Entry information : NtPrx19-1A(Nitab4.5_0011461g0020)
Entry ID 7208
Creation 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx19-1A(Nitab4.5_0011461g0020)
Name NtPrx19-1A(Nitab4.5_0011461g0020)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx019]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx19-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx19-1B 658 0 1..329 1..329
StPrx03 593 0 1..329 1..329
LePrx82 550 0 1..308 1..308
NtPrx17-1A 530 0 24..328 18..322
Literature and cross-references NtPrx19-1A(Nitab4.5_0011461g0020)
DNA ref. GenBank:   FH441110.1 [3' end]  FH732428.1 [Fragment]
EST ref. GenBank:   FS387616.1 [Fragment]
Protein sequence: NtPrx19-1A(Nitab4.5_0011461g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (299)
PWM (Da):   %s   36939.74 (33497.9)  
PI (pH):   %s   8.02 (7.50) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATNNQQFSP SSRFIILLLA LLFHIHYAKS DLQLNYYSQS CPRAEEIVKE QVIKLYHKHG NTAVSWIRNL FHDCMVKSCD ASILLDTTKE QKSEKTSQRN FGMRNFKYIE TIKEALENEC  PNTVSCADIV VLSARDGVVM LGGPHIEMKT GRRDSKGSYL TEVENFIPNH NDSMSLVLSR FQSVGVDTEG TVALLGAHTV GRVHCVNIVN RLYPTVDPTL DPNYANYLKG RCPSPNPVLK 
AVEYARNDRV TPMVLDNVYY KNILSNKGLL IVDQQLVSDP TTYPFVEKFA NDNGYFHSQF AKALIILSEN SPISGDKGEI RKVCRHVNK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Uncorrect prediction from SGN (short PS is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACCA ATAATCAACA ATTCTCTCCC TCCTCAAGAT TCATCATTCT ATTATTAGCG TTACTCTTCC ACATTCATTA TGGTACTACT TCTCCCCTTA TATTAATGAC CAGCTCTTCA  TTACCGTTTA TCTATTCGTT CTAGCTTTGA CAACTTAAAT TTTTTTTTGT AATATACTCC CTCCCTCCGT TTACTTTTAC TTGTCCACCA TACTAAAAAA ATATTTTTAC TTTTACTTGT  TCATTTTCGC AAATCAAGAG AAAACAATCT TTTTTTCCTA TTTTACCCTT ATCATTAACT AAATTCTTCA AATCATTTTT CAAGATTTTT TGAAATATGA TTATTATTAT AAGTAAAATT  ATAATACTTT AATTATTTTT TCTTAAAAGG AGTACAAAGT CAAAAGTGAA CGGAGAGATT TTCTTTCCGG TGTACCAAAA GGAATATGAG AATTTTCTGA CGCTTCATTT CAATTATCCA  CTTCAAAATA AAAGACCTTT TTTGTGTACA CTAAAAACTA CTACTACTAT CTATTTATCC TTTTTCTAGT GATAAAGAAG AATATATACC TCTATATTAT CATATATTTA TACGTACTAA  CTACTGATTT TAATGGACGC AGCAAAAAGT GATCTCCAGT TAAATTACTA TTCACAGAGT TGCCCAAGAG CTGAAGAAAT CGTCAAAGAA CAAGTCATCA AGTTGTACCA CAAACATGGA  AATACTGCAG TTTCTTGGAT CAGAAATCTC TTCCATGATT GCATGGTTAA GGTAAAATAC ATATACCCAT CCACTGAAAA AAAATAATTA ATGAGAGTCC TGAGCTAATA TATGCAAGCC  GGAGATATCT CGGCCTATAT TTGCACCAAT ATGGGATCTC CATTAGTAAT GGGTAAATCT GTTTGGAAAT AAAGCTCTTT TTATCATAGA AATAGACATG CGATTGACAT CTGTCACTGT  GAAACAAGTC GGTAGCTCAA AACTGGAATT GGCACAATAT AATATAGCCA AGTCTTCGCC CTTGCTCAAT TTGGCTTAGA CCCATTAATA TGCTATGTAA AGGTAAATTC AAAATTTAAA  CTTAAAAATG ACGTGTTTAG TTGAACCTGT ACAAGTCCGC CTCTTGATAT TTTGGCACGT CATGAAATGC ATAAACCAAT AATATAAATT TGATTTGATT TTATTTATTT ATTTTTGCAG  TCATGCGATG CATCGATACT ATTAGACACA ACAAAGGAAC AGAAATCAGA GAAGACATCA CAGAGGAATT TTGGGATGAG AAATTTTAAG TATATAGAGA CAATTAAAGA GGCCCTTGAG  AATGAATGTC CAAACACAGT TTCTTGCGCT GATATTGTTG TTCTTTCTGC TAGAGATGGT GTTGTCATGG TACGTTAATG TCTTTAATTA ACCTCTGTCT CAATTTCATT TTTTCTTATA  AAATGACTTT TTTTTTAATT AATTTACTCT GTTATTATTT GACACAGTTA GGAGGGCCAC ACATTGAAAT GAAAACTGGA AGAAGGGATA GCAAAGGCAG TTACTTAACA GAAGTTGAGA  ATTTCATTCC TAACCACAAT GATTCCATGT CGTTAGTTCT TTCTCGTTTC CAGTCTGTTG GTGTTGACAC TGAAGGAACA GTTGCTCTAC TTGGTAAACT AACTATGCCC CCTAAATTAG  ACTTCTCCCA AAAAGTTCCC ATTAAATTTA GTTTACTATT TATTTTCCCG ATGAGTAAGT CCAGAGGCGG AGCCAGAATT TGAAGTTTTT GGATTCTAGA CTTATTGTCG AACCATAACT  CGTTATAGTT ACTGTGTTCA CAATTAAATA CTTACACATA TTTAATAAAT TTTCTAATAC AAATAAAGGA TCTAAGCATA GGCTACTAGG TTCGTCCGAA CGTGTAACTT ATACTCTCCC  TTCACTCCTG AGTCGGTCCA ACTAGTGCTA GTATCCAGAT CTTTATTGCT TAGGATATTT CTTGTTTTAT CATAATTTTC AACCACGTTT ACAAATTTTT AACAATGTTC AGTTTATGTG  AAACAAACAT AGTACTAATA GTTGATCATG ATGTATTTCT TTGTTAAAAA AATTAGGTTA TAACTTTGCT AAATGAGATT CTTAATTTAA TACTATATCT AAAATCAATT CGAAAAGCTC  AAGATCACCT TTTTTGGGGG ATTTTTTCAC AAATATTGTT TACTTATTTT GTATGCAGGG GCACATACAG TAGGACGAGT TCACTGTGTA AACATAGTAA ACAGACTTTA CCCAACAGTT  GATCCAACCC TAGACCCCAA CTATGCCAAT TATCTCAAAG GGCGATGCCC CTCCCCGAAC CCGGTTCTTA AAGCAGTGGA GTACGCCAGA AACGACCGTG TAACGCCAAT GGTGTTGGAC  AACGTATACT ACAAGAACAT TTTGAGCAAT AAAGGGCTGT TAATTGTGGA TCAACAGTTG GTTTCTGATC CAACTACGTA TCCTTTTGTG GAGAAATTTG CTAACGATAA TGGATATTTT 
CATAGTCAGT TTGCTAAAGC TCTGATTATC TTGTCGGAAA ATAGTCCAAT TAGTGGTGAT AAAGGGGAGA TAAGAAAGGT CTGTCGCCAT GTGAACAAGT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACCA ATAATCAACA ATTCTCTCCC TCCTCAAGAT TCATCATTCT ATTATTAGCG TTACTCTTCC ACATTCATTA TGCAAAAAGT GATCTCCAGT TAAATTACTA TTCACAGAGT  TGCCCAAGAG CTGAAGAAAT CGTCAAAGAA CAAGTCATCA AGTTGTACCA CAAACATGGA AATACTGCAG TTTCTTGGAT CAGAAATCTC TTCCATGATT GCATGGTTAA GTCATGCGAT  GCATCGATAC TATTAGACAC AACAAAGGAA CAGAAATCAG AGAAGACATC ACAGAGGAAT TTTGGGATGA GAAATTTTAA GTATATAGAG ACAATTAAAG AGGCCCTTGA GAATGAATGT  CCAAACACAG TTTCTTGCGC TGATATTGTT GTTCTTTCTG CTAGAGATGG TGTTGTCATG TTAGGAGGGC CACACATTGA AATGAAAACT GGAAGAAGGG ATAGCAAAGG CAGTTACTTA  ACAGAAGTTG AGAATTTCAT TCCTAACCAC AATGATTCCA TGTCGTTAGT TCTTTCTCGT TTCCAGTCTG TTGGTGTTGA CACTGAAGGA ACAGTTGCTC TACTTGGGGC ACATACAGTA  GGACGAGTTC ACTGTGTAAA CATAGTAAAC AGACTTTACC CAACAGTTGA TCCAACCCTA GACCCCAACT ATGCCAATTA TCTCAAAGGG CGATGCCCCT CCCCGAACCC GGTTCTTAAA  GCAGTGGAGT ACGCCAGAAA CGACCGTGTA ACGCCAATGG TGTTGGACAA CGTATACTAC AAGAACATTT TGAGCAATAA AGGGCTGTTA ATTGTGGATC AACAGTTGGT TTCTGATCCA  ACTACGTATC CTTTTGTGGA GAAATTTGCT AACGATAATG GATATTTTCA TAGTCAGTTT GCTAAAGCTC TGATTATCTT GTCGGAAAAT AGTCCAATTA GTGGTGATAA AGGGGAGATA 
AGAAAGGTCT GTCGCCATGT GAACAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAAACCTCA ATATACCTAA CATATGGCCA CCAATAATCA ACAATTCTCT CCCTCCTCAA GATTCATCAT TCTATTATTA GCGTTACTCT TCCACATTCA TTATGCAAAA AGTGATCTCC  AGTTAAATTA CTATTCACAG AGTTGCCCAA GAGCTGAAGA AATCGTCAAA GAACAAGTCA TCAAGTTGTA CCACAAACAT GGAAATACTG CAGTTTCTTG GATCAGAAAT CTCTTCCATG  ATTGCATGGT TAAGTCATGC GATGCATCGA TACTATTAGA CACAACAAAG GAACAGAAAT CAGAGAAGAC ATCACAGAGG AATTTTGGGA TGAGAAATTT TAAGTATATA GAGACAATTA  AAGAGGCCCT TGAGAATGAA TGTCCAAACA CAGTTTCTTG CGCTGATATT GTTGTTCTTT CTGCTAGAGA TGGTGTTGTC ATGTTAGGAG GGCCACACAT TGAAATGAAA ACTGGAAGAA  GGGATAGCAA AGGCAGTTAC TTAACAGAAG TTGAGAATTT CATTCCTAAC CACAATGATT CCATGTCGTT AGTTCTTTCT CGTTTCCAGT CTGTTGGTGT TGACACTGAA GGAACAGTTG  CTCTACTTGG GGCACATACA GTAGGACGAG TTCACTGTGT AAACATAGTA AACAGACTTT ACCCAACAGT TGATCCAACC CTAGACCCCA ACTATGCCAA TTATCTCAAA GGGCGATGCC  CCTCCCCGAA CCCGGTTCTT AAAGCAGTGG AGTACGCCAG AAACGACCGT GTAACGCCAA TGGTGTTGGA CAACGTATAC TACAAGAACA TTTTGAGCAA TAAAGGGCTG TTAATTGTGG  ATCAACAGTT GGTTTCTGAT CCAACTACGT ATCCTTTTGT GGAGAAATTT GCTAACGATA ATGGATATTT TCATAGTCAG TTTGCTAAAG CTCTGATTAT CTTGTCGGAA AATAGTCCAA  TTAGTGGTGA TAAAGGGGAG ATAAGAAAGG TCTGTCGCCA TGTGAACAAG TGATTAGAAA TCATGTACTA CCAAATATAT AATAAGTGCA ATTAGACTTC TGTTTCTTGT TGGGTATGTT 
ACCAATTAGT AAAATCAAGT GTAACAATTG TCGTTGAATG A 

Retrieve as FASTA