Entry information : LePrx29 (Solyc03g044100.2.1[2.3])
Entry ID 627
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx29 (Solyc03g044100.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx29 (Solyc03g044100.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx013]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Callus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx29
start..stop
S start..stop
StPrx02 660 0 1..331 1..331
NtPrx92-1A 577 0 1..331 1..330
NtPrx22-1B 566 0 1..331 1..332
NtPrx22-1A 566 0 1..331 1..332
Literature and cross-references LePrx29 (Solyc03g044100.2.1[2.3])
Literature Alcala,J. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx29 (Solyc03g044100.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (304)
PWM (Da):   %s   35920.04 (32829.5)  
PI (pH):   %s   7.94 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-331
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGYLQVFITS FLSISCVSIF MPNLVDAQLK TNFYAQTCPN VESIVRNVVN QKFKQTFVTI PAVLRLFFHD CFVEGCDASV IIASTAGNTA EKDHPDNLSL AGDGFDTVIK AKAAVDAIPS  CKNKVSCADI LALATRDVIQ LSGGPGYAVE LGRLDGLTSK STNVGGKLPK PTFNLDQLNT MFASHGLNQA DMIALSAAHT VGFSHCDQFS NRIFNFNPKN PVDPSLNKTY AAQLEQMCPK 
NVDPRIAINM DPITPRAFDN VYFQNLQNGM GLFTSDQVLF TDQRSKGTVN LWASNSKVFE TAFVNAMTKL GRVGVKTGKN GNIRIDCGAF N* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, 3 introns) and 17 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTATT TACAAGTTTT TATTACATCA TTTTTGTCAA TTTCTTGTGT TAGTATTTTC ATGCCAAACT TGGTAGATGC TCAACTCAAA ACCAATTTTT ATGCCCAAAC TTGTCCTAAT  GTTGAATCCA TTGTGCGTAA TGTTGTTAAC CAGAAATTCA AACAAACGTT TGTCACAATT CCGGCTGTTC TTCGTCTTTT CTTCCATGAT TGCTTTGTTG AGGTACATAT ATTGCATTAT  ATTTCGCGTT ATAAGGTCTC ACATTTATAG AGGGAACGGA GGCAAATGGA TCTTGTGCTA TTCCTTTATC ACATTGATTT AACTTTTTAA GGTTGAAATT AAGTCTAAAA TTCAGTTTAT  TGTAATAAAG AATCATAACC TTGACACATA TAACTGATTT TACATATTTT CTTCTTCTTT ATATTTAAAT TTGCTGTACT TGAGTCGAGG GTCTTTAGGG AAAAGTTTTT CTACTTTCAT  AAGATAATTA TAATGTTTGT GTGCATTCTG CTCTCTCAGA CCTCACTTGT GATATTTCAC TGTATATGTT ATTGTTAACG TTGCATATCA TTGATTCCTT ATCACTAATG TCAGGTAGTG  ACAGAGACAA AATTTAATTT TGCCAAGGGC TATTACAATA TAAAAGGAAA AAATAGACAT GTGTAAACAA TAAAAGGAGT CAACATATAA TATATAAATA TATATAAAAA AAAAATTTGA  CCTAGCTAAA CAGTGTAATT TTCTAGCTAA AGATGTCATT TGACACCTCT CGACATAAGG TGGGAAACCT CGTGTTATAT CGTTCAAAGC CCCATTTTTT ATTGATTCTC GTGTTATATT  TTACACGCTT TCATATTCAG TTAATGGTGT CTGGCCTTGT AAAAATGTCA AGCTTGTATG ATTTTAGACA ATCTTTATCG ACTCATATAT CCTCTCTTTT TTTTAATGTT AATGTAGGGT  TGTGATGCAT CGGTGATAAT AGCATCAACG GCAGGGAACA CAGCAGAAAA AGATCACCCA GATAATCTTT CATTGGCTGG AGATGGATTT GACACAGTTA TCAAAGCAAA AGCCGCAGTT  GATGCGATCC CAAGTTGTAA AAATAAAGTT TCTTGTGCTG ATATTCTTGC CTTAGCCACT CGAGATGTTA TTCAACTAGT ATGTACCATA CTTTTTGCAT CTTCTTTTCT TTAAATTGGA  TGATTGATAT TTGTATTCAG CCTCGGATAC TACATATACG TATAACGTTA TTACGTAGGA CACATGCATA TGTCTACTTA TTTATCTTTA TATAAATTCA AACATCTCTT TATATATGCA  GTCCGGTGGA CCGGGGTATG CAGTGGAATT GGGGAGATTA GATGGTTTGA CATCAAAATC TACAAATGTA GGGGGAAAGT TGCCTAAACC TACTTTCAAT TTGGATCAAC TCAATACAAT  GTTTGCCTCT CATGGTTTAA ATCAGGCTGA TATGATTGCC TTATCTGGTA ATTTTCTTAT ACTTTATTTA TTTCATTTTA TATGATATCG TTTGGTTTTT TGAGATTAAA AAATATTTTT  TATACCGATA TCAAAATAGT CATAATATTC TTAAAAAAAT ATCCAATCAT TATGTAATCC AGCTGTTAAA GCCCTCAATC CTCTATGACA GGCATATTTT TGGCATTTTA TAAAAAGAGG  AGCTAATATA GTCAATGGTG CCAATTAGCA TATTGGACTG ACTTGTCCCA CACGTAGCCG TCTCTTTCTC ATATAAAACA CATGCAAGAT GAATTAATAA ATACATGTAC GTTATATATT  AACGTGTGAA TTTCTAAAAA AAATTGATCG AAGGCTTAGT GGTAAGGACT AAGGAAGGAG TTAGAGGAAA TGCTTTCCAC TTTTTAAAGG GACGTAAAAT CTTAGAACTT TCATATTCTT  AGTTTTGGCT TCGCCTCTGC TAGACAGTAT ATTTTTTTTA AAAAATTTAC TGAATATGTG CATATATTTT ATTTAGAACC TAGTTATTAG TATAAGAAGT CAAATGCAAA ATCCATGAGA  TTGAAATTCT AACATGGTTG GAAGAAGTAT GTATGTATCA AACTTGGTTA TAATTGATTT TATCATGCAG CGGCCCATAC TGTTGGATTT TCTCACTGCG ACCAATTCTC GAACCGAATT  TTCAACTTTA ACCCTAAAAA CCCAGTGGAT CCAAGTCTCA ACAAGACGTA TGCAGCCCAA TTAGAACAAA TGTGTCCGAA AAATGTGGAC CCAAGAATAG CCATCAACAT GGACCCAATA  ACACCTAGGG CTTTTGACAA TGTGTATTTC CAAAACTTGC AAAACGGAAT GGGCCTATTC ACATCAGATC AAGTTTTGTT CACAGACCAA AGGTCTAAAG GTACTGTTAA TTTGTGGGCC 
AGTAATTCTA AAGTTTTTGA AACCGCATTT GTTAATGCGA TGACTAAATT GGGCCGAGTT GGTGTGAAGA CGGGTAAGAA TGGAAATATT CGTATAGACT GTGGAGCATT TAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTATT TACAAGTTTT TATTACATCA TTTTTGTCAA TTTCTTGTGT TAGTATTTTC ATGCCAAACT TGGTAGATGC TCAACTCAAA ACCAATTTTT ATGCCCAAAC TTGTCCTAAT  GTTGAATCCA TTGTGCGTAA TGTTGTTAAC CAGAAATTCA AACAAACGTT TGTCACAATT CCGGCTGTTC TTCGTCTTTT CTTCCATGAT TGCTTTGTTG AGGGTTGTGA TGCATCGGTG  ATAATAGCAT CAACGGCAGG GAACACAGCA GAAAAAGATC ACCCAGATAA TCTTTCATTG GCTGGAGATG GATTTGACAC AGTTATCAAA GCAAAAGCCG CAGTTGATGC GATCCCAAGT  TGTAAAAATA AAGTTTCTTG TGCTGATATT CTTGCCTTAG CCACTCGAGA TGTTATTCAA CTATCCGGTG GACCGGGGTA TGCAGTGGAA TTGGGGAGAT TAGATGGTTT GACATCAAAA  TCTACAAATG TAGGGGGAAA GTTGCCTAAA CCTACTTTCA ATTTGGATCA ACTCAATACA ATGTTTGCCT CTCATGGTTT AAATCAGGCT GATATGATTG CCTTATCTGC GGCCCATACT  GTTGGATTTT CTCACTGCGA CCAATTCTCG AACCGAATTT TCAACTTTAA CCCTAAAAAC CCAGTGGATC CAAGTCTCAA CAAGACGTAT GCAGCCCAAT TAGAACAAAT GTGTCCGAAA  AATGTGGACC CAAGAATAGC CATCAACATG GACCCAATAA CACCTAGGGC TTTTGACAAT GTGTATTTCC AAAACTTGCA AAACGGAATG GGCCTATTCA CATCAGATCA AGTTTTGTTC  ACAGACCAAA GGTCTAAAGG TACTGTTAAT TTGTGGGCCA GTAATTCTAA AGTTTTTGAA ACCGCATTTG TTAATGCGAT GACTAAATTG GGCCGAGTTG GTGTGAAGAC GGGTAAGAAT 
GGAAATATTC GTATAGACTG TGGAGCATTT AATTAA 

Retrieve as FASTA