Entry information : NtPrx21-1A(Nitab4.5_0000780g0010)
Entry ID 7212
Creation 2010-02-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx21-1A(Nitab4.5_0000780g0010)
Name NtPrx21-1A(Nitab4.5_0000780g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx21-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx21-1B 652 0 1..329 23..351
StPrx49 581 0 1..329 1..327
StPrx29 574 0 1..329 1..327
NtPrx47-1A 574 0 1..328 35..362
Literature and cross-references NtPrx21-1A(Nitab4.5_0000780g0010)
DNA ref. GenBank:   FI030377.1 [5' end]
EST ref. GenBank:   EB684025.1 [5' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.12492
Protein sequence: NtPrx21-1A(Nitab4.5_0000780g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35608.98 Transmb domain:   %s   i21-40o
PI (pH):   %s   8.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATLGYLCSL ILMCILGLLG SSDAQLQPNF YAKSCPKAEK TIQDYVQKHI PNAPSLAAAL IRMHFHDCFV RGCDASVLLN STSSTGNQTE KVGIPNQTLR GFDFIDAVKK VVEAECPGVV  SCADIVALIA RDSVVATGGP YWNVPTGRRD GRISNVSETT DIPAPFNNLS SLQTSFAKKG LDLKDLVLLS GAHTIGISHC SSFSTRLYNF TGTFGTQDPS LDSEYAANLK AKKCKSLDDN 
TTKVEMDPGS SRTFDLSYYK LLLKRRGLFQ SDAALTTTTI TKSYVNQLVD GSFKEFYTEF AQAMEKMGRI EVKTGSAGEI RKHCAVVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 6 ESTs. Unigene compiles ESTs from both alleles. Uncorrect prediction from SGN (Short PS and exon 3 are missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TAGGCTATTT GTGTTCTTTA ATATTGATGT GTATTCTAGG ACTCCTAGGA TCAAGCGATG CTCAATTGCA ACCAAACTTT TATGCAAAGA GCTGTCCAAA AGCAGAGAAG  ACCATTCAAG ACTATGTCCA GAAGCACATT CCAAATGCTC CATCTCTTGC CGCTGCCTTA ATTAGAATGC ATTTTCATGA TTGCTTTGTC AGGGTAATTA TTAATTACTA TATATGTCTT  GTTATTATAA CACTTGAACA TACCATTTGA GAATTGCATA GTTGTTATGC TTATTTTGAT CTTTTTTCTT TCTTTTTGGG GTCTTAATTT ACAATTTTGC AGGGTTGCGA TGCTTCAGTG  CTCCTGAATT CACTTGAACA TACCATTTGA AAATTGCATA GTTGTTATGC TTATTTTGAT CTTTTTTCTT TCTTTTTGGG GTCTTAATTT ACAATTTTGC AGGGTTGCGA TGCTTCAGTG  CTCCTGAATT CACTTGAACA TACCATTTGA AAATTGCATA GTTGTTATGC TTATTTTGAT CTTTTTTCTT TCTTTTTGGG GTCTTAATTT ACAATTTTGC AGGGTTGCGA TGCTTCAGTG  CTCCTGAATT CAACATCAAG TACAGGAAAC CAGACCGAAA AAGTAGGAAT CCCTAATCAA ACACTGAGAG GCTTCGATTT CATTGATGCT GTGAAAAAAG TAGTTGAAGC TGAATGTCCT  GGAGTAGTCT CTTGTGCCGA TATCGTTGCA TTGATTGCTA GAGACTCTGT TGTGGCCACT GTAAGACAAT AAGTTCAACT ATCTAAGCCA TTTGGAATCT TTACACAAAC ATCCGTTTGG  AATCTGTTTA CTATGTATAG CCAGATTATA CACCAGTATA TATATTTTAT ACATTCACCG ATTATTTTTA GTTTAAGTTG TTGGATGGAC GGCTATTTAG TTTAATACTT CTAAACATTA  GTTTTCTATT TATAATGACC ATCTTCTTCT TGGGAATGAT AGGCGCCACA CTGAACCAAG GGGTGTCATA TTTTATGTAT AGTTACTATA CGTTGACTCC CCTTGACTTT TTGATGTATC  TAATTTTTTA TATTTTGACA CCTCTTGATG AAAATTCTGG CTCCTCCACT AACAGGGAGG CCCTTATTGG AATGTGCCAA CTGGGAGAAG AGATGGAAGA ATCTCTAACG TTTCAGAAAC  CACAGATATT CCAGCTCCAT TCAATAACTT ATCTAGTCTC CAGACTTCTT TTGCTAAGAA GGGCCTTGAC CTCAAAGACT TGGTTCTATT ATCTGGTAAG CCAAAAATAA TTCACATGCT  TATTTACTCC TTCTGTTTTA ATTTAGATGA GTTAGTTTCA CTTGACATAA AGTTTAAGAA AAAAAAGAAG ATCGTAAAAG CTTAAGGGGT AAAAGCTTTG TGAGGTCATA ATATTTGTGT  GACTATAAAA ACTTTTCGTT AAGGATAAAC TGAGTAAAAT GAAAAGTTCA AAGATAATTG TTTCCAAATA TAGAAATGTG TCATTCTTTT TGGAACGTAC TAATAAGAAA AGTATGTTAT  TTAAATTGAA ACGGAGGTAG TATTACTTCT TTGTTATGCC CTGACTGCCT GATAAGTATG GCATGTGTAT AGGTGCATTT TCAAGAGAGC AAGGGGTGTT AACCAATACT GCTTCCAAAA  AGTTTTCTTA TATTAGTGTA GATAATATTT TTCCAAGAAA CTATATTCAT ATAACTTCAT ATGGGTTCCA CGCAGTTTTA TCTACAACGA GTCCAATGCG GATAGAACAT CTAGTAGCGG  ACCGATTAAA TTCTGTTAAT GAAAATAGTG CTCCTAATTC ATTATTCTTA AAAATAATGC AGATACTAGT AAATAATAAT TTGGTACAAA AAAGTCGAGA CACGATCTCA CTTAGCAGCA  GAATTGTGAA ACTGTAAGAG TATAAGTCGA TACTGATTAT GCAAAATCCT GTGAATGCCA CTGTATAGGT GTTAACTATA ATTTCCATTG ATAATATATA ATTCTTTCAG GTGCTCATAC  CATTGGAATC TCTCATTGCT CATCATTTTC AACACGTTTA TACAATTTCA CTGGAACTTT TGGTACTCAA GATCCATCTT TAGACAGTGA ATATGCAGCT AACCTTAAGG CCAAAAAATG  CAAATCGCTC GATGATAACA CAACAAAAGT TGAGATGGAC CCAGGGAGTT CCAGGACATT TGATCTTAGC TATTACAAGC TTCTACTCAA AAGGAGAGGC CTCTTTCAAT CTGATGCTGC  CTTGACAACT ACTACTATAA CAAAGTCATA TGTCAACCAA CTCGTCGACG GATCATTCAA AGAGTTCTAT ACTGAATTTG CTCAGGCAAT GGAAAAAATG GGAAGAATTG AAGTTAAGAC 
AGGCTCTGCT GGTGAAATTA GGAAGCACTG TGCGGTTGTG AATAGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TAGGCTATTT GTGTTCTTTA ATATTGATGT GTATTCTAGG ACTCCTAGGA TCAAGCGATG CTCAATTGCA ACCAAACTTT TATGCAAAGA GCTGTCCAAA AGCAGAGAAG  ACCATTCAAG ACTATGTCCA GAAGCACATT CCAAATGCTC CATCTCTTGC CGCTGCCTTA ATTAGAATGC ATTTTCATGA TTGCTTTGTC AGGGGTTGCG ATGCTTCAGT GCTCCTGAAT  TCAACATCAA GTACAGGAAA CCAGACCGAA AAAGTAGGAA TCCCTAATCA AACACTGAGA GGCTTCGATT TCATTGATGC TGTGAAAAAA GTAGTTGAAG CTGAATGTCC TGGAGTAGTC  TCTTGTGCCG ATATCGTTGC ATTGATTGCT AGAGACTCTG TTGTGGCCAC TGGAGGCCCT TATTGGAATG TGCCAACTGG GAGAAGAGAT GGAAGAATCT CTAACGTTTC AGAAACCACA  GATATTCCAG CTCCATTCAA TAACTTATCT AGTCTCCAGA CTTCTTTTGC TAAGAAGGGC CTTGACCTCA AAGACTTGGT TCTATTATCT GGTGCTCATA CCATTGGAAT CTCTCATTGC  TCATCATTTT CAACACGTTT ATACAATTTC ACTGGAACTT TTGGTACTCA AGATCCATCT TTAGACAGTG AATATGCAGC TAACCTTAAG GCCAAAAAAT GCAAATCGCT CGATGATAAC  ACAACAAAAG TTGAGATGGA CCCAGGGAGT TCCAGGACAT TTGATCTTAG CTATTACAAG CTTCTACTCA AAAGGAGAGG CCTCTTTCAA TCTGATGCTG CCTTGACAAC TACTACTATA  ACAAAGTCAT ATGTCAACCA ACTCGTCGAC GGATCATTCA AAGAGTTCTA TACTGAATTT GCTCAGGCAA TGGAAAAAAT GGGAAGAATT GAAGTTAAGA CAGGCTCTGC TGGTGAAATT 
AGGAAGCACT GTGCGGTTGT GAATAGTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACTAAGGAC GTGACATTAG TGCCTATAAA AAAACTCAGA TGTTCTTGGA ATTGATGTGT GTCAAGAAAC ACAACAAAGG AAAGAACATA TCTCCTTTTG AAGATTAGAA ACAAAATGGC  TACATTAGGC TATTTGTGTT CTTTAATATT GATGTGTATT CTAGGACTCC TAGGATCAAG CGATGCTCAA TTGCAACCAA ACTTTTATGC AAAGAGCTGT CCAAAAGCAG AGAAGACCAT  TCAAGACTAT GTCCAGAAGC ACATTCCAAA TGCTCCATCT CTTGCCGCTG CCTTAATTAG AATGCATTTT CATGATTGCT TTGTCAGGGG TTGCGATGCT TCAGTGCTCC TGAATTCAAC  ATCAAGTACA GGAAACCAGA CCGAAAAAGT AGGAATCCCT AATCAAACAC TGAGAGGCTT CGATTTCATT GATGCTGTGA AAAAAGTAGT TGAAGCTGAA TGTCCTGGAG TAGTCTCTTG  TGCCGATATC GTTGCATTGA TTGCTAGAGA CTCTGTTGTG GCCACTGGAG GCCCTTATTG GAATGTGCCA ACTGGGAGAA GAGATGGAAG AATCTCTAAC GTTTCAGAAA CCACAGATAT  TCCAGCTCCA TTCAATAACT TATCTAGTCT CCAGACTTCT TTTGCTAAGA AGGGCCTTGA CCTCAAAGAC TTGGTTCTAT TATCTGGTGC TCATACCATT GGAATCTCTC ATTGCTCATC  ATTTTCAACA CGTTTATACA ATTTCACTGG AACTTTTGGT ACTCAAGATC CATCTTTAGA CAGTGAATAT GCAGCTAACC TTAAGGCCAA AAAATGCAAA TCGCTCGATG ATAACACAAC  AAAAGTTGAG ATGGACCCAG GGAGTTCCAG GACATTTGAT CTTAGCTATT ACAAGCTTCT ACTCAAAAGG AGAGGCCTCT TTCAATCTGA TGCTGCCTTG ACAACTACTA CTATAACAAA  GTCATATGTC AACCAACTCG TCGACGGATC ATTCAAAGAG TTCTATACTG AATTTGCTCA GGCAATGGAA AAAATGGGAA GAATTGAAGT TAAGACAGGC TCTGCTGGTG AAATTAGGAA  GCACTGTGCG GTTGTGAATA GTTAAGTGGT CTTTGTTTCA TTTTCTTTTT TGGTTCTACG GCTCGTATTT GTACGAGCCC TTTGTTAAGA TAGTTTGGGC CAAAATGTGT TATGTTCCTT 
TTGTATTTAT TAATTCTATT CGATTTTGTA ACTTGATGGT TATTTTGAAT AAATTATATA TATATATATG ATGTGAA 

Retrieve as FASTA