1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : PpaPrx[P]49 (PP00009G00420)
Entry ID 6949
Creation 2009-08-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-01-05 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-01-27 (Qiang Li)
Peroxidase information: PpaPrx[P]49 (PP00009G00420)
Name (synonym) PpaPrx[P]49 (PP00009G00420)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaPrx[P]49
start..stop		 S start..stop
PpaPrx27 204 5.58e-65 12..243 40..298
PpaPrx16 171 1.89e-52 2..241 31..281
PpaPrx52 171 2.76e-52 8..243 28..275
PpaPrx06 171 2.76e-52 8..243 28..275
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6949' 'join(594952..595107,595263..595433,612827..613231)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 594952..595107 154 N° 2 595263..595433 169 N° 3 612827..613231 403  
join(594952..595107,595263..595433,612827..613231)


exon

Literature and cross-references PpaPrx[P]49 (PP00009G00420)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_9 (594952..613231)
mRNA ref. JGI transcript:   114185
Protein sequence: PpaPrx[P]49 (PP00009G00420)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   243
PWM (Da):   %s   26816.94  
PI (pH):   %s   8.69
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFCSADALVQGFYSKKCPNKETILFDTLKDLDANDGDLPPILLLHFQDCFVRDGDASVLLDVAKSEKTAAPGARLLGFEAVEALKSAVERACPGVVSCADILAYAARDSGNISKALEASQ
FLPRSKFNISQLVVNFKVQRLTKKEMIVLSSTHTINKTACHHIDNRIYYYLSKFGVDLNIIANLVRKMKKKCCSFGLQKCIVNLYTNICIKFDSKYSSNLVAKRGMLVLDQVLLNDVSMH
PLV*

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Large introns and 3' is missing. No EST.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCTGCAGCGCAGATGCGCTGGTTCAAGGGTTCTACAGCAAAAAATGTCCCAACAAGGAGACGATCCTCTTCGACACATTGAAAGATCTTGATGCCAACGACGGGGACCTTCCTCCT
ATCCTCCTACTTCACTTCCAAGACTGCTTCGTTCGAGAGTGAGAGGCCTGTCGAGATGTTTAATTCGTCAAGGTTTGTGATCATCGATCATGATATCATACTTGCAGAATAGAAGAATTA
ATACGATTCGAGGGGCGTAATGTATTTTTGAGTATCTGATTCGCGAAACTTAACGTTGCTCCCTTTTCTGCAGGACGGCGATGCGTCTGTGCTTTTGGACGTTGCTAAGTCGGAGAAGAC
AGCCGCGCCTGGCGCACGTCTTCTGGGTTTTGAGGCCGTTGAGGCGCTCAAGTCGGCAGTAGAGAGAGCCTGCCCAGGCGTAGTTTCATGTGCTGATATATTGGCATACGCAGCACGTGA
TAGTGTGTGTTCCAAAAACATTATGTGTTATGAAAATTGTATCAGAACTATTTTGTGCATGATCTACGTGCTATAGCCTCTAGAACCGTACGAAAGCCTAGGAGGTACAANNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTACATTTATTGCATTATCAAAA
TCTTGGGATCTATATGTTTAGTTGATTGCATTGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCATTGAAGAGATAGTACAATCTATTGTCCTTGAGGAGGAGATGCAAAAGAAAAAGAAGATT
AGTTCTCTATTTTTTGCTTTAATAGTGCTTGCAAGAGGAAAAAAATTCTTAAAGAAAGACCATCTACAATAAAAATAGAAGCTTAAAATTGATAAGTCTAAAAGTATTTATAGGACATGT
AGACAAAAGAGGCATTGAAAAGGTGATACAAAATGTCCAAAATAAATAGCAATGGTGTAATAAATATTAGAGTTGCTATTATTCTTTCAACTTTAGTGGCATCATTTAATTCAAAAACAA
TAATTGCATTGTTATCTTAATCATGGCATTATGTATGTATTAATAATGCAATAGATGTTCACATCCAAAGAGATAGGAATAACCTTCTTAATTTTTAGAAAAATATAACTATCCAACTCT
AAGGCTATGATGGTGGCATTAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTAAAGATAAAAAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCATTCAATTTCAATAATCGAGATCAGTAGATCCTAAGCCAAGAAAAAAAATTAAGGAGATAAAT
CGAGGTCTTCAAGATTCTCTAGTAAATCGGGTGGAATGTGTCTAAGCCGTTCTTACCAGGAGTCAACAAAAAGGAAAAGGACCAATTCAATATTTGGGTGAGCTTGATGCAAAGGGCCAA
TTTGATCAAATTACGGGGACATCCAATCCAGGTCCTGTTACAGGCCTCTTATCCAATATGAGATCTGACTCGGTTGGACAATCCAATGAGGTCCTGATGTTAGGGACATAGTCCTTAGAA
CCTTCTAGAGACAAGTTCATAGAAACCTTCTAGAGACAAGTTTCTAGAACCTTCTAGAAGCAAGTCTCTGGAACCTTCTAAAAGCTTCTTAGTTGGTAGAAGATGTTAGGAACATAGTCC
TTAGAACCTTCTAGAGATAAGTTTCTAGAATCTTCTAGAGATAAGTTTCTAGAATCTTCTAGAAGCAAGTCTTTGGAACCTTCTAGAAGTTTCCTAGTTGATAGAAGTTGCTTGAGAAGC
TTCCTAAATAGGGGTATATATCAAAATCGAGGCAGAAGAGTTCTTCAGTCTCGACAACACATCTCTTGGAGCTCTAGCTCACTTCTCTGGTCTTGTTCTTATATTCATCTGATTAATCTA
GTTCTTTCCAGTTCTTCTTGAACTTCTTATTAGATCTCGAGTCTGTATTTTTGTGTCCGTGACAGTTTGTCAAGACTTCACTCACCTTAGATATCAGAGTTAGTTTCTTCCTCATTAGAG
TGCGGATTACTCCTCTGCTTGGAAGTGTACTAGGATTTTAGAGGTTGCGGATTACCCTCCTCTAAACTGATACTTCTTTTGTTACAATATTGGAGTCTTATTCTTGTTCGAGAGAGTGGA
TTACTTCTTTTCTTGAAGCTCTTAAGGCATTTTAGAAGTTGCAAAGTACCCTCCTCTAAACCAATATTGTTTTCTTGTAGAGTCATTTGTGTCCTTCTCTTAGAATGGCCGGAGGCCAAG
ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTTTGTTCAC
GAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNACTTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNGTTTGACAATAACTTCTTTCTGAAGCTTGCTCACCCAAAAATATAAGAAAGGGAGAGAGCACTACCAAAATTCGTAGTTGATGTAGTTATTTTCTCCAAGATAAAATAGAATTTTT
TTAGTAGCCATAGTTTGGTGTTTTGATATGGATAGCCAAGAGATAGATACTATGCCAGTCAGATTATCTCAACCGACTAGCTCACGAAGGCGACCCCGAGATGAAGAACTGCCTACACCA
CGATGACAACGAAGGATACCGAGTAACCGATCACTGGTGATTGTATTTGAGTCCGAGCCTGCTTACGATGGTCAATCAGAAGGCTTGTTTGTAGGACAATTTCACAATGAGGACACGGAA
GTTCATCCTTGGTCAGAAGTTGAAGGAGTGGGCCACTATCATTGGCTTCAAGGGCCGATGAACCACTTGCCTCGTGAACAACAGTTAGAGTTCATAGCATACCTGGTCGTCCTTAGAACC
TTCTAGAGACAAGTTTATAGAAACCTTCTAGAGACAAGTTTCTAGAACCTTCTAGAAGCAAGTCTTTGGAACCTTCTAGAAGTTTCCTAGTTGATAGAAGTTGCTTAAGAAGCTTCCTAA
ATAGGAGTATATATCGGAATCAAGGTTGAAGAGTTCTTCAGTCTTGACAATACATCTCTTGGAGCTCTAGCTCACATCTCTGGTGTTGTTCTTGTATTCATCTGATTGATCTAGTTCTTG
CCAGTTCTTTTTGAACTTCTTGTTAGATCTCGAGTCTGTATTTCTGTGTCCGTGACACCCGATTATGGAGGCTTCAGTTCCATTTCAAGCTATTCCATTCTCTATGCCATTTTGGAGAAA
CGTTCTTTCCGTGGAAAGATCCTCTTAGAAAAGGGAATTCCATAGAAGCGCGGTTTGCTGTTCCAATTTGGAGTCGAGGGCGGAAGAGTAGGGGACCTCACGGAGTTNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGCATTCAAGGAGATTAGGGGATTTTGGGGTTGGAGAGCTAGCTTCAAGCTCCTTCAAAAGGTGTAAGACTTAGTTTTAGAGGGTTC
GGGAGGACTTTGCAATTGTTGTTCAAAGTCAGTGTTTGTATTGGTGATTTGGATTTTTTGCAATAAAGTTAGGGTTAGTACTCTTGACTATTTTCTAAAATTAGAGAAATATTTGTAGTT
GAAATTTTAGAAGTATCTAGTTGGTTGAGTATGCCAAGTGCTTGCAAAAATTTGTATTAATCTAATGGTACGGATAGAGGATATTTGATCATTAATGTAAAGAGGTATCAGAAGTTGGCA
GATTGGGGTTGTTTAGGGTTTCTGCAATATTTGGAGATCTACTTGCTGGAATAAGGTGAATTTTAGCATGTTAAGTCGAGGACTTAAAAGAGGAGCTGCACACAAATTTTTAATGAGAAC
TAACAAATGAAAAAGGAGAAATTGTAATTCAAAGTTCGTCATCAACTTTCTAAGCAGTGGTCAAGGGACATCAGTGTAGATTTACAGCGTTTTCTTGCAATCTGTAAGTTGGATTGGATT
GAAACTTCTTGAACATTTAAAAGACTTTCAAAGACACTAGTGGTAGAAGTTTTACAACAATCAAACAATCAGATTGAGAATAACAGCTTGACGAAGCTTGCTATCTAGGATTAGGGTTNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAACTTGTGCTTATAATATCTTGAAGTTATTAAAAAT
AGTATTTCTAAGTACTTTGTATTGGGATTAAACTTTTACATTGAAATCCGAAATAGTTTACATTTAGATAGTTGAAATCTACTAGAATACTTAGATACTTGCAAAACATTGTTTCATCTT
CCACAACGAGATGCCTGGTGCATTTTTAAGCAAGATAGCACGTAATACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATCTAAATTAAGTTGAAGAATAATAAGTCTTTGTTATAAAAGAAACA
AGGTCAAAGGAAGATTGCATTCTATCTTCTATCTTTCTTTGTAGCTTCCATGTATTTATGACACTAAGGAGACGAAGAACCAACAACCAACAGATTCAACTCAAGAGCTTTCATTTGTAA
ACTTACCAGACGAGACATTGAAATTGTCACAACCTTCAAGATGACAAAATCAAGATGAAGATCTTCAAGAATGACATGTCTTTCCTTAAATAGATGGCAAGATACAATGTGTTTGGTATC
ACGACTTTGGAAGAGACTCCTAATGTTTGGTGATTTTATTAAAAGTAGAAACAACTCTTAATGATATTTCAAATGTTTTCTTTGAAGGAAGTTATAAAGGCTTCAACAAAATCCAAATAA
TAAGGTGGTCTTCTTGCCTTGGTATGGGATACTATCGATGGCTGAGAGGGCCTATCAACTATCTTCAAAGAAAACAAAGATCGGAGTATGTTGCAAATATAATTCACTGCATCTTGGATT
TTCTCAACATATGAAGATAGCTCCTTGTGGAACTCATCCTTAAAAGGAGGGGAGGTAATATTATGGATATACACATGTAAATCAATAATTACCTATATGATTAAATAAAATTAAGTTAAA
GTATGTTAATTCCATAATATCCTCTATAAAAGCTTCCTAGAAGCTTTATAGATACCACTTTGACTTTATAAATGTCTATAATTGACTTTTTAGATTAAAAACGTGGTCAACAAATTGGCC
ATGTACTACATATATTAGGTAGCTTGAAGAACAAGCTAACTATATGGCCTACACATAAAAAACTTGCCTTGTAAGGTAAGGCATGTGTCTTGCAAAGCCAACACATATTAGGGATCCTAT
AGAATATCACTACATAGATTTTAGTTAGATAGTATATATAAAAGCAAGAGTGAAGCTTTCTTCATTTTTGTCAACTCCTTTTTTGCTTTTAGTTTAGTTTTAAAAGTCTAGTTTCTTTTT
CTTTTAGTAATAGCGATTCTAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCAAATTTTCTAGGTTTATGCATCTTTTTGTAGTTCATGTCCTT
GACAAAAGGAGAAGGATAAAATACTTATATGTGAATCATGTATTATTGGCAAGGCCCATAGATAGCCTTTCTTACACAAGCACAAGCATGCCAATGGTATTTTAGATGTAATAGTATTGA
TCTTGGTTATTTTGATATATTTAGATTTAATGGTGTCAAAAGATTAATTGTGTAGATTGATAAATATTCAAGCTATTGTAGCCTTGTATTTCTTCAATCTAAAGACCAAGTACATATTGC
TTATAAGACTTATAAAGTAGAGGCATAAAGATAAATTTAAAGAAACATAAAAAAAATTCTTATTAATCAAGGCATTGAATTCTTGAATAGTAATCTTGGTTTTCACTTCAAAGGCTTTTA
ACACATTTTATTTGTAAGAAATGATGCCTATCATGTTTTCATAATATACCTTATTTTTGTAACACAATGTAAAAATTGCCTTTGATCTAGAATTCATGGTATTTGCTAGAAGATAAGATG
GTAATATCTCCAAGGCCTTAGAAGCATCACAATTTTTGCCAAGGTCTAAGTTTAACATCTCTCAACTTGTAGTAAACTTCAAAGTCCAAAGATTGACAAAGAAAGAAATGATTGTGCTCT
CTAGTACTCATACAATCAACAAGACTGCATGCCACCACATTGACAATAGGATTTACTATTATCTAAGCAAGTTTGGAGTAGATCTTAACATCATTGCCAATCTCGTCAGGAAGATGAAGA
AGAAATGTTGCTCTTTTGGACTTCAAAAGTGCATTGTCAACTTGTACACCAACATTTGTATAAAATTTGACTCCAAATACTCTAGCAACTTAGTAGCTAAGAGGGGCATGTTAGTTTTGG
ACCAAGTGTTGTTGAATGATGTGTCAATGCACCCTTTAGTTTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCTGCAGCGCAGATGCGCTGGTTCAAGGGTTCTACAGCAAAAAATGTCCCAACAAGGAGACGATCCTCTTCGACACATTGAAAGATCTTGATGCCAACGACGGGGACCTTCCTCCT
ATCCTCCTACTTCACTTCCAAGACTGCTTCGTTCGAGACGGCGATGCGTCTGTGCTTTTGGACGTTGCTAAGTCGGAGAAGACAGCCGCGCCTGGCGCACGTCTTCTGGGTTTTGAGGCC
GTTGAGGCGCTCAAGTCGGCAGTAGAGAGAGCCTGCCCAGGCGTAGTTTCATGTGCTGATATATTGGCATACGCAGCACGTGATAGTGGTAATATCTCCAAGGCCTTAGAAGCATCACAA
TTTTTGCCAAGGTCTAAGTTTAACATCTCTCAACTTGTAGTAAACTTCAAAGTCCAAAGATTGACAAAGAAAGAAATGATTGTGCTCTCTAGTACTCATACAATCAACAAGACTGCATGC
CACCACATTGACAATAGGATTTACTATTATCTAAGCAAGTTTGGAGTAGATCTTAACATCATTGCCAATCTCGTCAGGAAGATGAAGAAGAAATGTTGCTCTTTTGGACTTCAAAAGTGC
ATTGTCAACTTGTACACCAACATTTGTATAAAATTTGACTCCAAATACTCTAGCAACTTAGTAGCTAAGAGGGGCATGTTAGTTTTGGACCAAGTGTTGTTGAATGATGTGTCAATGCAC
CCTTTAGTTTAA

Retrieve as FASTA