAGCATACCTGAGTGATGACTTTGGTGGAAACAAACCTTCATATGCAAAACTG
GCTAGAGGGACTGAAGGTGTGACTGGAATCTTAATGGTGATCAGCATGGCCATTGCATTTACACTTGCAACAAGATGGTTCAGGAGGAGCCTCATTAAGTTTCCAAAACCCTTTGACAGG
CTCACTGGATACAATGCATTCTGGTATTCGCACCACTTGTTTGTCATTGTCTACATCCTGCTCACCATCCATGGTGTATTCCTGTATATGGTGCATAAATGGTACAAAAAGACGACATGG
ATGTATCTTTCTGTTCCAGTTTTACTATATGCCGGAGAAAGGGCGCTGAGGTTTTTTCGTTCTGGCTTCTATACTGTCAGGCTTCTCAAGGTTGCAATTTATCCTGGAAATGTTCTCACA
TTGCAAATGTCTAAGCCTCCCCAATTCCGGTACAAGAGTGGACAGTACATGTTTGTCCAGTGCCCTGCTGTTTCTCTATTTGAGTGGCATCCATTTTCAATTACCTCCGCACCTGGTGAT
GACTACCTCAGTGTTCACATTCGGCAGCTAGGTGACTGGACTCAAGAACTAAGAAGAGTGTTCTCTGAAGCCTGTGAACGTCCTGTAGCCGGTAAGAGTGGACTTCTCAGGGCTGATGAA
ACAACAAAAAAAAGCTTGCCAAAGCTCTTGATAGATGCGCCTTATGGTGCACCGGCACAAGATTACCGTAAATATGATGTGTTGTTACTTGTTGGTCTGGGAATTGGAGCAACACCTTTC
ATCAGCATTCTCAAAGATCTTCTTAATAACATTGTCAAAATGGAGGAGCAAGCAGATTCGGTCTTGGATATCAGTAGGACATCAGACCTGAGCATTGGAAGCAATGATACATCAACCTCT
AACAAAGTTTCACCAAAACGTAAGAAGGCTGTAAGGACCACCAACGCTTATTTCTATTGGGTAACAAGGGAGCAAAGTTCTTTTGATTGGTTCAAAGGAGTCATGAATGAAGTTGCAGAG
CTTGATCAAAGGGGTGTGATTGAGATGCATAATTACTTGACCAGTGTGTATGAGGAAGGCGATGCTCGATCAACCCTCATTACCATGGTCCAAGCCTTAAACCATGCGAAAAACGGTGTG
GACATTGTCTCCGGGACCAGGGTGCGAACGCATTTTGCAAGGCCTAATTGGAAGAAGGTTCTTTCTAAATTATGTTCCAAGCACTGTAATGCAAGGATAGGTGTGTTTTACTGCGGAGCA
CCTGTCTTGGCTAAAGAACTAGGCAAGCTCTGCTATGATTTCAATCAAAAAGGTTCCACAAAGTTCGAGTTCCACAAGGAGCATTTCTAA

Retrieve as FASTA