Entry information : LjPrx47
Entry ID 698
Creation 2009-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-10-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-10-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LjPrx47
Name LjPrx47
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx241]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Lotus
Organism Lotus japonicus (corniculatus var japonicus)    [TaxId: 34305 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Roots
Senescing leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LjPrx47
start..stop
S start..stop
GmPrx183 517 0 1..315 12..327
MtPrx27 502 0 1..316 14..332
GmPrx76 468 6e-168 1..316 15..330
GmPrx235 466 6e-167 1..316 15..330
Literature and cross-references LjPrx47
Literature Asamizu,E. et al., Plant Mol. Biol. 54 (3), 405-414 (2004)
EST ref. GenBank:   DC599360.1 [5' end]
Other ref. GenBank:   AP010082.1 (15480..17210)
Protein sequence: LjPrx47
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316
PWM (Da):   %s   34430.98  
PI (pH):   %s   4.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSFFILSVAV RSQLSPYFYA KTCPDLFGIV RREVQNALKN EMRMGASLLR LHFHDCFVNG CDGSILLDGD EDSEKFAAPN LNSARGFEVI DRIKSSVESA CSGVVSCADI LAIAARDSVQ  LSGGPFWFVP QGRRDGLVSN GTLANISIPA PTDTLDTIIS KFNNVGLDHK DVVTLSGSHT IGRARCASFS KRLFNFSETG APDDTIETDT LTELQNLCPE SGDGNITSVL DQDSADQFDN 
HYFKNLLHGK GLLGSDQILF SSEDATATTK PLVQFYSENE RFFLMEFAYA MVKMGNINPL TGSEGEIRKN CRVVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns) and 16 ESTs. Ecotype="MG-20".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTTCT TCATTTTGAG TGTGGCTGTA AGGTCCCAAT TGTCCCCATA TTTTTATGCA AAAACATGCC CTGATCTTTT TGGAATAGTG AGAAGAGAGG TCCAAAACGC TCTGAAAAAT  GAGATGCGAA TGGGTGCTTC TTTGCTTCGG CTTCACTTCC ATGATTGCTT TGTAAATGTA TGTAAAAAAT GGCCTGACTT GCATGTTCTA GTTCCTTTTT TGGTTAAATT GCAAGTTTAA  GATTCCATTT TAATTTTTAA CTTTAAAACA CTTCATATTT GTTGTTCCAT AATCAAATTT TATCAATCAA TTCATATTTT TACTGCCCCA TAGTAGCAAA AAAACACCTT ACTAAGACTG  AAATGTTTTA GACTTAGCTA TTCTGCTAGA AAACATTTGA ACAGATATAA TATACCAAGT AATTTATGTA CTAAGGGTTG ATCACTTTTT TTTTCTTTAT CCAATATATT TTACTATCAG  GGTTGTGATG GTTCAATTCT ACTGGATGGA GATGAAGATA GTGAGAAATT TGCTGCTCCT AACTTGAATT CTGCTAGAGG ATTTGAAGTT ATAGATAGAA TCAAAAGTTC AGTGGAGAGT  GCATGTAGTG GAGTTGTGTC CTGTGCTGAT ATATTAGCCA TAGCTGCTAG AGACTCTGTT CAACTGGTAC GTTCAATGAT TAAATATAGT TATCTCACAA AGAAAAAGGA AAGCTGAATA  CATGTTTAGA AGTCCTTTTA CATTTTATTC TAAAGTTAGA ATCAATTCTG ATTAGAAGTT TCTGTCAATA GCTTCTGGTT GTCATAATTG ATTTTGAAGA AATAAACACA AGCTGATCTG  AATATGCTAT CGGTTTGTGT TTACTTTTTT ACCATAATCA CATTCACGTT TTGCAGAGTG GAGGTCCCTT TTGGTTTGTT CCGCAAGGAC GGAGAGATGG ATTAGTCTCA AACGGGACAT  TGGCAAATAT TTCAATTCCC GCTCCAACTG ACACATTAGA TACCATCATT TCCAAGTTTA ATAACGTTGG CCTTGATCAC AAAGATGTTG TTACTTTATC AGGTAATATG TTTAAATAAC  TTATCTTTTC CTCAGAATTA ATTACAACAC TCATAAGCTA CTCAAAAACT TATCTCTAGA ATTGATTTTG GTTTTATAAT GAATTGTATA AGCATTTTCA AACATTAGTC ATGAAAACAA  TAGTGGTATA AGCCTACAAG GATTAATGTC ACCTATTACC TATTCTCATA AATTGAACAA TTACTAACAT CTATCTATTT ATTTATGTAC ATGTGAAATA TTTCTTCAGG TTCACATACC  ATTGGGCGAG CAAGGTGTGC CTCATTTAGC AAAAGATTGT TCAATTTCTC CGAAACAGGA GCACCAGATG ATACTATAGA AACTGACACA CTTACTGAAT TGCAAAACTT GTGCCCAGAA  AGTGGAGATG GGAACATAAC TAGTGTGCTA GACCAAGACT CAGCGGATCA ATTTGATAAC CACTACTTCA AGAACTTGCT CCATGGAAAG GGTCTCCTTG GCTCTGACCA GATTCTGTTT  TCGAGTGAGG ACGCCACCGC AACTACTAAA CCTTTGGTCC AGTTTTATAG CGAAAATGAA AGGTTTTTTC TTATGGAGTT TGCCTATGCC ATGGTCAAAA TGGGGAACAT AAACCCGCTA 
ACTGGTTCTG AGGGAGAGAT TCGAAAGAAC TGCAGAGTCG TTAATTCTTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGCATAG CAACTTGGTA ACAGCAAAAT GATAATGAAT AGATCATGCA GTTCTAATGC ATATTTTTGG CTTATGAGTT TCTTCATTTT GAGTGTGGCT GTAAGGTCCC AATTGTCCCC  ATATTTTTAT GCAAAAACAT GCCCTGATCT TTTTGGAATA GTGAGAAGAG AGGTCCAAAA CGCTCTGAAA AATGAGATGC GAATGGGTGC TTCTTTGCTT CGGCTTCACT TCCATGATTG  CTTTGTAAAT GGTTGTGATG GTTCAATTCT ACTGGATGGA GATGAAGATA GTGAGAAATT TGCTGCTCCT AACTTGAATT CTGCTAGAGG ATTTGAAGTT ATAGATAGAA TCAAAAGTTC  AGTGGAGAGT GCATGTAGTG GAGTTGTGTC CTGTGCTGAT ATATTAGCCA TAGCTGCTAG AGACTCTGTT CAACTGAGTG GAGGTCCCTT TTGGTTTGTT CCGCAAGGAC GGAGAGATGG  ATTAGTCTCA AACGGGACAT TGGCAAATAT TTCAATTCCC GCTCCAACTG ACACATTAGA TACCATCATT TCCAAGTTTA ATAACGTTGG CCTTGATCAC AAAGATGTTG TTACTTTATC  AGGTTCACAT ACCATTGGGC GAGCAAGGTG TGCCTCATTT AGCAAAAGAT TGTTCAATTT CTCCGAAACA GGAGCACCAG ATGATACTAT AGAAACTGAC ACACTTACTG AATTGCAAAA  CTTGTGCCCA GAAAGTGGAG ATGGGAACAT AACTAGTGTG CTAGACCAAG ACTCAGCGGA TCAATTTGAT AACCACTACT TCAAGAACTT GCTCCATGGA AAGGGTCTCC TTGGCTCTGA  CCAGATTCTG TTTTCGAGTG AGGACGCCAC CGCAACTACT AAACCTTTGG TCCAGTTTTA TAGCGAAAAT GAAAGGTTTT TTCTTATGGA GTTTGCCTAT GCCATGGTCA AAATGGGGAA  CATAAACCCG CTAACTGGTT CTGAGGGAGA GATTCGAAAG AACTGCAGAG TCGTTAATTC TTAATATCTG CTGCAGGTTA CAGAAAAAAT ATAAGAACTA GGAACAAATG AAGTATTCAA 
CTTATAATGT GTATTTCATA GCCAAAACAT TATAGTTATT ATCAGTGATC TTCACTCTTG TGCTGTATTT TGCATGAATA AATTG 

Retrieve as FASTA