The peroxidases and oxidases database
Entry information : GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Entry ID 7189
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-05-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Name (synonym) GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh12
start..stop		 S start..stop
GmRboh06 1855 0 1..941 1..941
CcajRboh04 1837 0 1..941 1..940
PauRboh05 1786 0 1..941 1..946
CcaRboh05 1772 0 1..941 1..945
Literature and cross-references GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01004545.1 (2729..10919)
Protein sequence: GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   941
PWM (Da):   %s   106616.29 Transmb domain:   %s   o375-397i517-539o559-581i738-755o
PI (pH):   %s   9.77
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNGIPRHERR WASDSVPGKA TVSAGTSPGT ESNSAAEEFV EVTLDLQDDD TIVLRSVEPA SVISIDDSVA GSGNQTPASV SRSPTIRRSS SRGFRQFSQE LKAEAVAKAR QFSQELRRFS  WSHGHASRAL SSSSAPNGAG AGFETALAAR ALRKQRAQLD RTRSGAHKAL RGLKFISNRS NGVDAWNEVQ SNFDRLAKDG FLNRTDFAQC IGMKDSKEFA LELFDALSRK RRLRTDKISR  EELFEFWSQI TDQSFDSRLQ IFFDMVDKNE DGRITEEEVK EIILLSASAN RLSRLQEQAE EYAALIMEEL DPEGLGYIEL WQLETLLLQK DTYLNYSQAL SYTSQALSQN LQGLRKKSPI  RRMSRRLVYY LQENWRRLWV LTLWVSIMIG LFTWKFIQYK NKDAFQIMGY CLLTAKGAAE TLKFNMALIL LPVCRNTITW LRSTKLGYVV PFDDNINFHK TIAGAIVIGI ILHAGDHLAC  DFPRLVSTSE ERYEKYLKGV FGDHKPSYVD LVKGVEGVTG ILMVFLMIIA FTLATKWFRR NLIKLPKPFS RLTGFNAFWY SHHLFVIVYV LLIIHGIKLY LVHKWYHKTT WMYLAVPVLL  YASERILRLF RSGLYTVRLG KVAIYPGNVL TLQMSKPPQF RYKSGQYMFV QCPAVSPFEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRQ LGDWTQELKR VFSEACEPPV SGKSGLLRAD ETTKKSLPKL  KIDGPYGAPA QDYKKYDVLL LVGLGIGATP FISILKDLLK NIIKMEEMAD SISDISRGSD LSVGSTTDSP SLNKNAPKRK KTLKTTNAYF YWVTREQGSF DWFKGVMNEV AELDQRGVIE 
MHNYLTSVYE EGDARSALIT MVQALNHAKN GVDIVSGTRV RTHFARPNWK KVFSKMCSKH CNGRIGVFYC GAPVLARELS KLCFEFNEKG PTKFEFHKEH F 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from genomic (chromo 8, 13 introns).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGGTA TTCCGAGACA CGAGCGCCGA TGGGCGTCCG ACAGCGTTCC GGGAAAAGCG ACCGTCAGCG CCGGAACTTC GCCGGGAACT GAGTCCAACT CCGCCGCGGA GGAGTTCGTG  GAGGTGACAC TCGATCTTCA AGACGATGAC ACCATCGTTC TCCGGAGCGT CGAGCCAGCC TCCGTCATTA GCATCGACGA CAGCGTCGCC GGCAGCGGAA ATCAAACTCC GGCGTCGGTT  TCGAGGTCTC CGACTATACG TCGGAGCTCG TCGAGAGGAT TCCGGCAGTT CTCGCAGGAG CTGAAAGCCG AGGCGGTTGC GAAGGCCAGG CAGTTCTCGC AGGAGCTGCG GCGCTTCTCG  TGGAGCCATG GCCATGCTTC GCGCGCGCTT TCGTCTTCCT CTGCTCCGAA CGGCGCCGGC GCCGGATTTG AAACGGCGTT GGCGGCTCGC GCTCTCAGGA AACAACGAGC TCAGCTTGAT  CGCACGCGCT CCGGTGCGCA CAAAGCGCTT CGCGGTCTGA AATTTATCAG CAACAGGTCC AATGGCGTTG ATGCGTGGAA CGAGGTGCAG AGCAACTTCG ATAGGCTTGC TAAGGACGGT  TTTCTCAATC GCACCGATTT CGCTCAATGC ATAGGTCCGT TTCTTTTTCA AATCTCGCAT TGTTCGTTTA AATCATTAGA TTCGTTATCC TATAGTGCTT TCTTTTCCCT CCCTGTTTCA  TTGCATTGAA TTTTCAATAA CTGTTTAGAT CTTTCATCTT TGTATATATA CTCTTTCTTC TTCTTGCTTC TGTTTTTTTT TTTTGTTAGC TTAAAGTGTG TTGCATCTGA ATTTTTATTT  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AACTAAATTT GAGTTCCACA AGGAGCATTT CTAA 

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