Entry information : NtPrx17-1B(Nitab4.5_0000669g0080)
Entry ID 7206
Creation 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx17-1B(Nitab4.5_0000669g0080)
Name NtPrx17-1B(Nitab4.5_0000669g0080)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx17-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx17-1A 629 0 1..330 1..324
StPrx04 583 0 12..330 5..324
LePrx30 577 0 12..330 5..324
NtPrx19-1B 538 0 1..328 1..328
Literature and cross-references NtPrx17-1B(Nitab4.5_0000669g0080)
EST ref. GenBank:   FS386202.1 [5' end]   EB425356.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.6928
Protein sequence: NtPrx17-1B(Nitab4.5_0000669g0080)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (163)
PWM (Da):   %s   37185.49 (18144.8)  
PI (pH):   %s   6.39 (5.04) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-193
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDNNHNHFSL SSRFLLLLLP LLLHIHHVRS ELQLNYYLES CPRAEEIIKE QVAQLYHKHG NTAVSWIRNL FHDCMVKSCD ASIYLDTANG QESEKTSPKN FGMRNFKYVE TIKQALESEC  PNTVSCADIV ALSARDGLLW LGGPRVEMRT GRKDSKESYL AEVESSLPNH NDSMSSVLSR FQSIGVDTEG TVALFGAHSV GRVHCVNLVH RLYPTVDPTL DPDYAKYLKG RCPTPNPDPE 
AVLYSRNDRE TTMILDNMYY KNILNHKGLL IVDQELVTDS TTSPFVEKMA ADNGYFHDQF ARALLILSEN NPLTGDQGEI RKVCRYVNSA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (FS407980.1, FS387436.1, FS378901.1, AM835462.1, FS403468.1, FS429390.1). Uncorrect prediction from SGN (start of PS is not predicted). Unigene compiles ESTs from both alleles. Cultivar="K326", "SNN"
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACAACA ACCACAATCA TTTCAGTCTC TCCTCAAGAT TTCTCCTTCT GTTATTACCA CTACTTCTTC ACATTCACCA TGGTAATTAA TTCTCCACTT ATATTTAAAT TTTATGACTT  CTTCTACTTT TTTCAGATAT TGACTAACTT CTTGATAAAG TATAATTGTG TTTTAAGTTA TGTTGCGTGC ACTCTCTAAA ATAATGTCGC ATCCGTATCG GATCCTCCAA AAATACATTA  CTTTTAAAGG ACCCGACACA CACCCGTCGA CAACATTTTC GGAGATTCCG ATCAACAATA AGTTTTAAGT TGGGAGATAC TCAATCTTAG CACTAAAATA TTGTTTTCAA ATTTATATTA  GCGTAACCAA ATTTTACACT ATTTGTGCAA TTTAACATGT TATTGCACGT TATTTACTGT ATTTTTCATG TTATCTACTT AACCACCAGT TCAAACATAT CATGCTTGTT ATAAAAAGTT  ATTACATGTT ATTGTATGCA ACTTAACCCG TTGGTGTAAC ATATTATATA TATACACTAT CATTGCAAAG AACTTAAATT CTATACTATA GAAGAAATTA TTTGAGGGCG GATATAGCAT  GCGGCGAGCG GTGTAACGTG ACACCGCTTC GTCGGAATTT TTATTAAATA TATATATATA TATAAATAGC ATACAAAATA AAAATATTGG ATATAAATAT AAAAAATAAT ACCACTTTTC  ATTATAGTGA TTTATTTATT CATTCATTTT TTTAAATTTT GACATCGCTT ACCAAATATC CCGGGTACGC CCCTGAAACT ATTAGTAGTC TATTTCACTT CTTTTCCCTA GTAATAAAGA  ATAACATCTA TAATTGTACA TATGTACTAA TTGCTGGGTT TTAATTGCAG TAAGAAGTGA ACTCCAATTG AACTACTACT TAGAGAGTTG CCCAAGAGCT GAAGAAATAA TCAAAGAACA  AGTGGCACAG TTGTACCACA AGCATGGCAA TACAGCAGTT TCTTGGATTA GAAATCTCTT TCATGATTGC ATGGTTAAGG TAATATTAAT TAATACTCTT AATTCTCCAA TTAAAAGTAA  ATTAATAACA CTGCTAGCTA CAACATTATA CAACAACAAT AATAAACTGA GTGAAATTTC ATAAGTGGGG TCGGATGATA GCAGTGTATA TGTAGACCTT ACCCCTACAT TGAAAAGGTA  AAGTGGTTGT TCCGGATAGA CCCTTAGCTC AAAAAAAGAT GAAAAGAAGC AGTAGCAATA GACAGTAACA ACAACAAGAT ACTAAAAAAA TTAAAGCGAA AAATAATACT CCCACCGTTT  TAGTTTAAAT GACATACTTT TCTTATTAGT CCATTTAAAA AAGACTGACA TATTTCTATA TTTGAAAATA ATTTAACTTT AAACTTCTCA TTTTACTCAC TTTACCCTTA ATGAGAAACT  TTTATAACCA TACAAATGCA TGTCCCCATA AAACTTTTAC CCCCTTAAGT TTGTGAACCA CATGTTTCAA AAATCTTTTT TTTTTCTTCC TTAAACTTGT GCCAAGTTAA ACTACATCAT  TTAAATTTAA ACGAAGGGAG TAAGAAAACA ACAGATAATA ATAGCTACAA CATTATGACC AATTTATATA TTAATATGTT TTTTTTCTTG CAGTCATGTG ATGCATCAAT ATATTTGGAC  ACAGCAAATG GACAGGAATC AGAGAAGACA TCTCCAAAAA ACTTTGGAAT GAGAAATTTT AAGTATGTAG AGACTATTAA ACAGGCACTT GAGAGTGAAT GTCCTAATAC TGTTTCTTGT  GCTGATATTG TTGCTCTTTC CGCCAGAGAT GGTCTTCTCT GGGTAAGTTG ATCAAATCCA CCTTCTTGTA CATCTCCCCT GATCCGGATA TAATATTGAT AGCGCAAAAT TATCTTATAC  TATCAGTATA TTTTAATTTG TTGAAATAGA GTTTTAGAGC AATAGTAAAG TTGTACTCAA CTTGAAAAAA AAAGAAACCT CAAGCCGATA AGTCATGGTG TTCGATAATT CGAAAGAAGA  GCTAAGGGCT GATCTACGAC CACCCTCTCA CTCACAGGAC ACATGCGATA TGTGTGATGC CGATACCCAG ATTTAGATAT CCACTTCAGA CTATTTACCT TATTTATGAT CTTCTTACGG  CCATCACGTT ATTCTATAAT TAAATATGCT ATTTATGCTA AAGATAGTCC TTCGTAGATC TCTACGAACA ATCTTAGACT GGCGTATTGA TAGTAGATGC TACCCACGCT GATGGTCGCT  TACCCAAACC CATCTATGTA TATACGCTTA TAGCTCACCT CCTCCCCCAT ACGACTCTCG ATGGTAGAAG AGAAAAGGAA CATATCTAAT GAGTCTTGAT TGCAATAGTA TAAGTTCGTA  TGACCTATAG ATCAAGGTTC GAGCTGTGAA AATAGTCACT AATACTTGCA TTAGTGTAGA CTGTCTATAC CACACACTCC TTGAGGTGCG TCCCTTCCTC GGATTTTGTG TGAATATCGG  ATATTTTGTG CAACGAACTG ACCTAATGTA TTTTAATACG TAACTATGAA AGCGATAACT TATAATTTAT TACTTTTCCA TTTTTCTTTC CCTTATAGAA TTGAGTCTAA TTTGTTTAAT  TTGTGTGATA CATAGTTGGG AGGGCCACGT GTTGAAATGA GAACAGGAAG GAAAGACAGC AAAGAAAGTT ACTTAGCAGA AGTTGAGAGT TCCCTTCCTA ATCACAATGA TTCCATGTCA  TCAGTCCTTT CTCGATTCCA ATCCATTGGT GTTGATACTG AAGGAACTGT TGCTCTTTTT GGTAAATCTC CCCTCTAATT AGCTGTTTAT TTTTTCAAAC TCCCAAGTTT AACACAAAAA  GTAAATGACT AAATTTTGTA TACTGACAAT TGTATTATAT GCTTATTTAA TTAAAAGTCA ATTAGTATAG TCGGACGGTG CTTGGATAAG TTTATAAGTT GGTTACTAAT TTATAAGTAT  TTTTTGACTT ATCTATACAT TTGTATCGTA GGTCAAAATC GGTCAAAAGT TCACTCTCAA TTTATGATTT TTATGCACTT TTAGTTTAAC TAAATTTTTT ACTATTATAT CCCTAATTTC  TTTTTTAATC TCCAAAATAC CTTTTCCAAA ATAAAAGATT GGACTCCCTT TCCATTTCAT TTCCGTCATT CTTTCCTTTT AATATAAAAA GACACTTTTA TATTTTTTTT TGCAAATAGC  TTTAATGGTA ATTTAGTAAT TTTAATAAAA ATACTTTTTA CCTACATCAT TGCAACTGCA TATGTTAAAC GATTTTATCC AAACTTGTAA CTACTTATTT ATCCAAACAG ACTTCTAATT  GTCTTATTTT ATGTGGATAC AGGGGCTCAC TCGGTAGGAC GAGTTCATTG TGTAAACCTA GTACACAGAC TTTATCCAAC AGTTGATCCT ACCCTTGACC CTGACTATGC TAAGTACCTT  AAAGGTCGAT GTCCGACACC GAATCCTGAC CCAGAGGCCG TTTTATACTC AAGGAATGAT CGCGAAACTA CAATGATCCT AGACAATATG TACTACAAAA ACATCTTGAA CCACAAGGGG  CTATTAATTG TAGATCAAGA ATTGGTTACT GATTCAACTA CTTCTCCATT TGTGGAAAAA ATGGCTGCTG ACAATGGCTA TTTCCATGAT CAATTTGCTC GGGCTTTGCT CATTTTGTCT 
GAAAACAATC CACTTACTGG AGATCAAGGC GAGATTAGAA AAGTTTGCCG TTACGTAAAT AGTGCTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACAACA ACCACAATCA TTTCAGTCTC TCCTCAAGAT TTCTCCTTCT GTTATTACCA CTACTTCTTC ACATTCACCA TGTAAGAAGT GAACTCCAAT TGAACTACTA CTTAGAGAGT  TGCCCAAGAG CTGAAGAAAT AATCAAAGAA CAAGTGGCAC AGTTGTACCA CAAGCATGGC AATACAGCAG TTTCTTGGAT TAGAAATCTC TTTCATGATT GCATGGTTAA GTCATGTGAT  GCATCAATAT ATTTGGACAC AGCAAATGGA CAGGAATCAG AGAAGACATC TCCAAAAAAC TTTGGAATGA GAAATTTTAA GTATGTAGAG ACTATTAAAC AGGCACTTGA GAGTGAATGT  CCTAATACTG TTTCTTGTGC TGATATTGTT GCTCTTTCCG CCAGAGATGG TCTTCTCTGG TTGGGAGGGC CACGTGTTGA AATGAGAACA GGAAGGAAAG ACAGCAAAGA AAGTTACTTA  GCAGAAGTTG AGAGTTCCCT TCCTAATCAC AATGATTCCA TGTCATCAGT CCTTTCTCGA TTCCAATCCA TTGGTGTTGA TACTGAAGGA ACTGTTGCTC TTTTTGGGGC TCACTCGGTA  GGACGAGTTC ATTGTGTAAA CCTAGTACAC AGACTTTATC CAACAGTTGA TCCTACCCTT GACCCTGACT ATGCTAAGTA CCTTAAAGGT CGATGTCCGA CACCGAATCC TGACCCAGAG  GCCGTTTTAT ACTCAAGGAA TGATCGCGAA ACTACAATGA TCCTAGACAA TATGTACTAC AAAAACATCT TGAACCACAA GGGGCTATTA ATTGTAGATC AAGAATTGGT TACTGATTCA  ACTACTTCTC CATTTGTGGA AAAAATGGCT GCTGACAATG GCTATTTCCA TGATCAATTT GCTCGGGCTT TGCTCATTTT GTCTGAAAAC AATCCACTTA CTGGAGATCA AGGCGAGATT 
AGAAAAGTTT GCCGTTACGT AAATAGTGCT TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAGCAAATT ACAAGACTTC ACTATATACA GAGACATGGA CAACAACCAC AATCATTTCA GTCTCTCCTC AAGATTTCTC CTTCTGTTAT TACCACTACT TCTTCACATT CACCATGTAA  GAAGTGAACT CCAATTGAAC TACTACTTAG AGAGTTGCCC AAGAGCTGAA GAAATAATCA AAGAACAAGT GGCACAGTTG TACCACAAGC ATGGCAATAC AGCAGTTTCT TGGATTAGAA  ATCTCTTTCA TGATTGCATG GTTAAGTCAT GTGATGCATC AATATATTTG GACACAGCAA ATGGACAGGA ATCAGAGAAG ACATCTCCAA AAAACTTTGG AATGAGAAAT TTTAAGTATG  TAGAGACTAT TAAACAGGCA CTTGAGAGTG AATGTCCTAA TACTGTTTCT TGTGCTGATA TTGTTGCTCT TTCCGCCAGA GATGGTCTTC TCTGGTTGGG AGGGCCACGT GTTGAAATGA 
GAACAGGAAG GAAAGACAGC AAAGAAAGTT ACTTAGCAGA AGTTGAGAGT TCCCTTCCTA ATCACAATGA TTCCATGTCA TCAGTCCTTT CTCGATTCCA ATCCATTGGT GTTGATACT 

Retrieve as FASTA