The peroxidases and oxidases database
Entry information : GmRboh02 (GmRboh2 / Glyma03g39610.1)
Entry ID 7174
Creation 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh02 (GmRboh2 / Glyma03g39610.1)
Name (synonym) GmRboh02 (GmRboh2 / Glyma03g39610.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh02
start..stop		 S start..stop
GmRboh15 1778 0 1..885 1..871
CcajRboh03 1749 0 1..885 1..884
PvRboh02 1710 0 1..885 1..881
PauRboh04 1704 0 1..885 1..881
Literature and cross-references GmRboh02 (GmRboh2 / Glyma03g39610.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01002195.1 (97172..90838)
EST ref. GenBank:   BW682101.1 [5' end]   BW682102.1 [Fragment]   GR837330.1 [Fragment]
Protein sequence: GmRboh02 (GmRboh2 / Glyma03g39610.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   885 (293)
PWM (Da):   %s   100627.8 (31216.5) Transmb domain:   %s   o337-356i416-438o476-498i518-540o550-567i701-718o
PI (pH):   %s   9.66 (8.76) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-319
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIQLEQQQE TWSETSSTGS RSTRVGFSGP MSGPLVTSNK KSSKKSARFK DQEDEDFVEI TLDVRDDTVS VQNIRGGDPE TALLASRLEK RPSSLSVRLR QVSQELKRMT SSKKFDRVDR  AKSGAARALK GLKFMTKNVG TEGWSQVDKR FDELAVDGKL PKTRFSQCIG MNESKEFAGE LFDALSRRRG ITSASISKDQ LREFWEQITD QSFDSRLQTF FDMVDKNADG RITQEEVQEI  IALSASANKL SKIQDRAEEY AALIIEELDP DNVGYIELYN LEMLLLQAPA QSTHITTDSR IMSQMLSQKL VPTKDHNPIK RGFRSLAYFV EDNWKRIWVI LLWLSICAAL FTWKFIQYKH  RAVFDVMGYC VTSAKGAAET LKFNMALILL PVCRNTITWL RSKTKLGMAV PFDDNINFHK VIAFGIAIGV GIHAIAHLTC DFPRLLHATD EEYEPMKPFF GEDRPNNYWW FVKGTEGWTG  IAIVVLMAIA YTLAQPWFRR NRLKLPKPLK RLTGFNAFWY SHHLFVIVYG LFIVHGYYLY LSKKWYKKTT WMYLAIPMIL YACERLLRAF RSGYKSVKIL KVAVYPGNVL ALHMSKPQGF  KYSSGQYIFV NCPDVSPFQW HPFSITSAPG DDYVSVHIRT LGDWTSQLKA VFAKACQPAS GDQSGLLRAD MLQGNNIPRM PKLVIDGPYG APAQDYKNYE VILLVGLGIG ATPLISILKD  VLNNMKQQKD IEEGMVESGV KNKRKPFATN RAYFYWVTRE QGSFEWFKGV MDDVAEYDKD GIIELHNYCT SVYEEGDARS ALITMLQSLH HAKSGVDIVS GTRVKTHFAR PNWRSVFKHT 
ALKHPGKRVG VFYCGAHTLV GELKRLSLDF SRKTNTKFDF HKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 03, 11 introns) and 6 ESTs. Unigene mix ESTs from GmRboh15 and 02. Position chromo Gm03:45618205..45624765
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATTC AATTGGAGCA GCAACAGGAA ACATGGTCGG AGACGTCGAG CACGGGGAGC AGGAGCACGC GAGTGGGCTT CAGCGGGCCC ATGAGCGGCC CATTGGTGAC GTCCAACAAG  AAGAGCAGCA AGAAAAGCGC TAGGTTCAAG GACCAAGAGG ATGAGGACTT CGTGGAGATA ACGTTGGACG TTCGCGACGA CACCGTGTCG GTCCAGAACA TCAGGGGCGG GGACCCCGAG  ACGGCGCTGC TCGCCAGCCG CCTCGAGAAG CGTCCCTCCT CGCTGTCGGT GCGACTCCGG CAGGTGTCGC AGGAGCTCAA GCGCATGACC TCGTCCAAGA AGTTCGATAG GGTCGACAGG  GCCAAGTCTG GTGCTGCTCG TGCCCTCAAA GGGCTCAAGT TCATGACCAA AAATGTTGGA ACCGAAGGTT GGTCCCAGGT GGACAAACGC TTTGATGAGT TGGCCGTTGA TGGCAAATTG  CCCAAAACGC GCTTCAGTCA GTGCATTGGT ATGTTTTCTT TATTCATTGT TTATACAATT ATACACCCCC CCTCACTCAC CATTTCGAAC AATTATTATT GATGAAATAA ATTGCCTTTT  TTTAAATTAA TAAAAATATT CAATCAAACA TGTACGATAC TGAAAAAGTT GCGTTTTGAA CGCTAGACAA CACTCTTTTA TGGTTCTATT ATTAAACCTC TGTTAACATT TCTTTTCTTT  TACTGTATTT ATGTATATAT GATGAGTATT ATCAAATACG TATTTACTTA AGCTATTTGG TATGGATTAA TTGTTTTTGG ATAATTTCTT TTTCTTATAT TTATTTTACA CTTGAATTGG  TCTTTCTATT ATTTCATCAA ATGTTGCATC ATTATCTACC ATATTATTTC CCTATTCAGA TTGGTGTAAG CAGATAAGTG TGCATATTAT AATGAAACTG TGAGAGTTGT TATCGTTTAG  TGAAATTAAA TAATTAAGAA TGGTTTAAAA AATGTGACAT CTACTCCTAC TTTGTTCGGT GGGTTCATCT GGTCATCATC GTATATTTCT CCTTTTTTTT TATAAGTCAT ATCTATAAGC  TTATTACTTT ATATAAGTCA CTTTATAGTT AAATATTTTT AAATTTATCT TTATTCTCTA ATTATATCAT GTTTAAGTAC TTTTACTTTT TTTCTTATAA TTTTTTAACT TCCACTTTTC  TAAAAAGAAA AATAAGATGG AAAGAGGAAT TATAATAGAA TTAGTGAACT TTTAAATAAT AAAAGTAATT TAAAAATGTT TTAATAAACA AATTTTTAAT CATTGTGAAT TAATTAAAAA  TGACTAATAA TAAGAAAAAT AAAAAGTACT AGCAATTAGG GCAGGATACT GATTTGCATG GCTTATGCTA CCCCAAGAAT TAATTAATTA ATTACCTTTC CTAAAACTAA ATAATGATAT  ATAGGCATGA ACGAGTCGAA GGAGTTTGCT GGCGAATTAT TTGATGCATT ATCTCGTCGC CGGGGCATAA CATCGGCTTC CATAAGCAAG GATCAGTTGC GCGAATTTTG GGAACAAATT  ACAGACCAGA GCTTTGATTC AAGGCTCCAG ACCTTCTTTG ACATGTAAGA CTTCAACTTC ATCATTTCCT TCGTTTTGTT TTTTCCATTA TAATTAAATC CGTATATGCC ATAATGCTCA  ATTTTCTAAA TCCTTATAGT ACAATTGAGT ATATTGTCAG AGATTGTGGG AAATTGCTTG CCAATTACTT CTCGCTATAT ATCAAACAAA TTAAATAAAA AAACAACGCC GCATTTCATG  CATTTTCATG TGAATTAAAG TGGCGTTTTT TGTAACCAAT ACAGCTGAGG AGTTGAAATA AAAATATCTT TAATTAATGA AAGAAGTTTT GAGTGCAGTT CTTTGTTTAT GACACTATAA  ATCATTTTAA GGTTAATTAT CCACTTTTTT GCTAAAAAAA TTGTATATAT ATTTTTATTA TAAAAATTTA TTTGAGCTAT TTCTTTCTTT GACTATTTGT TTAATAAATT GAAAAAAGAT  CTAAACTAAA ACACTTTTAG AACTTGGAAT TTCTGCACTT TTTTAGTGTG GAATTGAAGT TTTCACTACG AGGTCAACTG AGTCCTGACC AAAATATTTA TGGTGAATTT TGGAACCCTA  TATTTTAACT AAATAGTAAA TTTTACGCGA ATGTCAAATC GCCAAATGAG CTACACCTCC AGGCTAAAAT AATGAATTGG TCTAAATAGT TATTTAAAAC ACTTACCGAA AAAAAAAACG  CCTATTCTTT AAGGATGTTG TTTAATCCGT TGTTCAAACC TTAGCATATT TTGTTATAGG ATTAGGTGTG GAATAGTCGA GGGTAGAGTG GAAAGTAAGA AGAAATCAGC ATATTAAATA  ACAAATTGAA TACACAAGAA AAATAAATGA ATGAATCAAC GGGTGGCTCT TTTAAGGGAT CAAAGAAAAA AGGAAGGAAA GAACCAAATA TTTCACCCTT TAAATAAAAA GAACGAGTCA  ACGGATAGTT GGGTGGACTA TTGAAAAATC TGTGTGAAAT CAGCTAGCAG CTATTGGAGA AACATTGTAT GAATGTATAT ATCTAAGTCA AAAAAAGAAA AACAATTACG AGTTAAATGT  CAACAATATT GAATTTTGGT TGGATCTTCA CCCATTTCCT GTGACTTGTC CCTAAATAAT TTTAATTCAT GTCAGGGTGG ACAAAAATGC CGACGGAAGA ATCACCCAAG AAGAAGTTCA  AGAGGTGAGT GTTACTATGA TAAAAAAGAA GAATTTATTC CCTCATTTTT AATTTTCCCA TTAAATGAGG TGGTAAAACG TCATTTGATA TTAGTGTAAA AAAGTGGTAA CATGTCATTT  GATATTAGTG TAAAACCTTT TTTACACTAA CAATACATTA CTGCTTTTTT TTACAAGAAA CTTATGGAAA TGTAAACATT ATTGTGTTAT TCATTTTACA GATTATCGCC TTAAGCGCTT  CCGCTAATAA GCTGTCAAAA ATACAAGATC GGGCAGAGGA ATATGCAGCC CTTATCATCG AGGAGTTGGA TCCAGACAAC GTTGGATACA TTGAGGTTTA TATTCTATCT ATTTTTTTTA  AAAAAATTTA TCTTCACTCC CATTTTGTGA AAAATAAAAG GGGGTCCAAA GTGAATATCA TTTTATTAAA GTTAGATACT AAAAAATGAA CTAAAATGTC AAATTTGAAA ACTAAGAATT  TACTCTTTTT GTTGTTCAAC TATCGTAAAT GAGCCCAAGG CCTCCTTTAA AAATTTTCAG TTATCGTAAT TGGCCTAGAT AGGAATATAC TTAAGCCTTA AATTTTATTT TATTTTCCCT  TCAAATTTTT CAACACACAG ACTACATATG GATGACCAGT TGACCCATGC CAGATTGGCA GCCTATTACT TTAGCTTATA GTTATAGTAG TAAAGTATGA ATGATAAGTT GCTTTTCCCA  ACTTATTTTT TCCCTAAACA AATCGGAGAG TATTTAAACT TAAACATCTA GTAACTTTTA CTAAAAATTT TACCCAACTT AACTCAAACT TTTCTTGTTT AATTTTTTTA ATGCAGCTAT  ACAACTTAGA AATGCTTCTT TTGCAAGCCC CAGCACAATC AACCCACATA ACCACGGATA GCCGTATCAT GAGTCAAATG CTGAGCCAGA AGCTGGTCCC AACCAAAGAT CACAACCCCA  TCAAGCGTGG CTTCCGGTCA CTGGCTTACT TTGTGGAGGA CAATTGGAAA CGGATTTGGG TTATTCTCCT CTGGCTTTCA ATTTGTGCTG CCCTTTTCAC TTGGAAGTTC ATTCAATACA  AGCACCGTGC CGTGTTCGAC GTCATGGGCT ATTGTGTCAC TTCAGCCAAA GGTGCTGCTG AAACCCTCAA GTTCAACATG GCCTTAATCC TGTTACCCGT TTGCAGAAAC ACCATAACTT  GGCTCAGAAG TAAGACCAAG TTAGGCATGG CTGTTCCTTT TGATGACAAC ATCAACTTTC ACAAGGTACC TATATGCATG GATGAAGAAA TTAATAAATG GTCTCGAACT ACTACAATCT  TAATCAATTT TTACTGACAC ATATGTGTTA GGTGAATAAT AATTGAGACT ATTGATAGTA ATACATGCTG ATTGATTTTT TTTAATTATT AAATAATTTT CGATTAGACT ACTATTAGAG  TCTCGATCGA AAGATTATGG ATAACACTAA TCGTTTAATA ATTATTTTAT GTAATAATTT ACTCTTAATT TTATTGTATT TTTTAATTAA TTAGCTAATT ATGCATTACT TTGATTCCTA  TAGGTGATAG CTTTTGGCAT TGCAATTGGG GTTGGGATAC ATGCAATTGC ACATTTAACG TGTGACTTCC CAAGGTTGTT GCACGCAACG GACGAGGAAT ATGAGCCCAT GAAGCCATTT  TTTGGAGAAG ATAGGCCCAA CAATTATTGG TGGTTCGTGA AGGGAACCGA GGGTTGGACC GGGATAGCCA TTGTGGTGCT TATGGCTATA GCCTACACTT TGGCTCAACC TTGGTTCCGA  CGAAACAGGC TCAAGCTCCC TAAACCTCTG AAAAGGCTCA CTGGATTCAA TGCGTTTTGG TACTCTCACC ATCTTTTTGT CATCGTCTAT GGGCTTTTCA TCGTTCACGG TTACTACTTG  TACCTCTCCA AGAAATGGTA CAAGAAAACG GTATGCATGA ATGCACTATT ATATCCCCGT TTCCCTTTAA TTTTGCTTGA TATGAAATTT TGTTCTTAAT TTGAACAACA CTTTATTGCC  ACAGACTTGG ATGTATCTTG CAATTCCTAT GATACTATAC GCATGCGAGC GATTACTTCG TGCTTTTAGG TCTGGATACA AAAGTGTCAA GATTTTGAAG GTAAATTACT TCTGAAGATT  TTACCTTCTC TCTTTTAATT AATGTCATTT TTCCTGTTAA TGACCTTACA TATACTAAAA TTTTAACGTT TTTTATTATC TTGAAATTCA GGTTGCAGTG TACCCTGGAA ATGTCTTGGC  CTTGCACATG TCTAAACCAC AAGGATTTAA GTACTCTAGT GGACAGTATA TTTTTGTTAA TTGCCCAGAT GTCTCTCCTT TTCAATGGTA AGTGAACATT CCTTTTCTTA TTATTTTTAT  TGCACGTTAC CATTAAAATA AACAAAAAAA TTAACAATTT TGTTGTGTGG TATCTGTAGG CATCCTTTCT CTATTACATC AGCCCCAGGA GATGATTATG TAAGCGTTCA CATTAGGACT  TTGGGTGATT GGACATCACA ACTGAAAGCT GTTTTTGCTA AGGTAAATTT TGCTCTAGAC AACCACTTTT TCTTCATTGG GAAAATATGC TAGTACTTTA CTTTCCTCAA ATATGTTGCA  CAATATAACT TATATTAGTA TTCCATTCAT GTGATTGATG CAGGCATGTC AACCAGCAAG TGGTGACCAG AGTGGTCTTC TACGAGCTGA TATGTTACAA GGCAACAACA TACCAAGGTT  AGTTATGACT AGAGACAATG ATTTTATTTA TTTAAAACAT TCAAATTGGT TCTTTACTCA CTCCAATGAA ACTGAAATTA CTTCTAGGAT GCCAAAGCTC GTGATCGATG GTCCTTATGG  AGCTCCAGCA CAAGACTACA AAAACTACGA AGTAATCCTT CTCGTGGGAC TAGGAATTGG TGCCACCCCT TTGATTAGTA TTCTCAAAGA TGTGCTAAAC AACATGAAAC AACAGAAAGA  CATAGAAGAA GGGATGGTAG AAAGTGGAGT CAAGAACAAG AGGAAACCTT TTGCCACCAA CCGCGCCTAT TTCTACTGGG TTACTCGTGA GCAAGGTTCC TTTGAATGGT TCAAGGGTGT  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GGGCGCACAC ATTGGTTGGA GAACTTAAGA GGCTTTCTCT TGACTTTTCC AGGAAAACCA ACACCAAGTT TGATTTTCAT AAAGAGAATT TTTAA 

Retrieve as FASTA