Entry information : NtPrx08-1A(Nitab4.5_0002604g0030)
Entry ID 62
Creation 2010-02-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx08-1A(Nitab4.5_0002604g0030)
Name NtPrx08-1A(Nitab4.5_0002604g0030)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx020]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx08-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx08-1B 672 0 1..337 1..337
StPrx58 596 0 1..335 1..335
LePrx47 587 0 1..335 1..335
IaquPrx35 543 0 3..324 2..323
Literature and cross-references NtPrx08-1A(Nitab4.5_0002604g0030)
Literature Lein,W., Usadel,B., Stitt,M., Reindl,A., Ehrhardt,T., Sonnewald,U. and Boernke,F. Large-scale phenotyping of transgenic tobacco plants (Nicotiana tabacum) to identify essential leaf functions. Plant Biotechnol J 6 (3), 246-263 (2008)
EST ref. GenBank:   AM804895.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.18555
Protein sequence: NtPrx08-1A(Nitab4.5_0002604g0030)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337
PWM (Da):   %s   37643.91  
PI (pH):   %s   7.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPYSHFFFFL LISLAFAAMA APTLRPGFYT ETCPQAEFIV KDVMKKAMKR EPRSLASVMR LQFHDCFVNG CDASLLLDDT PNMLGEKMAL SNINSLRSYE VVDEVKEALE RACPGVVSCA  DLLIMAARDA VVLTGGPNWE VKLGRLDSLT ASQEDSNQIM PSPRSNATYL IDLFNRYNLS IKDLVALSGS HSIGKGRCFS IVFRLYNQSG SGRPDPTIEP RFREKLDKLC PLGGDGNVTG 
NLDATPEVFD NQYFKDLVNG RGFLNSDQTL FTNPFTREYV REFSVSQEKF FKAFVEGMIK MGDLQSGRPG EIRRDCRVVN SRRPRVEVLF ETSNRGE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs (AM802641.1). Strain="SNN". Unigene compiles ESTs from both alleles.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTATA GCCATTTTTT CTTCTTTCTC CTTATAAGCT TAGCTTTTGC AGCTATGGCT GCTCCTACAC TTAGGCCAGG TTTTTACACG GAAACATGTC CACAAGCTGA ATTTATAGTC  AAAGATGTGA TGAAAAAAGC AATGAAAAGA GAGCCCAGAA GCTTAGCCTC AGTGATGAGA TTGCAGTTTC ATGATTGCTT TGTTAATGTA ATAGTAAACA TTTCAAGAAT CCATTTTTTT  GTTGCTGTAT TTGAAAATTC TTGTTTTTGG GTTAATTTTT GTTTTATTTT TTTAGGGATG TGATGCTTCT TTGTTGTTGG ATGATACACC AAATATGCTT GGGGAGAAAA TGGCTTTATC  AAATATAAAT TCACTGAGGT CTTATGAAGT TGTAGATGAA GTTAAAGAGG CACTGGAAAG AGCCTGCCCT GGTGTTGTTT CTTGTGCTGA TCTTTTAATC ATGGCTGCTA GAGATGCTGT  TGTTCTGGTA TATTTATATT CTCATCTTTT CAACTTCCAT TACCACAAAA AAAAAAAAAG AGGAAAAATT TCATCTTTTT TTTTTTTTTG GGGGGGGGnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn GGGGGGGTGG GGGGTTGTTC CATCCTGTAA GTCTTCTTCC ATGAGCTTTT  GCCTACCAGC TAATTAGGGC GGGGGCAGGA GCAGAGATAG AATTCTGACT TTATTAGTTC CGAATTTTGA AAATACGACT TTAAAATTTA ATGTTTGATT CTAAATTAAA TATTTGTACA  TATTTAATGA ACGTTTTAAT ACGAACTACT TTGTTTGAGC AAAAGCTATT CGAAACCATA GCTGGACTTC TGGTTCCGTC GCCCCTGGGC AGGAGAAGAA TAAGGATATA ATCATATAAA  TATGTATCTC AGAGTAAGCT TAATTATTTT GTTTTTTGAT AAGGTCAAAG CAAGCTTAAT GTAAACCAAA TAATTTAAAT AATGATGGTG TTCGGAACAA CTTGTGTGTA TTTTGATTAT  GTTGTTGCGT ACTTGCTACC TCCCACTCGC ACCAGCATAG GTGATAGGAA GCTCTGCCCA TAAAAAATTA GACAGACGAG AAGAAATCAC ATATATTTTT TTTGGTCTCT ACCGAAATTT  AAGGAATACA AATAATTCAT TGGTATACTA AGTCCTTGAT CATTGTTCTG TATCATTACA AATTGAGGAG TGAGTAGGGG TAAAAGAAAA GGGAAAAGGA ACCCCAAATG TTGTACTAGT  AATTATGATG AAAAATCTCC TCTTATTCAT TTTCTTTTTC CTATGCTGTC TTTTGAGTTA CTTGGTAAAA CAGAGGATCT TATTTGTTTT AAACTTTTAC TCAGACTGGA GGTCCAAATT  GGGAAGTGAA GTTGGGAAGG CTAGATAGTT TAACAGCAAG TCAAGAAGAT TCAAACCAAA TCATGCCAAG TCCAAGATCA AATGCAACAT ATCTCATTGA TCTTTTCAAC AGATATAATC  TCTCAATCAA AGATCTTGTA GCACTTTCTG GTTCTCACTC CATTGGCAAA GGAAGATGTT TTTCTATTGT CTTTAGGCTA TATAATCAGT CCGGCTCGGG CCGGCCTGAT CCTACCATTG  AACCAAGATT CAGAGAAAAG TTAGACAAGC TTTGTCCACT TGGTGGAGAT GGGAATGTAA CAGGAAATTT GGATGCAACA CCTGAAGTAT TTGACAATCA ATATTTCAAA GACTTGGTAA  ATGGTAGAGG GTTCTTGAAT TCAGATCAAA CACTTTTTAC TAACCCTTTT ACTAGGGAAT ATGTTAGAGA ATTTAGTGTA AGTCAGGAGA AATTTTTTAA GGCTTTTGTT GAAGGGATGA 
TAAAGATGGG TGACCTGCAA TCTGGCCGCC CAGGTGAGAT TAGACGGGAT TGCAGAGTGG TGAATAGCCG TCGTCCGCGA GTTGAAGTCT TGTTTGAGAC TTCAAATAGA GGAGAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTATA GCCATTTTTT CTTCTTTCTC CTTATAAGCT TAGCTTTTGC AGCTATGGCT GCTCCTACAC TTAGGCCAGG TTTTTACACG GAAACATGTC CACAAGCTGA ATTTATAGTC  AAAGATGTGA TGAAAAAAGC AATGAAAAGA GAGCCCAGAA GCTTAGCCTC AGTGATGAGA TTGCAGTTTC ATGATTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCTT CTTTGTTGTT GGATGATACA  CCAAATATGC TTGGGGAGAA AATGGCTTTA TCAAATATAA ATTCACTGAG GTCTTATGAA GTTGTAGATG AAGTTAAAGA GGCACTGGAA AGAGCCTGCC CTGGTGTTGT TTCTTGTGCT  GATCTTTTAA TCATGGCTGC TAGAGATGCT GTTGTTCTGA CTGGAGGTCC AAATTGGGAA GTGAAGTTGG GAAGGCTAGA TAGTTTAACA GCAAGTCAAG AAGATTCAAA CCAAATCATG  CCAAGTCCAA GATCAAATGC AACATATCTC ATTGATCTTT TCAACAGATA TAATCTCTCA ATCAAAGATC TTGTAGCACT TTCTGGTTCT CACTCCATTG GCAAAGGAAG ATGTTTTTCT  ATTGTCTTTA GGCTATATAA TCAGTCCGGC TCGGGCCGGC CTGATCCTAC CATTGAACCA AGATTCAGAG AAAAGTTAGA CAAGCTTTGT CCACTTGGTG GAGATGGGAA TGTAACAGGA  AATTTGGATG CAACACCTGA AGTATTTGAC AATCAATATT TCAAAGACTT GGTAAATGGT AGAGGGTTCT TGAATTCAGA TCAAACACTT TTTACTAACC CTTTTACTAG GGAATATGTT  AGAGAATTTA GTGTAAGTCA GGAGAAATTT TTTAAGGCTT TTGTTGAAGG GATGATAAAG ATGGGTGACC TGCAATCTGG CCGCCCAGGT GAGATTAGAC GGGATTGCAG AGTGGTGAAT 
AGCCGTCGTC CGCGAGTTGA AGTCTTGTTT GAGACTTCAA ATAGAGGAGA GTAA 

Retrieve as FASTA