Entry information : SmAPx02-1_0 (SmAPx02a_0)
| Entry ID | 7196 |
|---|---|
| Creation | 2010-02-09 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-02-09 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: SmAPx02-1_0 (SmAPx02a_0)
| Name (synonym) | SmAPx02-1_0 (SmAPx02a_0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Isoetopsida Selaginellaceae Selaginella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Selaginella moellendorffii [TaxId: 88036 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7196' 'join(1354208..1354320,1354371..1354495,1354546..1354595,1354659..1354724,1354782..1354830,1354898..1354980,1355045..1355124,1355187..1355289,1355364..1355594)' |
Exons►
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Literature and cross-references SmAPx02-1_0 (SmAPx02a_0)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_0 (1354208..1355594) |
|---|---|
| mRNA ref. | JGI transcript: 139337 |
| EST ref. | GenBank: FE499277.1 [5' end] FE475492.1 [3' end] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Smo.4450 |
Protein sequence: SmAPx02-1_0 (SmAPx02a_0)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns) and 13 ESTs. ESTs from two varaiants are compiled in the same unigene | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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| cDNA► Send to BLAST |
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