Entry information : ZmRboh01(Zm00001d029861 / GRMZM2G089291)
Entry ID 6707
Creation 2009-04-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-12-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmRboh01(Zm00001d029861 / GRMZM2G089291)
Name ZmRboh01(Zm00001d029861 / GRMZM2G089291)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmRboh01
start..stop
S start..stop
SbRboh 1266 0 5..669 15..677
ToriRboh11 815 0 49..669 172..799
DdruRboh09 807 0 43..669 170..809
LjRboh09 801 0 6..669 117..810
Literature and cross-references ZmRboh01(Zm00001d029861 / GRMZM2G089291)
Literature Alexandrov,N.N., Brover,V.V., Freidin,S., Troukhan,M.E., Tatarinova,T.V., Zhang,H., Swaller,T.J., Lu,Y.P., Bouck,J., Flavell,R.B. and Feldmann,K.A. Insights into corn genes derived from large-scale cDNA sequencing. Plant Mol. Biol. 69 (1-2), 179-194 (2009).
DNA ref. GenBank:   AC231400.4 (191886..187249)
mRNA ref. GenBank:   EU952228
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Zm.122806
Protein sequence: ZmRboh01(Zm00001d029861 / GRMZM2G089291)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   669
PWM (Da):   %s   75986.33 Transmb domain:   %s   i144-163o228-247i279-301o327-349i356-374o
PI (pH):   %s   9.81
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRPRWVRLEP AATVAKSPIL MLRGAKIASA VVRYADQPEL FTQAYLCSCD RNSTSRITGK DIKQAIMFSA SLNKLTLNQD EATEYTNLIL EELQTGQGVL QMNVMSKGLS RDLQPTCGPI  PVPMKCSRQR HILTATVVFF QAHWRRIFVV FLWLMACAAL FTWKFMQYRQ RLAFEVMGYC LSTAKGAAET LKLNMAIVLL PVCRNTVTWL RRSRVINSVI PFNDNINFHK LVAAGIVIGV  ILHGGIHLAC DFPRITRTDK AFFGRTIAAD FGYHQPSYLE IVVSTEGTTG IAMVVLMFVA FLLASSPSRR NPGMLPPLVR QLAGFNAFWY SHHVFIAVYV LLIVHSMFLF LAKDVAEKTT  WMYVAIPVVI YIGERMFRMV RSMVFDVKIL NATVYPGMVL ALKVTKPPGF RYQSGMYVFV QCPEVSKFEW HPFSLTSAPD DDHLSIHIRS LGDWSYQMYD VFQQMLLSSN SSMPKIFFDG  PYGAASQDHS KYEIILLIGL GIGATPFISV LKDIANGLDK GHGNLNYHSD RLKKAYFYWV TREQGSFEWF RDIMKEVSVL DSKQGVIEMY NYLTSVYQEG DKRSMLISAI QALHFARHGI 
DIISKTPVHT HFSRPNWPRV LHGLARRHIG ERIGVFYCGP DDLGRQLEKL CHKVNTKTFT RFVFHKEHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 13 introns) and 8 ESTs. Also found in AC214496.3.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGTCCGC GGTGGGTGCG CCTAGAGCCT GCAGCCACCG TAGCGAAATC TCCAATCTTG ATGTTGCGCG GGGCGAAGAT TGCCTCTGCC GTCGTTAGGG TCAAGCACCG AGTCGCCGGC  TGCTGCCCCC TCTCCCTATC GTCGCGCCAT CCATTTCCTC GCCGTTGACG ACGACGAGCG AGACTAGGGA CCGGCCTTCG ACGAAGTGGC GGCTACTGCT CGATCTAGCG AGGGTGGCTG  GCATCGAGCT GGGGCGGCGG CCATGAGCCA TCTCTTCGAC AACAGGTAGG TGGAACAGGG GCGCGGGATG AGACCATGAG AGTGCGCACA AGCGAGCTGT GGCAGGCTGG CAGCTGGCAT  TGGGAAAATC AGGCAACTCA ACTTGATAGA TCAAAGGATG AAGGTGCTAA ATGTGACAGA CGATGCAGCC GCGGATTTAA CCAAACGAAC TGCTAAATAA TCTTACTGAA ATTTTTTATT  CTACTTTGTG CGTTTGATTT CCTGTAAAAG CTGGTGGTAT TATGCATTGG GATCTTTCGT TCATATCCTT TTATTGTTTC TATAATGCCT TATTAGCATA TCTACACGGA AACACTTGAA  GGATCCCATT CAAAAAATCA ACTTAAACGT GATTGCTATT ATGTTGAACC TGCCATACAG GTTTTGAAAA ATCAACAAGA GAATGTTCAA TAGTTTGAAG TCCTCAGAAA TTACAAAAGC  GTGTTATTAT TTGATCTTCA AACAATTTAC TTGCTCCTGC AGGTGAGAAT GAATCTTACA GTTCAACCAT ATATCCTCTT CCGGACAATG TAAATATCAA CTCCAGTAGA TCGATCAGTC  GGTGTCCTAG CCATGGCATC AGAATAGCAA TGGACAGGTA TTCTTCCTGA ATTGTGATCC CCAACTCTTT GTAGTATGCC GATCAACCAG AATTGTTTAC GCAAGCATAT CTTTGCAGCT  GCGACAGAAA CTCAACTAGC AGAATCACAG GGAAGGATAT TAAGCAGGTA CTGTAGAAGT CATCAGTGAT GTAAAACTAC TTGTTATTGC TGTGGGCCTA ACATGTCTCC TTATGTGCTT  GTAATTTATC AGGCGATTAT GTTCAGTGCC TCTTTGAACA AGCTCACATT AAACCAAGAT GAGGCCACCG AATACACAAA TTTGATCCTA GAAGAACTTC AGACAGGTCA AGGAGTCCTC  CAGGTGATCT TCTTGTAATT TAAAACAAAC AGTTCTTCAT AACCATGTAT AATTATGCTA CTATCATCTT TTAAGGCTCA CTATGTCAGT ACAGACCCCC CATGTTAGTA AACGCAATTG  GTGGCATATA CAAAAGCTTG GGACTTAGCA GTACCAGATT CAAACATGTA TCTCCTAGTA ATTCAAATCT AATTTACAGA TGAATGTCAT GAGCAAGGGC CTGTCAAGGG ATCTCCAACC  AACCTGCGGG CCAATACCAG TGCCAATGAA ATGCAGCCGA CAGCGACATA TACTTACTGC AACCGTAGTC TTCTTCCAAG CTCACTGGAG GCGTATATTT GTGGTTTTCT TGTGGCTCAT  GGCATGTGCT GCACTCTTCA CATGGAAGTT CATGCAGTAC AGACAGCGGT TGGCTTTCGA GGTAATGGGG TACTGCCTGT CGACAGCCAA GGGGGCTGCA GAGACGCTCA AGCTCAACAT  GGCCATTGTG CTCCTACCTG TTTGCCGCAA CACGGTCACT TGGCTCAGGA GAAGCCGTGT TATCAACTCG GTCATCCCAT TTAATGACAA TATTAACTTC CACAAGGTGT GTGTCATCTT  TTTTCAATCC TGTCACGCTT TACTAGTCTG CAGATAGACT GAGTTTAACG CTCATCTTTT AGTTTAGCTT GTTGCAGCGG GAATTGTGAT CGGTGTAATC CTTCATGGAG GCATCCACCT  GGCATGCGAC TTCCCAAGGA TCACAAGGAC AGATAAGGCC TTCTTTGGAC GCACAATTGC CGCTGACTTT GGGTACCACC AGCCATCCTA CCTGGAGATA GTGGTATCAA CCGAGGGGAC  AACTGGTATA GCAATGGTGG TACTAATGTT TGTCGCATTC TTGCTTGCTA GTAGTCCTTC GAGAAGAAAT CCAGGAATGC TGCCACCTCT CGTCAGACAG TTAGCTGGGT TCAATGCCTT  CTGGTACTCG CACCATGTGT TCATCGCTGT CTATGTGCTC CTCATTGTGC ATTCCATGTT CCTATTCCTA GCAAAGGATG TAGCAGAGAA GACGGTATGA TACTACTCAT TAAATAAATA  CAGTAAGGTC AGTATGTTTA TGTCCCTCTT ATTCCCACAA AATGCATGTG TAGACGTGGA TGTATGTCGC AATTCCTGTG GTGATCTACA TTGGAGAACG GATGTTCAGG ATGGTCAGAT  CTATGGTGTT CGATGTCAAG ATCCTCAATG TGTGATAATC TGTAACAAAT AATGTATTCT TTTCGGTGAA AATATGAGTT GTTGTGTCAG CTTTCAATCA TTACTTTGTT TTTTTTTTCG  TTTTCTGCTC CTTTTACAGG CCACAGTTTA TCCAGGGATG GTACTTGCAC TCAAGGTGAC AAAGCCTCCA GGTTTTCGGT ATCAAAGTGG AATGTATGTA TTTGTCCAAT GTCCAGAAGT  ATCAAAGTTT GAATGGTGAG AATACCTCTA CAAATTATGC TAGTCAACAA CTGCTGTGCT GTACAAATTT CAATTGTTAA TTTCCTTCTG TCACTTGAAT GAACTGCGTC CTTGGACATT  CTTACCTATA CTAATTCCAG ATTTACTTTA TCCAACTGTC TCAGGCACCC ATTTTCCCTT ACATCTGCTC CAGACGATGA TCACTTGAGC ATCCATATAA GATCTCTTGG TGATTGGAGC  TACCAAATGT ATGATGTCTT CCAACAGGTG AAGCACCAAT TCTTTACCAC TCTTCAAACA AGAGATTTTT TTTTTCTTCT CAAACGCTCT TCAAACAACA ATTATTGATA CTTAAAAATA  TGTTTTGAGT TTTGTAGATG CTACTTTCCA GCAACTCCAG CATGCCTAAA ATATTCTTTG ATGGTCCCTA CGGTGCAGCG TCACAGGATC ACTCAAAGTA CGAAATTATA TTGTTAATTG  GACTTGGAAT AGGAGCAACG CCTTTCATAA GTGTTCTCAA AGACATTGCC AATGGATTAG ATAAGGCAAT GACTGCACCT TCATGATATG CAATTTACGT CTATCATATC AGCTGAAAAT  CTATCATATT TATCTGAAAC TATCTCAGGG GCATGGCAAC TTAAATTATC ACTCTGACCG ACTGAAGAAG GCCTACTTTT ATTGGGTGAC AAGAGAGCAA GGATCCTTTG AGTGGTTCAG  GGATATCATG AAAGAGGTTT CGGTTCTAGA CAGCAAGCAG GTTTCACTTT TATAACCACT TTTAATTAAA AAGTAACCAT ACTTATCTTC TTCACAGATG GCATATGGCC ACGTCACTAC  ATATGATGCA TTGTTAAGAT GTTATAATGC ACTTGTAGGG TGTGATAGAA ATGTATAACT ACCTGACAAG TGTCTACCAA GAAGGTGATA AGCGGTCGAT GCTAATAAGT GCGATTCAAG  CACTTCATTT TGCACGCCAT GGCATTGATA TCATCTCAAA AACTCCTGTA AGCATATCTA TTTCCAACGC AACTACGCAT GACACAAGTG TTGTGCGCCT AATATCTTTG GTTCTCAACC  ACATGTCGCT ACACACTAGT AGGGGTGGTA ATGGGCTCTA AATTTTACGC TATAGAATTT CAGGATCGAA TCATATTAGG ATTAGGCTAT ATTCCTATTC ATTTTTGAAC TAAAATTTAT  TAAGAGACCT AACTTTTTAT GAAGAAACAT TTGGATCACG ATCCATTACC ACCCCTACGC ACTAGCTTTG GACAATGTGG AATGTTAAAC ACAAATCTAT AATTTGTAGG TTCATACGCA  CTTTTCGAGG CCAAACTGGC CTAGAGTGCT ACATGGCCTT GCAAGAAGGC ATATCGGGGA GAGGATAGGT AAGAATACTG TCTTGTTCAT GCCTAGAAAC TTAGTATTCC CTTTCCTGAA  AATTAAATGA AAGAACAACT TAGAGATGAA AAAGGCAAAG GGCATTCTTT ATCTATTTCA TGATTTGTTT AGTCATAATG TTTCATGCAT AACAGTGATA TTAGGGGTCA AATAAAACTT  AAACTTGCCC AGAGTAAAAA CATGATATTA GGGATCAACT AGAACTTGCC CCAGAGTAAA ACTAACGCAC AGAACTACTT GACTGGTGCA TCAAAACGCC TAAGAGCATG TCAATTCGGG  TCATTATATA AAAACATGTT TAGTTTACCA TGGTTATTTG GTGTGTACTT CATATTTTAC GTGTGCTTGG CATGGCAATA TTCTCATTCG TCTTCATGTC CTAAGGAGCT GCAGAAATTT  TCTTCTGTAT TAGGATAACC TAGTAGAAGA AACTCTTAGT GTGGAGAAAT ATTTGCTTCT CTGTTCCTCC TAAATTGAAC TTGAATGCAT TTGGCAGGGG TTTTCTACTG TGGTCCGGAC 
GATTTGGGAA GGCAGCTGGA GAAGCTCTGC CACAAAGTGA ACACAAAAAC ATTCACGCGA TTTGTGTTCC ACAAGGAGCA TTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGTCCGC GGTGGGTGCG CCTAGAGCCT GCAGCCACCG TAGCGAAATC TCCAATCTTG ATGTTGCGCG GGGCGAAGAT TGCCTCTGCC GTCGTTAGGT ATGCCGATCA ACCAGAATTG  TTTACGCAAG CATATCTTTG CAGCTGCGAC AGAAACTCAA CTAGCAGAAT CACAGGGAAG GATATTAAGC AGGCGATTAT GTTCAGTGCC TCTTTGAACA AGCTCACATT AAACCAAGAT  GAGGCCACCG AATACACAAA TTTGATCCTA GAAGAACTTC AGACAGGTCA AGGAGTCCTC CAGATGAATG TCATGAGCAA GGGCCTGTCA AGGGATCTCC AACCAACCTG CGGGCCAATA  CCAGTGCCAA TGAAATGCAG CCGACAGCGA CATATACTTA CTGCAACCGT AGTCTTCTTC CAAGCTCACT GGAGGCGTAT ATTTGTGGTT TTCTTGTGGC TCATGGCATG TGCTGCACTC  TTCACATGGA AGTTCATGCA GTACAGACAG CGGTTGGCTT TCGAGGTAAT GGGGTACTGC CTGTCGACAG CCAAGGGGGC TGCAGAGACG CTCAAGCTCA ACATGGCCAT TGTGCTCCTA  CCTGTTTGCC GCAACACGGT CACTTGGCTC AGGAGAAGCC GTGTTATCAA CTCGGTCATC CCATTTAATG ACAATATTAA CTTCCACAAG CTTGTTGCAG CGGGAATTGT GATCGGTGTA  ATCCTTCATG GAGGCATCCA CCTGGCATGC GACTTCCCAA GGATCACAAG GACAGATAAG GCCTTCTTTG GACGCACAAT TGCCGCTGAC TTTGGGTACC ACCAGCCATC CTACCTGGAG  ATAGTGGTAT CAACCGAGGG GACAACTGGT ATAGCAATGG TGGTACTAAT GTTTGTCGCA TTCTTGCTTG CTAGTAGTCC TTCGAGAAGA AATCCAGGAA TGCTGCCACC TCTCGTCAGA  CAGTTAGCTG GGTTCAATGC CTTCTGGTAC TCGCACCATG TGTTCATCGC TGTCTATGTG CTCCTCATTG TGCATTCCAT GTTCCTATTC CTAGCAAAGG ATGTAGCAGA GAAGACGACG  TGGATGTATG TCGCAATTCC TGTGGTGATC TACATTGGAG AACGGATGTT CAGGATGGTC AGATCTATGG TGTTCGATGT CAAGATCCTC AATGCCACAG TTTATCCAGG GATGGTACTT  GCACTCAAGG TGACAAAGCC TCCAGGTTTT CGGTATCAAA GTGGAATGTA TGTATTTGTC CAATGTCCAG AAGTATCAAA GTTTGAATGG CACCCATTTT CCCTTACATC TGCTCCAGAC  GATGATCACT TGAGCATCCA TATAAGATCT CTTGGTGATT GGAGCTACCA AATGTATGAT GTCTTCCAAC AGATGCTACT TTCCAGCAAC TCCAGCATGC CTAAAATATT CTTTGATGGT  CCCTACGGTG CAGCGTCACA GGATCACTCA AAGTACGAAA TTATATTGTT AATTGGACTT GGAATAGGAG CAACGCCTTT CATAAGTGTT CTCAAAGACA TTGCCAATGG ATTAGATAAG  GGGCATGGCA ACTTAAATTA TCACTCTGAC CGACTGAAGA AGGCCTACTT TTATTGGGTG ACAAGAGAGC AAGGATCCTT TGAGTGGTTC AGGGATATCA TGAAAGAGGT TTCGGTTCTA  GACAGCAAGC AGGGTGTGAT AGAAATGTAT AACTACCTGA CAAGTGTCTA CCAAGAAGGT GATAAGCGGT CGATGCTAAT AAGTGCGATT CAAGCACTTC ATTTTGCACG CCATGGCATT  GATATCATCT CAAAAACTCC TGTTCATACG CACTTTTCGA GGCCAAACTG GCCTAGAGTG CTACATGGCC TTGCAAGAAG GCATATCGGG GAGAGGATAG GGGTTTTCTA CTGTGGTCCG 
GACGATTTGG GAAGGCAGCT GGAGAAGCTC TGCCACAAAG TGAACACAAA AACATTCACG CGATTTGTGT TCCACAAGGA GCATTTCTAA 

Retrieve as FASTA