Entry information : NtPrx13-1A(Nitab4.5_0001223g0010)
Entry ID 7243
Creation 2010-02-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx13-1A(Nitab4.5_0001223g0010)
Name NtPrx13-1A(Nitab4.5_0001223g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx047]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx13-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx13-1B 673 0 1..360 1..360
NtPrx27-1B 607 0 1..360 1..358
NtPrx27-1A 597 0 1..360 1..358
StPrx72 568 0 1..360 1..363
Literature and cross-references NtPrx13-1A(Nitab4.5_0001223g0010)
DNA ref. GenBank:   FH673678.1 [3' end]
EST ref. GenBank:   FG155339.1 [5' end]   FG162403.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx13-1A(Nitab4.5_0001223g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360 (340)
PWM (Da):   %s   38511.26 (36433.1) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   6.86 (6.26) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-360
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFRLSHLSL ALSLVALALA GVAIYRNTYE AMSKGFQTLS PEFDLLESAA SILTLNNNAD QQNSDSKLTQ PLSPSACIFS AVRGVVNSAI DRERRMGASL IRLHFHDCFV DGCDGGVLLD  DIPGSFQGEK TSPPNNNSAR GFEVIEQAKQ RVKDTCPNTP VSCADILAIA ARDSVVKLGG QGYNVALGRR DARTANFTGA LTQLPAPFDN LTVQLRKFND KNFNAREMVA LAGAHTVGFA  RCATVCNSNN VNPAARLQCN CSVTQNDTNL QQLDITPAVF DRVYFQDLNR NQGILFSDQV LTGNTTTAAI VTTYSNNGAV FFGDFAAAMI KMGNLPPSQG VQLEIRDVCS RVNPSSVASM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (FG171312.1, FG171819.1, FG156789.1, FG150216.1, FG158581.1, FG165409.1, FG155406.1, FG157534.1, FG187239.1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTTTGAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTGTGGCTCT TGCACTTGCA GGTGTTGCCA TTTATAGGAA CACTTACGAA GCCATGAGTA AGGGATTCCA AACACTTTCT  CCAGAGTTTG ATCTGCTGGA GTCAGCAGCC AGCATTTTAA CCCTAAATAA TAATGCTGAT CAGCAAAATT CAGACAGCAA GTTAACTCAA CCATTATCTC CATCGGCATG CATCTTCTCG  GCTGTTCGAG GAGTTGTAAA CAGTGCAATT GATAGAGAAA GACGCATGGG AGCTTCTCTC ATTCGTCTCC ACTTCCATGA CTGCTTTGTT GATGTAAATT CCTTCACCCC TTCCTACTGC  TCTCGCATTC TTTACCCTCT TTCCCCTTTT TACTTTAAAA GAACAACAAA GAAATTAAAA GAATAAGAAT CAATAAAAGG CAGTTTTGTT TTTGGTAAAA AGTTTTCCTA AATTTGTCAA  TCTTTAAAGG TTTAACCGGA GTTTTTCACA AGTGTCTAAA GCCAATAATT TCGCTATGAG TGTTTGAGAT TTCCTACGAG CAAGGTTGTC CAACTGATTG TAACTCTGCC CCTACCACGG  CCATAATTAA CCTATAATGC ATGCACCTAA ATAAGGTCAA AACAATTTAT TTACTTATGG TAAAAAAATA TTTTGTCCTA GCTAGTATTT AATCAATCAA ACAAGTACTT ATCAATTTAT  TATTATATTA TGAGAAATGT TTGCTATTAC GACTATATTG AAAAATCTCA GTTGGGTTTT TATTTTTTTT GGGGGGGGTG GGGTGGTGAG GTGGAGGGGT ACAAATAGTG GAGTAGCTGT  GAACCTGCAC GGAACAAGTC AAACCCACCC TAACTTGGAA AAATCTATTC TGCTTCTTTT TAGGTTGCCT TCCAATTCTT GTTTGTTACT GTCGCTTAAG TAACTTTTTC CTAAAAAAAA  AAAAGAATGA AAAAAAAATA CTCTATCAAT TTCATTTTAC GTGGCAAAAT TTAAGTAGAC ACGAAGAAAA AAAAAAGGAT TTCTGAAATT TATGATTTAA AATTAGTCAA ACATATTTGT  GTGATCCTAA ATCAAGGGAA AAAATAGTTA AAATAGTTAC CAAAATTTAA AAAAATATTT ATCTTTTTTA AAAGGACTAA AAAGTAAAAA GTAAATGTTG GGAGGGAGTA GCTTTGTCCT  ATTTCCCCCC TAATTAACAA AGCTTTGCCA CATGCTTTTT CACTTTCAAC GTACTTGAAT GTCATTTGCT CGTTCTGATT ATTCTCATCC TGACTATCTA TCTATGCTCA TGATCGAGCT  TCCATTTCTT CTTTCAGTTT ATCTAGCTAG TCATAAAACT TCATTTTCAT TAACCATAAA GCAAGATTAA GGTTCATTTT ACATCAATTC ACGTAACCTA TAGTTCATTT ATAATTTAAA  AACATATATA TTTTACTGAA GTGATGATTA TGGTTGACTA ATAGCTACAT CTTTTATTAA CAGGGTTGCG ATGGAGGAGT TCTTCTAGAC GATATTCCCG GATCATTCCA AGGGGAAAAA  ACCTCACCAC CCAACAACAA CTCAGCCAGA GGTTTTGAAG TCATAGAACA AGCTAAACAA AGAGTAAAAG ATACTTGTCC CAACACGCCT GTATCTTGCG CAGACATCTT AGCTATTGCT  GCTCGGGATT CTGTTGTTAA AGTAAGTTCA TTAATTTTCT ATCTCTAACG TACCAAATGT TTCTTTAACG ATTATTTACC GCCACCCCAT GGTTTTGGGG TATAGAGTTT CTGTTAATTC  GCTACACAAG ACAGCGAAAA ACAATTTTAT ATTATTAGAT TAAGAGTTGA CTTCCACCAA CAGTAAGGTA TGTCAATAAT ATGGCAATCA GGACTAATTT TGCAATAAAA ATAAGTACGT  AGATTAATTG TTAAACCTAA AATTGAATTA TTAGGCCAAG CAATTAAATA TACATTATTA GAATAGGATT TTAATTATAC ACACAGATAG TATTAAGGAT TTTTCGCACG ATCAATAAAT  TTTAATATGT GATAGCATGT TAATTTGTTG TAACTTTTGT AACCAGTTAT TATTACTCCG CCCATTTCAT CCTATGTGAA ACTGGATACG GAGTTTAACA AAGAAAGACT TTTGGAATTA  TATTTTTAAA CATGTCATGA TATTTATGTG AATTATAAAA TTATGTTATT AAAAGTTTTT AATATAGAAA TGTGTCATTT TTTTTTTGTA ATAAATTAAT GAGAAAATAG CATAAACAAA  CCAAGAGAAT AACTGAAAAG TCTGTTGTGT ATTTGACAGC TAGGAGGACA GGGCTATAAC GTTGCACTAG GGAGAAGAGA TGCAAGAACG GCCAACTTCA CTGGTGCTTT AACTCAGCTT  CCAGCTCCAT TCGATAATCT AACCGTCCAA TTAAGAAAAT TTAATGACAA AAACTTTAAT GCCCGGGAAA TGGTGGCGCT AGCCGGTGCA CACACGGTGG GTTTCGCCAG GTGCGCCACC  GTGTGCAACA GCAACAATGT TAACCCAGCG GCACGCCTTC AATGCAACTG CTCCGTCACC CAAAACGACA CCAACTTGCA ACAATTGGAT ATAACTCCTG CTGTGTTCGA CAGAGTTTAC  TTCCAGGACT TAAACAGGAA CCAGGGCATA CTTTTCTCGG ATCAAGTGTT GACGGGGAAT ACCACCACTG CTGCTATTGT AACAACCTAC AGCAATAATG GTGCTGTTTT CTTTGGAGAT 
TTTGCTGCTG CTATGATCAA GATGGGAAAC TTGCCTCCCT CACAGGGCGT TCAATTGGAA ATTCGTGATG TTTGTAGCAG GGTCAATCCC AGCTCTGTGG CTTCTATGTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTTTGAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTGTGGCTCT TGCACTTGCA GGTGTTGCCA TTTATAGGAA CACTTACGAA GCCATGAGTA AGGGATTCCA AACACTTTCT  CCAGAGTTTG ATCTGCTGGA GTCAGCAGCC AGCATTTTAA CCCTAAATAA TAATGCTGAT CAGCAAAATT CAGACAGCAA GTTAACTCAA CCATTATCTC CATCGGCATG CATCTTCTCG  GCTGTTCGAG GAGTTGTAAA CAGTGCAATT GATAGAGAAA GACGCATGGG AGCTTCTCTC ATTCGTCTCC ACTTCCATGA CTGCTTTGTT GATGGTTGCG ATGGAGGAGT TCTTCTAGAC  GATATTCCCG GATCATTCCA AGGGGAAAAA ACCTCACCAC CCAACAACAA CTCAGCCAGA GGTTTTGAAG TCATAGAACA AGCTAAACAA AGAGTAAAAG ATACTTGTCC CAACACGCCT  GTATCTTGCG CAGACATCTT AGCTATTGCT GCTCGGGATT CTGTTGTTAA ACTAGGAGGA CAGGGCTATA ACGTTGCACT AGGGAGAAGA GATGCAAGAA CGGCCAACTT CACTGGTGCT  TTAACTCAGC TTCCAGCTCC ATTCGATAAT CTAACCGTCC AATTAAGAAA ATTTAATGAC AAAAACTTTA ATGCCCGGGA AATGGTGGCG CTAGCCGGTG CACACACGGT GGGTTTCGCC  AGGTGCGCCA CCGTGTGCAA CAGCAACAAT GTTAACCCAG CGGCACGCCT TCAATGCAAC TGCTCCGTCA CCCAAAACGA CACCAACTTG CAACAATTGG ATATAACTCC TGCTGTGTTC  GACAGAGTTT ACTTCCAGGA CTTAAACAGG AACCAGGGCA TACTTTTCTC GGATCAAGTG TTGACGGGGA ATACCACCAC TGCTGCTATT GTAACAACCT ACAGCAATAA TGGTGCTGTT  TTCTTTGGAG ATTTTGCTGC TGCTATGATC AAGATGGGAA ACTTGCCTCC CTCACAGGGC GTTCAATTGG AAATTCGTGA TGTTTGTAGC AGGGTCAATC CCAGCTCTGT GGCTTCTATG 
TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCCGGGATG GCTTTTCGTT TGAGTCATTT GAGCCTTGCC CTGAGCCTTG TGGCTCTTGC ACTTGCAGGT GTTGCCATTT ATAGGAACAC TTACGAAGCC ATGAGTAAGG GATTCCAAAC  ACTTTCTCCA GAGTTTGATC TGCTGGAGTC AGCAGCCAGC ATTTTAACCC TAAATAATAA TGCTGATCAG CAAAATTCAG ACAGCAAGTT AACTCAACCA TTATCTCCAT CGGCATGCAT  CTTCTCGGCT GTTCGAGGAG TTGTAAACAG TGCAATTGAT AGAGAAAGAC GCATGGGAGC TTCTCTCATT CGTCTCCACT TCCATGACTG CTTTGTTGAT GGTTGCGATG GAGGAGTTCT  TCTAGACGAT ATTCCCGGAT CATTCCAAGG GGAAAAAACC TCACCACCCA ACAACAACTC AGCCAGAGGT TTTGAAGTCA TAGAACAAGC TAAACAAAGA GTAAAAGATA CTTGTCCCAA  CACGCCTGTA TCTTGCGCAG ACATCTTAGC TATTGCTGCT CGGGATTCTG TTGTTAAACT AGGAGGACAG GGCTATAACG TTGCACTAGG GAGAAGAGAT GCAAGAACGG CCAACTTCAC  TGGTGCTTTA ACTCAGCTTC CAGCTCCATT CGATAATCTA ACCGTCCAAT TAAGAAAATT TAATGACAAA AACTTTAATG CCCGGGAAAT GGTGGCGCTA GCCGGTGCAC ACACGGTGGG  TTTCGCCAGG TGCGCCACCG TGTGCAACAG CAACAATGTT AACCCAGCGG CACGCCTTCA ATGCAACTGC TCCGTCACCC AAAACGACAC CAACTTGCAA CAATTGGATA TAACTCCTGC  TGTGTTCGAC AGAGTTTACT TCCAGGACTT AAACAGGAAC CAGGGCATAC TTTTCTCGGA TCAAGTGTTG ACGGGGAATA CCACCACTGC TGCTATTGTA ACAACCTACA GCAATAATGG  TGCTGTTTTC TTTGGAGATT TTGCTGCTGC TATGATCAAG ATGGGAAACT TGCCTCCCTC ACAGGGCGTT CAATTGGAAA TTCGTGATGT TTGTAGCAGG GTCAATCCCA GCTCTGTGGC  TTCTATGTAA AAGGAAAACT TGAATTTGGC AAAAAGGAAT TCATGAACTC ACTATTAGTC GGTTGATGTT TTCTTAAAAT AAAAGAATCA CTGGTTCCAG AATGTGGTTC TAGTATTTGT 
TTTATAATTT GTAGTAATAT TTGGTTTCGC TCTTCTTGTA TAATCATTTG ATTCCATGTA TAACTTCCAA AATTA 

Retrieve as FASTA