Entry information : PcLDS02
| Entry ID | 6647 |
|---|---|
| Creation | 2009-03-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-11-24 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-03-28 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PcLDS02
| Name | PcLDS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6647' 'join(832436..832502,832561..832772,832832..832896,832953..833169,833224..833460,833510..833572,833624..833663,833715..833919,833974..834097,834256..834367,834426..834753,834894..835158)' |
Exons►
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Literature and cross-references PcLDS02
| Literature | Martinez,D., Larrondo,L.F., Putnam,N., Sollewijn Gelpke,M.D., Huang,K., Chapman,J., Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C., Larimer,F., Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_3 (832436..835158) |
Protein sequence: PcLDS02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (11 introns). No EST. Strain="RP-78". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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