Entry information : NtPrx08-1B(Nitab4.5_0000241g0260)
Entry ID 7235
Creation 2010-02-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx08-1B(Nitab4.5_0000241g0260)
Name NtPrx08-1B(Nitab4.5_0000241g0260)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx020]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Mixed tissues
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx08-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx08-1A 672 0 1..337 1..337
StPrx58 587 0 1..334 1..334
LePrx47 580 0 1..334 1..334
IaquPrx35 545 0 3..324 2..323
Literature and cross-references NtPrx08-1B(Nitab4.5_0000241g0260)
EST ref. GenBank:   FG192413.1 [5' end]   FG192506.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx08-1B(Nitab4.5_0000241g0260)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337 (317)
PWM (Da):   %s   37418.69 (35143.6) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   5.86 (5.53) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-337
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPYSHFFFFL LISLAFAAMA VPTLRPGFYT ETCPQAESIV KDVMKKAMKR EPRSVASVMR LQFHDCFVNG CDASLLLDDT PNMLGEKLAL SNINSLRSYE VVDEVKEALE RACPGVVSCA  DLLIMAARDA VVLTGGPNWE VKLGRLDSLT ASQEDSNQIM PSPRSNATYL IDLFSRYNLS MKDLVALSGS HSIGKGRCFS VVFRLYNQSG SGRPDPTIEP RFREKLDKLC PLGGDGNVTG 
DLDATPEVFD NQYFKDLVNG RGFLNSDQTL FTNPFTREYV REFSVSQKKF FMAFVEGMIK MGDLQSGQPG EIRQDCRVIN SRRPRVEVLF ETSNGGE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 3 ESTs (FG192506.1, FG192413.1, FG640485.1) and GSS.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTATA GCCATTTTTT CTTCTTTCTC CTTATAAGCT TAGCTTTTGC AGCTATGGCT GTTCCTACAC TTAGGCCAGG TTTTTACACA GAAACATGTC CACAAGCTGA ATCTATAGTC  AAAGATGTGA TGAAAAAAGC AATGAAAAGA GAGCCCAGAA GCGTAGCCTC AGTTATGAGA TTGCAGTTTC ATGATTGCTT TGTTAATGTA ATAAAAATTT CAAGAATCCA TTTTTTTTCC  TGTATTTGAA AATTCTTGTT TTGGGGTTAA TTTTTGTGTT TATTTATTTA TTTATAGGGA TGTGATGCGT CTTTGTTGTT GGATGATACA CCAAATATGC TTGGAGAAAA ACTGGCTTTA  TCAAATATAA ATTCACTGAG GTCTTATGAA GTTGTAGATG AAGTTAAAGA GGCACTGGAA AGAGCCTGCC CTGGTGTTGT TTCTTGTGCT GATCTTTTAA TCATGGCTGC CAGAGATGCT  GTTGTTCTGG TATATTTATA TTCTCATCTT TTCAACTTCC ATTTCCAAAA AAGGAAAAAA ATCATCTTTT TTGGGTGGTG GTGGTTAGGC TTGGCGTATC AAAGTTGCTG TCATATAACT  AGAAGTTCAC GGCTTTGAGC CGTGGAAATA GCCTCTTGCA CAAATGCAGG GTAAGGCGGT GTACAATAAA CCCCTGTGAT TCGGCCTTTA CTCGGACCCC GCGCATAGCG AAAGCTTAAT  GCACTGGTGT TGGTGTGGGA GGTGTGGGGA GATTTCCATA CTGAAACATT TCTTTTCTGA GTTTTTGCCT ACCAGCTAAT TAGAATTTTT TTGGGGGGGG AGTAGGGGGT GGGAGTGGTG  GAGGGGAGGA GAAGAAGGAT ATAATCATAT AAATATGTAT CTCAAAGTAA GCTTAATTGT TTTTTTCTTT TGATAAGGTC AAAGTAAGCT TTATGTAAAC CAAAGGAGCC CAAATAATTG  AATTTCTTTT GGTGTTCGAA ATAACTTTTG TGTATTTTGA TTATGCTATT GCGAACTTGC TACCTTCCAC TCCCACAAGC ATAGGTAATA GGAAATTCTG CCCATCAAAA ATTAAACAGA  TAAGAAATCA CATACTATAT TTCTGTCTCT GCCGGAATTT GAGGAATACA AGTAATTCAT TAGTATACTA AGTTCTTGGT ATTACAAATT GAGGAGTGAG TAGGGGTAAA AGAAAAAGGA  AAAGGAACCC CAAATTTTGT ACTACAGTAA TTATGATGAA AAATCTCCTC TTTTTCGTTT TCTTTTCCCT ATGTTGTCTT TTGAGTTACT TGGTAAAACA GAGGATCTTA TTTGTTTTAA  ACTTCTACTC AGACTGGAGG TCCAAATTGG GAAGTGAAGT TGGGAAGGCT AGATAGTTTA ACAGCAAGTC AAGAAGATTC AAACCAAATC ATGCCAAGCC CAAGATCAAA TGCAACATAT  CTCATTGATC TTTTCAGCAG ATATAATCTC TCAATGAAAG ATCTTGTAGC ACTTTCTGGT TCTCATTCCA TTGGCAAAGG AAGGTGTTTT TCTGTTGTCT TTAGGCTATA TAATCAGTCC  GGCTCGGGCC GGCCTGATCC TACCATTGAA CCAAGATTCA GAGAAAAGTT AGACAAGCTT TGTCCACTTG GTGGAGATGG GAATGTAACA GGAGATTTGG ATGCAACACC TGAAGTATTT  GACAATCAAT ATTTCAAAGA CTTGGTGAAT GGTAGAGGGT TCTTGAATTC AGATCAAACA CTTTTTACTA ATCCTTTTAC AAGGGAATAT GTAAGAGAAT TTAGTGTAAG TCAGAAGAAA  TTCTTTATGG CTTTTGTTGA AGGGATGATA AAGATGGGTG ACTTGCAATC TGGCCAGCCA GGTGAGATTA GACAGGATTG CAGAGTGATT AATAGCCGTC GTCCGCGTGT TGAAGTCTTG 
TTTGAGACTT CAAATGGAGG AGAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTATA GCCATTTTTT CTTCTTTCTC CTTATAAGCT TAGCTTTTGC AGCTATGGCT GTTCCTACAC TTAGGCCAGG TTTTTACACA GAAACATGTC CACAAGCTGA ATCTATAGTC  AAAGATGTGA TGAAAAAAGC AATGAAAAGA GAGCCCAGAA GCGTAGCCTC AGTTATGAGA TTGCAGTTTC ATGATTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCGT CTTTGTTGTT GGATGATACA  CCAAATATGC TTGGAGAAAA ACTGGCTTTA TCAAATATAA ATTCACTGAG GTCTTATGAA GTTGTAGATG AAGTTAAAGA GGCACTGGAA AGAGCCTGCC CTGGTGTTGT TTCTTGTGCT  GATCTTTTAA TCATGGCTGC CAGAGATGCT GTTGTTCTGA CTGGAGGTCC AAATTGGGAA GTGAAGTTGG GAAGGCTAGA TAGTTTAACA GCAAGTCAAG AAGATTCAAA CCAAATCATG  CCAAGCCCAA GATCAAATGC AACATATCTC ATTGATCTTT TCAGCAGATA TAATCTCTCA ATGAAAGATC TTGTAGCACT TTCTGGTTCT CATTCCATTG GCAAAGGAAG GTGTTTTTCT  GTTGTCTTTA GGCTATATAA TCAGTCCGGC TCGGGCCGGC CTGATCCTAC CATTGAACCA AGATTCAGAG AAAAGTTAGA CAAGCTTTGT CCACTTGGTG GAGATGGGAA TGTAACAGGA  GATTTGGATG CAACACCTGA AGTATTTGAC AATCAATATT TCAAAGACTT GGTGAATGGT AGAGGGTTCT TGAATTCAGA TCAAACACTT TTTACTAATC CTTTTACAAG GGAATATGTA  AGAGAATTTA GTGTAAGTCA GAAGAAATTC TTTATGGCTT TTGTTGAAGG GATGATAAAG ATGGGTGACT TGCAATCTGG CCAGCCAGGT GAGATTAGAC AGGATTGCAG AGTGATTAAT 
AGCCGTCGTC CGCGTGTTGA AGTCTTGTTT GAGACTTCAA ATGGAGGAGA GTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATATACCATT CATCTCCCTT TTCAAGAACC AATACAACAA ACGAAAAAAA TTAAACACTA GTAAAAAAAT ATCCAAGAAT CAAGAATGCC TTATAGCCAT TTTTTCTTCT TTCTCCTTAT  AAGCTTAGCT TTTGCAGCTA TGGCTGTTCC TACACTTAGG CCAGGTTTTT ACACAGAAAC ATGTCCACAA GCTGAATCTA TAGTCAAAGA TGTGATGAAA AAAGCAATGA AAAGAGAGCC  CAGAAGCGTA GCCTCAGTTA TGAGATTGCA GTTTCATGAT TGCTTTGTTA ATGGATGTGA TGCGTCTTTG TTGTTGGATG ATACACCAAA TATGCTTGGA GAAAAACTGG CTTTATCAAA  TATAAATTCA CTGAGGTCTT ATGAAGTTGT AGATGAAGTT AAAGAGGCAC TGGAAAGAGC CTGCCCTGGT GTTGTTTCTT GTGCTGATCT TTTAATCATG GCTACCAGAG ATGCTGTTGT  TCTGACTGGA GGTCCAAATT GGGAAGTGAA GTTGGGAAGG CTAGATAGTT TAACAGCAAG TCAAGAAGAT TCAAACCAAA TCATGCCAAG CCCAAGATCA AATGCAACAT ATCTCATTGA  TCTTTTCAGC AGATATAATC TCTCAATGAA AGATCTTGTA GCACTTTCTG GTTCTCATTC CATTGGCAAA GGAAGGTGTT TTTCTGTTGT CTTTAGGCTA TATAATCAGT CCGGCTCGGG  CCGGCCTGAT CCTACCATTG AACCAAGATT CAGAGAAAAG TTAGACAAGC TTTGTCCACT TGGTGGAGAT GGGAATGTAA CAGGAGATTT GGATGCAACA CCTGAAGTAT TTGACAATCA  ATATTTCAAA GACTTGGTGA ATGGTAGAGG GTTCTTGAAT TCAGATCAAA CACTTTTTAC TAATCCTTTT ACAAGGGAAT ATGTAAGAGA ATTTAGTGTA AGTCAGAAGA AATTCTTTAT  GGCTTTTGTT GAAGGGATGA TAAAGATGGG TGACTTGCAA TCTGGCCAGC CAGGTGAGAT TAGACAGGAT TGCAGAGTGA TTAATAGCCG TCGTCCGCGT GTTGAAGTCT TGTTTGAGAC  TTCAAATGGA GGAGAGTGAC TACCAACTGA ATTGGAGAAA GGTTTGAAAA AGTCTATTCT AGTTTTATGA TCAGAATAAT ATCAATCAGA TTGTTTGTTC TGATGTTTTA TGGGTAGCTT  TGTTTGGATT TTACTTCAGT ATTTCCTGGC TGACCATGAA GGGGAGTCTT GGCGTAACTG ATAAAGTTGT TGTCATGTGA CCGAGGTCAT GGGTTTGAGT CTTGTAAACA ACCTCTTGCA 

Retrieve as FASTA