Entry information : PtroKat01
Entry ID 6419
Creation 2008-12-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-10-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-02-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtroKat01
Name PtroKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan
Organism Pan troglodytes (chimpanzee)    [TaxId: 9598 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtroKat01
start..stop
S start..stop
GgoKat 1100 0 1..527 1..527
HsKat01 1096 0 1..527 1..527
PabeKat01 1084 0 1..527 1..527
MnemKat01 1078 0 1..527 1..527
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6419' 'join(34708808..34708873,34718983..34719154,34720784..34720894,34721873..34722003,34722886..34722990,34723593..34723718,34726553..34726744,34727206..34727358,34731783..34731921,34734639..34734769,34738501..34738608,34741168..34741251,34741578..34741643)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 34708808..34708873 64 N° 2 34718983..34719154 170 N° 3 34720784..34720894 109 N° 4 34721873..34722003 129
N° 5 34722886..34722990 103 N° 6 34723593..34723718 124 N° 7 34726553..34726744 190 N° 8 34727206..34727358 151
N° 9 34731783..34731921 137 N° 10 34734639..34734769 129 N° 11 34738501..34738608 106 N° 12 34741168..34741251 82
N° 13 34741578..34741643 64  
join(34708808..34708873,34718983..34719154,34720784..34720894,34721873..34722003 ,34722886..34722990,34723593..34723718,34726553..34726744,34727206..34727358,347 31783..34731921,34734639..34734769,34738501..34738608,34741168..34741251,3474157 8..34741643)


exon

Literature and cross-references PtroKat01
Literature Chimpanzee Sequencing and Analysis Consortium. Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature 437 (7055), 69-87 (2005).
DNA ref. GenBank:   NC_006478.2 (34708808..34741643)
mRNA ref. GenBank:   XM_001147928.1
Protein sequence: PtroKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   527
PWM (Da):   %s   59541.62  
PI (pH):   %s   7.38
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MADSRDPASDQMQHWKEQRAAQKADVLTTGAGNPVGDKLNVITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITKYSKAKVFEHIGKKTPIAVRFSTVAGES
GSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDPI
FPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMVWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLVNANGEAVYCKFHYKTDQG
IKNLSVEDAARLSQEDPDYGIRDLFNAIATGKYPSWTFYIQVMTFNQAETFPFNPFDLTK
VWPHKDYPLIPVGKLVLNRNPVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEASPDKMLQGRLFAYPDT
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GGAPNYYPNSFGAPEQQPSALEHSIQYCGEVRRFNTANDDNVTVRAFYVNVLNEEQRKRLCENIAGHLKDAQIFIQKKAVKNF
TEVHPDYGSRIQALLDKYNAEKPK
NAIHTFVQSGSHLAAGEKANL*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 11, 12 introns). No EST. Isolate="Yerkes chimp pedigree #C0471 (Clint)".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTGACAGCCGGGATCCCGCCAGCGACCAGATGCAGCACTGGAAGGAGCAGCGGGCCGCGCAGAGGTACACTCTGTGCTCCCCGAGCGGGCCCGAGGGTCCGTTTAGAAAGCGGGGG
CGTCGGCAAGTAAAGGCCCGGCTTCCCCCGGGGCGGCGCTCGGAGGGACTGTACCGCGGCTCACTGGGCAGGGGGATCCCCTTCGGTGCAGACGGACTCTTACATTCGCCGGAGCAGGGG
AGGGGGGTTCGGGTAGTGGTGCGCGGGACTGCAGGCTTTGTTGTCCGCGACAGGCTCGGGTGGTTGCTTCAGAATTTTGCACTTTTGCCAACTGGGACAGAGGTCGCAGCTTGGGGACAG
AATGAGGGCTCATGGGGAAAGAGGCAGAGAGCTGCAGCTGCAAGGAAGTCAGTGAGGGGAGAAGTGGAACCAGGCTCTAACGGTGCTCTTCTTGAAATACTGTTTACACGCTTTCATAGT
TGTGGGGTCCCAGCAGGGCAAGGATTGTGTTTTACAATCTTGATGTCTCCAGCACCAGTCACAGTGACTGGTACGTACTATGCACATTATTAAACGACTAAATAAAAGAACTTTTACATC
CATTGTCTCATTTGCACTTCAGAATGTCAAGCCTAGCATTTTAGAGCTGGGGGGTGACATTAGGGATTGGTTAATGCGTTTATTCTATTCTTTGAGCACCTGTAGGTGCTAGGCACTGTT
CCGGGGCAAGGTGTACAAATTCCAGTGCGGTAAGAACAACACCCTTGAGAAGCTGAGAGTCTAGTCTGGGAGACGAGACACATAAACAGATGACTACACACCAGCGTGGTGAGGGCTCTA
ATACAGGTTATCTGTAGAATGTAGAGGGAGTGACCAGGTGGGCCGGACAAAGCAGGTGACATTTGAACAGGAATTTTTTTAAATGAGTAGGATTTTAACTTGGTGGTGGGGGAGGCATTC
CTGGCCTGTGCCCACGGGTGCAGAGTCTCAGAGGGCATCTATGAGGAGGTTGGATTAGATGAGACCGCATCTGGTCTGAGTCTACTGTTGGCAGATTGGCCCAGGGAGTCTAAAGGTCTT
GCCCTGTTCCCTGGCTGCTGGTTAATGGTAGAGAGAGGACTGCAGCCCTGTTTTCCCTATTCTGCCTAGTGCTCTTGCTCAAAACTGAGGTTCGTGAACTGGGGTATTAATGCTAAGTGC
TCATGGATTGCTTTAATGGTTCCCTGTTTGGGAAAAGGCTGCCATTCTCCTCCAAGGGCCTGGAAAATCTCCCCTCTTGGCCCTGTTCTTTGTTATATACCATTAGGTTGGTTCATGAGC
TCTTAAAGTAAACCAGAGAGAGGTAGAGTCTTAGTAAAGGATGTGCCACTACTTCGTGGCAGAGACAAGGTTAGAATTCAGCTTCTTGGACCCAAGACTCTTTCCTTACCCAGTGGGTGC
AAATCCTGGTTCACACGGAAGTTTTCATGAATACTTGGTGAATTGAGAAAAGTGTGGACAAAGTAGTGAGATTTTTACAAAACAAAATATTTTCTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT
TTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCGCCACTCACTGCGAACTCCACCTCCTGGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGG
GATTACAGGTGTCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGACTGGAACTCCTGACCTCAGGAGATCCGCCCGCCTTGGC
CTCCCAAAGTACCGAGATGTGTGAGCCACCGCGCACGGCCAATATTTTCATTTTTAAAGGACTCCCCTTTATTCTGAGACTAGCTGCCTTCTTCCTTGTTTGGGAGAATCATGAACTGTT
GAAGTCCCTGCTGTTGATTTACCTTACATAGTTGCCCATGTGAGAAATGGCTGACTCAAAAAGCACATCTATAGTTGGGAGGCTCTTAATTGAAATACAGCCATCCCCTTTGTCCATGAC
ATCTCAGGGCACTGTGTACATCGTCCTGATTGGCAGTCACATTGATGTCTTATTGTTCCTCAGTTTTAGCTGCTCTTAGTAAAAACCGCTTACTTCTTTTAGGCACTTCTCCCTCCCCCC
AGGGCCCTCCAAAAGGAATTATGCATATGCCTTATAGCCCATATAATTTTCAAACACTTTTTTTAAATGAAAAATTTCAAATATTCAGAAAAGTTGAAAAAATTTTGCAGTGTATATCTA
TATATCTGCCATTTAGATTCTACAAGGAACATTTTGCCCTGTGTCTTTTATTACGTTACTCCATCTGTCTGTCCATCCTTTAATTCATTCAAGTTGTTTCATGTATTAGCAGTTTGTTCT
TTTCATTGCTGAGTAAGATTCCATTATTTGAATATACCACCATTTGGATATCCTGTTGCTGGACACCTGGGCTATTTAATTTTTTTTCTATTGTAAGTCAAGCTGCTGTGGCTGGGCATG
AAGGCTCATGCCTATAATCCTACCACTTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATAGTTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAAGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACAACAAATAAAAG
AAGTGGCCAGACATGGTGACACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGTTGAGTTGGGAGGATTGCTTGAGCTTGGGCTGTGGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTACATGACTGCACTC
TAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACCCTGTCTTAAAAATGAAAAATAAATAAAGCTGCTATAAAAATTCTTACATAAGTCTTTTTGTGCACAGGTGGTTTTATTTCTCTTAGGAAATACCTA
GGAGTAGATTTATTGGGTCATAAGGTAAGTGAATGTGTTATGAGAAACTGCTGAGCCTTTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTATACTTCATCAGCAGTGTATGGGAGTTCCAGTTGCTC
CACATCCTACCAACTTTTGGTGTTGTCAGTCTTTTACTTTTAGCTGTTGGGTGTGCAGTGGTATCTCATTATGGTTTTAATTTGCTTTGCTCTGATGACTAATGATGCAAAGCATCTTTT
TACATGTTATTGACCATTGGTATATATTCCTTTGAAGTATATGTTCAAATTTTCTGTCTTTTTAAAAATTGAATTGCTTTTAAATTATTGATTCATAGCCCATATTTTAAGTTCTATCAT
GTGGAATCATGTGTAGGCTAAGTGTTATAATAATAAATCTCAACATGTATCATGGTATAAACATATTAGAAATTTATGGCCGGGCGCGGTGACTCACACCTATAATCCAGCACTTTGGGA
GGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAAACTAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATC
CCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGATAATGGCTTGAACCCTGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATCCTGCCATCGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAA
AAAGAAAAAAAAAGAAATGTATTCCTTTCCTACATGAATGGCCCAAAGTGGTTTGAGGTTGAAGGAGGTGGGTGGGTGCTCTGCTTCCCACAGTTATTGAGGGCACCAGGCTGAAGGAAG
CTCCCCCTTGGTCAACACATGGCTTTTATGGGCGTCACTGTCCAGCACAGAAGGCTCAAGAGCATGGAGAAGGGTATATGAGTGTGGGAAGGTTTAGGGTCCAGGGTCACTGCCACTTAC
ATTCTGTTGGCTAGAACTCTGTTACAGGCCACACCTGGGGTAGTCTACCCCCTGTCCAGGAAGCTGACTCTACTATATTATCCAAAGCGTACATTTCATATTTGGTGAAAATCTGTCCAG
CCATTTTCTTGTGATGCGGCAATGGACATGCAACATAATTTCTTTTTAAAGAATATGTCATTTTTACTTTCTGACATTAAGATATTCTGTTAGAAAATTATGACAGTAACAGATGGTATT
TAAAAAAAATCTCCCCTTGCTTGGTAAATGCTTTTATCTAAGTGGGCAGCTTTGTGCTAATATGCTCTCTTCCACTTCCCAATTAGTTTTGATGCTTTACTGATCTAGGAGAGCTTTACG
GTTTGGGACTACTATAGGAGAACACTCTGTTGCCACCTCTCTCAAGAATCAGAGTGTCCTATTTTGGAAACACAGTCAGCCAATGTGAAAGCAATTTATTGGGCGTATCTTCTGTGGTCA
GATTTGGTTTGCTGACAGGTGAATTGGGAGTTTTGTAAACTTTAATAAGTGAGCATTGAGTCAGATGTGTTCATGAGTATGACCTCGATCCACTTAAAAATTCTTATTTCTTTTTCTCTC
TTGGCAGGAGGGAGGTGGTTGTGCAGGTATTCCCAGCCACTTTGAAGGGAACTTAAATGGGAACTTTATTGCTCGCTGCTTAGAATGCCATGGGCTCTTCTTTTGAGATACTTACCTTTA
ACCCATTTCCTGTTTTTTTTTTTTAAGTGCAGCTTGCTGCCAGTGCTCTTTTCTTGGGGGTAAATGGGAAATGTTAATAAGTAGCCTCTGATCCCTTTAAAATGGGAGAATTTGACCATT
TGAAACCTTACCTTTTTATACAGTTCTCTTATTACCTGGGAGAGAGGTTAAGTCTTAGACTATCCATTTCTGTCAGTGAGTTGCCTATGCATTATAGCCTGTGAGGGTCTACATTTTTTT
AGGGTAACCCTGGTAATAACTGCGTTGATGTTACACTGCCAACATTTGGGATGGAGAAGGGGTGACTGAGTGACTTAACCCTTGGTCCACATGTGCTTTCATTTCTCCTGAAATATACCT
AGGTATGGAATCGCTAAGTCATTATGTGCAGTGGGAGAGACTATGGGAGATGGGACAGAAATTTTTAAGGTTTCATTTCTTTTTCTTAGCTTTTGCATGGTGGGTAGGTCTATGCAAACC
TACCCTCAAAGTCTGAGGAAGCTGAGAGGCCAAAGAAAGAGGCTGACAAATCAAGTTTCTCAGAAAGAAATGTTTAATACGGACTTAGGACCAGAAACCATGTCTGTGTCTTGCGTGTTG
GCGGACAAGATGGTGGATCCCATACCATTACCCCTCAGACCCAGGGCTTAATACCATAGGGAAGGGCAATTCAGAAGGGAGGTATGGCATGACTGAAGTATGATAATGTCAAGGTTGTTT
GACCTCAGGGCAGGATTTATAGTAAATAGGGGCTCTTTCACAAGGAATAATAGATAAACTGGAAATCTTAAAACTGGAGTTAATCAGAAGTCAGCATGGTGGATCAGTATCTAAGATGGA
ATTGCTTTAGCTTCCACAGCAGTCAATATCTAGACCACCCTTATTATTTTCCCACAGACTAAGAAATTTGAAGGTCAGGACAGTCTTTGGTTTCCTGTAAGTGGGTGTATACGTTGTAGG
CACTTGAATCTTTGTTGAATAAGTGGAGAATGTTAGGCAGTTATTTGCTAGAAAACGCTAGGCACATTCTTTATCACAGAATGAAAAGACGTCATTATGACTCCTCTGGGACTGACGGGC
AATTTGCATTAACCAATCTTTTAATTAAAAGTGGAAGAATATGTTTAGGTTCTTGAAACTTCTGTGAGTGAAGGGAACTACTAAGTGGAAAGTGTAATATGTTGATAAAATATTTCACCA
GATGAAGCCAACGTTACTCCTCCCAGGAAAACTTCTTCATTTATGTATTAGCTCTGGCCAAAAGAAGCCTACAAAGGCAGCAAAGTCAAAATAGAATTTTACTTTAAGTCCCTACCTCTA
ATAATTGTGCTAGTTTTTAGCCAAGCTAATTTCTGTGGCAGTTTTCATAACAAGTTTGTCTAAAGGTGTTTGATCAGAATTTATAAATTAAAATATTTCTCTCATTTTTTGGAGGGGCGA
TGCAGGGAGAGGGATAGACTGTTGCTGCTTCCTCCTGCTTGTTAGAAAGGCTCTTGGCCATATCATATTGGTCCGTGGTTTAGTTTATTTGCATGCTGAATCCACACACATTTGTTTTAT
GTTTGTTAGTATATTGAGCAGTGTATTAGGGATCAGGGATATAGATGTAAAGGGAGTACACAGTCTAGAGAGGAAAAATAGTGACAGGCTGGGCGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAG
CACTTTGGGAGGCCAAGATGGGCGGATTTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACATGATGGAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGATGGTGGT
CGCCTGTAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGACGGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGA
GACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAAAAACAGTAACATAAACAGGCAATTACAATATTTTGTTATATGGGGCACAAGAAGATGCCCTTGGCCCTGCTTCATGAGTGGTGTGGGGCAGTGTAG
AGAGAGCAGTTCAGGAGAGGTACGTATGGATGTCATGGGAGCTAGCAGCCAGGAAGATGTAAACATGTTAACAAGGACCTCTCCAGAGAGAGGTCTTAAAATTGTCCAGCCATAGAGAAG
CTTTTCTCTCTTTAAAAATATTCTGGCTCTAAAGTTATTCATTGAGTTAAAAACAATAATTGCAAGTTGGAGGAAATCTCTTTGCCTGTCCTTACGTGTTACATGTAACAAGTAAACCTG
TGCCACAACACTGACATCTCTGCAAAGTTACTTAAGTTTTCTGAGTTTGTAGTATCGCCCATTAAATGGGATTAATAATATCGATCTCCGGATTATTGACAGGCTTAAGTGAGATAACTT
GCGTGGTCCATTTTCTAGCCCCACCCTCTCATTTCATCTAGTAAATCTTCATTGCATTAATTATTTTCAACTTAAATACACCGCATCCTGCTCCTCACCTTCTAATATTAATAAATACTC
TATCTTTCAGGTTAGATCAGTTCCTCTTATCCAATGTTGCGCTAAACATCCCCTGAAGTTGGGGGATCTTTTCCTTTCTAGTTTTTGCTCCCTGGCTTCCCTTTTCTGTTGCTGACTGTT
GAAGCTTTCCTGCCCCACTGGCTTTGAAGGTAAATTGTATATACATGAGCTTGTGGGGAAAGCTGTTATATAAATGAAGACAATTGATCTAACTATTAGAGTGGGGAAATGGAAGAGATT
CTGAAGCCTCCATTTGTAACTTAAAAACTCAGGTTTCATTTCTTAACAGGATTGATGTTAAGGAGGGGATTCCTTCATTGGGCAGGAGGGAGGACTGCCATAATTCCAGCATTCCCACTC
TTAATAGTCAGTGTCATCAGGAAAGACCACCTCAAGCTTTAGTACTTTATTCATTTATCCAACTCTGCACCTGCTGCCTTTGGGTGTGGTATTTATTCTTGACCATATCACCCTGACCCG
GTAACCAGAAGGGAACATGTGATGTGCTCTCATCTCTGCCTTAGGGGCAGCTCCCTCCCCACGTTAAGAATGCTGGCATGTAAATAACACTCTCATCTGTTTAGCGTTCCTTTTACTGAG
CTTCTTGGTATCTTTTCTCATACTTGTACCTTTTATGGGATGTCCCCCCCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCAGCTC
ACCGCAACCTCCGCCTGCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGTCACCCCTCCACTGCACCTGGTACTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG
GTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCTGCCACAGCCTCCCGAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGGATGTCCCTT
TATTTTTTAAAGGCTGCCTTAAATACCTTGTTTGTATGTTGAAAAGAGCATTTAAAGAGTGAACAGATTTGGTTTGCTCTGGCTCTCTAATTATTTTAACTTTGTTATCACCCAATAGTT
CTAGGTTAGTGGTTTTCAATCCTAGCTTGAACAGGAATCATTTAAAAATAGCCCAGGCCTCACCCAGGGCACTTCTATCAGACATCTCTAGGGGGGATGGCCCAGGCATCAGGAGGCTTT
AAAAAGCTCCTCAGGTGATTTCAGTGCATTGCCAAGGTTGAAAACCAAGGCTTTAGGTTTAAACTAAAGGTGAAGTTGCTCTTTTTCTGGTTCATTTTCTACTTTAGAAAGCAGAAATTT
TTTTTCTGGTTCATTTTCTACTTTAAATTAAAAATAAACCTACAGAGGGTAACACATATTAGCACGTCACAGAGGGTCACACGTATTAGCAACATATGTATCTTCAAAAGAGTGATGTGA
CTGGGTGGTAAGTGTTGATTGGACCCTTAAACTGTGACAGTTTAGAAGGGGCTTTGCTAGATGGGTTTAGGGACAGAGATGGTAGAGTGAGAGAGTGTGGATGGAGGAGTATGCATCTGT
CATGATTACTAGAAAAATAAAACTTCAAATGCTTTGCTCCTTCTGCTGCGAGGTCATGTTCTCACAGCCAGTGAAGTGACAGCATATATGTGCTGAATGTGTGGCTTGCATTTTACATTT
AGCTCTTTTAATTCATGTGTTAACCTTAGGAGGTACTTATTATTCTATTTTGCAGATGAAAATGGAGACTCATAAATAAGTAACTTACCAGCAGCTACATAGCTGGTAATTGGTAGAACT
GGAAGTTGGACCCAGGCTCTAGTGCTGGCACTCATAGTTTCTCCCTGCTGCCATATTGGCCTCTTCCTACTTGGATGAAGATATAACTCTAGTGGCAAGGGCATTTACTAGTGTGTGAGA
AGGTCTTGTTTATTCGTTTTTGCAAATTGCACGGTCTCCTTTATTCAATGTCTTTTTTCAAACAGCTCACAGATCTTTTGTGGTTTTGTAAGTGCCTACTCCCCACCATATTGCCTTCTA
GAGAAGAGGCAGGAATTTATTTTAATGTACAGGACAGACATGCATGGGGAGTAAAACTACAGACTCCACTCTAGGTGTGTGGAAATACTAAAAATAGTGCTTTTCTCTGTGTGTGAAGTT
GGTCTGTTGAGTTTTGTCATAGACAGCGTTGAGTTCCTCTCCCAGGTGGAGGTGGCATAGCTTTGCGTCACCTACATGTCTCTCCTGATTTCCAGTGAGCCAGGGAAGACACTGCAGAAG
CAGTTGTCTGTGGTCAAAAGTATTCTCTGACCGTGGAACTAGATGAAGCTAAGAGCTTCCAGGATCATGTGGGGCTAGAAGAATGCCGCTCTAACCCTAGAGGAGGGACAGCTGAGTGTC
TTCTGATGTAACTGAAATTGGAGAATCAGGTGGATTAAAATTAATTATTTATTACAGTAAAATAACCTATCCCATTTCAGAGACATTTGCTATCTTTAAAACATTAATACTATAATCCAC
CTTACCAGTAACAGTTTACTTTTAGTGACAGTGAAAGCCATTGACTTTTTTTTTTTAATTGAAAAGAGATGTTGCAAATAGCTGCTGTACATTGCTTGAGATGCACTAAACAGGGTAGCA
CACTTGAAGGTCGTGGCAGTAATAAAGCGTTTGTAAGTTCTGAGTAAAGTATTGACCAGCACAGCTTCCCTGGAGACCATCTTCTCATTGCGGGATTGGACGTTTCACTGTTAAGCTTGT
AGGACGCTTTTGTGCACCTCTCTGACTGGGAGCTTTGCAGAACCCAGTGGCTTTCTCTGGAGCAGGTGCTGAGCACATTTTCAGGCTCCAAAATCATCTTTCTGCTCTTCAGAGCAAGTT
TCTTAGCAGATTGGTGTCGAGATTTGTCAAGGGTTTCTGGGGCATGACTAAAAGTTTCAGGCAATAGCCCATCTTGTCAGATTTTAGTACTTTGGACACAGGAAATTAAAAAAGAGGGCA
GATGGTATAAACATTGCAAAGCTATGTACCCGTGACAGTGTAAATAAAAGGTTTGATTGTGCTAACTCTTCTGCACTTTCTTTCTGTGTTTCTGTAGAAAGCTGATGTCCTGACCACTGG
AGCTGGTAACCCAGTAGGAGACAAACTTAATGTTATTACAGTAGGGCCCCGTGGGCCCCTTCTTGTTCAGGATGTGGTTTTCACTGATGAAATGGCTCATTTTGACCGAGAGAGAATTCC
TGAGAGAGTTGTGCATGCTAAAGGAGCAG
AGGTAAGTGCTGTGTTTATTTGCTGTAAAAGATTGTTTCACAGCACCTGGGTCAAGTGTTATTTCCCAAAGGATTGGAAGACCTTTAACAC
AAGTGCCAGATCTCCATTTGTGGGAGAAAGGAAAAACATCCAGCAGTAGGGAAATTAGTAAATAAATGATGGTTATTTCCTCAGGTTAAACATTATATATAAAATTGTTTCTTTTAAAAA
TAGCAATCTTCCATTTCTCCCATCATTGAAGGAATAAAAATACAATAAGTCCTCACTTAACGTCAATAGGTTCTTGGAAACTTTGACTTTAAGCTAAACAACATGTAATGAAACCAATTT
TATGATAGGCTAATTGTCATAAGCAAGAGTTAAGTTCCTATGGCATATTTCTGATTGATAAAACATCACCAAACTTCTAAATAGAAGACTCAAAATACATCTTATATTAAACATTGAAAT
AAATGTGAGCCGTACATACCTTTAAGAAAGATTAGTAAAATAAGATAGTTATTTACTAGCTTATTCCAGTTCAAGGTGGTGGGAGGCCAGAGCCTGTCCTGGCAGGTTGGGGTACAAGGC
AAGAGCCAGCCCTGGACAGGATGCTGTCCATTGCAGGGTGGACTCACATTGGGACCATTCAGACATGCCAGTTCACCTAACACGCACATCTTTGGGATGTGGGGGGAAGCTGGAGTACCA
GGAGAAAACCTATCTAGACATGGGGAGAACATGCAGACTCCACACAGATGGTGGCCTCAGCTAGGAATAGATTTTTTTCTCATCAACGTTGTAATGAAACAATGTTGAACAAAACAATGT
TATTTGAGGGTCTGCTGTACAGAAATACAGACATAGACACATGCACTGCAATTGCAACTAAGTTTAAATGATGTACTTATTGGGTAATTACTGGAATGAGCTGCAAAATTTGGGGTAGTT
ATGTTAGGGTGGTGGGTTTGTGATGGTTTTTCCTTTCTTTGTTTCCAACAATTTCTGTAAAACTTTCTTTATTGCTGTTATATCAGACACAAAAGATGGGGGTGGTATTTGAAAGAAAGT
GAAAAACTCAGTTGGAAAAAGAGCTCCACAGAAAGGAAGTTTTTCTCTTAGCTTGCTGACTTGGACTTCCAGTTAGGACTTCTGCATTTCTTCATCTCTTCTTCCTGGATAAGGCTTCTT
CCCATCTTCTCCAGTGATTTGTGTGTATTTTTCCATCTTGACTTGTTTAGTTTATTGCTTGCTTTGTATCATCGTTGCTAAGTGTTGAAAAGATTCTTTCTCTTATGTTTTCATCTCCTC
TTCTCTCTGTTCTTCTCTTTCTCTCATAGGTCCTACCTGTACTTCAGGCCCGTCTGAGACCCTGTGTCCTTGGGCCAACCTTGATGACTTCTAGCCTCACTCACCTCCTTCTCTTGGCTC
CAGCTATGTGGCATTCAACTTAGCACTGAATGATAGAATAGGGCTTTGCATTTCACCCTCTTTATTTTGTGTTTGGGCATTTCCCCTTCCTCCAACATACTGGAAGCTCCCAGAAGGCTG
GTGCTAACCATCATTTTCTCTTGTCACCCAGGTGCCTGTTGAGGACCTGAATGTCTGAGTAATGGTCTCATGGTAAGGATTTCTGTGTCTTTCTCGTTAGGGGCCTTTGGCTACTTTGAG
GTCACACATGACATTACCAAATACTCCAAGGCAAAGGTATTTGAGCATATTGGAAAGAAGACTCCCATCGCAGTTCGGTTCTCCACTGTTG
TGGTAAGTTGGTTTATTGGTGTGATTGGT
ATGGCTTAACTCAACTTCACCTTTTGGGGATGTTTATAACTTAAAGAAAAAGTTATTAGAAAATAGGAAGCAAGCACTTCTCCAAGTTATGGCAAGGTTTTACAGTAGAAGACATATTTG
GAGACACATAGGAAGTTACTTGTATTTCTGTTTGTTGAGATCTTAGGAAATCACACTTACACAGAGGCTACCTCTGCAATTCTGTGACATTTGGAAAGAGCTTTCCTAAAAGTGGTTGCC
TCTAACAGAAGAATAGAGTGGAAATCTTATTTAATAACTATGCCTACAGCTGACCTTTATTGAGAATTAATTCTGTGCCAACTGTGGTTAGGTGCTTTACAGATATAATCTCTGATTTGT
AGATCTACTTTGCAGAGTGGGGTTCTTTTTATTTTTGAGAGGCTAAGTGATGTTTCTCACGTTACAGAGATAGTATTAGAGCTATCATACTATATTTCAACATACCTAGTGCTTCACTAG
TTCCGTTTCTGTGTCAGTCTCTGCATTTTAAAAATACTGTGGAATGTAAAAATAAATGAAATTAAGAACTAAGAACCAATATTTTAACTCATTTTCTTAATGTTAACCTCATCATTTTGA
CAACTCACTTATTCTGTTTGTCACTACTTTAAGCCTCATAATTATTTTCTTCCCTTATTTTAATTAAAAGTTCAATTACCTGTTTGAACAAAGTTATCTTATTATGGTAAATGAATGACA
TTGTCAGCTGTTATTACATGTGTTCTCTTATTGCTCTCAATTAATTATTTTGTTTGATTTGTGGACTGAATTAGCTGGTGGGTAGGAATAATAACCTGGGCACTTAAATACCTAATTTAG
TTCTTGGAAGTGGATTAGAAAGGATGGATCCAGGTGCTTCTTTATGTCTCCAGGCTTCTTGGATGCAAAGTGCTGTGGCTTATGCTTCCTGTTTCCATTTGAATATTGTAGCTGGAGAAT
CGGGTTCAGCTGACACAGTTCGGGACCCTCGTGGGTTTGCAGTGAAATTTTACACAGAAGATGGTAACTGGGATCTCGTTGGAAATAACACCCCCATTTTCTTCATCAGGGATCCCATAT
TG
TGGTAGGTAATAGAGTATTTTGCACTCAACAAATGTTTGTTGACTTAAATTGATTTCAAAGAGGTTGGCATTTGAGGAGAAGCCGTGGGAAAGGCAGAAAGAAAAGAATGTGAGTTGT
CTGGACTACTTTTTTCAACACATTTTTCTGTATTTAATAAGATAAAGTAAGAACAGTTACCATTGGTCTTAGATTTGTCATTTTAAGACAGATTGACTTAATGGGAAGTGAGTTTAGTTT
TCCTTGCAGAGCATCGAAGATTAGTAAAAAGAGGGACTTTACTTTGGAAACAAGCAGAGGGTGTCTCTACATGCTCTGAGTCAGCAGGAGGGGGTGTGTGTGCGTGCGCGCATGCGGGAG
GGTGGGTATATTTTTTCCGTGAAGAAATACTATAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGATCACTGGAGTCCATGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCATA
TCTCTGCAAAAAAATACAAAAATTAGCTAAGTGTGGTGGCTCATGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGATTTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAAGCTGCAGTGAGCT
GTGATCATGCCATTGCAATCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGACTATAGTTTTGAGTATATTTGAAATACTTTAGGGTATCTTAGATGCTA
GTTGTCTATGCTGAGTAAATTTCATATTATGGTTTGGCAGTTTAAAATTCTAGGATTGTATTTAGAATTATAATCCATAAACCTAGTAATAGGCATGTATAATGAAAGACACCATAATTC
CTGTAAACTTAGTTTTCGGATTTTTTTCTCTCTTTTTTCTATTTAGTTTCCATCTTTTATCCACAGCCAAAAGAGAAATCCTCAGACACATCTGAAGGATCCGGACATGGTCTGGGACTT
CTGGAGCCTACGTCCTGAGTCTCTGCATCAG
AGGTATGAACCCTTTTTTGCCATTGTATTATATCACCTGGGATGCAGTGTTTAATTATGCCTCTTCATAAAATGTCTCTCCAGTTTTGG
CTATTTTATTGGAATCAGCTTCCTCAGATTTCTTGATCATGAAGAGTTTTGTAGTAACTGGCTTTACTAATCATCCCCCATTCATTGGCCTTAAATGATGATGATGATGATGATAGATAG
CTAGCAACATTGTCAGTTGATATTTAGCAGTAGTAAGGATGAAAGTCTGTAGTGTAAGGTAAAGCTCTGTATTAAGGAAGTGGGGGGAAAGTAGTACCAAACAAATTTGCTATGCAAATA
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AGGTAAGCTGGGAGCAGCTTGGCCATGCAGAGGCTGTGTGTGTTGGGTTGGAGT
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TGATTAACCTGCTCATCTTGTTCTTTTAAAACAGAATGCGATTCACACCTTTGTGCAGTCCGGATCTCACTTGGCTGCAGGGGAGAAGGCAAATCTGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTGACAGCCGGGATCCCGCCAGCGACCAGATGCAGCACTGGAAGGAGCAGCGGGCCGCGCAGAAAGCTGATGTCCTGACCACTGGAGCTGGTAACCCAGTAGGAGACAAACTTAAT
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