Entry information : NtPrx20-1A(Nitab4.5_0001176g0090)
Entry ID 7210
Creation 2010-02-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx20-1A(Nitab4.5_0001176g0090)
Name NtPrx20-1A(Nitab4.5_0001176g0090)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx20-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx20-1B 662 0 1..329 1..329
LePrx01 604 0 1..329 1..328
StPrx54 603 0 1..329 1..328
NtPrx68-1A 565 0 1..328 1..328
Literature and cross-references NtPrx20-1A(Nitab4.5_0001176g0090)
EST ref. GenBank:   EB424888.1 [5' end]   FG179543.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.11965   Nta.6045
Protein sequence: NtPrx20-1A(Nitab4.5_0001176g0090)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (306)
PWM (Da):   %s   35903.27 (33537.1)  
PI (pH):   %s   8.63 (8.73) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFGYLSIL VLCILGFVSS GHAQLQLNFY AKSCPNAEKI IKDFVQKQVP KAPNTAAAIL RMHFHDCFVR GCDGSVLLNF TSSTGNQTEK QANPNLTLRG FSFIDAVKRL VEAECPGVVS  CADIIALVAR DAVVVTGGPF WNVPTGRRDG RISNVSEANA DIPAPTSNFT RLQQSFAKKG LDLNDLVLLS GAHTIGVSHC SSFSERLYNF TGTLGTQDPS LDSEYADNLK SRKCKSINDN 
TTIVEMDPGS FKTFDLSYYK LLLKRRGLFQ SDAALTKRTT TKSFIEHLVE GSLKEFYSEF AKAMEKMGRV EVKTGSAGEI RKQCAFVNS 

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Remarks Complete sequence from 33 + 11 ESTs (FG179457.1, FG621722.1, FS435214.1, FS413101.1, FS403404.1, FS421871.1...). Cultivar="Hicks Broadleaf"
Uncorrect prediction from SGN (splicing error introns 2 and 3).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTGGCTATTT GAGTATTCTG GTATTATGTA TCCTTGGATT TGTAAGCTCT GGACATGCTC AATTACAACT TAATTTCTAT GCCAAGAGCT GTCCAAATGC AGAGAAAATC  ATTAAAGACT TTGTCCAAAA GCAAGTTCCA AAGGCTCCAA ATACTGCAGC TGCCATACTC AGAATGCATT TCCATGATTG CTTTGTTAGG GTAAGTATAG TATGATTAAT TTGCCCTGTT  TCACTTACAT AATTGCTTTA TATACTTAAT TAATGTGCTT TGTTCTGATT CTTTTGTCTT CTCTGTTTTG TTCTTTGCAG GGTTGTGATG GATCTGTACT TCTTAATTTC ACTTCAAGTA  CAGGAAACCA AACTGAAAAA CAAGCTAATC CTAATCTAAC ATTGAGAGGC TTCTCCTTCA TTGATGCTGT GAAGAGACTA GTTGAAGCTG AATGCCCTGG AGTTGTCTCT TGTGCTGATA  TTATTGCCTT AGTTGCTAGA GATGCAGTTG TAGTCACAGT AAGTACAAAA CTTGAAGAAA TTAACAAAAT ACTCTCTTCT AGAACCATCA GACCCCACCG GTGAGAATAT ATTGCGTATG  TTATTGTTGT TCTACTCTCT TCTTGAACTC CAGACCCCAC CCGTGAGAAT ATACGGGGTC TGTTGTTATT GTTGTACTCT CTTCTTAAAC CCTCAGACCC CACCTGTAGG AATATAGTGG  GTCTGTTGTT ATCGTTGTAC TCTCTTCTTG AACCATTTTC TATAGCTATT AATTATCTTC TTGGCATAAT AGGGAGGTCC TTTTTGGAAT GTGCCAACTG GTAGAAGAGA TGGAAGAATA  TCAAATGTTT CAGAAGCCAA TGCTGATATC CCAGCTCCAA CTAGTAACTT CACTAGACTA CAACAATCTT TTGCGAAAAA GGGTCTTGAT CTGAACGACT TGGTCTTATT ATCTGGTATG  CACTGTATAT AATATTCTTA CATCATCAGG TTAAGTTACA CCCGCAATAA CATATAACTT GTTTTTATTG TAGGTGCACA CACCATTGGA GTTTCTCATT GCTCCTCGTT TTCGGAGCGT  CTATACAATT TCACAGGGAC TCTTGGTACA CAAGATCCAT CTCTAGACAG CGAATATGCA GATAATCTCA AGTCCAGAAA ATGCAAGTCA ATTAACGATA ATACCACTAT AGTTGAGATG  GATCCAGGTA GTTTCAAGAC ATTTGATCTT AGCTATTACA AGCTTCTGCT CAAAAGGAGA GGCCTATTCC AATCTGATGC AGCTTTAACA AAACGTACCA CAACGAAGTC ATTTATCGAA  CACCTTGTCG AGGGATCACT CAAAGAATTC TACAGTGAAT TTGCTAAGGC AATGGAGAAA ATGGGGAGAG TTGAAGTTAA AACAGGCAGT GCTGGTGAAA TCAGGAAGCA ATGTGCATTT 
GTGAATAGTT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTGGCTATTT GAGTATTCTG GTATTATGTA TCCTTGGATT TGTAAGCTCT GGACATGCTC AATTACAACT TAATTTCTAT GCCAAGAGCT GTCCAAATGC AGAGAAAATC  ATTAAAGACT TTGTCCAAAA GCAAGTTCCA AAGGCTCCAA ATACTGCAGC TGCCATACTC AGAATGCATT TCCATGATTG CTTTGTTAGG GGTTGTGATG GATCTGTACT TCTTAATTTC  ACTTCAAGTA CAGGAAACCA AACTGAAAAA CAAGCTAATC CTAATCTAAC ATTGAGAGGC TTCTCCTTCA TTGATGCTGT GAAGAGACTA GTTGAAGCTG AATGCCCTGG AGTTGTCTCT  TGTGCTGATA TTATTGCCTT AGTTGCTAGA GATGCAGTTG TAGTCACAGG AGGTCCTTTT TGGAATGTGC CAACTGGTAG AAGAGATGGA AGAATATCAA ATGTTTCAGA AGCCAATGCT  GATATCCCAG CTCCAACTAG TAACTTCACT AGACTACAAC AATCTTTTGC GAAAAAGGGT CTTGATCTGA ACGACTTGGT CTTATTATCT GGTGCACACA CCATTGGAGT TTCTCATTGC  TCCTCGTTTT CGGAGCGTCT ATACAATTTC ACAGGGACTC TTGGTACACA AGATCCATCT CTAGACAGCG AATATGCAGA TAATCTCAAG TCCAGAAAAT GCAAGTCAAT TAACGATAAT  ACCACTATAG TTGAGATGGA TCCAGGTAGT TTCAAGACAT TTGATCTTAG CTATTACAAG CTTCTGCTCA AAAGGAGAGG CCTATTCCAA TCTGATGCAG CTTTAACAAA ACGTACCACA  ACGAAGTCAT TTATCGAACA CCTTGTCGAG GGATCACTCA AAGAATTCTA CAGTGAATTT GCTAAGGCAA TGGAGAAAAT GGGGAGAGTT GAAGTTAAAA CAGGCAGTGC TGGTGAAATC 
AGGAAGCAAT GTGCATTTGT GAATAGTTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTGTGTAGA GAAACACATT AAAGAAAAGA AAGGTTTCTT TTGAGACAGA GGAAAAAATG GCTTCATTTA GCTATTTGAG TATTCTGGTT TTATGTATTC TTGGAATAGT AAGCTCTGGA  CATGCTCAAT TGCAGCTTAA TTTCTATGCC AAGAGCTGTC CAAAAGCTGA GAAAATCATT AAAGACTTTG TCCAAAAACA AGTTCCAAAA GCTCCAAATA CTGCAGCTGC CATACTTAGA  ATGCATTTCC ATGATTGCTT TGTTAGGGGT TGTGATGGAT CTGTACTTCT TAATTTCACT TCAAGTACAG GAAACCAAAC TGAAAAACAA GCTAATCCTA ATCTAACATT GAGAGGCTTC  TCCTTCATTG ATGCTGTTAA AAGATTAGTT GAAGCTGAAT GCCCTGGAAT TGTCTCTTGT GCTGATATTA TTGCCTTGGT TGCTAGAGAT GCAGTTGTAG TCACAGGAGG TCCTTCTTGG  AATGTGCCAA CTGGTAGAAG AGATGGAAGA ATATCAAATG TTTCAGAAGC CAATGCTGAT ATCCCAGCTC CAACTAGTAA CTTCACTAGG CTACAACAAT CTTTTGGGAA AAAGGGTCTT  GATTTGAACG ACTTGGTCTT ACTATCTAGT GCACACACCA TTGGAGTTTC TCACTGCTCC TCATTTTCGG AGCGTCTATA CAATTTCACA GAGATTCTTG GTACACAAGA TCCATCTCTA  GACAGCGAAT ACGCGGATAA TCTCAAGTCC AGAAAATGCA AATCAATCAA CGATAATACC ACTACCGTTG AGATGGATCC AGGTAGTTTC AAGACATTTG ATCTTAGCTA CTATAAGCTT  CTGCTCAAAA GGAGAGGTTT ATTCCAATCT GATGCAGCTT TAACAAAACG TACCACAACG AAGTCATTTA TCGAACAGCT TGTCGAGGGA TCACTCAAAG AATTCTACGC TGAATTTGCT  AAGGCAATGG AGAAAATGGG GAGAGTTGAA GTTAAAACAG GCAGTGCTGG CGAAATCAGG AAGCAATGTG CATTTGTGAA TAGTTAAAAG TTCACTTTTC TTTATTATTT CAAGTTTAAA 
TTAATGATTT TGTGAATGTA TTTGTTTGTT AATTTCCTCT GAGTGAGTAG TTTGGTGTAA TATGTATCAT TATTCATGTA CTTCTATATT TACTTTATCC TAATTTTAC 

Retrieve as FASTA