Entry information : PpaDiOx01
| Entry ID | 6271 |
|---|---|
| Creation | 2008-07-11 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2008-07-11 (Marcel Zamocky) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: PpaDiOx01
| Name | PpaDiOx01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Alpha-dioxygenase [Orthogroup: DiOx001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Physcomitrella patens [TaxId: 3218 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6271' 'join(122886..122984,123697..123966,124088..124237,124342..124472,124584..124797,124933..125078,125212..125442,125549..125751,125863..126106,126218..126464)' |
Exons►
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Literature and cross-references PpaDiOx01
| Literature | Rensing S., et al., The physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants. Science 319:64-69(2008). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A9T3F4 |
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_159 (122886..126464) |
| EST ref. | GenBank: BJ942409.1 [Fragment] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Ppa.1843 [5' end] Ppa.13350 [3' end] |
Protein sequence: PpaDiOx01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (9 introns) and 59 ESTs (29+1+29). Ecotype="Gransden 2004". |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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