Entry information : NtPrx23-1A(Nitab4.5_0004095g0030)
Entry ID 7218
Creation 2010-02-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx23-1A(Nitab4.5_0004095g0030)
Name NtPrx23-1A(Nitab4.5_0004095g0030)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx017]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx23-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx23-1B 657 0 2..334 3..335
StPrx45 572 0 3..334 49..381
LePrx77 560 0 3..334 2..334
GhPrx05 416 4e-147 10..332 2..323
Literature and cross-references NtPrx23-1A(Nitab4.5_0004095g0030)
EST ref. GenBank:   FS403277.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx23-1A(Nitab4.5_0004095g0030)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334
PWM (Da):   %s   36736.81 Transmb domain:   %s   i12-29o
PI (pH):   %s   8.56
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAALCKRNPK SLIFSSVMCF LIQITALNGQ LRVGFYSQRC HNAESIVSSV VKEASQREPR MPAMLLRLHF HDCFVQGCDG SILIDNVKEP ERNAFGHEGL GGFEEIQKAK TQLEGQCPGV  VSCADIVALA ARDAVVLAGG PFYEVETGRR DGRVSDLSLA AAMPDVDDSI DVLKGKFKNK GFTEKELVIL SGAHTIGTTA CFFMPRRLYN FTGRSDADPS INSKFLPELR SKCPKNGNIN 
FRIPLDNASE RKFDDQILHN IKNGFAVIAS DARLYDDKIT RAVIDSYLQR NKSIRNSPSF ASDFGLTMIK LGRLDVKTGL VGEIRKVCNS FNKM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from 2 ESTs (FS373437.1). Large 3'end is missing. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1, XX in the sequence, 3' is missing due to splicing error)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAT TGTGCAAGAG AAATCCAAAG AGTTTAATTT TCAGTTCAGT TATGTGCTTT CTAATACAAA TAACAGCTCT AAATGGACAA CTTAGAGTTG GATTTTATTC ACAAAGATGC  CATAACGCAG AATCCATTGT TAGCTCTGTC GTAAAAGAAG CTTCCCAAAG AGAACCAAGA ATGCCAGCCA TGTTACTTAG ACTCCATTTC CATGATTGCT TTGTTCAGGT ACCTAGCTTT  TTATCTTCCA CTTTTTTAGT ATGTCAACCT TATTCAATTT TAACCGAACA TTTTTTTTAA ATATTTTTAA AGGGTTGTGA TGGATCAATT TTGATTGATA ATGTGAAAGA ACCTGAAAGA  AATGCATTTG GTCACGAAGG CCTGGGGGGA TTTGAAGAGA TCCAGAAAGC CAAAACTCAA TTGGAAGGTC AATGCCCAGG GGTGGTATCG TGTGCAGATA TTGTTGCTTT AGCTGCTAGA  GACGCTGTCG TCTTGGTAAT GCATTAACCC ACTTGAGTTA TATATACACT AACATTAACT CTATTAGTTT AGTTTAATAA GGGCTAGCAG GTTAGTTATT ATCTTTATTA TAGGTTATTA  TTAATGTTTA TCATAATGAT TTACTTGTAG TTATCTTGTA ATTAATTTGG TTGCGCAAAT ATTTTTTACA CCGTCACTAC ATAAAACTTA AACTTTTGAC CAAAAACTAA ATTATTTTCC  ATACATAATT GACTCCGGAT ACTATTATTT CGATTTTAAT TTCTTCCTTA CGATTAAATG TGAAAATGTA CTAATTAAGG CGGAATAGCA TGTCTTTAGT CATGTGTATG ACATTTTTTT  TTCCTTTCAA TTTCATGTTC TTTTTGTGTA ATTTGAGATT ATTAAGAAAG AGCTCCATGT TAGGATTACT GTGTTGTCGA ATTAAGATAT AAAAAAATTC CGATCTTTCG TGATATATAT  ATAATGAATT GATGATTATG TAATTGCATT TTCTAAATTA AGAGATACTT AGTAACAGTC TAATTCTCTT TTGATACATT ATGAGATATA GGCTGGTGGA CCATTTTATG AAGTTGAGAC  AGGTAGAAGA GATGGTAGAG TATCCGATTT GTCTCTTGCA GCTGCAATGC CGGATGTGGA TGACTCAATT GATGTTTTAA AAGGAAAATT CAAAAATAAA GGCTTTACTG AAAAAGAACT  CGTCATTTTG AGTGGTATGA TCTATTCCTT CTACTTCAAT TTTATCCATT GGTATGATAT ATATAACCCT TCTATTTCAT TTATTAAAGT TAACTTACAC ATACAATATA ACAGGGATAC  TGTAATTATA GCAAGTTACA TATCGTATTT ATAGATTGTT AATTCCACAA GTTAACTATC TTTTTAGTGA ATTACAACTT GTTTGACCAA ACTGCAAAAA TCAGTTTATT TTGAGAAGTG  TTTTTTCTTA AAAGTGTTTT TTTGGTGAGG AGCAGTTTGT GTTTGACTAA TTTATTTGAA ATGCACTTCT GAATAGCAAT TAGTGTTTGA CCAAGCTTTT AAAAACTGCT TCTAAGTAGG  GATGACAAAA TGGTTTTAAA AAAATAGTTA ATCACCCATA TTATCCACTA AAAATGGATT GGATAGTGAA ACTTTTTTAA AAACAAGTCA AATATGGATA AGAACCATAT TATCCATTCA  GAAAATGGAT AACCAATGAG TCTAACTTTT ACATTTGAAA AGCATCAAAT CGGGGATTCC TCAAGTTAGG GAGACTAAGA ATTCTCCCAA AAGTGATCAT ATGTAAAAAA TCATGGATAA  TATAGTTACC CATATTATCC GTCGGTTAAA CCGTTTTTTA TCCATATTAA ATATGGGTTG GGTCGGATAA TTTATCCGTT TTTTCATTAC CCATTTCGAC TCGAACCATA TCCGATCCGA  CCCGCCCGTT TGACACTCCT ACTTCTAAGT CTATTTTTCT CAAAAGTGCT ATTTCTTTTT TTAGAGAAGC TACTTTTTTC TGCTTCTCCT CAAAAATACT TTTTTCCCTC TAAAAGCTTG  GCCAAACACT TCAATTTTCG AAAAAAAAAT GTTTTGGCTT GGAAAAGCTT GACCAAACAA GCTATTAATC GAGTAAAAAT TCCTTTGTAC TTTCAGCATA TAAAAATTAA ACTCGTATAA  TAAGACAGGT AAATAGTGAT GCTAATTGTA AACAGTGGCG GATCCACCTT GAGAGGTGGG GGTGCCATGC CACCCACAAG TTAGGCGAGA ACTTTTAGAA TCTATGTTGA AACTTTTCAG  AATATTGATT AAATGTATAC GCTGCCACCC GTAATATCAA ACAAGAGGAC GGTGCCATTG TTGGGAATTA ATTTCTTAAA GTTATTCTTG TGTTTAGGCT TAGGTTCGGG TCnAACTTAA  AATTATCAAA GCACCATAAA TAAAAACCAT GGCTCTTAAT TCAAAATTCT GGCACTTATG TAAATAAAAA GTTTTACAAG ATTATTCTCT TTAAAATTCT GTTAGCTTGT ATATATTATA  TAAAAAGTGC AATTGTCCTA TTGCTTGCAA GGTATAATTT CTTTTTCAAA AATATTTTTT TGCTTATGCT CTTATAGAAT TAGTGTGATT CTACTATTAA AAATACTCTC ACTTATGCAA  AAATTTTAAT AAAAAAGGCA TGATTCCTTA ATTGAAGGAA GATTGCTAAT TTTTACTTGT GCTCATTTAT TTTATATCAA ATTGTGTTGA TTTCTCTATT GAAAATATCG TTAAATTTAG  TAAACCACCC CCAATGAACT GAAAATAGAT CGAACCAAAT TGAATCCAAC CAATATATAC TCACACTCAA ACTTTATGGT CAGTGTGAGG GGTACATTAA AAGAAATGTG GCACCCGCTA  TCTTTAAATC CTAAATCCGC CTCTGATTGT AAACATACAG AATCATGGAT ACAATATAGC TATAATATCA TATATTATTG TCACTATATT TTAAGTTGAC ATTAATTAAT GCATCATGTT  AAACATGTAG GGGCACATAC AATTGGCACA ACAGCTTGTT TTTTCATGCC TCGAAGATTA TACAATTTCA CTGGAAGATC AGATGCAGAT CCAAGTATTA ATTCTAAGTT CCTCCCAGAG  TTAAGAAGCA AATGCCCCAA AAATGGAAAC ATAAATTTCA GAATACCTCT TGATAACGCA AGCGAACGAA AATTTGACGA TCAGATTTTG CACAACATAA AGAATGGTTT CGCAGTTATA  GCATCGGATG CAAGGCTTTA TGACGACAAA ATTACGCGAG CAGTGATCGA TTCTTATCTT CAGAGAAATA AATCAATTCG TAATTCACCA TCATTTGCAT CGGATTTTGG TTTAACCATG 
ATAAAGTTAG GAAGGCTTGA TGTCAAGACT GGATTAGTAG GAGAGATTAG AAAGGTTTGT AATTCTTTTA ATAAAATGTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAT TGTGCAAGAG AAATCCAAAG AGTTTAATTT TCAGTTCAGT TATGTGCTTT CTAATACAAA TAACAGCTCT AAATGGACAA CTTAGAGTTG GATTTTATTC ACAAAGATGC  CATAACGCAG AATCCATTGT TAGCTCTGTC GTAAAAGAAG CTTCCCAAAG AGAACCAAGA ATGCCAGCCA TGTTACTTAG ACTCCATTTC CATGATTGCT TTGTTCAGGG TTGTGATGGA  TCAATTTTGA TTGATAATGT GAAAGAACCT GAAAGAAATG CATTTGGTCA CGAAGGCCTG GGGGGATTTG AAGAGATCCA GAAAGCCAAA ACTCAATTGG AAGGTCAATG CCCAGGGGTG  GTATCGTGTG CAGATATTGT TGCTTTAGCT GCTAGAGACG CTGTCGTCTT GGCTGGTGGA CCATTTTATG AAGTTGAGAC AGGTAGAAGA GATGGTAGAG TATCCGATTT GTCTCTTGCA  GCTGCAATGC CGGATGTGGA TGACTCAATT GATGTTTTAA AAGGAAAATT CAAAAATAAA GGCTTTACTG AAAAAGAACT CGTCATTTTG AGTGGGGCAC ATACAATTGG CACAACAGCT  TGTTTTTTCA TGCCTCGAAG ATTATACAAT TTCACTGGAA GATCAGATGC AGATCCAAGT ATTAATTCTA AGTTCCTCCC AGAGTTAAGA AGCAAATGCC CCAAAAATGG AAACATAAAT  TTCAGAATAC CTCTTGATAA CGCAAGCGAA CGAAAATTTG ACGATCAGAT TTTGCACAAC ATAAAGAATG GTTTCGCAGT TATAGCATCG GATGCAAGGC TTTATGACGA CAAAATTACG  CGAGCAGTGA TCGATTCTTA TCTTCAGAGA AATAAATCAA TTCGTAATTC ACCATCATTT GCATCGGATT TTGGTTTAAC CATGATAAAG TTAGGAAGGC TTGATGTCAA GACTGGATTA 
GTAGGAGAGA TTAGAAAGGT TTGTAATTCT TTTAATAAAA TGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAACTACTAC TACCACCAAA ATTTTCCATT GATCTTTCAT TTGCACACTT CTTCTGCTTC CTTTGTAACT TGACTACTAC TACCACCAAA ATTTTCCATT GATCTTTCAT TTGCACACTT  CTTCTGCTTC CTTTGTAATC TAACAATGGC GGCATTGTGC AAGAGAAATC CAAAGAGTTT AATTTTCAGT TCAGTTATGT GCTTTCTAAT ACAAATAACA GCTCTAAATG GACAACTTAG  AGTTGGATTT TATTCACAAA GATGCCATAA CGCAGAATCC ATTGTTAGCT CTGTCGTAAA AGAAGCTTCC CAAAGAGAAC CAAGAATGCC AGCCATGTTA CTTAGACTCC ATTTCCATGA  TTGCTTTGTT CAGGGTTGTG ATGGATCAAT TTTGATTGAT AATGTGAAAG AACCTGAAAG AAATGCATTT GGTCACGAAG GCCTGGGGGG ATTTGAAGAG ATCCAGAAAG CCAAAACTCA  ATTGGAAGGT CAATGCCCAG GGGTGGTATC GTGTGCAGAT ATTGTTGCTT TAGCTGCTAG AGACGCTGTC GTCTTGGCTG GTGGACCATT TTATGAAGTT GAGACAGGTA GAAGAGATGG  TAGAGTATCC GATTTGTCTC TTGCAGCTGC AATGCCGGAT GTGGATGACT CAATTGATGT TTTAAAAGGA AAATTCAAAA ATAAAGGCTT TACTGAAAAA GAACTCGTCA TTTTGAGTGG  GGCACATACA ATTGGCACAA CAGCTTGTTT TTTCATGCCT CGAAGATTAT ACAATTTCAC TGGAAGATCA GATGCAGATC CAAGTATTAA TTCTAAGTTC CTCCCAGAGT TAAGAAGCAA  ATGCCCCAAA AATGGAAACA TAAATTTCAG AATACCTCTT GATAACGCAA GCGAACGAAA ATTTGACGAT CAGATTTTGC ACAACATAAA GAATGGTTTC GCAGTTATAG CATCGGATGC  AAGGCTTTAT GACGACAAAA TTACGCGAGC AGTGATCGAT TCTTATCTTC AGAGAAATAA ATCAATTCGT AATTCACCAT CATTTGCATC GGATTTTGGT TTAACCATGA TAAAGTTAGG  AAGGCTTGAT GTCAAGACTG GATTAGTAGG AGAGATTAGA AAGGTTTGTA ATTCTTTTAA TAAAATGTAA TAACATTTAT ATTGAGATAT AATATTACTT AATTAGTGTA CGTGTTTGTT  GTCCTCGAGA AGAATAAAAT CATGTGATGT TTCCCTATCT AACAATGGCG GCATTGTGCA AGAGAAATCC AAAGAGTTTA ATTTTCAGTT CAGTTATGTG CTTTCTAATA CAAATAACAG  CTCTAAATGG ACAACTTAGA GTTGGATTTT ATTCACAAAG ATGCCATAAC GCAGAATCCA TTGTTAGCTC TGTCGTAAAA GAAGCTTCCC AAAGAGAACC AAGAATGCCA GCCATGTTAC  TTAGACTCCA TTTCCATGAT TGCTTTGTTC AGGGTTGTGA TGGATCAATT TTGATTGATA ATGTGAAAGA ACCTGAAAGA AATGCATTTG GTCACGAAGG CCTGGGGGGA TTTGAAGAGA  TCCAGAAAGC CAAAACTCAA TTGGAAGGTC AATGCCCAGG GGTGGTATCG TGTGCAGATA TTGTTGCTTT AGCTGCTAGA GACGCTGTCG TCTTGGCTGG TGGACCATTT TATGAAGTTG  AGACAGGTAG AAGAGATGGT AGAGTATCCG ATTTGTCTCT TGCAGCTGCA ATGCCGGATG TGGATGACTC AATTGATGTT TTAAAAGGAA AATTCAAAAA TAAAGGCTTT ACTGAAAAAA 
GAACTC 

Retrieve as FASTA