Entry information : NtPrx20-1B(Nitab4.5_0021096g0010)
Entry ID 7211
Creation 2010-02-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx20-1B(Nitab4.5_0021096g0010)
Name NtPrx20-1B(Nitab4.5_0021096g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx20-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx20-1A 662 0 1..329 1..329
LePrx01 606 0 1..329 1..328
StPrx54 604 0 1..329 1..328
NtPrx47-1B 565 0 1..328 1..328
Literature and cross-references NtPrx20-1B(Nitab4.5_0021096g0010)
EST ref. GenBank:   EB449434.1 [5' end]   DV160124.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx20-1B(Nitab4.5_0021096g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (306)
PWM (Da):   %s   35870.36 (33568.1)  
PI (pH):   %s   8.78 (8.73) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFSYLSIL VLCILGIVSS GHAQLQLNFY AKSCPKAEKI IKDFVQKQVP KAPNTAAAIL RMHFHDCFVR GCDGSVLLNF TSSTGNQTEK QANPNLTLRG FSFIDAVKRL VEAECPGIVS  CADIIALVAR DAVVVTGGPS WNVPTGRRDG RISNVSEANA DIPAPTSNFT RLQQSFGKKG LDLNDLVLLS SAHTIGVSHC SSFSERLYNF TGILGTQDPS LDSEYADNLK SRKCKSINDN 
TTIVEMDPGS FKTFDLSYYK LLLKRRGLFQ SDAALTKRTT TKSFIEQLVE GSLKEFYAEF AKAMEKMGRV EVKTGSAGEI RKQCAFVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from Genomic and ESTs (FS429801.1, FS378575.1, EB451764.1). Uncorrect prediction from SGN (splicing error introns 2).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTAGCTATTT GAGTATTCTG GTTTTATGTA TTCTTGGAAT AGTAAGCTCT GGACATGCTC AATTGCAGCT TAATTTCTAT GCCAAGAGCT GTCCAAAAGC TGAGAAAATC  ATTAAAGACT TTGTCCAAAA ACAAGTTCCA AAAGCTCCAA ATACTGCAGC TGCCATACTT AGAATGCATT TCCATGATTG CTTTGTTAGG GTAAGTATAG TACTATGATT TATTTGCCAT  GTGCCCATGT TTCACATATA GAATTTCTTT ATATACTTAA TTAATGTGCT TTGCTCTGAT TCTTGTTTCT TCTCTGTTTT GTTCTTTGCA GGGTTGTGAT GGATCTGTAC TTCTTAATTT  CACTTCAAGT ACAGGAAACC AAACTGAAAA ACAAGCTAAT CCTAATCTAA CATTGAGAGG CTTCTCCTTC ATTGATGCTG TTAAAAGATT AGTTGAAGCT GAATGCCCTG GAATTGTCTC  TTGTGCTGAT ATTATTGCCT TGGTTGCTAG AGATGCAGTT GTAGTCACAG TAAGTCCAAA ACTTGAAGAA ATTAACAAAA TACTCTCTTC TTGAACCCAC AGACCTCACC TGTGAAAACA  TACTGGGGTC TGTTGTTGTC GTTGTACTCC GTGGCGGATC TAGAGTGCAG TTACTGAGTT CCGGCAACCC AATAACTTTT GCGTAGACCC TGTATTTCTA TTAAAAAATC CATTAAATAT  TTATAAATAT CTAATTGTGA ACCCAGTTAG TATTGTATAT TAATTCAAGA TTACGACAGG AACCCATATA CTTTAAATCC TGGATCCACC TTTGGTTGTA CTCTCTTCTT GAACCATTTT  CTATACGTAT TAACTATCTT CTTTTCTTGT TGTTGTTGTT ATTGTCACTT GGCATAATAG GGAGGTCCTT CTTGGAATGT GCCAACTGGT AGAAGAGATG GAAGAATATC AAATGTTTCA  GAAGCCAATG CTGATATCCC AGCTCCAACT AGTAACTTCA CTAGGCTACA ACAATCTTTT GGGAAAAAGG GTCTTGATTT GAACGACTTG GTCTTACTAT CTAGTATGAG TTTAAGTTCT  GTGCACTATA TAATATTCTT ACATCATTAT CAGGTTAAAT TACCCGCAAT AACATGTATA ACTTGTTTTT ATTTATAGGT GCACACACCA TTGGAGTTTC TCACTGCTCC TCATTTTCGG  AGCGTCTATA CAATTTCACA GGGATTCTTG GTACACAAGA TCCATCTCTA GACAGCGAAT ACGCGGATAA TCTCAAGTCC AGAAAATGCA AATCAATCAA CGATAATACC ACTATCGTTG  AGATGGATCC AGGTAGTTTC AAGACATTTG ATCTTAGCTA CTATAAGCTT CTGCTCAAAA GGAGAGGTTT ATTCCAATCT GATGCAGCTT TAACAAAACG TACCACAACG AAGTCATTTA  TCGAACAGCT TGTCGAGGGA TCACTCAAAG AATTCTACGC TGAATTTGCT AAGGCAATGG AGAAAATGGG GAGAGTTGAA GTTAAAACAG GCAGTGCTGG TGAAATCAGG AAGCAATGTG 
CATTTGTGAA TAGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTAGCTATTT GAGTATTCTG GTTTTATGTA TTCTTGGAAT AGTAAGCTCT GGACATGCTC AATTGCAGCT TAATTTCTAT GCCAAGAGCT GTCCAAAAGC TGAGAAAATC  ATTAAAGACT TTGTCCAAAA ACAAGTTCCA AAAGCTCCAA ATACTGCAGC TGCCATACTT AGAATGCATT TCCATGATTG CTTTGTTAGG GGTTGTGATG GATCTGTACT TCTTAATTTC  ACTTCAAGTA CAGGAAACCA AACTGAAAAA CAAGCTAATC CTAATCTAAC ATTGAGAGGC TTCTCCTTCA TTGATGCTGT TAAAAGATTA GTTGAAGCTG AATGCCCTGG AATTGTCTCT  TGTGCTGATA TTATTGCCTT GGTTGCTAGA GATGCAGTTG TAGTCACAGG AGGTCCTTCT TGGAATGTGC CAACTGGTAG AAGAGATGGA AGAATATCAA ATGTTTCAGA AGCCAATGCT  GATATCCCAG CTCCAACTAG TAACTTCACT AGGCTACAAC AATCTTTTGG GAAAAAGGGT CTTGATTTGA ACGACTTGGT CTTACTATCT AGTGCACACA CCATTGGAGT TTCTCACTGC  TCCTCATTTT CGGAGCGTCT ATACAATTTC ACAGGGATTC TTGGTACACA AGATCCATCT CTAGACAGCG AATACGCGGA TAATCTCAAG TCCAGAAAAT GCAAATCAAT CAACGATAAT  ACCACTATCG TTGAGATGGA TCCAGGTAGT TTCAAGACAT TTGATCTTAG CTACTATAAG CTTCTGCTCA AAAGGAGAGG TTTATTCCAA TCTGATGCAG CTTTAACAAA ACGTACCACA  ACGAAGTCAT TTATCGAACA GCTTGTCGAG GGATCACTCA AAGAATTCTA CGCTGAATTT GCTAAGGCAA TGGAGAAAAT GGGGAGAGTT GAAGTTAAAA CAGGCAGTGC TGGTGAAATC 
AGGAAGCAAT GTGCATTTGT GAATAGTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGTAGAGA AACACATTAA AGAAAAGAAA GGTTTCTTTT GAGACAGAGG AAAAAATGGC TTCATTTAGC TATTTGAGTA TTCTGGTTTT ATGTATTCTT GGAATAGTAA GCTCTGGACA  TGCTCAATTG CAGCTTAATT TCTATGCCAA GAGCTGTCCA AAAGCTGAGA AAATCATTAA AGACTTTGTC CAAAAACAAG TTCCAAAAGC TCCAAATACT GCAGCTGCCA TACTTAGAAT  GCATTTCCAT GATTGCTTTG TTAGGGGTTG TGATGGATCT GTACTTCTTA ATTTCACTTC AAGTACAGGA AACCAAACTG AAAAACAAGC TAATCCTAAT CTAACATTGA GAGGCTTCTC  CTTCATTGAT GCTGTTAAAA GATTAGTTGA AGCTGAATGC CCTGGAATTG TCTCTTGTGC TGATATTATT GCCTTGGTTG CTAGAGATGC AGTTGTAGTC ACAGGAGGTC CTTCTTGGAA  TGTGCCAACT GGTAGAAGAG ATGGAAGAAT ATCAAATGTT TCAGAAGCCA ATGCTGATAT CCCAGCTCCA ACTAGTAACT TCACTAGGCT ACAACAATCT TTTGGGAAAA AGGGTCTTGA  TTTGAACGAC TTGGTCTTAC TATCTAGTGC ACACACCATT GGAGTTTCTC ACTGCTCCTC ATTTTCGGAG CGTCTATACA ATTTCACAGG GATTCTTGGT ACACAAGATC CATCTCTAGA  CAGCGAATAC GCGGATAATC TCAAGTCCAG AAAATGCAAA TCAATCAACG ATAATACCAC TATCGTTGAG ATGGATCCAG GTAGTTTCAA GACATTTGAT CTTAGCTACT ATAAGCTTCT  GCTCAAAAGG AGAGGTTTAT TCCAATCTGA TGCAGCTTTA ACAAAACGTA CCACAACGAA GTCATTTATC GAACAGCTTG TCGAGGGATC ACTCAAAGAA TTCTACGCTG AATTTGCTAA  GGCAATGGAG AAAATGGGGA GAGTTGAAGT TAAAACAGGC AGTGCTGGTG AAATCAGGAA GCAATGTGCA TTTGTGAATA GTTAAAAGTT CACTTTTCTT TATTATTTCA AGTTTAAATT  AATGATTTTG TGAATGTATT TGTTTGTTAA TTTCCTCTGA GTGAATAGTT TGGTGTAATA TGTATCATTA TTCATGTACT TCTATATTTA CTTTATCCTA ATTTTGCAAC TTGCTGGTGT 
TCTAGCAATA AAAATAGTAA TGAAATTGAA AAAGTGGGAA TCTTTCCTGG C 

Retrieve as FASTA