Entry information : LePrx28 (Solyc01g006290.2.1[2.3])
Entry ID 626
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx28 (Solyc01g006290.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx28 (Solyc01g006290.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flower buds
Fruits
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx28
start..stop
S start..stop
StPrx09 646 0 1..327 1..326
NtPrx09-1A 530 0 1..327 1..324
StPrx20 518 0 1..327 1..324
NtPrx09-1B 511 0 1..327 1..324
Literature and cross-references LePrx28 (Solyc01g006290.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx28 (Solyc01g006290.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (304)
PWM (Da):   %s   35795.86 (33094.4)  
PI (pH):   %s   6.84 (6.61) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSFLRFILAI FFLVSINFGV SNAHYKLTPT FYDCTCPNVI HIVRDVMEQI QRRDVRAGAK IIRLHFHDCF VNGCDGSILL NNATGIISEK DANPNVGAGG FDIVDEIKTA LENECPGVVS  CADILALASE IGVVLAGGPS WQVPLGRRDS LTANRSGANS DIPSPTETLA VMIPQFTRKG MDLTDLVALS GAHTFGRARC RTFNQRLFNF SGSGRPDPTI DSNYLKTLQR LCPQGGNGGT 
FANLDKSTPD EFDNYYFTNL KNHQGLLQTD QELFSTSGSS TISIVTNYAN NQHKFFDDFV CSMIKLGNIS PLTGTNGEIR KDCKRIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 3 introns) and 5 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTTT TAAGATTTAT TTTAGCAATT TTCTTCTTGG TTTCAATTAA TTTTGGAGTA TCAAATGCTC ATTATAAATT AACTCCTACA TTTTATGATT GCACTTGCCC AAATGTCATA  CACATTGTAC GTGATGTTAT GGAGCAAATT CAACGTAGAG ATGTTCGAGC TGGGGCCAAA ATTATTCGTC TTCATTTTCA TGATTGCTTC GTTAACGTAC GTTAATTTCA TTAGAAAAAA  AAACATGATT TTCAATTTCT TTTACTAATG TTACTATTTA ACATATGGTT TCATTTCATG TGCATGTTTA TGTGTCTTGA TACATTACGT TATTGACAAC GTAAATAATT TTTATATTAA  CTAACAACAT TGTAGTTTAA CATATAATTA TGGATTATAT TTAACTAAAG ATTTAAATAA TATGCACTAA TAGTTATATT GTTCATACTC ATTAAAAATA ATGTTGTATT TGCGTTAAAT  CCTTAAAAAA TACACTATTT TGGAGGATTC AACACGGATT CATTGACGTT TTTAAAAAGT CCGAGCAACG TAGACAGATA TAATAGTATG TATAAGTTTA AGTTTTACAC ACTGATAAGG  TATAGTTAGA GAATAATTAT GCTATCATAG AGTTCAACTT GTAAGTACCG TTTATAGTGA TTTATTACGA TAAATATTTT TTACATTGTT AATATATCGT AACTCGGCAT ATATAGTTAA  ATTAATGGTG ATTTTAACTT TTGTATACAG GGTTGTGATG GATCAATTTT ACTTAATAAT GCAACTGGAA TTATAAGTGA AAAAGATGCA AATCCAAATG TTGGTGCTGG AGGATTTGAT  ATTGTTGATG AAATTAAAAC CGCATTGGAA AATGAGTGCC CTGGCGTTGT TTCTTGTGCT GATATTTTAG CTCTTGCATC TGAAATCGGA GTTGTTTTGG TAAATCACAC AATTTCGTCA  TAGCGTTTTA CTTTTACATG TATTTCAAAC GATTCTAATA AAAATAATTT TCTTAAGTTA AAAATTGATC GAAAAATAAA TATATTTTTT TACTTCAAGA AGGTAGAAGT TATAAGGTTT  GTATAATCAT TTGTCAGACT ATACACAGTA TAATGTTATT GGTAAGTCAA AAAGTGTCAA TATGTAATAT ATATAAATAA AAAAATATTT TTAACTATAA TGTGTAATTT TTCGAAAAAA  AGATACTGTC GATCAACACG CCTCAAGTAT ACGTGACTCC ACCGCCTGAT GTGATTTATA AGTCATGAAT TCAAATTGTA AAAGTAATCA TCTATGTTAA CGTCAAAATA AACTGTCTAC  ATTTCTTTTT TCTAATTCTA TCTGAATACG AAATGCTTCG TTTATCGAAC TATTTTTTTA AATTCAGGCT GGAGGTCCAT CATGGCAAGT TCCTTTAGGG AGAAGAGACA GCTTAACAGC  AAACAGAAGT GGAGCTAATA GTGATATCCC AAGCCCTACT GAAACCCTTG CTGTTATGAT ACCACAATTC ACTAGAAAGG GAATGGATTT AACTGATCTT GTTGCTCTAT CAGGTAATCG  ATTCGATTAA TTCAAATTCG TATAATATTT TTTTTTACTA TATATGAGGG ATTTTAGCAT TCGTTGTTAA GAGGATTATA ATTTCGGAGT CTGAACTCGA AATATCTAAT TAAAGAACAT  GAGGACCTTA GCACCCCCTC AATAGTAAAA TTTCATGTCG TATAATATTA GTCCGTAAAA AAAGAATAAC GTATTCCTAT ATCATTTTAC TCTTAACAAA ATAATTTATC ACCTCATAAA  TACCTATAAT TTATTTTAGC CTACAAGGTT CAAAAATCTT CGTTTCATTC TAAATTTTTT TGCGTCCAAT CAAACACCTT CACGTAGATC AAAACGAAGG AAGTACCATT TACCCTAACT  TGCCCATCAA TGTTTATAAA TACTTGTAAT TTGAAGTAGT TGTTTTCGTG TTATCTATAA GTCACTGGTT CGAATCGTAA ATCATCTACA TTACACCTCT CAATACGCTG CGATCTTTTT  TCGGTATTTA TTAACACGAA GTGCTTTGTA CATCAAACTA CCCTATGATC TTTTTTTATA CATTGATTAC GAGTAATCTG ATCGTATAAA TATTTTTTTT TTTGATTGTG TAGGGGCACA  TACATTTGGA AGAGCAAGAT GTAGAACATT CAATCAAAGA CTTTTCAACT TTAGTGGAAG TGGTAGACCT GATCCAACCA TAGACTCTAA TTATTTAAAA ACATTACAAA GACTTTGTCC  ACAAGGTGGA AATGGTGGTA CTTTTGCTAA TCTTGATAAA TCAACTCCAG ATGAATTTGA TAATTATTAT TTTACAAATC TTAAAAATCA TCAAGGGTTA CTTCAAACTG ATCAAGAATT  GTTTTCTACA TCTGGATCTA GTACAATTTC AATTGTGACT AATTATGCAA ATAATCAACA CAAGTTCTTT GATGATTTTG TTTGTTCAAT GATTAAATTG GGAAATATTA GTCCATTAAC 
AGGTACTAAT GGAGAGATTA GGAAAGATTG CAAGAGGATT AATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTTT TAAGATTTAT TTTAGCAATT TTCTTCTTGG TTTCAATTAA TTTTGGAGTA TCAAATGCTC ATTATAAATT AACTCCTACA TTTTATGATT GCACTTGCCC AAATGTCATA  CACATTGTAC GTGATGTTAT GGAGCAAATT CAACGTAGAG ATGTTCGAGC TGGGGCCAAA ATTATTCGTC TTCATTTTCA TGATTGCTTC GTTAACGGTT GTGATGGATC AATTTTACTT  AATAATGCAA CTGGAATTAT AAGTGAAAAA GATGCAAATC CAAATGTTGG TGCTGGAGGA TTTGATATTG TTGATGAAAT TAAAACCGCA TTGGAAAATG AGTGCCCTGG CGTTGTTTCT  TGTGCTGATA TTTTAGCTCT TGCATCTGAA ATCGGAGTTG TTTTGGCTGG AGGTCCATCA TGGCAAGTTC CTTTAGGGAG AAGAGACAGC TTAACAGCAA ACAGAAGTGG AGCTAATAGT  GATATCCCAA GCCCTACTGA AACCCTTGCT GTTATGATAC CACAATTCAC TAGAAAGGGA ATGGATTTAA CTGATCTTGT TGCTCTATCA GGGGCACATA CATTTGGAAG AGCAAGATGT  AGAACATTCA ATCAAAGACT TTTCAACTTT AGTGGAAGTG GTAGACCTGA TCCAACCATA GACTCTAATT ATTTAAAAAC ATTACAAAGA CTTTGTCCAC AAGGTGGAAA TGGTGGTACT  TTTGCTAATC TTGATAAATC AACTCCAGAT GAATTTGATA ATTATTATTT TACAAATCTT AAAAATCATC AAGGGTTACT TCAAACTGAT CAAGAATTGT TTTCTACATC TGGATCTAGT  ACAATTTCAA TTGTGACTAA TTATGCAAAT AATCAACACA AGTTCTTTGA TGATTTTGTT TGTTCAATGA TTAAATTGGG AAATATTAGT CCATTAACAG GTACTAATGG AGAGATTAGG 
AAAGATTGCA AGAGGATTAA TTAA 

Retrieve as FASTA