Entry information : LePrx23 (Solyc02g082090.2.1[2.3])
Entry ID 621
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx23 (Solyc02g082090.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx23 (Solyc02g082090.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx23
start..stop
S start..stop
NtPrx79-1A 570 0 1..321 1..326
NtPrx79-1B 567 0 1..321 1..326
StPrx39 473 4e-171 1..233 1..233
InPrx86 475 2e-170 19..319 28..328
Literature and cross-references LePrx23 (Solyc02g082090.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx23 (Solyc02g082090.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (303)
PWM (Da):   %s   36492.31 (34188.1)  
PI (pH):   %s   5.71 (5.26) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-324
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKSFVFLTAA LFLVAAVCAS AYDEDDLPYD YYSKTCPKLE CIVHKKMEEW IKKDYSLAPA LMRLHFHDCF VRGCDASILL DYEGSEKDAN VSKTLRGFEV IEDIKRELEK ECPKTVSCAD  ILTVAARDAT LAVGGPYWMV PYGRKDGTVS NAKEADQLVP MGHEVVTDLL ELFQSKGLNV LDLVVLSGAH TIGKTTCESL QYRLYNYNGT KKSDTRLDHL YLNYLERKCR WASEYVDLDA 
VTPKKFDVQY YKNLQKGMGL LLTDQLLYKD SRTAPIVTAL ATQPDEFGSL FSASMVKMGN IQDYLSNDGE VRLTCSRVNA PTKY* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 2, introns 1 and 3) and 3 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAGTT TTGTTTTCCT CACGGCGGCG TTGTTTCTGG TGGCCGCCGT GTGTGCTTCA GCATATGATG AGGACGATCT TCCTTATGAC TACTACAGCA AGACCTGTCC CAAGTTGGAG  TGTATAGTGC ACAAGAAAAT GGAGGAATGG ATTAAAAAAG ATTATTCACT TGCTCCTGCT CTCATGAGGT TGCATTTCCA TGATTGTTTT GTTAGGGTAC GTATTGATCT TACCTATATA  GTTTCACTAT CTAGGTAATG TACAAAATAA TTAAGTTAAA TAACACGCCT TTTGTTTTTT CTTTTTTTCT TTATAGTCAT TTGATTTTTG AAAATTTATT GATTTGACTA ATTCAGATGT  GAACCACGTT TGATCAGCTT TTATGGGAAT CGCTCCATAC TTGGGGATTT CCCATTTTTT GTAAGCTTGA ACATGATTGT TGAGGTTATG GTCAAGGGTG TTGAAGGGAT CTTATACGTC  ACATTCTATC CTTGTGCATT TTCTTGTTGA ATAATTTATG AGTTAAAAAA TGGATAATTT AACCAAAATA AAAAAAGTCT ATTAGAAAGT TTCTCTCTTT TTGGGAATTT TTATTTCATA  TTTCTTTCTA ACATTTTTGT ACAAATTTAC CAATTGATCT TAAATTTCTC ATTTTACGAT ATATTTTATC ATAAAAAAAA AACTCATTTT ATACTTAATT GATGACATAT TTTATAGCGA  AAAAAGTCAT TAGATACTTA GTACTACAAA ATTTCAATGT TCTTATTTCT TATTTAAAAA TTAATACGAT GCCTCATCAC ACCTTTATTC AAGTTTGAGA CACAACTATT CACCAATTAG  TAGATTGTAA TATAGAATGC ATTAACAAAT GCATTTTTTC TATTTAATTT CTAAAAATAT TGTTTATGGA TGGTACGTAG GGATGTGATG CCTCCATATT ATTAGACTAC GAAGGAAGTG  AGAAGGATGC CAACGTAAGC AAGACATTAA GGGGATTCGA AGTAATCGAG GATATCAAAC GAGAATTGGA GAAAGAGTGT CCTAAAACAG TATCCTGTGC TGATATTTTA ACCGTAGCCG  CAAGAGACGC CACACTTGCA GTAGGTGGTC CTTACTGGAT GGTTCCATAT GGCAGGAAGG ATGGCACAGT TTCCAATGCT AAAGAAGCTG ATCAATTAGT CCCAATGGGT CACGAAGTAG  TCACTGATTT ACTTGAATTA TTCCAATCCA AAGGATTAAA TGTTCTCGAC TTGGTTGTCC TCTCTGGTCA GTACTTTTTC CATTATCCAT GTTTTCTAGC ACTATTAAAT TTTTAATTGT  TAGGTTATAT ATCTAATCAT AGTCTAAAAC GTCAAATAAT ATTTCAATGC AAATTTTAGT TAATCGAACG TTAGATAACG AGGGATCAAA AGTAATATAT CCTTATTTCG AATTGAGCTA  GCAAATTTTT ACCATTAATG ATCATAAAAG TATCGTTAAA TATTCAATAT GATTCCAGAA GATCTAGTTT CGTTGCGATT ATATAACTTA ATATCAATTT TGTTTTAATT TATGTGTTAC  ATGTATGTAG GAGCTCACAC AATTGGAAGA ACAACATGTG AATCTCTACA ATACAGGTTA TACAATTATA ATGGGACTAA GAAATCAGAT ACAAGACTTG ATCATCTCTA CTTAAATTAT  TTGGAAAGAA AATGTAGATG GGCATCTGAA TATGTTGATC TTGATGCTGT TACTCCAAAG AAATTTGATG TTCAATACTA CAAAAATCTA CAAAAGGGAA TGGGACTTTT GTTGACTGAT  CAATTGTTGT ATAAAGATTC AAGAACTGCA CCAATTGTCA CTGCTTTGGC TACTCAACCA GATGAATTTG GAAGCCTATT TTCAGCATCT ATGGTCAAGA TGGGAAATAT TCAAGATTAT 
CTTAGCAATG ATGGTGAAGT CCGACTCACT TGTTCCCGTG TTAACGCCCC TACTAAATAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAGTT TTGTTTTCCT CACGGCGGCG TTGTTTCTGG TGGCCGCCGT GTGTGCTTCA GCATATGATG AGGACGATCT TCCTTATGAC TACTACAGCA AGACCTGTCC CAAGTTGGAG  TGTATAGTGC ACAAGAAAAT GGAGGAATGG ATTAAAAAAG ATTATTCACT TGCTCCTGCT CTCATGAGGT TGCATTTCCA TGATTGTTTT GTTAGGGGAT GTGATGCCTC CATATTATTA  GACTACGAAG GAAGTGAGAA GGATGCCAAC GTAAGCAAGA CATTAAGGGG ATTCGAAGTA ATCGAGGATA TCAAACGAGA ATTGGAGAAA GAGTGTCCTA AAACAGTATC CTGTGCTGAT  ATTTTAACCG TAGCCGCAAG AGACGCCACA CTTGCAGTAG GTGGTCCTTA CTGGATGGTT CCATATGGCA GGAAGGATGG CACAGTTTCC AATGCTAAAG AAGCTGATCA ATTAGTCCCA  ATGGGTCACG AAGTAGTCAC TGATTTACTT GAATTATTCC AATCCAAAGG ATTAAATGTT CTCGACTTGG TTGTCCTCTC TGGAGCTCAC ACAATTGGAA GAACAACATG TGAATCTCTA  CAATACAGGT TATACAATTA TAATGGGACT AAGAAATCAG ATACAAGACT TGATCATCTC TACTTAAATT ATTTGGAAAG AAAATGTAGA TGGGCATCTG AATATGTTGA TCTTGATGCT  GTTACTCCAA AGAAATTTGA TGTTCAATAC TACAAAAATC TACAAAAGGG AATGGGACTT TTGTTGACTG ATCAATTGTT GTATAAAGAT TCAAGAACTG CACCAATTGT CACTGCTTTG  GCTACTCAAC CAGATGAATT TGGAAGCCTA TTTTCAGCAT CTATGGTCAA GATGGGAAAT ATTCAAGATT ATCTTAGCAA TGATGGTGAA GTCCGACTCA CTTGTTCCCG TGTTAACGCC 
CCTACTAAAT ATTAA 

Retrieve as FASTA