The peroxidases and oxidases database
Entry information : LePrx50 (Solyc05g010330.2.1[2.3])
Entry ID 649
Creation 2006-08-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx50 (Solyc05g010330.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx50 (Solyc05g010330.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx023]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Germinating seeds
Radicles
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx50
start..stop		 S start..stop
StPrx75 673 0 1..347 1..347
NtPrx93-1A 622 0 1..347 1..345
CroPrx17 620 0 15..341 1..325
NtPrx93-1B 616 0 1..347 1..345
Literature and cross-references LePrx50 (Solyc05g010330.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
EST ref. GenBank:   AW625192.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Les.23099 [5' end]
Protein sequence: LePrx50 (Solyc05g010330.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347 (312)
PWM (Da):   %s   38491.48 (35210.7) Transmb domain:   %s   i12-29o
PI (pH):   %s   7.29 (4.82) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-337
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFINFCQSR IVIFEFLVLV FIGIYFSKLN GISDSHLSLD YYKKTCPSVE GIVRKEMECA CLSDPRNAAL ILRLHFHDCF VQGCDGSVLL DDTVTLKGEK NAPNNKNALK GFKIIDRIKN  RIESECPGTV SCADILTIAA RDAVLLVGGP YWDVPLGRKD SKKAGYELTD TNLPTADEGL ISIISKFISQ GLSVTDMVAL SGAHTIGKAR CVNFRNRIYG DFKMTSTSYI NPISSSYLTK 
LKSLCPPIEI NGSSDNNETS MDNITPNLFD NSYYHVLLKG EGLINSDQQL YSSFLGIQTK KIVEKYATNT IAFFEQFAES MVKMGNITNP ETYVNGEVRK SCRFVNT* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 3 introns) and 4 ESTs.
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTA TTAATTTTTG TCAATCAAGA ATTGTGATTT TTGAGTTTTT GGTTTTGGTA TTTATTGGCA TTTATTTTAG TAAATTGAAT GGAATTAGTG ATTCACATTT AAGTCTTGAT  TATTATAAAA AAACATGTCC TTCTGTAGAA GGAATTGTGA GGAAAGAAAT GGAATGTGCT TGTCTTTCTG ATCCTCGTAA TGCTGCTCTG ATTTTGAGAT TACATTTTCA CGATTGTTTT  GTTCAGGTAC GTAAACGAAA ATATGAAGAT GTTCTCAATT CAATTTATTG TAATTGTTAG ACTGTACGAG CATTTCATTT AAAAGGAAAC AAATAGTAGA GAGAGGTATA CGTAAATGTG  GTCAACTTTT AAATACACCA CAAAGTGGTC ACCGGATGTA AATTTTCAAC ATGTAAAGAT TTGAAAATAT ATGATTTTTA TTACTTAATT ATATTATATT TGAATGATCT CTCCTTTCCT  GTGACCTGAT TCTTTTGCAT AAGTTCAACA TATATTTACA CAAATAACCA CTTAGTGAGT CACTTCTTTA AAATTAGACA AGTAGTCTGA AATAAATCTA ATTTTGAAAA AGTGGTCAAT  TTTTAAATAC AAACCAAAAG AGTTGTCAAT TGGTTTAAAG CATAAAATTC GTTGTCAAAC ACATGGAAAT ATTTCGTTCA CTTTATAGAT GGTGATAAGA TTTAAACTTG CGAACATTTT  ATCTGCACTG ATATCATGTT GAATTGTACT GTAACAGGGT TGCGATGGTT CGGTATTGTT GGATGATACA GTGACATTAA AAGGAGAAAA GAATGCTCCA AACAACAAAA ATGCACTAAA  AGGATTCAAA ATTATTGATA GGATTAAAAA TAGAATTGAA TCTGAGTGTC CAGGAACTGT TTCTTGTGCT GATATTCTAA CTATTGCTGC TAGAGATGCT GTTCTTCTGG TAATTATATT  CTTAGAAATT AAATTTATTT ATGATAATAT ATAATATTAT TAAATTATTA GTGTTTAGGT TACTTTGGTT ATCATTTAAA TAAAAATATC ATCATATGAA TAAGGGTCAT TTGAGTTTAT  ATACAGTTAA ATCTTTTTAT AACTAGGTTA TTTGTCTAGA AATATTGTTA GAATATATAA TATAACATAA CAGTCTGATT GTATGTACAA CTAAGATGCG ATTTTTTTGA TACATTATAT  TCTTTGGAAT GTTGTTTATG ATATTATTAG AATATTAATG TTTACTTTTT TAAAATTATG ATTATAGGAA TAATTAAAGT TGTATTAATT AATTAATTAA TGATGTTTAT TAATTAATTT  GTGTACTAGG TTGGTGGACC TTATTGGGAT GTTCCATTAG GTAGAAAAGA CTCAAAAAAA GCAGGATATG AATTGACAGA TACAAATCTT CCAACAGCTG ATGAAGGATT AATTTCTATT  ATTTCTAAGT TTATATCACA AGGACTTTCT GTTACTGATA TGGTTGCTCT TTCTGGTAAG CATTATTTGA TATATATAAT CTTCGTTTCA ATTTACGTGA CACAATTTGT ATTTTGGATA  GTAAAATAAG AAAAAAAATC TTTGATTGTA ATTAATTATA TGTATACTTA TTACCTAGTT TCTATATATG TAAATTACTT TTCAAAAATC TTAGCGAATA TATGTCTAAA TATATTCACA  ATTAAAATGA ACAGAACACT CCAAACTTAC AAAATAATCA TATCTCTACG CATCTAAAAT TTTATGTGTC AGATCAACGT CAGGTGTCTA CGAGACACAA CAAGGATGAG CTTGAGGAGT  TTAGTTGTCA GTTCTGACCA AGTTAAGGTG TCCTAGATAT ACACTTTAAA AGTTGGAATA TTGCTAATTT ACAAGGACGA GTTGGATTGT TTAGTTGTTA GTTGAGACTA AGCCAACATG  TTTTAGATAT ATAGGCATAA TACATAAATA TACCCTTCAA CTTGGCTTCA AATCACAGTT ATGCCCTTCA ACTTTGGGTG TGCACAAGTA GACACTTAAA CATGTATAAA ATTGAACAAA  TTATGTCATC CTACATGTCA TTTTTTGTCC TACGTGGTGT CCTATGTGTA TTTTGCCATG TAGGACTCAT GTGTTTATTT ATTTAAAAGT TGGATAGTTA AAGTGTCTGT TTGTTTATTA  TGACAGTTGG AGGTCAAAGT TAAAATTTAA AGTTAAGTTT AAGGTCCAAT ATATGTATTA TGCCTAGGTA TATATACACT ATCAAAGTTG GAGTACCACT AATTAACGAG GAAGAGTTGA  AGTATTTAGT TGTTAGTTGA GACTTCCAAC AACGTGTCCT AGATATACAC TTTCAAAGTT AAAGTATTTC TAATTAACGA GTATGAGTTG GAGTGTTTAA TTGTCAGCTT GGATCAAATT  TGAGTGTTTG TTTATGTATT GTACAAAAGA TTAATTACAT GACTTTTTAA ATTAAAGGAT TACACAAAAT TTATCTTATT TTTACTTAAT TGTGTTCAAA ATTTGGCAGG TGCACATACC  ATAGGAAAAG CAAGATGTGT GAATTTCAGA AATAGAATAT ATGGAGATTT CAAAATGACA AGTACTTCAT ATATAAATCC AATTTCATCC TCATATCTTA CTAAATTAAA ATCATTATGT  CCTCCAATTG AAATTAATGG ATCATCAGAC AACAATGAAA CATCAATGGA CAATATTACT CCAAATTTAT TTGATAATTC ATATTATCAT GTCTTACTTA AAGGTGAAGG ACTCATAAAT  TCAGATCAAC AACTTTATTC AAGTTTTCTT GGGATTCAAA CTAAAAAAAT TGTTGAAAAA TATGCAACAA ATACAATTGC ATTTTTTGAA CAATTTGCTG AATCAATGGT CAAAATGGGA 
AATATTACAA ATCCAGAGAC TTATGTGAAT GGAGAAGTGA GAAAGAGTTG TAGGTTTGTG AACACATAG 

Retrieve as FASTA