Entry information : PinvLDS01
| Entry ID | 6513 |
|---|---|
| Creation | 2009-01-21 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-03-02 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Catherine Mathe |
| Last annotation changes | 2015-12-11 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: PinvLDS01
| Name | PinvLDS01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Paxillaceae Paxillus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Paxillus involutus [TaxId: 71150 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6513' 'join(197210..197383,197442..197501,197558..197642,197684..198237,198289..198507,198562..198726,198788..198867,198925..199093,199142..199175,199220..199263,199309..199356,199406..199544,199597..199940,199994..200161,200212..200297,200346..200466,200527..200830,200878..200891,200937..200957,201014..201072,201127..201154,201212..201284,201337..201368,201421..201432)' |
Exons►
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Literature and cross-references PinvLDS01
| Literature | Stephen,S.A., Caillau,M., Wright,D.P., Johansson,T., Tunlid,A., Soderstrom,B., Read,D.J. and Scholes,J.D. Transcriptional programmes for nutrient acquisition by the ectomycorrhizal fungus Paxillus involutus. |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_38 (197210..201432) |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 14490 |
Protein sequence: PinvLDS01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (23 introns) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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