Entry information : LbiCIIBC01
| Entry ID | 6535 |
|---|---|
| Creation | 2009-05-13 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-10-26 (Nizar Fawal) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-04-30 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: LbiCIIBC01
| Name | LbiCIIBC01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Other class II peroxidase type C [Orthogroup: CIIBC001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Tricholomataceae Laccaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Laccaria bicolor [TaxId: 29883 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6535' 'complement(join(4249295..4249330,4249386..4249463,4249526..4249656,4249712..4249791,4249849..4249899,4249959..4249973,4250030..4250055,4250106..4250120,4250176..4250270,4250326..4250447,4250498..4250563,4250615..4250627,4250690..4250752,4250802..4250856,4250906..4250970,4251026..4251152))' |
Exons►
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Literature and cross-references LbiCIIBC01
| Literature | Peter,M., Courty,P.-E., Kohler,A., Delaruelle,C., Martin,D., Tagu ,D., Frey-Klett,P., Duplessis,S., Chalot,M., Podila,G. and Martin ,F. Analysis of expressed sequence tags from the ectomycorrhizal basidiomycetes Laccaria bicolor and Pisolithus microcarpus. New Phytol. 159 (1), 117-129 (2003). |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: LG_10 (4251152..4249295) |
| EST ref. | GenBank: CB011448.1 |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 191903 |
Protein sequence: LbiCIIBC01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (15 introns) and 1 EST. The predicted 3' can be shorter than expected (concerved residues are missing)=> more ESTs needed to confirm. |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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