Entry information : SmAPx04-1_7 (SmAPx04a_7)
| Entry ID | 7200 |
|---|---|
| Creation | 2010-02-10 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-02-10 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: SmAPx04-1_7 (SmAPx04a_7)
| Name (synonym) | SmAPx04-1_7 (SmAPx04a_7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Isoetopsida Selaginellaceae Selaginella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Selaginella moellendorffii [TaxId: 88036 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7200' 'complement(join(2423527..2423682,2423734..2423793,2423840..2423944,2424015..2424092,2424151..2424225,2424279..2424365,2424414..2424481,2424538..2424625,2424670..2424770,2424824..2424944,2424997..2425152,2425201..2425329))' |
Exons►
|
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Literature and cross-references SmAPx04-1_7 (SmAPx04a_7)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_7 (2425329..2423527) |
|---|---|
| mRNA ref. | JGI transcript: 85469 [Incorrect prediction] |
| EST ref. | GenBank: FE507096.1 [5' end] FE507095.1 [3' end] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Smo.1505 |
Protein sequence: SmAPx04-1_7 (SmAPx04a_7)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (11 introns) and ESTs. ESTs from the two are compiled in the same unigene. Incorrect prediction from JGI (first exon is incorrectly predicted) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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