Entry information : NtPrx11-1B(Nitab4.5_0000375g0150)
Entry ID 7205
Creation 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx11-1B(Nitab4.5_0000375g0150)
Name NtPrx11-1B(Nitab4.5_0000375g0150)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx008]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx11-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx11-1A 626 0 1..321 1..321
NtPrx78-1A 575 0 1..321 1..319
CanPrx18 573 0 1..317 1..320
NtPrx78-2B 573 0 1..321 1..319
Literature and cross-references NtPrx11-1B(Nitab4.5_0000375g0150)
Literature Wang,J., Sheehan,M., Brookman,H. and Timko,M.P. Characterization of cDNAs differentially expressed in roots of tobacco (Nicotiana tabacum cv Burley 21) during the early stages of alkaloid biosynthesis. Plant Sci. 158 (1-2), 19-32 (2000)
mRNA ref. GenBank:   AF154655.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx11-1B(Nitab4.5_0000375g0150)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321
PWM (Da):   %s   34358.49  
PI (pH):   %s   10.08
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLKINAIV LFIFVSLLIG NSSAQLSTGF YSKSCPKLYQ TVKSAVQSAI KKETRMGASL LRLFFHDCFV NGCDGSLLLD DTSSFTGEKR AAPNVNSARG FEVIDNIKSA VEKVCPGVVS  CADILAVTAR DSVVILGGPN WNVKLGRRDA RTASQAAANR SIPPPTSNLN RLISSFSAVG LSTKDMVALS GAHTIGQARC TTFRARIYNE TNNLDASFAR TRQSNCPRSS GSGDNSLAPL 
DLQTPNKFDN NYFKNLVNKK GILHSDQQLF NGGSADSIVT SYSNNPRSFS SDFVTAMIKM GDIRPLTGSN GEIRKNCGRI N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect prediction from SGN (splicing error introns 1 and 3)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT TAAAGATTAA TGCTATTGTT TTGTTTATCT TTGTGAGCTT ACTAATTGGA AATTCATCAG CTCAACTTTC AACTGGTTTC TACTCAAAAT CTTGTCCTAA ACTTTATCAA  ACTGTGAAAT CTGCAGTGCA ATCTGCTATT AAGAAGGAAA CTCGAATGGG TGCTTCTCTT CTTCGTCTAT TCTTCCATGA TTGCTTCGTC AATGTAATCT ACTATCTTCA TTTCCTCTTT  CTTTGCTTTT CTCTTTTCAT TTGAGTTCAA TTTTTATATA CAAACGGTCA GTGGCGGAGC CAGAATTTTC ACTAAGGATG TCAAAAAATA AAATAAATAA ACACACGAAG AAATTAAGGG  GGAGTCAAGA TATAGTAAGT AATATATACG TTTAAATTTT TTACCTAGCT ACATAGTTGT AACTTTTCGA ACGAATGGAT ATCAATTGAT ACCCCTTGGG ATAACGTGGC TCCGCCACTA  CTAACATTGA AATTTTGCTT ACACTAAGGC TACCTAGAAG ATAGCCATAA GTAATCGTCT ATAAAAAGTG AAACTTAGTA ACTTAAAAAA AACAGGGCAT TACATGTTAA GTAACATATT  AGTAGAATAT ATTTATAGTC CGTCAATATA TATAACTTAA ATGCTTTTAT TTTGCACTAT TTTACTGTTT ACTTTTTCTA ACTGTATACA TAGATTATCA ACTAATTATA TATAGTTATA  CATATATTAT ATATGGATTA TACATATATT ATATATCCGT CGGCTATTTT TAGCTTAAAC GGTTGGTTGA ACGACTATTT AGATTAATTC TTCTTTAATT ATTTCCTTTC AGGGATGCGA  TGGATCGTTA CTCCTTGATG ACACATCAAG CTTCACAGGA GAGAAAAGGG CTGCTCCAAA TGTCAATTCT GCTAGAGGAT TTGAAGTTAT TGACAATATC AAATCTGCTG TTGAGAAAGT  GTGCCCTGGT GTTGTTTCTT GTGCTGATAT TTTGGCCGTT ACAGCTCGGG ACTCTGTTGT TATTGTAAGT TTTAATTATA TTTTCAAGAC TTTTTCAAGT TAAGCAACTG CATTTTAAGT  TTATATTCTC ATATAAGTAA TTTTGTGACC TTATTATGTA TATATATGCA GCTTGGAGGC CCCAATTGGA ATGTAAAATT GGGCAGAAGA GATGCTAGAA CAGCAAGTCA AGCTGCTGCA  AATAGAAGCA TTCCTCCTCC AACTTCTAAC CTTAATAGAC TCATTTCTAG TTTCAGTGCG GTTGGCCTTT CCACTAAGGA TATGGTTGCC TTATCTGGTT TGTTCTTTTT TCCCTAATTC  CCTCCTGTTT AAATAATATT TAAATTATAT ACATGAACAA TGCAAATCTT TTTAACACTA TTAATATAGT TTAACATGTT ATATGTTACG CGGCGCCTTC CTGAAGTTCC TTGGAAGGGC  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nCCCCCCCCC ACCCCCCCAC CCACCCCCAA AAAAAAATAA AAAGGAAAAT ATACTCTCAA TCCATAAAAG CTGATGGAAT TACATTTAGG GGTTGTTTGG TTGGAAATAA GTTATTCCAA  GATTAATTAT CTCAGGATTA GTTATTTCAC CTTTTCATGG GGATAAAAAA ATACTACAAT CCCAGAACAA CTAATCCCGG GATTAATTAT ACCGCAGTTT TCTACAAATC AAATATGGGA  TAAACTCTTC TTAAATTTAG TCCCGGAATT AATTATTCCT TATTTCTCAT ATCAAACGAG TCCATACAGT ACTTAGTTTA AACAGATTTC TTATTATGGA TAAGCTAGAT TTTTGAACAT  ACAAGTTATA TTAAAGTATG TTCATCTCAA CTCACTAAAT CTAGCGTATT TATATTAAAA CAAGTAATCA CAAATTAAAA TTCACACAAA CAAAAAAATT GACATTATAA ATGTCCCCTG  CTTAGGCCTA AACACCAATA ATCCCTAAAG AACAGAGGAA AATTTTGAAA ATTAAAGGGC AAAGATCTCT TTTAACCCGC GGTCAATAAT ATTTATATTT GGTAGCAGTA AAAGTGTATA  AAATTTGTAT ATAACATACA TAAATGAATA TTTATACAAA AAAAATAAAA TATTTTCAGA TTATTATTTT AATAGCGGCT ATACAAGTTC ATTTTTTAAA AATTTAAACT ATGTTTATGT  TTATGTTTGA CAGGGGCACA CACAATTGGA CAAGCAAGAT GCACAACATT TAGGGCACGT ATATACAACG AGACCAATAA CTTAGATGCA TCATTTGCAA GAACTAGACA AAGCAACTGC  CCAAGAAGTT CAGGTTCAGG GGACAACAGT TTAGCACCAC TTGATCTTCA AACTCCTAAC AAATTTGACA ACAATTATTT CAAGAATCTT GTTAACAAAA AGGGTATTCT TCACTCTGAT  CAGCAACTCT TTAATGGTGG ATCTGCCGAT TCGATTGTGA CATCTTACAG TAACAATCCT CGCAGTTTTA GCTCTGATTT TGTTACTGCT ATGATTAAGA TGGGTGATAT TCGTCCCCTT 
ACTGGTTCTA ATGGAGAGAT TAGGAAGAAC TGCGGTAGGA TCAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT TAAAGATTAA TGCTATTGTT TTGTTTATCT TTGTGAGCTT ACTAATTGGA AATTCATCAG CTCAACTTTC AACTGGTTTC TACTCAAAAT CTTGTCCTAA ACTTTATCAA  ACTGTGAAAT CTGCAGTGCA ATCTGCTATT AAGAAGGAAA CTCGAATGGG TGCTTCTCTT CTTCGTCTAT TCTTCCATGA TTGCTTCGTC AATGGATGCG ATGGATCGTT ACTCCTTGAT  GACACATCAA GCTTCACAGG AGAGAAAAGG GCTGCTCCAA ATGTCAATTC TGCTAGAGGA TTTGAAGTTA TTGACAATAT CAAATCTGCT GTTGAGAAAG TGTGCCCTGG TGTTGTTTCT  TGTGCTGATA TTTTGGCCGT TACAGCTCGG GACTCTGTTG TTATTCTTGG AGGCCCCAAT TGGAATGTAA AATTGGGCAG AAGAGATGCT AGAACAGCAA GTCAAGCTGC TGCAAATAGA  AGCATTCCTC CTCCAACTTC TAACCTTAAT AGACTCATTT CTAGTTTCAG TGCGGTTGGC CTTTCCACTA AGGATATGGT TGCCTTATCT GGGGCACACA CAATTGGACA AGCAAGATGC  ACAACATTTA GGGCACGTAT ATACAACGAG ACCAATAACT TAGATGCATC ATTTGCAAGA ACTAGACAAA GCAACTGCCC AAGAAGTTCA GGTTCAGGGG ACAACAGTTT AGCACCACTT  GATCTTCAAA CTCCTAACAA ATTTGACAAC AATTATTTCA AGAATCTTGT TAACAAAAAG GGTATTCTTC ACTCTGATCA GCAACTCTTT AATGGTGGAT CTGCCGATTC GATTGTGACA  TCTTACAGTA ACAATCCTCG CAGTTTTAGC TCTGATTTTG TTACTGCTAT GATTAAGATG GGTGATATTC GTCCCCTTAC TGGTTCTAAT GGAGAGATTA GGAAGAACTG CGGTAGGATC 
AATTAA 

Retrieve as FASTA